DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment beta-Spec and Sptb

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001259660.1 Gene:beta-Spec / 32746 FlyBaseID:FBgn0250788 Length:2308 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006240306.1 Gene:Sptb / 314251 RGDID:1303243 Length:2329 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2341 Identity:1111/2341 - (47%)
Similarity:1540/2341 - (65%) Gaps:75/2341 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 RWDPSQGPGNEYIDEYEYDGGNSSSRLFERSRIKALAEERESVQKKTFTKWVNSHLCRVNCRIAD 73
            |||   .|.:      |.|..:||:||||||||||||:|||.||||||||||||||.||:|||:|
  Rat    22 RWD---APDD------ELDNDSSSARLFERSRIKALADEREVVQKKTFTKWVNSHLARVSCRISD 77

  Fly    74 LYVDMRDGKHLIKLLEVLSGERLPKPTKGKMRIHCLENVDKALQFLREQRVHLENIGSHDIVDGN 138
            ||.|:|||:.|||||||||||.||:|||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||||
  Rat    78 LYKDLRDGRMLIKLLEVLSGEMLPRPTKGKMRIHCLENVDKALQFLKEQRVHLENMGSHDIVDGN 142

  Fly   139 ASLNLGLIWTIILRFQIQDITIEEVDNKETKSAKDALLLWCQMKTAGYHNVNVRNFTTSWRDGLA 203
            ..|.||||||||||||||||.::..:.:||:|||||||||||||||||..|||.|||:||:||||
  Rat   143 HRLVLGLIWTIILRFQIQDIVVQTQEGRETRSAKDALLLWCQMKTAGYPQVNVTNFTSSWKDGLA 207

  Fly   204 FNAIIHKHRPDLVQFEKLSKTNAIHNLNNAFDVAEDKLGLAKLLDAEDVFVEHPDEKSIITYVVT 268
            |||:||||||||:.|:||..:||.|||.:||||||.:||:..|||.||||.|:|||||||||||.
  Rat   208 FNALIHKHRPDLIDFDKLKDSNARHNLEHAFDVAERQLGIIPLLDPEDVFTENPDEKSIITYVVA 272

  Fly   269 YYHYFSKLKQETVQGKRIGKVVGIAMENDKMVHDYENFTSDLLKWIETTIQSLGEREFENSLAGV 333
            :||||||:|...|:|||:|||:..|:|.:||:..|....||||.|||.||..|..|:|.|||:||
  Rat   273 FYHYFSKMKVLAVEGKRVGKVIDHAIETEKMIEKYSGLASDLLTWIEQTISVLNSRKFANSLSGV 337

  Fly   334 QGQLAQFSNYRTIEKPPKFVEKGNLEVLLFTLQSKMRANNQKPYTPKEGKMISDINKAWERLEKA 398
            |.||..||.|||:||||||.|||||||||||:||:|||||||.|||.:||::||||:|||.||:|
  Rat   338 QQQLQAFSTYRTVEKPPKFQEKGNLEVLLFTIQSRMRANNQKVYTPHDGKLVSDINRAWESLEEA 402

  Fly   399 EHERELALREELIRQEKLEQLAARFDRKASMRETWLSENQRLVSQDNFGFDLAAVEAAAKKHEAI 463
            |::||||||.||||||||||||.||||||:||||||:||||||:|||||:||||||||.||||||
  Rat   403 EYQRELALRSELIRQEKLEQLARRFDRKAAMRETWLNENQRLVTQDNFGYDLAAVEAAKKKHEAI 467

  Fly   464 ETDIFAYEERVQAVVAVCDELESERYHDVKRILLRKDNVMRLWTYLLELLRARRMRLEISLQLQQ 528
            |||..||||||:|:..:..|||.|.|||.|||..||:|::|||:||.||||:||.|||.:|.||:
  Rat   468 ETDTAAYEERVKALEDLAQELEKENYHDQKRISARKNNILRLWSYLQELLRSRRQRLEATLALQK 532

  Fly   529 NFQEMLYILDNMEEIKQLLMTDDYGKHLMGVEDLLQKHSLVEADINILGERVKVVVQNSQKFLSD 593
            .||:||:.:|.|:|||..:::.::||||:.||||||||.|:||||.|.|::||.:...:.:|  .
  Rat   533 LFQDMLHSIDWMDEIKAHILSAEFGKHLLEVEDLLQKHKLMEADIAIQGDKVKTITAATLQF--T 595

  Fly   594 DPESYKPCDPEIIVSRVQQLEDAYAELVRLAVERRSRLEESRKLWQFYWDTADEENWIKEKEQIV 658
            :.:.|:||||::|..||..||..::||..:|..|:::||:|::||:|:|:..:.|:||||||||.
  Rat   596 EGKGYQPCDPQVIQDRVSHLEQCFSELSNMAAGRKAQLEQSKRLWKFFWEMDEAESWIKEKEQIY 660

  Fly   659 STDEVGHDLTTVNLMLSKHKALESEITSHDPQLQNVAKVGSELITEGHFGADRIKDRLKEILNKW 723
            |:.:.|.|||:|.::..||||.|.|:...|..|:.:.:...:::.:..||..:|:.|:||:..:|
  Rat   661 SSLDYGKDLTSVLILQRKHKAFEDELRGLDAHLKQIFQEAEDMVAQKQFGHPQIETRVKEVSAQW 725

  Fly   724 DHLLDLTKYRRQRLENAVEYFQLFADADDVDNWMLDTLRIVSSEDVGRDEANVQSLLKKHKDVAD 788
            |||.:|..:|::.|::|..:||...||||:..|:.|..|::|.||||:||...::|.||||:..:
  Rat   726 DHLKELAAFRKKDLQDAENFFQFQGDADDLKAWLQDAHRLLSGEDVGQDEGATRALGKKHKEFLE 790

  Fly   789 ELKNYAEVIDALHKQAESLKLNEAEKANVDKRLEAIDNRYKELTELAKLRKQRLLDALSLYKLMS 853
            ||:....|::.|..||:.......:..:|..||:|:...|:::...|:||..:|.:||.||.:..
  Rat   791 ELEESRGVMEHLENQAQGFPEEFRDSPDVTNRLQALRKLYQQVMAQAELRGHKLQEALDLYTVFG 855

  Fly   854 EADGVEQWIKEKTKMLDTMTPGKDIEDVEIMKHRFEGFDKEMNANASRVAVVNQLARQLLHVEHP 918
            |:|..|.|:.||.|.||.|.....:||:|:::|||:..|:||....:::..||..|..|:...||
  Rat   856 ESDACELWMTEKGKWLDQMDIPNTLEDLEVVQHRFDILDQEMKTLMAQIDGVNLAANNLVESGHP 920

  Fly   919 NSDEILERQNHLNQEWSTLREKAEAKMDDLKSAHGVQTFYIECRETISWIEDKKRILTETDSLEM 983
            .|.|:.:.|:.||:.|...:.....:.:.:.||..|..:.::|.||..||.||.:::..|..|..
  Rat   921 RSGEVKQYQDRLNKRWQAFQAVVSEQREAVDSALRVNNYCVDCEETSKWIVDKTKVVESTKDLGQ 985

  Fly   984 DLTGVMTLQRRLSGMDRDLAAIQAKLSSLEREANSIEDEHPEEAKIIRERIAQIELIWEQLTQML 1048
            ||.||:.:||:|||::||:.||:.::|:||||:..:.:.||::.:.|.:|.|.:|.:|:.|...|
  Rat   986 DLAGVIAIQRKLSGLERDVLAIRDRVSALERESQYLMESHPDQKEDIGQRQADVEKMWKGLQDAL 1050

  Fly  1049 KERDSKLEEAGDLHRFLRDLDHFQTWLTKTQTDVASEDTPTSLPEAEKLLNQHQSIREEIDNYTE 1113
            :.::..|.||..|..||:|||.|:.||:..|..|||||.|.||||||:||.||.:|:||||.:.:
  Rat  1051 QGQELSLGEASKLQAFLQDLDDFKAWLSMAQKAVASEDMPESLPEAEQLLQQHAAIKEEIDAHKD 1115

  Fly  1114 DYKNMMEYGERLTSEGSTSDDPQYMFLRERLNALKDGWEELHQMWENRQVLLSQSLDQQLFNRDA 1178
            ||..:...||::. ||.|  ||.|..|.:||..|...|:.|.:|||:|...|:|.|..|.|.:||
  Rat  1116 DYHRVKASGEKVI-EGQT--DPDYQLLGQRLEGLDTDWDALWRMWESRGNTLTQCLGFQEFQKDA 1177

  Fly  1179 RQTEVLLSQQEHFLSKDDTPVNLEQAENQLKRHEAFLTTMEANDDKINTLLQVADTLVEKDHFDA 1243
            :|.|.:||.||:.|:..:.|.:|..||..:::.|.||.:||.|.||:.:.:...:.||.:.:..:
  Rat  1178 KQAEAILSNQEYTLAHLEPPDSLAAAEAGIRKFEDFLVSMENNRDKVLSPVDSGNMLVSEGNLYS 1242

  Fly  1244 DKIGKRAENITGRRDDNRQRALDQHEKLKNQVKLHEFLQDLEELAEWVQEKYATSQDESYRSAKT 1308
            :||.::.:.|..|...|.::|.:....||:.::|..|||:.:||..|:.:|..||.|.||..|:.
  Rat  1243 NKIKEKVQLIEDRHMKNNEKAQEVTALLKDNLELQNFLQNCKELTLWINDKLLTSPDISYDEARN 1307

  Fly  1309 IHSKWTRHQAFEAEIAANKERLFEAEKSAQELSKEKPEFKDVIEPKLKELAKQFDDLEVHTKEKG 1373
            :|:||.:||||.||:|:::..|.......::|..|||:|.||:..:|:.|.|.:|:|:..||.|.
  Rat  1308 LHNKWMKHQAFMAELASHQGWLENIVAEGRQLMAEKPQFTDVVSERLEALHKLWDELQTTTKAKT 1372

  Fly  1374 AMLFDANREVLVQQTCDDIDSYITDLEKQIVSGDTANDLTSVNILMQKQQVIQTQMAVKARQVEE 1438
            ..|..|....|..||..|:..:|:.:|.|:.|.|...|||:||.::.|.:.::.|:.::..::||
  Rat  1373 EQLSAARSSDLRLQTHADLSKWISAMEDQLRSDDLGKDLTTVNRMLVKLKRVEEQVNLRKEELEE 1437

  Fly  1439 IDKQTEYLQKTVPEEKIEPIVVKKTAVLERFEKIKAPLLERQKALEKKKEAFQFCRDVEDEKLWI 1503
            :..:...|.....:..:        ::.:||..:..||..|:|.||..|...|..||:|||.||:
  Rat  1438 LFAEAPPLGAEAGDTDM--------SIEKRFLDLLEPLGRRKKQLELSKAKLQISRDLEDETLWV 1494

  Fly  1504 DEKLPVANSPDYGNSLFNVHVLKKKNQSLATEIDNHEPRINAICNNGRKLIDEGHEDAKKFEALI 1568
            :|:||:|.|.|||.:|..|.:..||||:|..||..|.||:..:.:.|::|:.....|.:..|..:
  Rat  1495 EERLPLAQSADYGTNLQTVQLFMKKNQTLQNEILGHAPRVEDVLHRGQELVKAAEIDCQDIEERL 1559

  Fly  1569 SDLTQKWQELKDAIENRRKHLLESEKVQQYFFDAQEAESWMSEQELYMMVEDRGKDEISAQNLMK 1633
            ..|...|..|::|...|.:.|.|:.:.|||:.||.|||:|:||||||:..::..|||..|..::|
  Rat  1560 GHLQSSWDTLREAAAGRLQRLREAHEAQQYYLDAGEAEAWISEQELYVFSDEPPKDEEGAIVMLK 1624

  Fly  1634 KHENLEQSVEDYANTIRQLGEVARQFSGDDISSGDAVAVKQSQLDKLYAGLKDLAGERRARLNEA 1698
            :|...:::||:|...|:||...|:.........|:.:...|.|:||.||||||:|.|||.:|...
  Rat  1625 RHLRQQRTVEEYGRNIKQLAGRAQSLLSAGHPEGEQIIRLQGQVDKQYAGLKDMAEERRRKLENM 1689

  Fly  1699 LQLFMLSREVDDLEQWITDREVVAGSQELGQDFDHVTLLSERFNEFARDTEAVGGERVAKVNGIA 1763
            ..||.|.||.||||||||::|:||.|||:||||||||:|.::|.:|||:|.|:|.|||..||.|.
  Rat  1690 YHLFQLKREADDLEQWITEKEMVASSQEMGQDFDHVTMLRDKFRDFARETGAIGQERVDNVNSII 1754

  Fly  1764 DNLIQAGHSDSATIAEWKDNLNESWQDLLELIETRTQMLAASRELHKFFHDCKDVLGRILEKQHG 1828
            :.||.||||::||||||||.||:.|.||||||:||.|:||||.:||::|:...::||.|.||...
  Rat  1755 ERLIDAGHSEAATIAEWKDGLNDMWADLLELIDTRMQLLAASYDLHRYFYTGTEILGLIDEKHRE 1819

  Fly  1829 VSDELGRDAGSVSTLQRKHYNFLQDLITLYSQVQQIQEESAKLQDAYAGDKAKEITNREQEVLHA 1893
            :.:::|.||.:..:..|.|..|.::|..|..||||.|:.:.:||.||||:||..|.::||||..|
  Rat  1820 LPEDVGLDASTAESFHRVHTAFERELHLLGVQVQQFQDVATRLQTAYAGEKADAIQSKEQEVSAA 1884

  Fly  1894 WDNLQAMCDARKQKLADTGDLFRFFNMVRILMIWMEDLVRQMNTSEKPRDVSGVELLMNNHQSLK 1958
            |..|...|..|:.:|.||.|.||||:|||.|:.|||.::||:.|.|:|||||.||||:..||.:|
  Rat  1885 WQALLDACAGRRAQLVDTADKFRFFSMVRDLLSWMESIIRQIETQERPRDVSSVELLLKYHQGIK 1949

  Fly  1959 AEIDTREDNFGACISLGKELLTRNHYASADIKDRLMTLSNSRNALLRRWEERWENLQLILEVYQF 2023
            |||:||..||..|:.||:.||.|.|.||.:|:::|..:.:.|..:..:||.|.:.|.::|||.||
  Rat  1950 AEINTRAKNFSTCLELGESLLQRQHQASDEIREKLQQVISRRQEMNDKWEARSDRLHMLLEVCQF 2014

  Fly  2024 ARDAAVAEAWLIAQEPYLLSSELGHTIDEVENLIKKHEAFEKSAAAQEERFSALERLTTFELKEM 2088
            :|||:|||||||||||||.|.:.|||:|.||.|||:|||||||.|:..|||:|||:.||.||||.
  Rat  2015 SRDASVAEAWLIAQEPYLASRDFGHTVDSVEKLIKRHEAFEKSTASWAERFAALEKPTTLELKER 2079

  Fly  2089 KRRQELAEEAERQRIKEEQEAKAASEAAEQAKREAERRDDVD-------------VGASHDDSAA 2140
            :......||...|    |:|.:.|.||.:......||....:             :...|.|...
  Rat  2080 QTPDRPTEEPGPQ----EEEGETAGEAPQVHHAATERTSPGEERGPWPQDLQPPPLPGHHKDEQE 2140

  Fly  2141 KDTAVE------FERVVEIQTERGGTPGA-----GEGH----EGYVTRKHEWDSTTKKASNRSWD 2190
            |....|      ..:|::.....|..|..     ..||    |||:.|||:.:...||||||||:
  Rat  2141 KSVGDERPATEPLFKVLDTPLSEGDEPTTLPAQRDLGHTVQMEGYLGRKHDLEGPNKKASNRSWN 2205

  Fly  2191 KVYMAAKAGRISFYKDQKGYKSNPELTFRGEPSYDLQNAAIEIASDYTKKKHVLRVKLANGALFL 2255
            .:|...:..:::||||.|.....  :.:.||....|::|..|||.:|.|||||.:::|:||:.:|
  Rat  2206 NLYCVLRNSQLTFYKDAKNLALG--VPYHGEEPLALRHAICEIAVNYKKKKHVFKLRLSNGSEWL 2268

  Fly  2256 LQAHDDTEMSQWVTSLKAQSDSTAVAASRS-----QTLPATS---------QKDEPKRRSFFTLK 2306
            ....|:.||..|:     |..|||:..|:|     |:||..|         :||:.||.|||..|
  Rat  2269 FHGKDEEEMLLWL-----QGMSTAINESQSIRVKAQSLPLPSLAGPDASVGKKDKEKRFSFFPKK 2328

  Fly  2307 K 2307
            |
  Rat  2329 K 2329

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
beta-SpecNP_001259660.1 CH 51..149 CDD:278723 83/97 (86%)
CH 170..269 CDD:278723 75/98 (77%)
Spectrin 298..408 CDD:278843 75/109 (69%)
SPEC 422..521 CDD:197544 72/98 (73%)
SPEC 525..740 CDD:238103 90/214 (42%)
SPEC 639..846 CDD:238103 75/206 (36%)
SPEC 848..1058 CDD:238103 73/209 (35%)
SPEC 955..1169 CDD:238103 92/213 (43%)
SPEC 1170..1380 CDD:238103 74/209 (35%)
SPEC 1386..1484 CDD:197544 24/97 (25%)
SPEC 1488..1699 CDD:238103 83/210 (40%)
SPEC 1594..1806 CDD:238103 114/211 (54%)
SPEC 1807..2015 CDD:238103 92/207 (44%)
Spectrin 2018..>2078 CDD:278843 43/59 (73%)
PH 2167..2275 CDD:278594 42/111 (38%)
PH_beta_spectrin 2167..2274 CDD:269975 42/110 (38%)
SptbXP_006240306.1 CH_SPTB-like_rpt1 40..156 CDD:409095 99/115 (86%)
CH_SPTB_rpt2 170..281 CDD:409168 83/110 (75%)
Spectrin 302..411 CDD:395348 74/108 (69%)
Spectrin 422..526 CDD:395348 76/103 (74%)
SPEC 530..742 CDD:238103 90/213 (42%)
SPEC 641..848 CDD:238103 75/206 (36%)
SPEC 745..954 CDD:238103 72/208 (35%)
SPEC 962..1168 CDD:238103 92/208 (44%)
SPEC 1170..1379 CDD:238103 74/208 (36%)
SPEC 1385..1475 CDD:197544 24/97 (25%)
SPEC 1485..1690 CDD:238103 82/204 (40%)
SPEC 1691..1901 CDD:238103 111/209 (53%)
SPEC 1798..2005 CDD:238103 92/206 (45%)
SPEC 2013..>2086 CDD:197544 48/72 (67%)
PH_beta_spectrin 2182..2287 CDD:269975 43/111 (39%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 191 1.000 Domainoid score I3140
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0517
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 2478 1.000 Inparanoid score I28
OMA 1 1.010 - - QHG52262
OrthoDB 1 1.010 - - D15759at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000586
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45312
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100348
Panther 1 1.100 - - O PTHR11915
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1255
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1413.840

Return to query results.
Submit another query.