DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment beta-Spec and unc-70

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001259660.1 Gene:beta-Spec / 32746 FlyBaseID:FBgn0250788 Length:2308 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001256073.1 Gene:unc-70 / 179077 WormBaseID:WBGene00006803 Length:2326 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2276 Identity:1293/2276 - (56%)
Similarity:1687/2276 - (74%) Gaps:55/2276 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    40 RIKALAEERESVQKKTFTKWVNSHLCRVNCRIADLYVDMRDGKHLIKLLEVLSGERLPKPTKGKM 104
            |.:.|.:|||.||||||||||||||.||:|::.|||:||||||.|::||.|||||||||||.|||
 Worm    99 RFRGLRDERELVQKKTFTKWVNSHLVRVSCKVQDLYMDMRDGKMLLRLLAVLSGERLPKPTPGKM 163

  Fly   105 RIHCLENVDKALQFLREQRVHLENIGSHDIVDGNASLNLGLIWTIILRFQIQDITIEEVDNKETK 169
            ||||||||:|.|||||.|.|||||:|||||||||:.|.|||||||||||||||||.|:.||.||:
 Worm   164 RIHCLENVEKGLQFLRNQHVHLENLGSHDIVDGNSRLTLGLIWTIILRFQIQDITFEDADNHETR 228

  Fly   170 SAKDALLLWCQMKTAGYHNVNVRNFTTSWRDGLAFNAIIHKHRPDLVQFEKLSKTNAIHNLNNAF 234
            |||:|||||||||||||.||||:||:|||||||||||:|||||||||.::.|.|:||::||.:||
 Worm   229 SAKEALLLWCQMKTAGYPNVNVKNFSTSWRDGLAFNALIHKHRPDLVDYDNLQKSNALYNLQSAF 293

  Fly   235 DVAEDKLGLAKLLDAEDVFVEHPDEKSIITYVVTYYHYFSKLKQETVQGKRIGKVVGIAMENDKM 299
            |.||::|||||.||||||.|:.|||||||||||||||||:||||:.:||||||||:...||||||
 Worm   294 DTAENQLGLAKFLDAEDVNVDQPDEKSIITYVVTYYHYFNKLKQDNIQGKRIGKVINELMENDKM 358

  Fly   300 VHDYENFTSDLLKWIETTIQSLGEREFENSLAGVQGQLAQFSNYRTIEKPPKFVEKGNLEVLLFT 364
            ::.||..:||||:||...||.|.||.|||:|.|||.||.:|::|||.||||||.|||.|||||||
 Worm   359 INRYETLSSDLLEWINAKIQLLNERHFENNLEGVQRQLTEFNDYRTQEKPPKFDEKGELEVLLFT 423

  Fly   365 LQSKMRANNQKPYTPKEGKMISDINKAWERLEKAEHERELALREELIRQEKLEQLAARFDRKASM 429
            |||.||||||:|:.|:|||:|:|||:||:.||||||||||.|:||||||||||||||||:|||.|
 Worm   424 LQSAMRANNQRPFVPREGKLIADINRAWQSLEKAEHERELVLKEELIRQEKLEQLAARFNRKAEM 488

  Fly   430 RETWLSENQRLVSQDNFGFDLAAVEAAAKKHEAIETDIFAYEERVQAVVAVCDELESERYHDVKR 494
            |||||:||||||||||||.||::||||.|||||||||||||||||||||||..|||:|.|||..:
 Worm   489 RETWLTENQRLVSQDNFGNDLSSVEAATKKHEAIETDIFAYEERVQAVVAVAGELEAENYHDQAK 553

  Fly   495 ILLRKDNVMRLWTYLLELLRARRMRLEISLQLQQNFQEMLYILDNMEEIKQLLMTDDYGKHLMGV 559
            |..||:||::||.||.:||.|||:|||:|:.:|:.|.:||..||.|::||..|:::|.|.|||.|
 Worm   554 INERKENVLQLWNYLFQLLLARRVRLELSMAIQKIFHDMLLTLDLMDDIKSRLLSEDLGAHLMDV 618

  Fly   560 EDLLQKHSLVEADINILGERVKVVVQNSQKFLS-DDPE--SYKPCDPEIIVSRVQQLEDAYAELV 621
            |||||||:|:|:||||:||||...:..:|:|.: |.|:  .|||.:|..|..|...|:..|.||:
 Worm   619 EDLLQKHALLESDINIIGERVNNSIAQAQRFRNPDGPDGSGYKPVEPGTIDERSDVLQKRYKELL 683

  Fly   622 RLAVERRSRLEESRKLWQFYWDTADEENWIKEKEQIVSTDEVGHDLTTVNLMLSKHKALESEITS 686
            .||.||:.|||::::|.||:||.|:.|:.|||:||::|:.:.|.|:.||:.:|:|||..|:.:..
 Worm   684 DLAAERKRRLEDNKRLCQFWWDVAELEHGIKEQEQVLSSTDTGRDIVTVSHLLAKHKNAENNLRD 748

  Fly   687 HDPQLQNVAKVGSELITEGHFGADRIKDRLKEILNKWDHLLDLTKYRRQRLENAVEYFQLFADAD 751
            .:..|..:...|.||..|...|:|.|..||.||.:..:.|.:|:..|::||...|||:|.|.|||
 Worm   749 LEKYLDRLDVSGKELQDESIPGSDNIPPRLAEIRDYINKLKELSASRKERLAGGVEYYQFFTDAD 813

  Fly   752 DVDNWMLDTLRIVSSEDVGRDEANVQSLLKKHKDVADELKNYAEVIDALHKQAESLKLNEAEKAN 816
            |||.::.||||::||||||:||..||.|||||.||.|||:|:.:.|..||.:||||.....|..:
 Worm   814 DVDRYLYDTLRVMSSEDVGKDEGTVQLLLKKHDDVHDELQNFDQHIKVLHAKAESLPQEAREHPD 878

  Fly   817 VDKRLEAIDNRYKELTELAKLRKQRLLDALSLYKLMSEADGVEQWIKEKTKMLDTMTPGKDIEDV 881
            :.:||:....:..||..|::||||||:||||||||.|:||.||.||.||.|:|.|:.||:|||:|
 Worm   879 IRQRLDTTLKQKAELENLSQLRKQRLIDALSLYKLYSDADSVESWIDEKGKLLATLVPGRDIEEV 943

  Fly   882 EIMKHRFEGFDKEMNANASRVAVVNQLARQLLHVEHPNSDEILERQNHLNQEWSTLREKAEAKMD 946
            |||||||:..:::|....::|..||.||||||:|||||||:||.|||.||..|:.||:..:.|.:
 Worm   944 EIMKHRFDTLEQDMKNQEAKVTNVNDLARQLLNVEHPNSDDILHRQNKLNARWAQLRDMVDQKRN 1008

  Fly   947 DLKSAHGVQTFYIECRETISWIEDKKRILTETDSLEMDLTGVMTLQRRLSGMDRDLAAIQAKLSS 1011
            :|:.||.::||.|:|:||::|||||.|:|.::|:|..||:|||.||||||.|:|||.||||||.|
 Worm  1009 ELERAHRLETFRIDCQETVTWIEDKTRVLEDSDALTNDLSGVMKLQRRLSMMERDLGAIQAKLDS 1073

  Fly  1012 LEREANSIEDEHPEEAKIIRERIAQIELIWEQLTQMLKERDSKLEEAGDLHRFLRDLDHFQTWLT 1076
            |.:||:.||.|.|:||:.|||.|.:|..:|:.|.:.::|.::||:|||||.||||||||||.|||
 Worm  1074 LHKEADDIERERPQEAQAIREDIKRIHQVWDILNKKVREHEAKLDEAGDLQRFLRDLDHFQAWLT 1138

  Fly  1077 KTQTDVASEDTPTSLPEAEKLLNQHQSIREEIDNYTEDYKNMMEYGERLTSEGSTSDDPQYMFLR 1141
            .||..||||:.|.||.|||:|||||.:||||||.|.||||.|...|:|:|.:   ..||||||||
 Worm  1139 ATQRQVASEEEPQSLAEAEQLLNQHAAIREEIDGYAEDYKKMRAMGDRVTQD---QTDPQYMFLR 1200

  Fly  1142 ERLNALKDGWEELHQMWENRQVLLSQSLDQQLFNRDARQTEVLLSQQEHFLSKDDTPVNLEQAEN 1206
            :||..|::|||||.:||:|||.||||.|:.|:|.|||:|.||:|||||::|:|||.|.:||||||
 Worm  1201 QRLAGLQEGWEELQRMWDNRQHLLSQGLNLQMFLRDAKQAEVMLSQQENYLAKDDIPQSLEQAEN 1265

  Fly  1207 QLKRHEAFLTTMEANDDKINTLLQVADTLVEKDHFDADKIGKRAENITGRRDDNRQRALDQHEKL 1271
            |||||:.|:|||:|||:||..:....|.|.:..|:.||||.|:|.||..||..||::|.:..:||
 Worm  1266 QLKRHQDFITTMDANDEKIRAVGMFGDQLCQDGHYAADKIHKKARNIDERRGANREKAQEVLKKL 1330

  Fly  1272 KNQVKLHEFLQDLEELAEWVQEKYATSQDESYRSAKTIHSKWTRHQAFEAEIAANKERLFEAEKS 1336
            |:.:.|.:||.|.:||.||::||...:|||:||.||||.||:.|||||::|:|||||||.:.:.:
 Worm  1331 KDALSLQQFLSDCDELREWIEEKMIRAQDETYRDAKTITSKFVRHQAFQSELAANKERLDQLKHA 1395

  Fly  1337 AQELSKEKPEFKDVIEPKLKELAKQFDDLEVHTKEKGAMLFDANREVLVQQTCDDIDSYITDLEK 1401
            |..|..:|||:...|:|:::|||.|:|:||..|:|||..||||||:.|..|:..|:..:.|.||.
 Worm  1396 AINLGDDKPEYHGTIDPQIEELATQWDELEKTTEEKGQKLFDANRQQLYVQSIADMKEWATQLEN 1460

  Fly  1402 QIVSGDTANDLTSVNILMQKQQVIQTQMAVKARQVEEIDKQTEYLQKTVPEEKIEPIVVKKTAVL 1466
            ::...|...|||:||:.||||.:|:|:|..||:.::::.:....|::..|:| :|.|...:.||.
 Worm  1461 EMTREDQPGDLTTVNVAMQKQHLIETEMIKKAQHIDQLMEMEPQLEELHPDE-LENIKAHRLAVQ 1524

  Fly  1467 ERFEKIKAPLLERQKALEKKKEAFQFCRDVEDEKLWIDEKLPVANSPDYGNSLFNVHVLKKKNQS 1531
            |:.::::|||.:|:||||:||.||||.|||:||||||.|:|.:|.:.:.|.||.:.|.|:|..|.
 Worm  1525 EQLQRLQAPLDDRRKALERKKAAFQFGRDVDDEKLWISERLVLAKAQNLGESLPDCHRLQKNLQL 1589

  Fly  1532 LATEIDNHEPRINAICNNGRKLIDEGHEDAKKFEALISDLTQKWQELKDAIENRRKHLLESEKVQ 1596
            |:.|||||||.||.|||||::||||||.:...||..|.:|...|||||:|:::|:..|.||||..
 Worm  1590 LSNEIDNHEPWINQICNNGQELIDEGHANGPAFEKKIQELRSAWQELKEAVKDRKGDLGESEKAH 1654

  Fly  1597 QYFFDAQEAESWMSEQELYMMVEDRGKDEISAQNLMKKHENLEQSVEDYANTIRQLGEVARQFSG 1661
            |:.:|..|||:||||||||||.::|||||.|.:|.:||||.|:..::.:|:|||.|...|.:|..
 Worm  1655 QFLYDCGEAEAWMSEQELYMMQDERGKDEFSTKNQIKKHERLQSDIDKFADTIRALATKAHKFVE 1719

  Fly  1662 DDISSGDAVAVKQSQLDKLYAGLKDLAGERRARLNEALQLFMLSREVDDLEQWITDREVVAGSQE 1726
            :.....:.:.|:|:|::||||||:||:.|||.||.|.|:|:.|.||:|||.|||.|:||||||||
 Worm  1720 EKSPLTEQIQVRQAQIEKLYAGLQDLSKERRKRLEETLELYALHREIDDLLQWIADKEVVAGSQE 1784

  Fly  1727 LGQDFDHVTLLSERFNEFARDTEAVGGERVAKVNGIADNLIQAGHSDSATIAEWKDNLNESWQDL 1791
            .|||::||.:|.|||.:||||||.:|.||||..|...|.||..||:|:.|||.|||:|||:|::|
 Worm  1785 NGQDYEHVQMLQERFQQFARDTENIGSERVANANDGCDTLIGHGHTDAPTIALWKDSLNEAWENL 1849

  Fly  1792 LELIETRTQMLAASRELHKFFHDCKDVLGRILEKQHGVSDELGRDAGSVSTLQRKHYNFLQDLIT 1856
            |||::||.|:|.|||.||||:|||:|.|.||:||.|.:.|:||||:.||..|.|||.|:|:|:..
 Worm  1850 LELMDTRAQILEASRLLHKFYHDCRDCLSRIMEKTHAMPDDLGRDSSSVGALSRKHQNYLKDIAA 1914

  Fly  1857 LYSQVQQIQEESAKLQDAYAGDKAKEITNREQEVLHAWDNLQAMCDARKQKLADTGDLFRFFNMV 1921
            :..||.||:.::|:|:|.||||||.:|.:||.||:.||.:|:.:||||..:|.||.|||:|.|||
 Worm  1915 IGEQVAQIERDAAELRDGYAGDKALDIGSRESEVVKAWRHLRGLCDARTSRLMDTSDLFKFMNMV 1979

  Fly  1922 RILMIWMEDLVRQMNTSEKPRDVSGVELLMNNHQSLKAEIDTREDNFGACISLGKELLTRNHYAS 1986
            |.|::||:::.|:||:.|:|:||||||||||||||||||||.||:||.||||||::||.|.||||
 Worm  1980 RDLLLWMDEVKREMNSQERPKDVSGVELLMNNHQSLKAEIDAREENFNACISLGRDLLNRKHYAS 2044

  Fly  1987 ADIKDRLMTLSNSRNALLRRWEERWENLQLILEVYQFARDAAVAEAWLIAQEPYLLSSELGHTID 2051
            ::|:.:|:.|:..|..::||||:|||.||||||||||||||||||:||.||||||:|.|.|..::
 Worm  2045 SEIEKKLIKLTTERAEMMRRWEDRWEYLQLILEVYQFARDAAVAESWLFAQEPYLISKEYGRNLE 2109

  Fly  2052 EVENLIKKHEAFEKSAAAQEERFSALERLTTFELKEMKRRQELAEEAERQRIKEEQEAKAASEAA 2116
            |...||||||||||||.||||||.|||:||||||||.:.|:|                       
 Worm  2110 ETIKLIKKHEAFEKSAFAQEERFLALEKLTTFELKETQHREE----------------------- 2151

  Fly  2117 EQAKREAERRDDVDVGASHDDSAAKDTAVEFERVVEIQTERGG-TPGA--GEGHEGYVTRKHEWD 2178
            |.|||.         |.:|..|.::.|..       .:|..|. ..||  ||..||.:.|||.::
 Worm  2152 ETAKRR---------GPAHIGSPSRSTPA-------AETSFGAQDDGAKQGEAFEGTLIRKHTYE 2200

  Fly  2179 STTKKASNRSWDKVYMAAKAGRISFYKDQKGYKSNPELTFRGEPSYDLQNAAIEIASDYTKKKHV 2243
            |..:||:||||:|:|...:...:|||||.|    :.:.:..|||...|...::.:||||.|||:|
 Worm  2201 SLDRKAANRSWEKLYAVLRQNELSFYKDPK----HRDESVHGEPPMALPGCSVNVASDYQKKKNV 2261

  Fly  2244 LRVKLANGALFLLQAHDDTEMSQWVTSLK-AQSDSTAVAASRSQTLPATSQKDEPKRRSFFTLKK 2307
            |.::|..||.:|.|...:.:|.:|:|.|: |...:....|||||||||.....: |:..||:..|
 Worm  2262 LSLRLPIGAEYLFQCGSEEDMQRWLTELQVATGQAQLEEASRSQTLPAEGSATK-KKGGFFSRGK 2325

  Fly  2308 K 2308
            |
 Worm  2326 K 2326

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
beta-SpecNP_001259660.1 CH_SPTB-like_rpt1 36..152 CDD:409095 86/111 (77%)
CH_SPTB_like_rpt2 169..273 CDD:409097 80/103 (78%)
Spectrin 298..408 CDD:395348 75/109 (69%)
SPEC 422..521 CDD:197544 74/98 (76%)
SPEC 525..740 CDD:238103 93/217 (43%)
SPEC 639..846 CDD:238103 94/206 (46%)
SPEC 848..1058 CDD:238103 116/209 (56%)
SPEC 955..1169 CDD:238103 131/213 (62%)
SPEC 1170..1380 CDD:238103 112/209 (54%)
SPEC 1386..1484 CDD:197544 34/97 (35%)
SPEC 1488..1699 CDD:238103 111/210 (53%)
SPEC 1594..1806 CDD:238103 118/211 (56%)
SPEC 1807..2015 CDD:238103 120/207 (58%)
Spectrin 2018..>2078 CDD:395348 45/59 (76%)
PH_beta_spectrin 2167..2274 CDD:269975 42/107 (39%)
unc-70NP_001256073.1 CH_SPTB-like_rpt1 99..211 CDD:409095 86/111 (77%)
CH_SPTB_like_rpt2 228..332 CDD:409097 80/103 (78%)
SPEC 368..580 CDD:238103 158/211 (75%)
SPEC 481..695 CDD:238103 130/213 (61%)
SPEC 698..908 CDD:238103 95/209 (45%)
SPEC 804..1014 CDD:238103 116/209 (56%)
SPEC 910..1120 CDD:238103 116/209 (56%)
SPEC 1122..1334 CDD:238103 130/214 (61%)
SPEC 1230..1439 CDD:238103 112/208 (54%)
SPEC 1440..1650 CDD:238103 96/210 (46%)
SPEC 1652..1864 CDD:238103 118/211 (56%)
SPEC 1865..2073 CDD:238103 120/207 (58%)
SPEC 2079..>2157 CDD:197544 57/100 (57%)
PH_beta_spectrin 2189..2290 CDD:269975 41/104 (39%)

Return to query results.
Submit another query.