DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc16F and Dnah8

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038955254.1 Gene:Dnah8 / 207117 RGDID:619986 Length:4727 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4136 Identity:1215/4136 - (29%)
Similarity:1997/4136 - (48%) Gaps:545/4136 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   174 VYMDYMLPHDSEYFTPYSLREVEYKDLNTYEPFYTVTRHGVTFWHCS----ENFFTPLDQWQQEF 234
            |:::.|.|         .:::||           :|.|.|:|....|    |:||..::.....|
  Rat   897 VFVNLMTP---------KMKKVE-----------SVLRQGLTVLTWSSLMLESFFKEVESVLDMF 941

  Fly   235 KQFLSIIQIRSFSIFRLWKGFKVWEKTIKWRKLNEARDYLQNNLFIVIPQLAKAILRMRSD--IV 297
            .|.|                          :|:|   |..:.::..|:.::||.:|...||  ..
  Rat   942 NQLL--------------------------KKVN---DLCEMHIDTVLKEIAKTLLISLSDSGAT 977

  Fly   298 QLQRLNFVNVSNIENW-----HPFYFLETHMR----IYEQLH---------KTFTDFREFIAKTI 344
            :::.:..:|.:..:.|     |....:|..::    |:||::         |...:.|:.:   :
  Rat   978 RVEDMLTLNETYTKEWADILNHKSRHVEEAVKELILIFEQIYEVKYTGKPAKPVPEQRKHV---V 1039

  Fly   345 FRACTDAIQARGFYPDDEVNYYPSLKKMREAHSFMDRARKRAFCKTLTNFLTYCDMMVYQMLYRI 409
            |.:..|..::..:.||       |..:..:.:...|..:|.  ||.:..|.:      :|:|..:
  Rat  1040 FGSEADEGESLEYDPD-------STARDVDNNDKEDEFKKE--CKEVYAFFS------HQLLDSL 1089

  Fly   410 TKKSFEDLATSFEVHDEVGPSEADINKHDRVDKRI---EKQRPQDKPQSPFFLAMLRLLPDRIDI 471
            .|      ||...:              |.:.|||   .:.|.:.:....|....:.|....:.:
  Rat  1090 QK------ATRLSL--------------DTMKKRIFVGNQGRKRSEDVVSFIKTEVHLAIPNVVM 1134

  Fly   472 EPSEDIIRIIFQRITGLILETVLEIHPF-------TTDPFFTQ--YTQPSIMGR---------QE 518
            .||.|.|:....|:..|.||....:..:       |..|..:.  ..||||||:         :|
  Rat  1135 VPSLDDIQQAINRMIQLTLEVSRGVAHWGQQQVRRTKSPQTSSRGSDQPSIMGKALKKEERSFEE 1199

  Fly   519 EV-------LYEGAPD------LHYLLRADIRFQYNRKNMFVLIRKAYERARLYTQRFHQIRENF 570
            .:       .|.|..:      |..||.:.:.          .:|||...|   .|.|.:.:   
  Rat  1200 SIPARKLKNFYPGVAEHKDISKLVLLLSSSVN----------SLRKAATEA---LQDFQKYK--- 1248

  Fly   571 EIDNSTDPTVLNTERDLQI------------LRAYCDRYCNNVRALDGILEYVFLGLLKLTQTNF 623
                    |:...:||:::            :|:....|....:.::.:...:.:|.|:|.....
  Rat  1249 --------TLWTEDRDVKVKEFLANNPSLTEIRSEILHYATFEQEIEELKPIIDVGALELHTEPM 1305

  Fly   624 KDTVTPVCSRLQNVLATYLPKLAEEETTRLYEEAQDFHGRICYEPHETLEIVAHIRFLDKCSTEL 688
            |..::......:.:|..||    .||                |:...:..||....:|.|.|..:
  Rat  1306 KLALSIEAKAWKMLLCRYL----NEE----------------YKKKMSDMIVFINEYLKKLSRPI 1350

  Fly   689 DGIFDGIDYVHDLLLIIKDFGIPID---DDSKEDYMDTEDYLNR-----TRETLEEIREKRQDFI 745
            ..: |.:.:..:.|..|:|..|.:|   ...:|.|    ..|||     |:|..|.:...|..| 
  Rat  1351 RDL-DDVRFAMEALSCIRDNEIQMDMTLGPIEEAY----GILNRFEVEVTKEESEGVDTLRYSF- 1409

  Fly   746 NRLED---AMQDDIAALKEDIHEVAIEALQPWLLDA---------------------NSNRLSVT 786
            |:|:.   ::||::..::.......:|::..:..|.                     .||||.:.
  Rat  1410 NKLQSKAVSVQDELVQVQPKFKSSLLESVDVFREDVINFTEAYETEGPMVPNIPPQEASNRLQIF 1474

  Fly   787 N-KLDSMLERLNKCRETADEFLGY---QKEFQIDLTMYDEMASGFYDIRMRQNLYRTW------- 840
            . ..|.:..:          |:.|   ::.|.:.:|.|:.:.....::.:.|.||..:       
  Rat  1475 QANFDDLWRK----------FVTYSAGEQLFGLPVTDYEVLHKTRKELNLLQKLYGLYDTVMGSI 1529

  Fly   841 SDWEESLAEWIVSDFNTLNVVDMVELNS---KTIKNCMQFQKYLPENNIVPVLQKSAEAFKEKLP 902
            |.:.|.|  |...|...:| .:::|..:   |..|....:|.||.       |:|..:.|.|..|
  Rat  1530 SGYYEIL--WGDVDIEKIN-AELLEFQNRCRKLPKGLKDWQAYLD-------LKKRIDDFSESCP 1584

  Fly   903 VIGYLRNPNLRARHWAEIEDLLNRKFFQEKDI----------LIQTYEDVHAFDDVAIGEALMQI 957
            ::..:.|..::.|||..|.:|....|..|.|.          |::..:|:   :|:.|       
  Rat  1585 LLEMMTNKAMKQRHWDRISELTGTPFDVESDTFCLRNIMEAPLLKNKDDI---EDICI------- 1639

  Fly   958 SSQATGEVQLENMLKGIETTWKETELSIVPHHDAKDVFILAGTE--ELQAVLDDSNVNINTIAAS 1020
              .|..|..:|..:..:...|....||. .....|...:|.|||  |:..:::||.:.:.::.::
  Rat  1640 --SAIKEKDIEAKMTQVIENWTNQNLSF-SAFKGKGELLLKGTESGEIITLMEDSLMVLGSLLSN 1701

  Fly  1021 KFVGPIKSKVDEWINAMDQFAKTFESWMDCQGAWIYLEAIFASADIQRQLPHEAKMFFTVDKSFK 1085
            ::..|.|..:..|:..:...:...|.|:..|..|:||||:|...||.:|||.|||.|..:|||:.
  Rat  1702 RYNTPFKKTIQNWVYKLSTSSDIIEEWLVVQNLWVYLEAVFVGGDIAKQLPQEAKRFQNIDKSWV 1766

  Fly  1086 ETVRQAKKVALALPTMSSVDV-----HKVLVENNRLLDLISRGLEAYLEVKRVVFPRFYFLSNDE 1145
            :.:::|.:    .|.:.|..|     .::|...:..|::..:.|..|||.||::||||:|:|:..
  Rat  1767 KIMQRAHE----NPNVISCCVGDETMGQLLPHLHEQLEVCQKSLTGYLEKKRLLFPRFFFVSDPV 1827

  Fly  1146 LLEILAQTRIPQAVQPHLRKCFDAIYRLEFGSKEGGDGKMVATNDIVAFLSPEGEKLQFGKGLKA 1210
            |||||.|......:||||....|.|..:.|..|:        .:.:.|.:|.||||:.....:.|
  Rat  1828 LLEILGQASDSHTIQPHLPAVSDNINEVTFHPKD--------YDRMTAVISREGEKIMLDTPVMA 1884

  Fly  1211 RGAVEEWLSKVEEAMFVSCKRYMR--------FGYQCYPAKEREDWFQDH-PNQVVLTVSQVQWA 1266
            :|.||.||..:.:....|....:|        .|:...|       |.:| |.||.|...|:.|.
  Rat  1885 KGPVEIWLLDLLKVQMSSLHNIIRSAFYQISDSGFLLLP-------FLNHFPAQVGLLGIQMLWT 1942

  Fly  1267 ADIHRIYEG--KERNPLNILEKMAKFEIKCLKDLGALAALTRKNISSLLRKILCALITIDVHAKD 1329
            .|.......  .:|..::|..:      |.|..|..|.:.|..:::...|.....||||.||.:|
  Rat  1943 HDSEEALNSAKDDRKIMHITNQ------KFLDILNTLISQTTHDLTKFDRVKFETLITIHVHQRD 2001

  Fly  1330 SVRMLIEKEVCKASDFNWLKMLRFYWADETETVYSRMAAANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLTDRCY 1394
            ....|::..:...:||.|||..|||:.::.:.....:...:..|..|:||....||:||||||||
  Rat  2002 IFDDLVKMHIKSVTDFEWLKQSRFYFKEDLDQTVVSITDVDFNYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCY 2066

  Fly  1395 LCLMGAFQMDLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQCGAW 1459
            :.|..|..|::||||||||||||||||||:.:.|.|..|||||||.:|::.:||.|.||||.|:|
  Rat  2067 ITLAQALGMNMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSW 2131

  Fly  1460 CCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRTAKAMRVKRFIF-EGREIKINRSCCVFITMNPGYAGRTEL 1523
            .||||||||::.||||.|||:..:.||:..|.|:||| :|..:.:|....:|:|||||||||.||
  Rat  2132 GCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVLTARKERKKQFIFSDGDCVDLNPEFGIFLTMNPGYAGRQEL 2196

  Fly  1524 PDNLKALFRPISMMVPDYALISEVILYSEGFEDPKILARKMVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGMRAV 1588
            |:|||..||.::|||||..:|..|.|.|.||.:..|||:|...:|:||.:||::|.|||||:|.:
  Rat  2197 PENLKIQFRTVAMMVPDRQIIMRVKLASCGFLENVILAQKFYVLYKLCEEQLTKQVHYDFGLRNI 2261

  Fly  1589 KSVLVMAGALKRASPNQREDITLIAALRDSNIPKFLADDAVLFRGILSDLFPGVELPDSQHPHLE 1653
            .|||...|:.|||.|...|..|::..|||.|:.|.:.:|..||..:::|||||::|..:.:..|:
  Rat  2262 LSVLRTLGSQKRARPEDSELSTVMRGLRDMNLSKLVDEDEPLFLSLINDLFPGLQLDSNTYAELQ 2326

  Fly  1654 ASLRLGLRQKNLQAV---PTTIRKCLQLYETMCVRWGVMLVGPTGGGKSVVLHALEFALSHLFEN 1715
            |::.   .|.||:.:   |....|.:|||||..||.|:|.:||:|.||:.|:..|..:|:..   
  Rat  2327 AAVD---NQVNLEGLINHPPWNLKLVQLYETSLVRHGLMTLGPSGSGKTTVITILMKSLTEC--- 2385

  Fly  1716 EVQDPNFRPVVIQTMNPKAVTMNELYGYVDLKTLEWQDGLLGLAVRTATTVEDEIHQWIMCDGPV 1780
                  .||.....|||||:|..:::|.:|..|.:|.||:.....|.....:...:.:::.||||
  Rat  2386 ------GRPHREMRMNPKAITAPQMFGRLDTATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGENIFLILDGPV 2444

  Fly  1781 DAVWIENLNTVLDDNKMLCLANSERIKLTAWIHMLFEVQDLLQASPATVSRCGMVYVDPGDLGWI 1845
            ||:||||||:||||||.|.|||.:||.:.....:||||.::..||||||||.||||:....|.|.
  Rat  2445 DAIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPTCKLLFEVHNIENASPATVSRMGMVYISSSALSWR 2509

  Fly  1846 PLIDTWREVDMKHKLPAPLAEFCYQLFVGYFDKALKIERKRAVYTIHQV-LGSKVRLC-CELNSA 1908
            |::..|.:...:.:..|         |:..:||..:     ..||..:: |..|::|. |...:.
  Rat  2510 PILQAWLKRRTQQEATA---------FLSLYDKVFE-----DAYTYMKLNLIPKMQLLECNYITQ 2560

  Fly  1909 QFEAVKWSAMSEEQG----KELVTKIFAWAVLWAIAS--NLKDAEK--VSFEEQWSK----AIAQ 1961
            ....::....|:|:|    .:.:.|:|.:.::|::.:  .|:..||  |......||    .||:
  Rat  2561 SLNLLEGLIPSKEEGGVSSVDHLHKLFVFGLMWSLGALLELESREKLEVFLRGHESKLNLPEIAK 2625

  Fly  1962 HPNMTLPNFTLWNYRIDLEKMDWGSWIDIMAKFVF--DPETSYYDMQVPTVDTTKYGYVSDLLFK 2024
            ..:.|:..|.:.:|.      ||..|...:..:.:  |....|..:.||.||..:..::.|.:.|
  Rat  2626 DSHHTMYEFYVTDYG------DWEHWNKRLQPYFYPTDSIPEYSSILVPNVDNIRTNFLIDTIAK 2684

  Fly  2025 RGMPVMVTGDTGVGKTVLAISCMKRLSQGNVIPVILNFSAQTSSNRTQEMIEGPLEKRKKTQLGA 2089
            :...|::||:.|..|||:..:.:|:......:...||||:.|.....|..||..::||..:..|.
  Rat  2685 QHKAVLLTGEQGTAKTVMVKAYLKKYDPEVQLSKSLNFSSATEPMMFQRTIESYVDKRMGSTYGP 2749

  Fly  2090 PVGKTVIVFIDDVNMPKLDTYGASPAIELLRQFLDFKGFYDREKL-YWKEILDVVLGCACAPPGG 2153
            |.|:.:.|||||:|||.::.:|.....|::||.::.:|.|..:|. .:..|:||.|..|...|||
  Rat  2750 PGGRKMTVFIDDINMPVINEWGDQITNEIVRQMMEMEGMYSLDKPGDFTTIVDVQLIAAMIHPGG 2814

  Fly  2154 GRNPLTPRFVRHFALFSLPKPNEETLTQIFNGILRGFL---QTFSSAVRALSEPMVNACVDVYMR 2215
            |||.:..|..|.|.:|:...|:..::.:||..|..|:.   :.|...:..:...:|:....::..
  Rat  2815 GRNDIPQRLKRQFTVFNCTLPSNTSIDKIFGIIGCGYFDPCRKFRPEICDMIGNLVSVGRVLWQW 2879

  Fly  2216 VATVMLPTPDKSHYIFNLRDLSKCIQGILQASNLHYNQENQILRLFYHETTRVFHDRLINIEDKN 2280
            ....|||||.|.||||||||||:..||:|............::.||.||..||..||.|..:|:.
  Rat  2880 TKVKMLPTPSKFHYIFNLRDLSRIWQGMLTIKAEECKTIPILMALFKHECNRVIADRFITPDDEQ 2944

  Fly  2281 IFKALMKEVCMDHFNRPVINDNEPPILFGDFM--------------VFGKPKNERIYDEIRDHTK 2331
            .|...:.....::.:..|.....|...|.||:              :|..||   ||:.:.....
  Rat  2945 WFNTQLIRAVEENISPEVAASINPEPYFVDFLRDMPEPTGDEPEDTMFEVPK---IYELVPSFEF 3006

  Fly  2332 LESVLNDYIADYNSVAVGKQMKLILFQDAMEHTVRLARLLRSDRGNGLLVGVAGMGKQSLTRLAS 2396
            |...|..|...:|.:..|..:.|:.|:|||.|.::::|::|:..||.|||||.|.|||||:||||
  Rat  3007 LCEKLQFYQKQFNEIIRGTSLDLVFFKDAMTHLIKISRIIRTSCGNALLVGVGGSGKQSLSRLAS 3071

  Fly  2397 HVNEYNCWQIEMRRNYDLNAFHEDLRVLYRIAGIDNQPVTFLLIDSQIVEEEFLEDINNILNSGE 2461
            .:..|..:||.:.|:|:::...:||:.||::||.|.:.:||:..|::|.:|.|||.:||:|:|||
  Rat  3072 FIAGYQIFQITLTRSYNVSNLIDDLKNLYKVAGADGKGITFIFTDNEIKDEAFLEYLNNLLSSGE 3136

  Fly  2462 VPNLFEGDEFEKIILDARDGCNENRKDDPCTRDDIYKFFINRVRNNLHVVMSMSPVGDAFRRRCR 2526
            :.|||..||.::|...............|.|.|::|::||:|.|.|||||:..||||:.||.|..
  Rat  3137 ISNLFARDELDEITQGLISVMKRELPRHPPTFDNLYEYFISRSRRNLHVVLCFSPVGEKFRARSL 3201

  Fly  2527 MFPSLVNCTTIDWFTSWPTEALYSVALGLLT--KIAPKMEDRISLASTTVFMHKTVEDASVKFYK 2589
            .||.|::..|:|||:.||.|||.:||...|:  .|...||.:..:.......|..|.::...:::
  Rat  3202 KFPGLISGCTMDWFSRWPKEALIAVASYFLSDYNIVCSMEIKRHVVEAMGLFHDMVSESCENYFQ 3266

  Fly  2590 EMKRHYYTTPSSYLELLKLYQNLL--KIKNMEIIAKRKRIANGLNKLLETNEVIAVMGKELEVMV 2652
            ..:|..:.||.|||..:..|:|:.  |:|.:...|:|..|  ||:||:|.:|.:|.:.::|.|..
  Rat  3267 RYRRRAHVTPKSYLSFINGYKNIYTEKVKYINEQAERMNI--GLDKLMEASESVAKLSQDLAVKE 3329

  Fly  2653 PQLDEKSAMMKSLVDNLTKETKQADAVKQSVLEDEMNAKEKAAVAQAISE--DAGKDLEIAMPAL 2715
            .:|...|.....::..:|...:.:..||..|  .|:..|.:..|.:..||  .|...||.|.|||
  Rat  3330 KELAVASVKADEVLAEVTVSAQASAKVKNEV--QEVKDKAQKIVDEIDSEKVKAESKLEAAKPAL 3392

  Fly  2716 REAEEALKGLTKADINELKSFTTPPALVQFCMEAVCILLG--------------VKPTWASAKAI 2766
            .|||.||..:...||..::....||.|:...|:.|.:|..              .||:|..:..:
  Rat  3393 EEAEAALNTIKPNDIATVRKLAKPPHLIMRIMDCVLLLFQKKIDPVTMDPEKPCCKPSWGESLKL 3457

  Fly  2767 MADINFIKRLFEYDKEHMKEDTLKKVKKYIDHKDFVPAKFEKVSKVAKSMSMWVISMDKFSKVYK 2831
            |:...|:..|.::.|:.:.|:|::.::.|.:..|:.....:||......:..|.::|..|..:.:
  Rat  3458 MSATGFLFSLQQFPKDTINEETVELLQPYFNMDDYTYESAKKVCGNVAGLLSWTLAMAIFYGINR 3522

  Fly  2832 VVEP---KIKRKE----AAEAELKEVMTVLRQKQKELAAVEAKIQGLRDSLEEKQREFQVIQDNV 2889
            .|.|   .:.::|    .|.|||.:...:|.:||.||..|:||...   ::.||..    :.::.
  Rat  3523 EVLPLKANLAKQEGRLAVANAELGKAQALLDEKQAELDKVQAKFDA---AMNEKMD----LLNDA 3580

  Fly  2890 DLTYGRINRAGRLTSALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVPGDVLVAAACVAYLGAFSHEYR----R 2950
            |:...::..|..|...||.|:|||.:..|.....:..:.||||:....::|||.|:..:|    :
  Rat  3581 DMCRKKMQAASTLIDGLSGEKVRWTQQSKEFKAQINRLVGDVLLCTGFLSYLGPFNQIFRNYLLK 3645

  Fly  2951 DMSALWVSKCREHKIPSSPEFNLLKVLGDPYEMRQWNVDGLPKDNISIENGIYATRALRWALMID 3015
            |.   |..:.:..|||.:...||:.:|.||..:.:|.:.|||.|::||:|||..|:|.|:.|:||
  Rat  3646 DQ---WELEMKARKIPFTENLNLIAMLVDPPTIGEWGLQGLPGDDLSIQNGIIVTKATRYPLLID 3707

  Fly  3016 PQEQANRWIRNMERANNLQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEINETIDPSLRPILQRETYR 3080
            ||.|...||::.|:.|:|||..:........||:::..|.|:|:|:|.|.:||:|..:|::...:
  Rat  3708 PQTQGKTWIKSKEKENDLQVTSLNHKYFRTHLEDSLSLGRPLLIEDIREELDPALDNVLEKNFIK 3772

  Fly  3081 FEGRTYLKLGDMVIDYDDNFKLYMTTKLPNPHYLPEVCINVTLVNFLVTESGLEDQLLADIVAIE 3145
            ......:|:||...|..|.||||:|||||||.:.||:....::::|.||..|||:|||..::..|
  Rat  3773 SGTAFKVKVGDKECDIMDTFKLYITTKLPNPAFTPEINAKTSVIDFTVTMKGLENQLLRRVILTE 3837

  Fly  3146 LPAMEIQRNDLVVKINSDKQQLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELVETLNDAKETSLIIAARLI 3210
            ...:|.:|..|:..:..:|:::..|||.:|..|..::|:::|||.|:..|...|:|:..::.:|.
  Rat  3838 KQELESERVKLLEDVTFNKRKMKELEDNLLYKLSTTQGSLVDDESLIGVLRITKQTAAEVSEKLH 3902

  Fly  3211 DTEETEKVITASRERYRILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYFTQVFCNVLRLDHPPQSVE 3275
            ...|||..|..::|.:|..|:||:||||::..::.::.|||.||..|.::|...:.........:
  Rat  3903 VAAETEIKINTAQEEFRPAATRGSILYFLITEMSMVNIMYQTSLAQFLKLFDQSMARSEKSPLPQ 3967

  Fly  3276 VRISTLMTDELRAIFDNISRGLFENHKIIFSFLLALSVERQEGRVTEEEFLFLSRGPVGNIRTKI 3340
            .||:.::......:|....|||:||||.:|:.|:.|.::.|.|.|..:||..|.:|... :..|.
  Rat  3968 KRITNIIEYLTYEVFTYSVRGLYENHKFLFALLMTLKIDLQRGTVKHKEFQALIKGGAA-LDLKA 4031

  Fly  3341 QPAKIKMSQIEWDSCIFLEDNFSSFFSGLTDELDK-PFFIQMQEN--------KEVFD-FAQTNQ 3395
            .|.|    ...|    .|:..:.:..     ||.| |.|.::...        |..|| .|...:
  Rat  4032 CPPK----PFRW----ILDMTWLNLV-----ELSKLPQFAEIMNQISRNEKGWKNWFDKDAPEEE 4083

  Fly  3396 PPTDKWNKRLRVFHKLMFISAFRKPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTEASGGTQLSSVYLDTSAVTPL 3460
            ...|.:|..|....||:.|.::...|.:.....|:..::.:.:||.. ...|...:.::...|||
  Rat  4084 IIPDGYNDSLDTCRKLLLIRSWCPDRTVFQARKYIADSLEEKYTEPV-ILNLEKTWEESDTHTPL 4147

  Fly  3461 IFVLSTGSDPMSGFLKFTTQMQFTDKYY-----SISLGQGQGPLAENLIEKSLRLGHWVFLQNCH 3520
            |..||.||||       |.|:....|..     :||:||||...|..|::.|::.|.||.|||||
  Rat  4148 ICFLSMGSDP-------TIQIDALAKKLKLECRTISMGQGQEVHARKLVQLSMQQGGWVLLQNCH 4205

  Fly  3521 LATSFM-QTLETIVRNLTLGITKAHVD-FRLYLSSMPIQTFPISVLQNSVKITNEPPKGIKANVF 3583
            |...|| :.|||::      :|:...| ||:::::.|...|||::||.|:|.|||||:|::|.:.
  Rat  4206 LGLEFMEELLETLM------VTETTEDSFRVWITTEPHDRFPITLLQTSLKFTNEPPQGVRAGLK 4264

  Fly  3584 GALTDLKQDFFEQHIQN-GNWRAIVFGLCMFHAVLLERRKFGPLGWNITYEFSESDRECGLKTLD 3647
            .....:.||..:  |.| ..|:.:::.:...|:.:.||||||||||||.|||:.:|....::.:.
  Rat  4265 RTFAGINQDLLD--ISNLPMWKPMLYTVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNSADFSASVQFIQ 4327

  Fly  3648 FFIDR-EVLDEIPWEAILYINGDITWGGRVTDYWDLRCLRTILTIFSSKRIIQPDYKYCRGDSYY 3711
            ..:|. ::...:.|..:.|:.|::.:||||||.:|.|.|.....::.|:::.:|.:.:..|   |
  Rat  4328 NHLDECDIKKGVSWSTVRYMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLNCFARVWFSEKMFEPSFCFYTG---Y 4389

  Fly  3712 RDPRKKTLTEYSAYVQGFPVLEDPEIFGMNQNANIVFQTKETAFFINTLLLGQPRSAADEGQAME 3776
            :.|..|||.:|..|:|..|.|::||:||::.||:|.:|:...:..:.|:...||:   :.|..| 
  Rat  4390 KIPVCKTLDQYFEYIQSLPSLDNPEVFGLHPNADITYQSNTASDVLETITNIQPK---ESGGGM- 4450

  Fly  3777 NEIAQQTIARIQKALATKIKREPI-HDTLSVLDAKGQVPSLTIVLVQEIDRFNIALGIIHDSLVN 3840
            .|..:..:.|:.:.:.:|:....: |:..:.|...|.:.|:.|.|.|||||....:.::.:||.:
  Rat  4451 GETREAIVYRLSEDMLSKLPPNYVAHEVKARLMKMGHLNSMNIFLRQEIDRMQRVISLLRNSLND 4515

  Fly  3841 LSKAIKGLVVMSEELENVFKALLSNQVPASWAKRSFLSIKPLPSYISDFQRRIDFIQQWAENGAP 3905
            |..||:|.::|||.|.:....:...::|..|.:.|:.| ..|..:.::...|......|...|.|
  Rat  4516 LKLAIEGTIIMSENLRDALDNMYDARIPQLWKRVSWDS-STLGFWFTELLERNAQFSTWIFEGRP 4579

  Fly  3906 RSYWISGFFFPQSFLTGVLQTYAR-RRVLPIDSLKIDFDVFERELVQQDFFEMHTNNMSDQKLYG 3969
            ..:|::|||.||.|||.:.|...| .:...:||:.|     ..|:::|...|:.|..:..     
  Rat  4580 NVFWMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSVTI-----HNEVLRQTKEEIITPPVEG----- 4634

  Fly  3970 NLPECTDAIINVHGIFIEAARWDLSKGGLCDANFGELFSRMPVVRFKPCLEISP--TVRYEAPLY 4032
                     :.::|::::.|.||...|.|.::....||.::||:........:|  ...|..|:|
  Rat  4635 ---------VYIYGLYMDGASWDRRNGKLTESTPKVLFMQLPVLHIYAINSTAPKDPKLYVCPIY 4690

  Fly  4033 KTQQRSGVLSTTGHSTNFILAVLLRSHNDPEFWIMRGTALV 4073
            |..:|:.:        .||..|.||:...|:.||:||.||:
  Rat  4691 KKPRRTDL--------TFITVVYLRTVLSPDHWILRGVALL 4723

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:285579 116/431 (27%)
P-loop_NTPase 1373..1603 CDD:304359 130/230 (57%)
P-loop_NTPase 1687..1832 CDD:304359 60/144 (42%)
P-loop_NTPase 1994..2264 CDD:304359 87/275 (32%)
P-loop_NTPase 2343..2613 CDD:304359 107/271 (39%)
MT 2625..2957 CDD:289543 94/358 (26%)
AAA_9 2985..3201 CDD:289547 82/215 (38%)
Dynein_heavy 3342..4066 CDD:281078 213/746 (29%)
Dnah8XP_038955254.1 DHC_N1 376..930 CDD:400611 11/52 (21%)
DYN1 1328..4375 CDD:227570 1012/3189 (32%)
AAA_6 2045..2372 CDD:403853 167/329 (51%)
Dynein_C 4429..4724 CDD:408026 84/327 (26%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.