DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc16F and Dnah6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4194 Identity:1890/4194 - (45%)
Similarity:2645/4194 - (63%) Gaps:209/4194 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    16 SKIKIKGKEKEKERKKDEDDD------GSRKARERGRSRRQSAG---------GGDHS-----VD 60
            :||:.||.......|::|.:.      .:.||:|:.|.|:|...         ..||.     .:
  Rat    41 NKIRAKGVLNYASLKENEPEPQTLVFRHTTKAQEKTRKRQQPVKLEPLPVLKLYQDHKQPEYIYE 105

  Fly    61 MGFKRV--TGEDRPSSMSMDRLDSDFAAFTDRASDANDGSITGPADGNGKKAQTGGKQK---RAS 120
            ...:::  ||..:||...::|              ::.||:         :||...|:|   |.|
  Rat   106 QNRQQLMSTGILKPSPSMIER--------------SSIGSL---------EAQEALKRKQVLRPS 147

  Fly   121 KHRLNFSTSKSAGSGTGNKS----RSASTTKITTG------ASLIPDLNLIINRMRNMPDDSFVY 175
            ....:.|.||...:..|.:.    ||::..|.|..      .:.|.|...||..:.......|:|
  Rat   148 ADVFSLSPSKLPRTSIGRRGLFGMRSSTYPKYTFNDREEVVKANIRDPLQIIKIVHENEHLGFLY 212

  Fly   176 MDYMLPHDSEYFTPYSLREVEYKDLNTYEPFYTVTRHGVTFWHCSENFFTPLDQWQQEFKQFLSI 240
            |...:|..|..:..|:|:.|.|:::|..: :||:::..||.....:..:...::|:||:.....:
  Rat   213 MIPAVPKSSIEYDTYNLKVVSYENINKND-YYTISKDAVTHVFNDDIEYIETERWEQEYLYHREL 276

  Fly   241 IQIRSFSIFRLWKGFKVWEKTIKWRKLNEARDYLQNNLFIVIPQLAKAILRMRSDIVQLQRLNFV 305
            .:|..||:||.||.|.||.|.::.:|:...|..|:.|||||.|.|..|:|::.....|   |:|:
  Rat   277 TKIPIFSLFRKWKAFSVWRKNVRSKKITGCRKALRKNLFIVNPYLRPALLKINDMCYQ---LSFM 338

  Fly   306 NVSNIENWHPFYFLETH----MRIYEQLHKTFTDFREFIAKTIFR-ACTDAIQARGFYPDD-EVN 364
            .:..||.:|.:...|..    :|:.|...:  .::..|.||.:.| :|..|::|.||.||| ||.
  Rat   339 GLCYIEKFHTYTLQEFKAAQVVRVQEVTER--LEYFRFEAKDVVRKSCRFALRAAGFIPDDCEVE 401

  Fly   365 YYPSLKKMREAHSFMD------------------RARKRAFCKTLTNFLTYCDMMVYQMLYRITK 411
            .:....|:..| ||:|                  :|.||..|..||.|:...|.::...|:.:|.
  Rat   402 THEDYFKINIA-SFIDAPSDLPTYGESEKMTYTEQASKRHHCMRLTCFIRLNDYLIQNTLHVLTV 465

  Fly   412 KSFEDLATSFEVHDEVGPSEADI-------NKHDRVDKR----IEKQRPQDKPQSPFFLAMLRLL 465
            .:...|........:..|| ||:       :|.:.::|:    :|||. :|:...|.||..|.|.
  Rat   466 NTASSLLNYLSDKLKRTPS-ADVIQKWITEDKPEVIEKKGAPMMEKQE-EDESLIPMFLTELILT 528

  Fly   466 PDRIDIEPS-EDIIRIIFQRITGLI---LETVLEIHPFTTDPFFTQYTQPSIMGRQEEVLYEGAP 526
            ...:..||| ||.:    ..|:|:|   ..|||.:.....|.:|..:|.|.|..:.||......|
  Rat   529 VQSLLFEPSLEDFL----DGISGIINHFENTVLSVPNLVPDSYFNAFTSPFINKKVEEKTCGPGP 589

  Fly   527 DLHYLLRADIRFQYNRKNMFVLIRKAYERARLYTQRFHQIRENFEIDNSTDPTVLNTER-DLQIL 590
            .|..:...|..|....:.:...|..|::.||||...|.:.:..|:.:.|.|...|..|. |::..
  Rat   590 SLSAVFEDDRNFLTIIQQIKETIHSAFDSARLYAATFEKFQIFFKENESLDLEALKEEEPDVEFF 654

  Fly   591 RAYCDRYCNNVRALDGILEYVFLGLLKLTQTNFKDTVTPVCSRLQNVLATYLPKLAEEETTRLYE 655
            .:..::|....:....:.....:|||.:.....|:.:.|...|...||...||:|::::...:..
  Rat   655 SSQLEKYHKQHKDSVALKPTRNVGLLLIDTKQLKEKLIPSPLRCLEVLNLMLPRLSKKKVDAIIS 719

  Fly   656 EAQDFHGRICYEPHETLEIVAHIRFLDKCSTELDGIFDGIDYVHDLLLIIKDFGIPIDDDSKEDY 720
            ||||...::.:.|..|:|.|..:.|||:....::.:.:..:.|..:..:|:.:.:....:....:
  Rat   720 EAQDAEYKLEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIETLEEEGNTVVQMYKLIEQYQVLTPPEDFAVF 784

  Fly   721 MDTEDYLNRTRETLEEIREKRQDFINRLEDAMQDDIAALKEDIHEVAIEALQPWLLDANSNRLSV 785
            ...:..:...|..:::....|:..|.:....:..|:..|..:::||.:.|..|.:||.:::...:
  Rat   785 ATMKPSITAVRNAIDKSVGDRESSIKQFCLHLGRDLEDLNNEVNEVKLLAQDPQILDISADPEKI 849

  Fly   786 TNKLDSMLERLNKCRETADEFLGYQKEFQIDLTMYDEMASGFYDIRMRQNLYRTWSDWEESLAEW 850
            ...|..:...|:..::.|.::..|||.|:::::.:|.:.....::|::|.|:.:.|:|::...||
  Rat   850 KTMLSDLQSVLDDLQKRAFQYKSYQKNFKVEVSKFDALEEVCAELRLKQLLWDSLSEWDKLQQEW 914

  Fly   851 IVSDFNTLNVVDMVELN---SKTIKNCMQFQKYLPENNIVPVLQKSAEAFKEKLPVIGYLRNPNL 912
            :.|.|:.|   |...||   :|..|...|.:|.||.|::||.|::..|..|||||||..||||.|
  Rat   915 LKSKFDCL---DPEVLNGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSVVPQLKQKVERMKEKLPVINDLRNPTL 976

  Fly   913 RARHWAEIEDLLNRKFFQ-EKDILIQTYEDVHAFDDVAIGEALMQISSQATGEVQLENMLKGIET 976
            :.|||:.||..::..... |..:.::...::|.||   ..:.:..||.||:||..||.:||.:|.
  Rat   977 KPRHWSAIEQTVDALLVDIEIPLTLERLSELHVFD---FAQEIQDISGQASGEAALEIILKKVED 1038

  Fly   977 TWKETELSIVPHHDAKDVFILAGTEELQAVLDDSNVNINTIAASKFVGPIKSKVDEWINAMDQFA 1041
            :||.||..|:||.|:||||||.||:::|.:||||.:|:.|||:|::|||:|::||:|...:..|.
  Rat  1039 SWKTTEFVILPHRDSKDVFILGGTDDIQVLLDDSTINVATIASSRYVGPLKTRVDDWQKQLSLFN 1103

  Fly  1042 KTFESWMDCQGAWIYLEAIFASADIQRQLPHEAKMFFTVDKSFKETVRQAKKVALALPTMSSVDV 1106
            :|.|.|::||..|:|||:||.:.|||||||.|||||..||||:||.:|:..::..||...:...:
  Rat  1104 QTLEEWLNCQRNWLYLESIFNAPDIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIMRKVNRLPNALRAATQPGL 1168

  Fly  1107 HKVLVENNRLLDLISRGLEAYLEVKRVVFPRFYFLSNDELLEILAQTRIPQAVQPHLRKCFDAIY 1171
            .:....||.|||.|.:.||||||.|||:||||||||||||||||||||.|||||||||||||:|.
  Rat  1169 LETFQNNNALLDQIQKCLEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQTRNPQAVQPHLRKCFDSIS 1233

  Fly  1172 RLEFGSKEGGDGKM---------VATNDIVAFLSPEGEKLQFGKGLKARGAVEEWLSKVEEAMFV 1227
            :|||......:||:         |.||||:|.||||||::..||||||||.|||||.|||||||.
  Rat  1234 KLEFALMPPTEGKIPGIDTEPEKVFTNDILAMLSPEGERVGLGKGLKARGNVEEWLGKVEEAMFS 1298

  Fly  1228 SCKRYMRFGYQCYPAKEREDW-FQDHPNQVVLTVSQVQWAADIHRIYEGKERNPLNILEKMAKFE 1291
            |.:|..:.....|..|.|.:| ...||:||:||:||:.|..|:....|.::    |.||.:.|||
  Rat  1299 SLRRLCKAAIADYQGKLRTEWVIAGHPSQVILTISQIMWCRDLTESLECED----NHLEALEKFE 1359

  Fly  1292 IKCLKDLGALAALTRKNISSLLRKILCALITIDVHAKDSVRMLIEKEVCKASDFNWLKMLRFYWA 1356
            ....:.|.||||:.|.::..|.|.|:.|||||||||:|.|..|::.:|..|..|:|.:.||:||.
  Rat  1360 QVNFERLNALAAIVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARDIVSELVQSKVDSAESFDWQRQLRYYWD 1424

  Fly  1357 DETETVYSRMAAANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLTDRCYLCLMGAFQMDLGGAPAGPAGTGKTETT 1421
            .:.:...:|||.:...|.||||||...||:||||||||||||||.|:||||||||||||||||||
  Rat  1425 VDLDNCVARMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQLDLGGAPAGPAGTGKTETT 1489

  Fly  1422 KDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQCGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRTA 1486
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat  1490 KDLAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRNA 1554

  Fly  1487 KAMRVKRFIFEGREIKINRSCCVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPISMMVPDYALISEVILYS 1551
            ||.::.||:|||||||:..:|..||||||||||||||||||||||||::||||:||||:||||||
  Rat  1555 KAAKLSRFMFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPMAMMVPNYALIAEVILYS 1619

  Fly  1552 EGFEDPKILARKMVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGMRAVKSVLVMAGALKRASPNQREDITLIAALR 1616
            ||||..|||||||.|||:|||:|||||:|||||||||||||||||:|||.:|:..||:.||.|||
  Rat  1620 EGFESSKILARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSLKRENPDLSEDVVLIRALR 1684

  Fly  1617 DSNIPKFLADDAVLFRGILSDLFPGVELPDSQHPHLEASLRLGLRQKNLQAVPTTIRKCLQLYET 1681
            |||:||||.|||:||.||:|||||||::|:..:..|.:::...:..:|||.....::|.:|||||
  Rat  1685 DSNLPKFLTDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYGILHSTIVDVMISQNLQPEICMVKKVIQLYET 1749

  Fly  1682 MCVRWGVMLVGPTGGGKSVVLHALEFALSHLFENEVQDPNFRPVVIQTMNPKAVTMNELYGYVDL 1746
            |.||.||||||||||||:.|...|...|.:|.:....:|.::||....:|||::||.||||.|:.
  Rat  1750 MLVRHGVMLVGPTGGGKTTVYQVLAETLGNLEKLNTGNPFYQPVKTFVLNPKSITMGELYGEVNN 1814

  Fly  1747 KTLEWQDGLLGLAVRTATTVEDEIHQWIMCDGPVDAVWIENLNTVLDDNKMLCLANSERIKLTAW 1811
            .||||:|||:.|:||.|.....|.|:||:.||||||:||||:|||||||||||||||||||||..
  Rat  1815 VTLEWKDGLMALSVRAAVNDTSEDHKWIISDGPVDALWIENMNTVLDDNKMLCLANSERIKLTPQ 1879

  Fly  1812 IHMLFEVQDLLQASPATVSRCGMVYVDPGDLGWIPLIDTWREVDMKHKLPAPLAEFCYQLFVGYF 1876
            :|||||||||..||||||||||||:|||.:|.|:|.:.||... :..||...:.|:...||..|.
  Rat  1880 VHMLFEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVKTWMST-LSKKLSEEIREYLLNLFNRYV 1943

  Fly  1877 DKALKIERKRAVYTIHQVLGSKV-RLCCELNSAQFEAVKWSAMSEEQGK--ELVTKIFAWAVLWA 1938
            |..|:...|:....|.||..||| .|||.|.|... :...:.:|.||.|  .:|.:.|.:..||:
  Rat  1944 DDGLRFVNKKCTQAIPQVDISKVTTLCCLLESLLL-SKDGNILSLEQMKLNTVVCQTFVFCYLWS 2007

  Fly  1939 IASNLKDAEKVSFEEQWSKAIAQHPNMTLPNF-TLWNYRIDLEKMDWGSWIDIMAKFVFDPETSY 2002
            :..||.:....||:.........:|:..||:. .||:..:|.:......|..|:..|.:..|..:
  Rat  2008 LGGNLTENHWDSFDTFIRTQFDDNPDARLPSSGDLWSIHVDFDTKRLDPWERIIPTFKYSREVPF 2072

  Fly  2003 YDMQVPTVDTTKYGYVSDLLFKRGMPVMVTGDTGVGKTVLAISCMKRLSQ-GNVIPVILNFSAQT 2066
            ::|.|||.||.:|||:.:.|......|:.||.|||||:|:|...:.|:.: ...:||.|||||||
  Rat  2073 FEMLVPTADTVRYGYLMEKLLAVRHSVLFTGTTGVGKSVIAKGLLNRIQESAGYVPVYLNFSAQT 2137

  Fly  2067 SSNRTQEMIEGPLEKRKKTQLGAPVGKTVIVFIDDVNMPKLDTYGASPAIELLRQFLDFKGFYDR 2131
            ||.||||:||..||:::|..||||..|.|::|:||:|||:||.||:.|.||||||:.||.|||||
  Rat  2138 SSARTQEIIESKLERKRKNILGAPGNKQVVIFVDDLNMPRLDRYGSQPPIELLRQYQDFGGFYDR 2202

  Fly  2132 EKLYWKEILDVVLGCACAPPGGGRNPLTPRFVRHFALFSLPKPNEETLTQIFNGILRGFLQTFSS 2196
            .||:||||.||.:..|||||||||||:||||:|||::..||.|:|.:|.|||..||.|||..|:.
  Rat  2203 NKLFWKEIQDVTIVSACAPPGGGRNPVTPRFIRHFSMLCLPMPSEHSLKQIFQAILNGFLADFTE 2267

  Fly  2197 AVRALSEPMVNACVDVYMRVATVMLPTPDKSHYIFNLRDLSKCIQGILQASNLHYNQENQILRLF 2261
            ||:..|..:|.|.|::|.|::..:||||.||||:|||||||||:|||||.......:|.||.|||
  Rat  2268 AVKQTSSNIVEAAVEIYNRMSVDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGILQCDPGTIREEMQIFRLF 2332

  Fly  2262 YHETTRVFHDRLINIEDKNIFKALMKEVCMDHFNRPVINDNE----PPILFGDFMVFGKPKNERI 2322
            .||..|||||||||.|||:.|..::.|:...||.  :..|.|    .||:||||:.||..|.:||
  Rat  2333 CHECQRVFHDRLINNEDKHYFHVILTEMANKHFG--IAIDLEYFLSKPIIFGDFIKFGADKADRI 2395

  Fly  2323 YDEIRDHTKLESVLNDYIADYNSVAVGKQMKLILFQDAMEHTVRLARLLRSDRGNGLLVGVAGMG 2387
            ||::.|..|:|:||.||:.||| :...|::||:.||||:||..|:||::|.:|||.|||||.|.|
  Rat  2396 YDDLPDIEKIENVLQDYLDDYN-LTNPKEVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTG 2459

  Fly  2388 KQSLTRLASHVNEYNCWQIEMRRNYDLNAFHEDLRVLYRIAGIDNQPVTFLLIDSQIVEEEFLED 2452
            ||||||||:|:..|.|.|||:.|.|:.::||||||.||::||::::.:.||..|:|||.||||||
  Rat  2460 KQSLTRLAAHICGYKCLQIELSRGYNYDSFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLED 2524

  Fly  2453 INNILNSGEVPNLFEGDEFEKIILDARD-----GCNENRKDDPCTRDDIYKFFINRVRNNLHVVM 2512
            |||||||||||||||.||.|:::...|.     |.:|.      .||:::::||:|||..||:|:
  Rat  2525 INNILNSGEVPNLFEKDELEQVLAATRPKAKEVGISEG------NRDEVFQYFISRVRQKLHIVL 2583

  Fly  2513 SMSPVGDAFRRRCRMFPSLVNCTTIDWFTSWPTEALYSVALGLLTKI---APKMEDRISLASTTV 2574
            .|||||:|||.|||||||||||.|||||..||.|||.||:....:.:   ..::::::||....|
  Rat  2584 CMSPVGEAFRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQWPREALLSVSKSFFSVVDTGNEELKEKLSLMCVNV 2648

  Fly  2575 FMHKTVEDASVKFYKEMKRHYYTTPSSYLELLKLYQNLLKIKNMEIIAKRKRIANGLNKLLETNE 2639
              |.:|...:.::|.|::|.|||||:|||||:.||..:|..|..::::.|.|:.|||.||||||.
  Rat  2649 --HLSVSHMADRYYSELRRRYYTTPTSYLELINLYLTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNI 2711

  Fly  2640 VIAVMGKELEVMVPQLDEKSAMMKSLVDNLTKETKQADAVKQSVLEDEMNAKEKAAVAQAISEDA 2704
            ::..|..:|..:.|.|.:||..:::|::.|..:.:.||.|:..|.|||..||.||...|||::||
  Rat  2712 LVDKMKLDLSALEPVLFQKSQDVEALMEKLVVDQESADQVRNVVQEDEAIAKVKAEETQAIADDA 2776

  Fly  2705 GKDLEIAMPALREAEEALKGLTKADINELKSFTTPPALVQFCMEAVCILLGVKPTWASAKAIMAD 2769
            .:|||.|:|||..|.:||..|.||||:|::.||.||.||...|||:.|||..||.|.:||.::.|
  Rat  2777 QRDLEEALPALEAANKALDSLDKADISEIRVFTKPPDLVMTVMEAISILLNAKPDWPTAKQLLGD 2841

  Fly  2770 INFIKRLFEYDKEHMKEDTLKKVKKYIDHKDFVPAKFEKVSKVAKSMSMWVISMDKFSKVYKVVE 2834
            .||::||.|||||::|...|.|:::||::.||||.|.|||||..|||.|||.:||.:|:|.|.||
  Rat  2842 SNFLRRLLEYDKENIKPQILSKLQRYINNPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRVVKEVE 2906

  Fly  2835 PKIKRKEAAEAELKEVMTVLRQKQKELAAVEAKIQGLRDSLEEKQREFQVIQDNVDLTYGRINRA 2899
            ||.::..||:|||...:|.|::||..|..||.:|:.|::..::...|.:.:...:.||..|:.||
  Rat  2907 PKRQKLRAAQAELDATITTLKEKQALLKQVEEQIRALQEEYDKGVNEKESLAKTMALTKARLVRA 2971

  Fly  2900 GRLTSALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVPGDVLVAAACVAYLGAFSHEYRRDMSALWVSKCREHK 2964
            |:||:||.||||||.|:::....::|.:.|:|.:|||||||.|||:.:||:.:...|:..|....
  Rat  2972 GKLTAALGDEQVRWEESIEKFQEEIANIVGNVFIAAACVAYYGAFTAQYRQLLIECWIDSCLALD 3036

  Fly  2965 IPSSPEFNLLKVLGDPYEMRQWNVDGLPKDNISIENGIYATRALRWALMIDPQEQANRWIRNMER 3029
            ||..|.|:|:..||||||:||||.||||:|.||.||||..|:..||.||||||:||||||||.|.
  Rat  3037 IPIDPSFSLINTLGDPYEIRQWNADGLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRWIRNKES 3101

  Fly  3030 ANNLQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEINETIDPSLRPILQRETYRFEGRTYLKLGDMVI 3094
            .:.|:|||:||:..:|:|||::|.|.||||||:.|.:||:|.|||.::|:...||..::|||..|
  Rat  3102 KSGLKVIKLTDTNFLRILENSIRLGLPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRLLIRLGDSDI 3166

  Fly  3095 DYDDNFKLYMTTKLPNPHYLPEVCINVTLVNFLVTESGLEDQLLADIVAIELPAMEIQRNDLVVK 3159
            |||.:|:.|||||:|||||||||||.||::||.||:||||||||:|:|.:|.|.:|.||..|:|:
  Rat  3167 DYDKSFRFYMTTKMPNPHYLPEVCIKVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELEGQRVQLIVR 3231

  Fly  3160 INSDKQQLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELVETLNDAKETSLIIAARLIDTEETEKVITASRE 3224
            |||||.||.::|||:|||||.|||||||:|||::||.|:|.||..|..||.:.|.||.:|..:||
  Rat  3232 INSDKNQLKSIEDKILKLLFTSEGNILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAESTELMINIARE 3296

  Fly  3225 RYRILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYFTQVFCNVLRLDHPPQSVEVRISTLMTDELRAI 3289
            |||.:|::|:::|||:|.|:|||||||||||||.|:|...:.......|::.|::.|:...|...
  Rat  3297 RYRPVATQGSVMYFVIASLSEIDPMYQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAILLQQTLLTA 3361

  Fly  3290 FDNISRGLFENHKIIFSFLLALSVERQEGRVTEEEFLFLSRGPVGNIRTKIQPAK-------IKM 3347
            :.|:||||||.||:|:||:|.:.:.||:.::||.|:.|..||..|  ..|.:|.|       |:|
  Rat  3362 YTNVSRGLFEQHKLIYSFMLCVDIMRQQEQLTEAEWNFFLRGSAG--MEKERPPKPEAPWLPIQM 3424

  Fly  3348 SQIEWDSCIFLEDNFSSFFSGLTDE-LDKPFFIQM--------QENKEVFDFAQTNQPPTDKWNK 3403
                |.||..||:.| ..|.|||.. |..|..|.:        .::.|.:...:..:.....|..
  Rat  3425 ----WFSCCDLEEWF-PIFEGLTRHILLHPISISLGSFETYINPQSWEGYPKQRHEEEKEHVWGS 3484

  Fly  3404 RLRVFHKLMFISAFRKPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTEASGGTQLSSVYLDTSAVTPLIFVLSTGS 3468
            ....||||:.:...::.:.:..:..::...:||.|.| :....|:::|.|.|:.|||:|:|||||
  Rat  3485 NFSSFHKLILVKCCKEEKVVFALTDFVIENLGKQFIE-TPPVDLATLYQDMSSSTPLVFILSTGS 3548

  Fly  3469 DPMSGFLKFTTQMQFTDKYYSISLGQGQGPLAENLIEKSLRLGHWVFLQNCHLATSFMQTLETIV 3533
            |||..|.:|..:..:.::..||||||||||:||.:|:.:.:.|:||||||||||.|:|..:|.::
  Rat  3549 DPMGAFQRFARESGYAERVQSISLGQGQGPIAEKMIKDATKSGNWVFLQNCHLAVSWMLAMEELI 3613

  Fly  3534 RNLTLGITKAHVDFRLYLSSMPIQTFPISVLQNSVKITNEPPKGIKANVFGALTDLKQDFFEQHI 3598
            :..|.........|||:|||||..|||::|||||||:|||||||::||:..|.|::...|||::|
  Rat  3614 KTFTDPNQSIKDTFRLFLSSMPCSTFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSFFEENI 3678

  Fly  3599 QNGNWRAIVFGLCMFHAVLLERRKFGPLGWNITYEFSESDRECGLKTLDFFIDREVLDEIPWEAI 3663
            ....||.::||:|.|||::.||:|||||||||.|||::|||||.|..|:.:...   .:|||:|:
  Rat  3679 LGMKWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALLNLNLYCHE---GKIPWDAL 3740

  Fly  3664 LYINGDITWGGRVTDYWDLRCLRTILTIFSSKRIIQPDYKYCRGDSYYRDPRKKTLTEYSAYVQG 3728
            :||.|:||:||||||.||.|||||:|..|.|...::.:|.|.....|:. |...:|.|:..|::.
  Rat  3741 IYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFFSPETLEDEYTYSESGIYFA-PLADSLQEFKDYIED 3804

  Fly  3729 FPVLEDPEIFGMNQNANIVFQTKETAFFINTLLLGQPRSAA-DEGQAMENEIAQQTIARIQKALA 3792
            .|:::|||||||::|||:|||.|||...|.|:|..||||:: .||:: .:||.|:.:|.|:..:.
  Rat  3805 LPLIDDPEIFGMHENANLVFQYKETNTLITTILEVQPRSSSGGEGKS-NDEIVQELVASIRTRVP 3868

  Fly  3793 TKIKREPIHDTLSVLDAKGQVPSLTIVLVQEIDRFNIALGIIHDSLVNLSKAIKGLVVMSEELEN 3857
            ..::.|...:||.|.|.:|::.|||.||.||:||||..|.:||.||..|:|||.||||||||:|.
  Rat  3869 ESLQMEGASETLFVKDPQGRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKLIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEK 3933

  Fly  3858 VFKALLSNQVPASWAKRSFLSIKPLPSYISDFQRRIDFIQQWAENGAPRSYWISGFFFPQSFLTG 3922
            |:::.|:||||:.|:..::.|:|||.|::.|...|..|:..|.:.|.|:|:|||||||||.||||
  Rat  3934 VYQSFLNNQVPSLWSNTAYPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLWLKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTG 3998

  Fly  3923 VLQTYARRRVLPIDSLKIDFDVF----ERELV---QQDFFEMHTNNMSDQKLYGNLPECTDAIIN 3980
            .||.:||:..||||.|...:::.    ::.||   .:| .:..|....|::    ||...|.:: 
  Rat  3999 TLQNHARKYNLPIDELSFKYNMIPVYRDQALVIEAAKD-IQFGTELPMDKE----LPTPEDGVL- 4057

  Fly  3981 VHGIFIEAARWDLSKGGLCDANFGELFSRMPVVRFKPCLEISP-TVRYEAPLYKTQQRSGVLSTT 4044
            |||:|::|:|||.....:.||..|::...:|||.|:|.....| ...|.:|||||..|:|.||||
  Rat  4058 VHGMFMDASRWDDKDMIIEDALPGQMNPMLPVVHFEPQQNYEPIQTLYHSPLYKTGARAGTLSTT 4122

  Fly  4045 GHSTNFILAVLLRSHNDPEFWIMRGTALVSAVLE 4078
            ||||||::.|||.|....::||.:|:||:..:.|
  Rat  4123 GHSTNFVVTVLLPSKRPSDYWIAKGSALLCQLSE 4156

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:285579 210/417 (50%)
P-loop_NTPase 1373..1603 CDD:304359 196/229 (86%)
P-loop_NTPase 1687..1832 CDD:304359 91/144 (63%)
P-loop_NTPase 1994..2264 CDD:304359 149/270 (55%)
P-loop_NTPase 2343..2613 CDD:304359 145/277 (52%)
MT 2625..2957 CDD:289543 154/331 (47%)
AAA_9 2985..3201 CDD:289547 136/215 (63%)
Dynein_heavy 3342..4066 CDD:281078 321/748 (43%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:400618 210/425 (49%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 1410/2674 (53%)
AAA_6 1441..1767 CDD:403853 250/325 (77%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:408026 145/331 (44%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166346129
Domainoid 1 1.000 498 1.000 Domainoid score I342
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 1 1.000 - - H15221
Inparanoid 1 1.050 3340 1.000 Inparanoid score I10
OMA 1 1.010 - - QHG56321
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000321
OrthoInspector 1 1.000 - - oto97650
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10676
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X4342
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1312.910

Return to query results.
Submit another query.