DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc16F and Dnah10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008767494.2 Gene:Dnah10 / 117252 RGDID:619988 Length:4592 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4147 Identity:1319/4147 - (31%)
Similarity:2067/4147 - (49%) Gaps:534/4147 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   136 TGNKSRSASTTKITTGASLI----PDLNLIINRMRNMPDDSFVYMDYMLPHDSEYFTPYSLREV- 195
            |.|...|..:..|..|...:    |.|..|||..:        |::.:     .:..|...|.| 
  Rat   765 TKNTITSEDSAVIDRGTMFVINFSPVLREIINETK--------YLEQL-----GFTVPELARNVA 816

  Fly   196 --EYKDLNTYEPFYTVTRHGVTFWHCSENFFTP-----LDQWQQEFKQFLSIIQIRSFSIFRLWK 253
              |.|.|...|....:..|    :|...|....     ||...||                 |.:
  Rat   817 LQEDKFLRYTEGIQRMLDH----YHLLVNTLNEAESVLLDDHSQE-----------------LLR 860

  Fly   254 GFKVWEKTIKWRKLNEARDYLQNNLFIVIPQLAKAILRMRSDIVQLQRLNFVNVSNIENWHPFYF 318
            .|:...|.:.|..|..| ||        |.:..:||.:..|.:.|:.:       |.|:      
  Rat   861 VFRSGYKRLNWNSLGIA-DY--------ITRCKQAIGKFESLVHQIHK-------NAED------ 903

  Fly   319 LETHMRIYEQLHKTFTDFREFIAKTIFRACTDAIQ-ARGFYP----------DDEVNYY----PS 368
            :.:.:.:.|.::.    ||..:.||     .|.:. .:.|:.          |..|.:|    |.
  Rat   904 INSRLTLIESINL----FRSPVIKT-----EDKLPGVKEFFEYIERERSRDVDHMVRWYMAIGPL 959

  Fly   369 LKKMR--EAHSFMDRARKRAFCKTLTNFLTYCDMMVYQMLYRITKKSFEDLATSFEVHDEVGPSE 431
            |.|:.  ..|:...||.|      |.::..|.:..:|.:|.::..|:.:..              
  Rat   960 LTKVEGLVVHTNTGRAPK------LASYYEYWEGKIYDVLVKLILKNLQAF-------------- 1004

  Fly   432 ADINKHDRVDKRIEKQRPQDKPQSPFFLAMLRLLPDRIDIEP-SEDIIRIIFQRITGLILETVLE 495
                 :..:.:.:           |.|.|...|....|.:.| :.:|.::....|.|.:..|   
  Rat  1005 -----NSLILRNV-----------PLFQAETILSAPEIILHPNANEIDKMCVHCIRGCVEVT--- 1050

  Fly   496 IHPFTTDPFFTQYTQ------PSIMGRQEEVL----YEGAPDLHYLLRADIRFQYNRKNMFVLIR 550
                   .:|.::..      |...|.:||::    |........::...:....|...:.|.|.
  Rat  1051 -------KYFVRWMNGSCIECPPQKGEEEEIVIISFYNDISQNSQIMDQAVMIPQNIHRLLVNIM 1108

  Fly   551 KAYERARLYTQRFHQIRENFEIDNS---------TDPTVLNTERDLQILRAYC------------ 594
            |       |.||:.:.|..:::|.|         ..|.|...|:    |:.|.            
  Rat  1109 K-------YLQRWKRYRPLWKLDKSIVMEKFAAKKPPCVAYDEK----LQFYAKIAADVMRHPLV 1162

  Fly   595 -DRYCNNVRALDGILEYVFLGLLKLTQTNFKDTVTPVCSRLQNVLATYLPKLAEEETTRLYEEAQ 658
             |.:|..::     ||    .|....|.|.|..||.        |...|.:.|.||...|.:|.:
  Rat  1163 KDEHCIRLQ-----LE----PLANTVQENAKSWVTS--------LGKLLNESAREELYSLRDEIE 1210

  Fly   659 DFHGRICYEPH---------------ETLEIVAHIRFLD----------------KCSTELDGIF 692
            .....:...|:               .|..::..:|:.|                :...||   .
  Rat  1211 HLAKNLKKSPNTLDDLKFVLATISEIRTKSLIMELRYKDVQERYRTMAIYSIFPPEAEQEL---V 1272

  Fly   693 DGIDYVHDLLLIIKDFGIPIDDDSKEDYMDTEDYLNRTRETLEEIREKRQDFINRLEDAMQDDIA 757
            |.|:.:.:.|.              .|.::.|..|...:.|..||  .|.:.||.....  |:.|
  Rat  1273 DNIENMWETLF--------------TDSVNVEHALGGIKRTFTEI--TRSEIINYRSQV--DEFA 1319

  Fly   758 ---------ALKEDIHEVAIEALQPWLLDANSNRLSVTNKLDSMLERLNKCRETADEFLGYQKEF 813
                     |:.||             ||..|..|   ...:..|.|..|.|:   |....:|.|
  Rat  1320 KRFYSEGPGAVGED-------------LDKGSELL---GSFEKELARHEKNRQ---ELANAEKLF 1365

  Fly   814 QIDLTMYDEM---ASGFYDIRMRQNLYRTW----SDWEESLAEWIVSDFNTLNVVDMVELNSKTI 871
            .:.:|||.|:   ......:||..:||.:.    .:|.::|  ||     .|||..:.|.....:
  Rat  1366 DLPITMYPELMKVQKEMAGLRMIYDLYDSLKIAKEEWSQTL--WI-----NLNVQYLQEGIEGFL 1423

  Fly   872 KNCMQFQKYLPENNIVPVLQKSAEAFKEKLPVIGYLRNPNLRARHWAEIEDLLNRKFFQEKDILI 936
            ||..:..:::...::...|:...:|||:.:|::..|::..||.|||.|:.:... .||:..:.. 
  Rat  1424 KNLRKLPRHVRSLSVAFHLETKMKAFKDSIPLLLDLKHEALRERHWKELMEKTG-VFFEMTETF- 1486

  Fly   937 QTYEDVHAFDDVAIGEALMQISSQATGEVQLENMLKGIETTWKETELSIVPHHDAKDV--FILAG 999
             |.:::.|.:.....|.|.:|.:.|..||.:|..:|.|..||:..:.::|.::.....  :||..
  Rat  1487 -TLDNMFAMELHKHTEVLNEIVTAAVKEVAIEKAVKEILDTWENMKFTVVKYYKGTQERGYILGS 1550

  Fly  1000 TEELQAVLDDSNVNINTIAASKFVGPIKSKVDEWINAMDQFAKTFESWMDCQGAWIYLEAIFASA 1064
            .:::...|||:.||:.:|:.|:||||....|.:|...:....:..|.||..|..|:|||:||...
  Rat  1551 VDDIIQCLDDNTVNLQSISGSRFVGPFLQTVHKWEKTLSLIGEVIEIWMLVQRKWMYLESIFIGG 1615

  Fly  1065 DIQRQLPHEAKMFFTVDKSFKETVRQAKKVALALPTMSSVDVHKVLVENNRLLDL--ISRGLEA- 1126
            ||:.|||.|||.|..:|:.||..:..         |:....:.:.....|||.||  :|.|||. 
  Rat  1616 DIRSQLPEEAKKFDVIDRIFKRIMGD---------TLKDPVIKRCCEAPNRLHDLQTVSEGLEKC 1671

  Fly  1127 ------YLEVKRVVFPRFYFLSNDELLEILAQTRIPQAVQPHLRKCFDAIYRLEFGSKEGGDGKM 1185
                  ||:.||..||||:|:|:||||.||..:. |..||.|:.|.:|.|..|.|...:.|: |:
  Rat  1672 QKSLNDYLDSKRNAFPRFFFISDDELLSILGNSD-PLCVQEHMIKMYDNIAMLRFHDGDSGE-KL 1734

  Fly  1186 VATNDIVAFLSPEGEKLQFGKGLKARGAVEEWLSKV------------EEAMFVSCKRYMRFGYQ 1238
            |:     |.:|.|||.:.|.|.::|.|.||:|::.|            :||:|..|:        
  Rat  1735 VS-----AMISAEGEVMVFRKIVRAEGRVEDWMTTVLNEMRRTNRLITKEAIFRYCE-------- 1786

  Fly  1239 CYPAKEREDWFQDHPNQVVLTVSQVQWAADIHRIYEGKERNPLNILEKMAKFEIKCLKDLGALAA 1303
               .:.|.||...:...|||..|||.|..::..::...::.....::...|   |..:.:..|..
  Rat  1787 ---DRSRVDWMMMYQGMVVLAASQVWWTWEVEDVFNKVKQGDKQAMKNYGK---KMHRQIDDLVT 1845

  Fly  1304 LTRKNISSLLRKILCALITIDVHAKDSVRMLIEKEVCKASDFNWLKMLRFYWADETETVYSRMAA 1368
            .....:|...||....::.|||||:|.|...|...:.:|.:|.|...|||||..|.:.:..|...
  Rat  1846 RITMQLSKNDRKKYNTVLIIDVHARDIVDSFIRGSILEAREFEWESQLRFYWDREPDELNIRQCT 1910

  Fly  1369 ANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLTDRCYLCLMGAFQMDLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAKQCV 1433
            ....|.|||:|..|.||:||||||.||.|..|..|.||||||||||||||||||||||||...||
  Rat  1911 GTFGYGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTLTQALSMYLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALGLLCV 1975

  Fly  1434 VFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQCGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRTAKAMRVKRFIFEG 1498
            |.||.:|:|||.:|:.||||||||||.|||||||||..|||||:.|:.|||.|...::..|.|||
  Rat  1976 VTNCGEGMDYKAVGKIFSGLAQCGAWGCFDEFNRIDASVLSVISSQIQTIRNALIHQLTTFQFEG 2040

  Fly  1499 REIKINRSCCVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPISMMVPDYALISEVILYSEGFEDPKILARK 1563
            :||.::....:|||||||||||||||:::||||||:.::|||...|.|::|:||||...|.||:|
  Rat  2041 QEISLDSRMGIFITMNPGYAGRTELPESVKALFRPVVVIVPDLQQICEIMLFSEGFLGAKTLAKK 2105

  Fly  1564 MVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGMRAVKSVLVMAGALKRASPNQREDITLIAALRDSNIPKFLADDA 1628
            |..:|:|..:|||:|:|||||:||:||||||||.|||.|.:.:||:.|:.||||.|:|||:.:|.
  Rat  2106 MTVLYKLAREQLSKQHHYDFGLRALKSVLVMAGELKRGSADLQEDVVLMRALRDMNLPKFVFEDV 2170

  Fly  1629 VLFRGILSDLFPGVELPDSQHPHLEASLRLGLRQKNLQAVPTTIRKCLQLYETMCVRWGVMLVGP 1693
            .||.|::||||||::.|..::|....::...|.:.....:|..:.|.:|::|||..|...|:|||
  Rat  2171 PLFLGLISDLFPGLDCPRVRYPDFNDAVEDVLEENGYVLLPVQVDKVVQMFETMLTRHTTMVVGP 2235

  Fly  1694 TGGGKSVVLHALEFA------LSHLFENEVQDPNFRPVVIQTMNPKAVTMNELYGYVDLKTLEWQ 1752
            ||||||||::.|..|      |:.|:               .:|||||::.||||.:|..|.:|.
  Rat  2236 TGGGKSVVINTLCQAQTKLGILTKLY---------------ILNPKAVSVIELYGILDPTTRDWT 2285

  Fly  1753 DGLLGLAVRTATTVED-EIHQWIMCDGPVDAVWIENLNTVLDDNKMLCLANSERIKLTAWIHMLF 1816
            ||:|....|......| :..::|:.||.|||:|:||:|:|:||||:|.|||.|||:|.:...:||
  Rat  2286 DGVLSNIFREINKPTDKKERKYILFDGDVDALWVENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLQSHCALLF 2350

  Fly  1817 EVQDLLQASPATVSRCGMVYVDPGDLGWIPLIDTWREVDMKHKLPAPLAEFCYQLFVGYFDKALK 1881
            ||.||..||||||||||||||||.:|.:.|....|.: .:::|:.   .::...||..|....:.
  Rat  2351 EVGDLQYASPATVSRCGMVYVDPKNLKYQPYWKKWLQ-QIQNKVE---QKYLNDLFEKYVPILID 2411

  Fly  1882 IERKRAVYTIHQVL----GSKVRLC---CELNS-AQFEAVKWSAMSEE-QGKELVTKIFAWAVLW 1937
            :       .|..:|    |.|:::.   .:||. .|...:..|.:..| :..:|:...|..|:..
  Rat  2412 L-------IIEGILDGRQGEKLKMVVPQTDLNMVTQLTKMMDSLLEGEIEDPDLLECFFLEALYC 2469

  Fly  1938 AIASNLKDAEKVSFEE---------------QWSK--AIAQHPNMTLPNFTLWNYRIDLEKMDWG 1985
            ::.|:|.:..::.|:|               .|::  .:..|    ||  ||:.:..|.::..|.
  Rat  2470 SLGSSLLEEGRIKFDECIKNLSSMPTAETEGNWARPGELPGH----LP--TLYEFHFDSKRNYWI 2528

  Fly  1986 SWIDIMAKFVFDPETSYYDMQVPTVDTTKYGYVSDLLFKRGMPVMVTGDTGVGKTVLAISCMKRL 2050
            .|..::.::|.:.:..:.|:.|.|||||:..::.:.:.|...||:..|::|..||....:.:|.|
  Rat  2529 PWNKLVPEYVHNHQKRFVDILVHTVDTTRTTWILEQMVKIKHPVLFVGESGTSKTATTQNFLKNL 2593

  Fly  2051 SQGNVIPVILNFSAQTSSNRTQEMIEGPLEKRKKTQLGAPVGKTVIVFIDDVNMPKLDTYGASPA 2115
            ::...|.:::|||::|:|...|..:|..:|||.|...|.|:||.::||:||:||||:|.||....
  Rat  2594 NEETNIVLMVNFSSRTTSLDIQRNLEANVEKRTKDTYGPPMGKRLLVFMDDMNMPKVDEYGTQQP 2658

  Fly  2116 IELLRQFLDFKGF-YDREK-LYWKEILDVVLGCACAPPGGGRNPLTPRFVRHFALFSLPKPNEET 2178
            |.||:..|: ||: |||.| |..|.|.|:....|....|||||.:.|||:..|::|::|.|:||:
  Rat  2659 IALLKLLLE-KGYLYDRGKELNCKSIRDLGFIAAMGKAGGGRNEVDPRFLSLFSVFNVPFPSEES 2722

  Fly  2179 LTQIFNGILRGFLQTFSSAVRALSEPMVNACVDVYMRVATVMLPTPDKSHYIFNLRDLSKCIQGI 2243
            |..|:..||:|...||:.::..:|..:....:.:|..:...:.|||.|.||||||||||:...|:
  Rat  2723 LHLIYYSILKGHTSTFAESISGVSRKLTFCTLTLYKNIVQDLPPTPSKFHYIFNLRDLSRVFNGL 2787

  Fly  2244 LQASNLHYNQENQILRLFYHETTRVFHDRLINIEDKNIFKALMKEVCMDHFN---RPVINDNEPP 2305
            :..:...:...:|::|::.:|..|||||||||..||.:.:..:..:..:|||   ..|:.|   |
  Rat  2788 VLTNPDRFQTVSQMVRVWRNECLRVFHDRLINEVDKQLVQDYIGNLVKEHFNDDYEMVMRD---P 2849

  Fly  2306 ILFGDFMVFGKPKNERIYDEIRDHTKLESVLNDYIADYNSVAVGKQMKLILFQDAMEHTVRLARL 2370
            ||||||....:.:..|||::|:|:...:::..:.:.:||.  |..:|.|:||.||:||..|:.|:
  Rat  2850 ILFGDFRTALQEEEPRIYEDIQDYEAAKALFEEILEEYNE--VNTKMNLVLFDDALEHLTRVHRI 2912

  Fly  2371 LRSDRGNGLLVGVAGMGKQSLTRLASHVNEYNCWQIEMRRNYDLNAFHEDLRVLYRIAGIDNQPV 2435
            :|.|||:.|||||.|.|||||.|||:....|..::|.:.|.|..|.|.:||:.||...|::|:.:
  Rat  2913 IRMDRGHALLVGVGGSGKQSLARLAAFTAGYEVFEILLSRGYSENNFRDDLKNLYMKLGLENKLM 2977

  Fly  2436 TFLLIDSQIVEEEFLEDINNILNSGEVPNLFEGDEFEKIILDARDGCNENRKDDPCTRDDIYKFF 2500
            .||..|:.:.||.|||.|||:|.||.||.||..:|.:.|:  ::.|....:......::.:::||
  Rat  2978 IFLFTDAHVAEEGFLELINNMLTSGMVPALFTEEEKDNIL--SQIGQEALKHGMGPAKESVWQFF 3040

  Fly  2501 INRVRNNLHVVMSMSPVGDAFRRRCRMFPSLVNCTTIDWFTSWPTEALYSVALGLL--TKIAP-- 2561
            :|:..||||:|:.||||||..|.|||.||.|||.|.||||..||.:||::||...|  ..:.|  
  Rat  3041 VNKSANNLHIVLGMSPVGDTLRTRCRNFPGLVNNTGIDWFMPWPPQALHAVAKSFLGNNSMIPSE 3105

  Fly  2562 KMEDRISLASTTVFMHKTVEDASVKFYKEMKRHYYTTPSSYLELLKLYQNLLKIKNMEIIAKRKR 2626
            |:||   |....|.:|::|.:.|.:|.::::|..|.||.:||:.:..|..||..|....||:.||
  Rat  3106 KLED---LVEHVVLVHQSVGEFSKQFQQKLRRSNYVTPKNYLDFINTYSKLLDEKTQYNIAQCKR 3167

  Fly  2627 IANGLNKLLETNEVIAVMGKELEVMVPQLDEKSAMMKSLVDNLTKETKQADAVKQSVLE-----D 2686
            :..||:||.|....:..:.::|......|.||||..::|::.:...|..|:..|:...|     :
  Rat  3168 LEGGLDKLKEATIQLDELNQKLAEQKIVLAEKSAACETLLEEIATNTAIAEEKKKLAEEKAIEIE 3232

  Fly  2687 EMN---AKEKAAVAQAISEDAGKDLEIAMPALREAEEALKGLTKADINELKSFTTPPALVQFCME 2748
            |.|   |.|||....|::|        .||.|..|:..|:.|.|:|:.|::||..||..||...|
  Rat  3233 EQNKIIAVEKAEAETALAE--------VMPILEAAKLELQKLDKSDVTEIRSFAKPPKQVQTVCE 3289

  Fly  2749 AVCILLGVKP-TWASAKAIMADINFIKRLFEYDKEHMKEDTLKKVKKYIDHKDFVPAKFEKVSKV 2812
            .:.|:.|.|. .|.:||.:|:|.||::.|.|.|.:.:.:..:|.:|..:...:....:.|.|||.
  Rat  3290 CILIMKGYKELNWKTAKGMMSDPNFLRSLMELDFDSITQGQVKNIKGLLKTLNTTIEEMEAVSKA 3354

  Fly  2813 AKSMSMWVISMDKFSKVYKVVEPKIKRKEAAEAELKEVMT--VLRQKQKELAAVEAKIQGLRDSL 2875
            ...|..:|.::..:..|::.::|  ||.:.|..|....:|  .|.:.|.||||::.:::.|....
  Rat  3355 GLGMLKFVEAVMGYCDVFREIKP--KRDKVARLERNFFLTKRELERIQNELAAIQKELEALGAKY 3417

  Fly  2876 EEKQREFQVIQDNVDLTYGRINRAGRLTSALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVPGDVLVAAACVAY 2940
            |....|.|.:|:..::...|:..|.:|.|.|..|.|||...:..|......:.||.|:.||.::|
  Rat  3418 EAAILEKQKLQEEAEIMERRLIAADKLISGLGSENVRWLNDLDELMHRRVKLLGDCLLCAAFLSY 3482

  Fly  2941 LGAFSHEYRRDM-SALWVSKCREHKIPSSPEFNLLKVLGDPYEMRQWNVDGLPKDNISIENGIYA 3004
            .|||:.|:|..| :..|.:...:..||.|..|.|..:|.|..|:.:|...|||.|.:|::|||..
  Rat  3483 EGAFTWEFRDAMVNQEWRNDILDRDIPLSQPFRLENLLTDDVEISRWGSQGLPPDELSVQNGILT 3547

  Fly  3005 TRALRWALMIDPQEQANRWIRNMERANNLQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEINETIDPS 3069
            |||.|:.|.||||:||..||:..|..|||:|....|...::.||.:::.|.|.|..:::|.|||.
  Rat  3548 TRASRFPLCIDPQQQALNWIKRKEERNNLRVASFNDPDFLKQLEMSIKYGTPFLFHDVDEYIDPV 3612

  Fly  3070 LRPILQRETYRFEGRTYLKLGDMVIDYDDNFKLYMTTKLPNPHYLPEVCINVTLVNFLVTESGLE 3134
            :..:|::.....:||.::.|||..:|||.||:||:.|||.||.|.|.|.....::|:.||..|||
  Rat  3613 IDNVLEKNIKISQGRQFIILGDKEVDYDSNFRLYLNTKLANPRYSPSVFGKAMVINYTVTLKGLE 3677

  Fly  3135 DQLLADIVAIELPAMEIQRNDLVVKINSDKQQLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELVETLNDAK 3199
            ||||:.:||.|...:|.||..|:.:.:.:|..|..|||.:|:.|..|.||:||:.|||:||.:.|
  Rat  3678 DQLLSVLVAYERRELEEQREHLIQETSENKNLLKDLEDSLLRELATSTGNMLDNVELVQTLEETK 3742

  Fly  3200 ETSLIIAARLIDTEETEKVITASRERYRILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYFTQVFCNV 3264
            ..:..::.:|...|:|...|...|:.||..|.|||||:||::.:|.::.||||||..|.:||...
  Rat  3743 SKATEVSEKLKLAEKTALDIDRLRDGYRPAARRGAILFFVLSEMALVNSMYQYSLIAFLEVFGLS 3807

  Fly  3265 LRLDHPPQSVEVRISTLMTDELRAIFDNISRGLFENHKIIFSFLLALSVERQEGRVTEEEFLFLS 3329
            |:...|...:..|:..:|......|::....||||.||::|||.:.:.:|:.||||.::|..|..
  Rat  3808 LKKSLPDSILLKRLKNIMDTLTFNIYNYGCTGLFEKHKLLFSFNMTIKIEQAEGRVPQDELDFFL 3872

  Fly  3330 RGPVGNIRTKIQPAKIKMSQIEWDSCIFLEDNFSSFFSGLTDELDKPFFIQ--MQENKEVFDFAQ 3392
            :|.:...::|.:.....:|...|:..|.|.:.||..|..|      ||.|:  :...:|.:|...
  Rat  3873 KGNISLEKSKWKKPCTWLSDQGWEDIILLSEKFSDIFGNL------PFDIEHNLPTWQEWYDKDS 3931

  Fly  3393 TNQPPTD-KWNKRLRVFHKLMFISAFRKPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTEASGGTQLSSVYLDTSA 3456
            ..|.|.. :::..:..|.||:.:..||..|....|..|:..|:|:.:.:.. .....:::..::.
  Rat  3932 LEQFPFPLRYDDHITAFQKLLILRCFRVDRVYRAVTDYVTLTMGEKYVQPP-MISFEAIFEQSTP 3995

  Fly  3457 VTPLIFVLSTGSDPMSGFLKFT-------TQMQFTDKYYSISLGQGQGPLAENLIEKSLRLGHWV 3514
            .:|::|:||.||||.|..:|..       |:::|      :::||||..:|..|:|.::..|.|:
  Rat  3996 NSPIVFILSPGSDPASDLMKLAERSGFGGTRLKF------LAMGQGQEKVALQLLETAVARGQWL 4054

  Fly  3515 FLQNCHLATSFMQTLETIVRNLTLGITKAHVDFRLYLSSMPIQTFPISVLQNSVKITNEPPKGIK 3579
            .||||||...:::.||..:..    |||.|.||||:|::.|.:.|||.:||.|:|:..|||.|:|
  Rat  4055 MLQNCHLLVKWLKDLEKSLER----ITKPHPDFRLWLTTDPTKGFPIGILQKSLKVVTEPPNGLK 4115

  Fly  3580 ANVFGALTDLKQDFFEQHIQNGNWRAIVFGLCMFHAVLLERRKFGPLGWNITYEFSESDRECGLK 3644
            .|:......:..|..|| ..:..::.:|:.|..||||:.||||||.:|||:.|:|:|||.:..::
  Rat  4116 LNMRATYFKISHDMLEQ-CPHTAFKPLVYVLAFFHAVVQERRKFGKIGWNVYYDFNESDFQVCME 4179

  Fly  3645 TLDFFIDREVLD---EIPWEAILYINGDITWGGRVTDYWDLRCLRTILT------IFSSKRIIQP 3700
            .|:.::.:....   .|||.::.|:.|::.:|||..|.:|.|.|.|.:.      ||.:   .||
  Rat  4180 ILNTYLTKAFQQHDPRIPWGSLKYLIGEVMYGGRAIDSFDRRILTTYMDEYLGDFIFDT---FQP 4241

  Fly  3701 DYKYCRGDSYYRDPRKKTLTEYSAYVQGFPVLEDPEIFGMNQNANIVFQTKETAFFINTLLLGQP 3765
            .:.:...|..|:.|......::...::..|:...||:||::.||.|.:.|:........||..||
  Rat  4242 FHFFRNKDVDYKIPVGDVKDKFVEAIEALPLANTPEVFGLHSNAEIGYYTQAARDMWGHLLELQP 4306

  Fly  3766 RSAADEGQAMENEIAQQTIARIQKALATKIKREPIHDTLSVLDAKG-QVPSLTIVLVQEIDRFNI 3829
            ::    |::.........|.::.|.:..|:.:  |.|...|....| .:...::||:||:.|||.
  Rat  4307 QT----GESSSGVSRDDYIGQVAKDIENKMPK--IFDLDQVRKHLGLNISPTSVVLLQELGRFNK 4365

  Fly  3830 ALGIIHDSLVNLSKAIKGLVVMSEELENVFKALLSNQVPASWAKRSFLSIKPLPSYISDFQRRID 3894
            .:..:..||..|.:|:.|.|.||.||::|.::|....:|..|.|.:..::|.|.:::..|.||.:
  Rat  4366 LVIRMTRSLAELQRALAGEVGMSNELDDVARSLFLGHIPHIWRKLAPDTLKTLGNWMVYFLRRFN 4430

  Fly  3895 FIQQWAENGAPRSYWISGFFFPQSFLTGVLQTYARRRVLPIDSLKIDFDVFERELVQQDFFEMHT 3959
            ....|.....|...|:||...|:|:||.::|...||...|:|...:    |.:....||..|:  
  Rat  4431 QYTLWVTESEPSVMWLSGLHIPESYLTALVQATCRRNGWPLDRSTL----FTQVTKFQDADEV-- 4489

  Fly  3960 NNMSDQKLYGNLPECTDAIINVHGIFIEAARWDLSKGGLCDANFGELFSRMPVVRFKPC----LE 4020
            |..:.|..:            |.|:::|.|.||:.:|.|..:....|...:|:::..|.    |:
  Rat  4490 NERAGQGCF------------VSGLYLEGADWDIERGCLVKSKPKVLVVDLPILKIIPIEGHRLK 4542

  Fly  4021 ISPTVRYEAPLYKTQQRSGVLSTTGHSTNFILAVLLRSHNDPEFWIMRGTAL 4072
            :..|.|  .|:|.|..|...:     ....:....|.:......|:::|..|
  Rat  4543 LQNTFR--TPVYTTSMRRNAM-----GVGLVFEADLFTAKHISHWVLQGVCL 4587

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:462462 134/431 (31%)
DYN1 1047..3704 CDD:227570 1020/2750 (37%)
AAA_6 1373..1699 CDD:463697 188/325 (58%)
Dynein_C 3750..4073 CDD:465677 82/328 (25%)
Dnah10XP_008767494.2 DHC_N1 309..879 CDD:462457 31/148 (21%)
DHC_N2 1375..1780 CDD:462462 130/430 (30%)
DYN1 <1616..4234 CDD:227570 1007/2718 (37%)
AAA_6 1915..2241 CDD:463697 188/325 (58%)
AAA_8 2894..3153 CDD:463701 113/263 (43%)
Dynein_C 4291..4589 CDD:465677 82/328 (25%)

Return to query results.
Submit another query.