DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LeuRS and Lars1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001285589.1 Gene:LeuRS / 326262 FlyBaseID:FBgn0284253 Length:1182 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001009637.1 Gene:Lars1 / 291624 RGDID:1304962 Length:1178 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1190 Identity:701/1190 - (58%)
Similarity:896/1190 - (75%) Gaps:28/1190 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 ERKGTFKVEYLQKIEREVQQRWEAERVHESDAPTAPKKRQAE--KFFVTFPFPYMNGRLHLGHTF 67
            |||||.||::|:|||:||||:||||:|.|..|.:..|::|:.  |:|||||:|||||||||||||
  Rat     3 ERKGTAKVDFLKKIEKEVQQKWEAEKVFEVSASSLEKQKQSSKGKYFVTFPYPYMNGRLHLGHTF 67

  Fly    68 SLSKAEYSMRYHRLKGRRVLWPFGFHCTGMPIKACADKLTRELEQFGFPPQFPETEEVVPVAAEA 132
            ||||.|:::.|.||||:..|:|||.||||||||||||||.||:|.:|.||.|||.||    ..|.
  Rat    68 SLSKCEFAVGYQRLKGKSCLFPFGLHCTGMPIKACADKLKREIELYGCPPDFPEEEE----EEEE 128

  Fly   133 ASEVP-----KDKSKGKKSKAVAKTGAAKYQWQIMQSLGLKDEEIKDFANAEHWLNYFPPLAVQD 192
            :|..|     |||:|||||||.||.|::||||.||:||||.||:|..|:.|||||:|||||||||
  Rat   129 SSAKPGDIVMKDKAKGKKSKAAAKAGSSKYQWNIMKSLGLSDEDIAKFSEAEHWLDYFPPLAVQD 193

  Fly   193 LKRIGVHVDWRRTFITTDANPYFDSFVRWQFNHLKERGKIMYGKRYTIYSPKDGQPCMDHDRSSG 257
            ||:||:.|||||:|||||.|||:||||||||..|:||.||.:||||||||||||||||||||.:|
  Rat   194 LKKIGLKVDWRRSFITTDVNPYYDSFVRWQFLTLRERNKIKFGKRYTIYSPKDGQPCMDHDRQTG 258

  Fly   258 EGVGPQEYTLIKMKVLE-VPKALSSIK-QPIFMVAATLRPETMYGQTNCWLHPDIKYIAWQANKN 320
            ||||||||||:|:|||: .|..||.:| :.||:||||||||||:||||||:.||:|||.:: ..|
  Rat   259 EGVGPQEYTLVKLKVLDPYPSKLSGLKGKNIFLVAATLRPETMFGQTNCWVRPDMKYIGFE-TAN 322

  Fly   321 NEVWVSTRRAARNMTYQGFTAVEGEIKVLAEVTGQDLLGVPLSAPLTKHKVVYSLPMLSIKEDKG 385
            .::::.|:||||||:|||||...|.:.|:.|:.|:::||..||||||.:||:|.||||:||||||
  Rat   323 GDIFICTQRAARNMSYQGFTKHNGVVPVVKELMGEEILGASLSAPLTCYKVIYVLPMLTIKEDKG 387

  Fly   386 TGVVTSVPSDSPDDYAALVDLQKKEAFRQKYGLKDEMVLPYEPIPIIEVPTLGKLSAVHAYETLK 450
            ||||||||||||||:|||.||:||:|.|.||.::|:||||:||:|::|:|.:|.|.||...:.||
  Rat   388 TGVVTSVPSDSPDDFAALRDLKKKQALRAKYAVRDDMVLPFEPVPVLEIPGIGNLPAVTVCDELK 452

  Fly   451 IQSQNDKDKLAEAKEMCYLKSFYDGVMLVGAFAGRKIQDVKKDLQKRLVDANEADVYYEPEKTIM 515
            ||||||::|||||||..||:.||||||||..|.|:|||.|||.:||.::||.:|.:|.||||.::
  Rat   453 IQSQNDREKLAEAKEKLYLRGFYDGVMLVDGFKGQKIQHVKKTIQKNMIDAGDALIYMEPEKQVV 517

  Fly   516 SRSADECVVALCNQWYLNYGEPEWQAQATKILHGMETFHEEARNNFEACLNWLHEYACSRTYGLG 580
            ||||||||||||:||||:||:..|:.|..:.|..||||.||:|.||||.|:||.|:|||||||||
  Rat   518 SRSADECVVALCDQWYLDYGDENWKKQTFQCLKNMETFCEESRKNFEASLDWLQEHACSRTYGLG 582

  Fly   581 TKLPWDDKWLIESLSDSTIYMAFYTVVHLLQGGTFRGEKPGPFGIKPSDMTGEIWDYIFFKETPL 645
            |:||||::||||||||||||||||||.||||||..:|:...|.||:|..||.::|||:|||:.|.
  Rat   583 TRLPWDEQWLIESLSDSTIYMAFYTVAHLLQGGDLQGQAESPLGIRPQQMTRDVWDYVFFKDAPF 647

  Fly   646 PKKTAIKQEHLAVLRREFEYWYPMDLRVSGKDLIQNHLTFCLYNHAAIWPNDENKWPKGMRVNGH 710
            | ||.|.:|.|..|::|||:|||:|||.||||||.|||::.:|||.|:||...:|||..:|.|||
  Rat   648 P-KTQIPKEKLDQLKQEFEFWYPVDLRASGKDLIPNHLSYYIYNHVAMWPEQSDKWPVSVRANGH 711

  Fly   711 LLLNSAKMSKSDGNFLTLTEAVDKFSADGMRLCLADAGDSVEDANFVESTADAGILRLYTFIEWV 775
            |||||.|||||.||||||::||||||||||||.||||||:||||||||:.||||||||||::|||
  Rat   712 LLLNSEKMSKSTGNFLTLSQAVDKFSADGMRLALADAGDTVEDANFVEAMADAGILRLYTWVEWV 776

  Fly   776 KEMLENRSSLRKGTDKTFNDQVFLSELNLKTQQTDENYRKMLFKEALRSGFYELQLARDKYRELC 840
            ||||.|.||||.|...:|||:||.||:|....:||:||.||:|||||::||:|.|.|:|||||| 
  Rat   777 KEMLANCSSLRSGPANSFNDRVFASEMNAGIIKTDQNYEKMMFKEALKTGFFEFQAAKDKYREL- 840

  Fly   841 GANGMHEDLVLEFIRRQALLVSPICPHMAEHVWGLLGNKESIVHARWPEVGAINEVDILCSEYLM 905
            ...|||.:||..||..|.:|::|.|||:.||:|.|||..:||:||.||..|.::|..|..|:|||
  Rat   841 ATEGMHRELVFRFIEVQTILLTPFCPHLCEHIWTLLGKPDSIMHASWPVAGPVDESLIRSSQYLM 905

  Fly   906 EAAHSFRLNLKN-LLQIKGKAGKDKSVNVQAAKPNRGLVWVAKTYPPWQCCVLDTMKELFNKSQA 969
            |.||..||.||| :...|||    |:......:|:...::|||.||.||...|.|::..|..:..
  Rat   906 EVAHDLRLRLKNYMTPAKGK----KTDKQPVQRPSHCTIYVAKNYPVWQHITLTTLRSHFEANNG 966

  Fly   970 -LPDNKVIAATLQQKAELKKFMKRVMPFAQMIREKVESGKGVAALAVTLEFDERQVLISNLEYLK 1033
             ||||||||..|....||||:||:||||..||:|.:|. ||...|.:.|||||:.||:.|:.||.
  Rat   967 KLPDNKVIACELGSLPELKKYMKKVMPFVAMIKENMEK-KGPRVLDLELEFDEQAVLMENIVYLT 1030

  Fly  1034 NTLDLDVLEIKYTDDPSAPEKTREEVRPGSPFISFSVAPNVSVELTNPIERSSLFQVNTVISEGD 1098
            |:|:|:.:::|:..:  |.:|.|||..||.|...|...|.|.|.|.||...|..|.....|.:||
  Rat  1031 NSLELEHIDVKFASE--AEDKVREECCPGKPLNVFRTEPGVPVSLVNPQPSSGHFSTKIDIRQGD 1093

  Fly  1099 TVQSLREKLSKI-IGLKTDAATLKIWRYEDPVLGPRKIPNFEDYKAGKSVLGEGN-FVLDVENKK 1161
            :.:|:..:|:|: .|:| |.:.:|:.|::||:||||::|.....:..|:::.|.. |.:|:.:||
  Rat  1094 SCESIIRRLTKMDRGIK-DLSKVKLMRFDDPLLGPRRVPVLGREQNEKTLISENAIFHVDLVSKK 1157

  Fly  1162 VSLEQAGKLTEVGRNLIYVV 1181
            |.|.:.|...::|..::|:|
  Rat  1158 VHLTENGLRADIGDTIVYLV 1177

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LeuRSNP_001285589.1 PLN02959 1..1068 CDD:215518 662/1073 (62%)
nt_trans 47..>204 CDD:294020 109/161 (68%)
LeuRS_core <525..758 CDD:173906 157/232 (68%)
Anticodon_Ia_Leu_AEc 756..876 CDD:153413 72/119 (61%)
Lars1NP_001009637.1 PLN02959 5..1064 CDD:215518 660/1072 (62%)
nt_trans 47..>231 CDD:294020 129/187 (69%)
LeuRS_core <527..759 CDD:173906 157/232 (68%)
Anticodon_Ia_Leu_AEc 757..876 CDD:153413 72/119 (61%)
Anticodon_Ia_like <858..907 CDD:299868 24/48 (50%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166342763
Domainoid 1 1.000 580 1.000 Domainoid score I205
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG0495
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H7083
Inparanoid 1 1.050 1414 1.000 Inparanoid score I109
OMA 1 1.010 - - QHG62150
OrthoDB 1 1.010 - - D131349at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004267
OrthoInspector 1 1.000 - - oto97002
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101014
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45794
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X3006
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1615.770

Return to query results.
Submit another query.