DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment r and pyr-1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001285343.1 Gene:r / 32640 FlyBaseID:FBgn0003189 Length:2224 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_495838.2 Gene:pyr-1 / 174385 WormBaseID:WBGene00004259 Length:2198 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2262 Identity:1271/2262 - (56%)
Similarity:1623/2262 - (71%) Gaps:123/2262 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 LALEDGTVLPGYSFGYVPSENESKVGFGGEVVFQTGMVGYTEALTDRSYSGQILVLTYPLIGNYG 72
            |.||||:...|..:|...|       ..||:|||||||||.|:|||.||:.|:|.||||||||||
 Worm     5 LHLEDGSTFVGSIYGATKS-------VVGEIVFQTGMVGYVESLTDPSYAKQLLTLTYPLIGNYG 62

  Fly    73 VPAPD-EDEHGLPLHFE----WMKGVVQATALVVGEVAEEAFHWRKWKTLPDWLKQHKVPGIQDI 132
            ||:.: .|:..||..||    |...::.....|.||.:    ||:..::|.:||::..||.:..|
 Worm    63 VPSAEILDQFKLPAEFESDRIWPAALIVEKICVDGEHS----HWQAVQSLSEWLRKADVPCLSGI 123

  Fly   133 DTRALTKKLREQGSMLGKIVYEKPPVEGLPKSSFVDPNVRNLAKECSVKERQVYGNPNGKGPRIA 197
            |.|.|.||:||.|:|..|:|.|....:..   .:||.|..||....|.||..|||:.:   ..|.
 Worm   124 DVRQLVKKIRETGTMKAKLVIESDNAQNF---DYVDVNAENLVDFVSRKEPVVYGSGD---QTIL 182

  Fly   198 ILDCGLKLNQLRCLLQRGASVTLLPWSARLEDE-QFDALFLSNGPGNPESCDQIVQQVRKVIEEG 261
            .:|||||.||:|||.:||..|.::||:..::.| .:|.||||||||:||.|..:|.::.|||..|
 Worm   183 AVDCGLKNNQIRCLAKRGFRVKVVPWNHPIDTESDYDGLFLSNGPGDPEICAPLVDRLAKVIARG 247

  Fly   262 QKPVFGICLGHQLLAKAIGCSTYKMKYGNRGHNLPCLHRATGRCLMTSQNHGYAVDLEQLPDGWS 326
            .||:||||||||:|::|||..|||:||||||||.||.|.|||||.:||||||||||.:.||..|.
 Worm   248 DKPIFGICLGHQILSRAIGAKTYKLKYGNRGHNQPCTHYATGRCYITSQNHGYAVDPDSLPADWK 312

  Fly   327 ELFVNANDGTNEGIVHASKPYFSVQFHPEHHAGPQDTEFLFDVFMESIQQ-KDLTIPQLIEQ--R 388
            .||.|.||.|||||||:|||:|||||||||.|||.|.|||||||.:|::| |..|...:.::  |
 Worm   313 ALFTNENDKTNEGIVHSSKPFFSVQFHPEHTAGPTDCEFLFDVFADSVRQAKSGTFMNVDQELTR 377

  Fly   389 LRPTTPAIDSAPVMPRKVLILGSGGLSIGQAGEFDYSGSQAIKAMRESNIQTVLINPNIATVQTS 453
            |...||...:..  .||||:||||||:|||||||||||:||:||:||..|:||||||||||||||
 Worm   378 LMTFTPIYHAKE--QRKVLVLGSGGLTIGQAGEFDYSGAQALKALREEGIRTVLINPNIATVQTS 440

  Fly   454 KGMADKCYFLPLTPHYVEQVIKSERPNGVLLTFGGQTALNCGVQLERAGVFSKYNVRILGTPIQS 518
            ||.||..||||:|..||..|||.|||.|:|.||||||||||.:.|.:.|:|.:|:|::|||.|.:
 Worm   441 KGFADFTYFLPITKEYVTDVIKKERPTGILCTFGGQTALNCAIDLYKDGIFEQYDVQVLGTQINT 505

  Fly   519 IIETEDRKLFAERVNEIGEQVAPSEAVYSVAQALDAASRLGYPVMARAAFSLGGLGSGFANNEEE 583
            |::||||.||.:.::.|||:||||:|..::..|::||..|||||:.|||::|||||||||:|.||
 Worm   506 IMKTEDRDLFNQEISAIGEKVAPSKAATTMEGAIEAAEELGYPVLVRAAYALGGLGSGFADNREE 570

  Fly   584 LQSLAQQALAHSSQLIVDKSLKGWKEVEYEVVRDAYNNCITVCNMENFDPLGIHTGESIVVAPSQ 648
            |.::||||||||:|::||||||||||||||||||||:||||||||||.||||||||||:||||||
 Worm   571 LIAIAQQALAHSNQVLVDKSLKGWKEVEYEVVRDAYDNCITVCNMENVDPLGIHTGESVVVAPSQ 635

  Fly   649 TLSDREYQMLRSTALKVIRHFGVVGECNIQYALCPHSEQYYIIEVNARLSRSSALASKATGYPLA 713
            |||||||..||:.|:|||||.|::|||||||||.|:|..||||||||||||||||||||||||||
 Worm   636 TLSDREYNALRTCAIKVIRHLGIIGECNIQYALDPYSLTYYIIEVNARLSRSSALASKATGYPLA 700

  Fly   714 YVAAKLALGLPLPDIKNSVTGNTTACFEPSLDYCVVKIPRWDLAKFVRVSKHIGSSMKSVGEVMA 778
            |||||||||..||.|:|||||.|||||||||||||||||||||.||.|||..||||||||||||.
 Worm   701 YVAAKLALGQHLPVIRNSVTGTTTACFEPSLDYCVVKIPRWDLGKFARVSTQIGSSMKSVGEVMG 765

  Fly   779 IGRNFEEAFQKALRMVDSDVLGFDPDVVPLNKEQLAEQLSEPTDRRPFVIAAALQLG-MSLRELH 842
            |||.||||.|||||||.....||.|  ...::...|:.||:|||:|.|.:|..:..| ..:.:.|
 Worm   766 IGRCFEEALQKALRMVSDHADGFSP--YTFSRPTTADDLSKPTDKRMFALARGMYYGDFDVEKAH 828

  Fly   843 QLTNIDYWFLEKLERIILLQSLLTRNGSRT-DAALLLKAKRFGFSDKQIAKYIKSTELAVRHQRQ 906
            :||.||.|||.:::.|:.:...|.:....| .|.|||:||:.||||:||||.|.|.|..||..|.
 Worm   829 ELTRIDRWFLFRMQNIVDIYHRLEKTDVNTVSAELLLEAKQAGFSDRQIAKKIGSNEYTVREARF 893

  Fly   907 EFGIRPHVKQIDTVAGEWPASTNYLYHTYNGSEHDVDFPGGHTI-VVGSGVYRIGSSVEFDWCAV 970
            ..||.|.|||||||||||||.|||||.|:||.|:||.|...:.: |:||||||||||||||...|
 Worm   894 VKGITPCVKQIDTVAGEWPAQTNYLYTTFNGIENDVSFNMKNAVMVLGSGVYRIGSSVEFDSSCV 958

  Fly   971 GCLRELRKLQRPTIMINYNPETVSTDYDMCDRLYFEEISFEVVMDIYEMENSEGIILSMGGQLPN 1035
            ||:|||:.|...||.:|.||||||||||:||||||||||||.|:|:|.:|..:|:||:.|||.||
 Worm   959 GCIRELKALGYSTITVNCNPETVSTDYDICDRLYFEEISFETVLDVYHLEKPKGVILAFGGQAPN 1023

  Fly  1036 NIAMDLHRQQAKVLGTSPESIDCAENRFKFSRMLDRKGILQPRWKELTNLQSAIEFCEEVGYPCL 1100
            ||||.|.|.|.|:.||||..||.||:||||||.|:...|.||:||:..|::.|..||.:||||||
 Worm  1024 NIAMSLSRAQVKIFGTSPNDIDNAEDRFKFSRKLESLKISQPQWKKSENMEDAKNFCAQVGYPCL 1088

  Fly  1101 VRPSYVLSGAAMNVAYSNQDLETYLNAASEVSREHPVVISKFLTEAKEIDVDAVASDGRILCMAV 1165
            :||||||||||||||::.:|||.:|..|:.|::|||||:|||:.||||:||||||.||:::.|||
 Worm  1089 IRPSYVLSGAAMNVAHNAEDLEVFLKQAAVVAKEHPVVVSKFINEAKELDVDAVALDGKLVVMAV 1153

  Fly  1166 SEHVENAGVHSGDATLVTPPQDLNAETLEAIKRITCDLASVLDVTGPFNMQLIAKNNELKVIECN 1230
            |||:|||||||||||||||.||:|..||:.||.||..:|...:|.||||||||||||||||||||
 Worm  1154 SEHIENAGVHSGDATLVTPAQDMNKLTLDRIKDITFRIAEAFNVNGPFNMQLIAKNNELKVIECN 1218

  Fly  1231 VRVSRSFPFVSKTLDHDFVATATRAIVGLD-------VEP-LDVLHGVGKVGVKVPQFSFSRLAG 1287
            :||||||||||||||:||||.||||::..|       ::| ..:|.|.|:|||||||||||||||
 Worm  1219 LRVSRSFPFVSKTLDYDFVALATRAMMASDSPAIRATIKPTATLLKGKGRVGVKVPQFSFSRLAG 1283

  Fly  1288 ADVQLGVEMASTGEVACFGDNRYEAYLKAMMSTGFQIPKNAVLLSIGSFKHKMELLPSIRDLAKM 1352
            |||.|||||||||||||||.:|.:|||||::||||.:||..:.:|||.:..|.|:|.|:..|.|:
 Worm  1284 ADVMLGVEMASTGEVACFGTSRCDAYLKALLSTGFVVPKQNIFISIGGYHAKAEMLKSVEALLKL 1348

  Fly  1353 GYKLYASMGTGDFYAEHGVNVESVQWTFDKTTPDDINGE-LRHLAEFLANKQFDLVINLPMSGGG 1416
            ||:||.|.||.|::..:.:||:.|.|.|::.:.|:.... .|.:.|||.||:|.||||||:.|.|
 Worm  1349 GYELYGSKGTADYFQSNKINVKPVDWPFEEGSSDEKTASGTRSVVEFLENKEFHLVINLPIRGSG 1413

  Fly  1417 ARRVSSFMTHGYRTRRLAVDYSIPLVTDVKCTKLLVESMRMNGGKPPMKTHTDCMTSRRIVKLPG 1481
            |.|||:|.||||:|||:|:|..|||:||:||.|..::::.|.|.:|.|.:..||:||:.:.:|||
 Worm  1414 AYRVSAFRTHGYKTRRMAIDNGIPLITDIKCAKTFIQALEMVGKRPTMNSLVDCVTSKSLKRLPG 1478

  Fly  1482 FIDVHVHLREPGATHKEDFASGTAAALAGGVTLVCAMPNTNPSIVDRETFTQFQELAKAGARCDY 1546
            .:|:|||:||||||||||:|:.:.||||||||.:.|||||:|.:||.::|.|.::||.|.:..||
 Worm  1479 MVDIHVHVREPGATHKEDWATCSKAALAGGVTTILAMPNTSPVLVDTDSFYQTEQLASAKSVVDY 1543

  Fly  1547 ALYVGASDDNWAQVNELASHACGLKMYLNDTFGTLKLSDMTSWQRHLSHWPKRSPIVCHAERQST 1611
            |||:||:.:|.....|.|..|.|||||||:||.|||:.:::.|.:|||.:|...|||||||:|:.
 Worm  1544 ALYIGATPNNSKFAAEFADKAAGLKMYLNETFSTLKMDNISDWAKHLSAFPANRPIVCHAEKQTL 1608

  Fly  1612 AAVIMLAHLLDRSVHICHVARKEEIQLIRSAKEKGVKVTCEVCPHHLFLSTKDVERLGHGMSEVR 1676
            ||::.:|.:.:|:|||.|||..:||.|::.||::|..||||||||||||..:|   |..|:.|||
 Worm  1609 AAILCMAQMANRAVHIAHVATADEINLVKEAKQRGWNVTCEVCPHHLFLIEED---LPDGIREVR 1670

  Fly  1677 PLLCSPEDQEALWENIDYIDVFATDHAPHTLAEK--RSERPPPGFPGVETILPLLLQAVHEGRLT 1739
            |.|..|||::|||:|::|||.|||||||||.|||  :..:.||||||||.:|||||.|||:|:||
 Worm  1671 PRLVKPEDRQALWDNMEYIDCFATDHAPHTWAEKTGKDGKIPPGFPGVEYMLPLLLTAVHDGKLT 1735

  Fly  1740 MEDIKRKFHRNPKIIFNLPDQAQTYVEVDLDEEWTITGNEMKSKSGWTPFEGTKVKGRVHRVVLR 1804
            |:::..:...||:.|||||.|..||:||||:|||||..|..:||:|||||.|.||.|:||.|::|
 Worm  1736 MKELTDRMSTNPRRIFNLPPQDDTYIEVDLNEEWTIPENGGQSKAGWTPFAGRKVFGKVHNVIIR 1800

  Fly  1805 GEVAFVDGQVLVQPGFGQNVRPKQSPLASEASQDLLPSDNDA---NDTFTRLLTSEGPGGGVHGI 1866
            ||.|.:||:::..||||:|||             |.|....|   :..|.::|            
 Worm  1801 GEEAVIDGRIVAIPGFGKNVR-------------LYPHSGTAHRGDSDFDQIL------------ 1840

  Fly  1867 STKVHFVDGANFLRPNSPSPRIRLDSASNTTLREYLQRTTNSNPVAHS-------LMGKHILAVD 1924
                            .|.|:..::|:|:.      |...::.|.||:       |:.|:.::|.
 Worm  1841 ----------------EPIPQQMIESSSDE------QSPLHTPPRAHTPIAFPGELLAKNCISVK 1883

  Fly  1925 MFNKDHLNDIFNLAQLLKLRGTKDRPVDELLPGKIMASVFYEVSTRTQCSFAAAMLRLGGRVISM 1989
            ..:|..:|.||.||...|....|..|:..:|.||::.::||||||||.|||:|||.||||.|||:
 Worm  1884 HLDKGQINRIFELADRYKHDVEKGHPLTHILNGKVLVNLFYEVSTRTSCSFSAAMQRLGGSVISV 1948

  Fly  1990 DNITSSVKKGESLEDSIKVVSSYADVVVLRHPSPGAVARAATFSRKPLINAGDGVGEHPTQALLD 2054
            |:.:|||:|||:|||:::|:.||.|::|||....||..|||....:|:||.|||.||||||||||
 Worm  1949 DSQSSSVQKGETLEDTVQVLGSYGDILVLRSNENGAADRAARVCDQPVINGGDGTGEHPTQALLD 2013

  Fly  2055 IFTIREEFGTVNGLTITMVGDLKNGRTVHSLARLLTLY-NVNLQYVAPNS-LQMPDEVVQFVHQR 2117
            ::|||:|.||||||||.:||||||||||||||:||.|| ::.|.||||:: |:||.||:.:|..:
 Worm  2014 VYTIRQEMGTVNGLTIALVGDLKNGRTVHSLAKLLCLYKDITLHYVAPSTELEMPQEVLDYVSSK 2078

  Fly  2118 G--VKQLFARDLKNVLPDTDVLYMTRIQRERFDNVEDYEKCCGHLVLT-------------PEHM 2167
            .  |::.|. .|...:...||:|:||||:|||.:.::|.|..|..|:.             |..:
 Worm  2079 SNFVQKKFT-SLAEGINHVDVVYVTRIQKERFSSPDEYNKVKGSYVINAKLLNEAARDVEEPSSL 2142

  Fly  2168 M-RAKKRSIVLHPLPRLNEISREIDSDPRAAYFRQAEYGMYIRMALLAMVVG 2218
            : .|:...||:|||||::||:.|:|.|.||||||||:.|:::||::|::::|
 Worm  2143 LVPARSLPIVMHPLPRVDEIAVELDHDERAAYFRQAKNGVFVRMSILSLLLG 2194

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
rNP_001285343.1 CPSaseIIsmall 7..376 CDD:273580 195/373 (52%)
CPSase_sm_chain 7..151 CDD:279346 65/147 (44%)
GATase1_CPSase 196..371 CDD:153215 114/175 (65%)
CPSaseII_lrg 403..1455 CDD:273581 689/1063 (65%)
CPSase_L_D2 524..726 CDD:280881 153/201 (76%)
CPSase_L_D3 815..935 CDD:280882 61/121 (50%)
P-loop_NTPase 947..>1149 CDD:304359 128/202 (63%)
ATP-grasp_4 1084..1265 CDD:302634 126/188 (67%)
MGS_CPS_I_III 1327..1453 CDD:238711 60/126 (48%)
CAD_DHOase 1475..1821 CDD:238641 195/347 (56%)
PLN02527 1918..2220 CDD:178142 158/319 (50%)
OTCace_N 1919..2060 CDD:280825 74/140 (53%)
OTCace 2067..2216 CDD:278609 76/166 (46%)
pyr-1NP_495838.2 CarA 1..364 CDD:223579 196/375 (52%)
Biotin_carb_N 391..1452 CDD:332540 689/1062 (65%)
CAD_DHOase 1472..1817 CDD:238641 195/347 (56%)
OTCace_N 1877..2194 CDD:332206 157/317 (50%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C160164147
Domainoid 1 1.000 315 1.000 Domainoid score I692
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG0458
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H1412
Inparanoid 1 1.050 2422 1.000 Inparanoid score I12
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S533
OMA 1 1.010 - - QHG55291
OrthoDB 1 1.010 - - D15670at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001016
OrthoInspector 1 1.000 - - oto18773
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100435
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R1046
SonicParanoid 1 1.000 - - X1225
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1615.650

Return to query results.
Submit another query.