Protein Alignment para and cacna1ha

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001259619.1
• Gene: para / 32619
• FlyBaseID: FBgn0285944
• Length: 2145
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073800984.1
• Gene: cacna1ha / 560875
• ZFINID: ZDB-GENE-130103-1
• Length: 2301
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 2044
• Identity: 514/2044 - (25%)
• Similarity: 898/2044 - (43%)
• Gaps: 441/2044 - (21%)

  Fly    47 EGEVPQYGRKKKQKEIR------YDDEDEDEGPQPDPTLEQG-------VPIPV----RLQGSF- 93
            :||..::.:..:::|:|      |.        .|.||.|.|       ..|||    :.:||.
Zfish     3 DGEGKEHFQYLEREEVRIPISALYQ--------APGPTEETGDEEEKSSTWIPVHESSQARGSGA 59

  Fly    94 ---PPELASTPLEDIDPYY---SNVLTFVVVSKGKDIFRFSASKAMWMLDPFNPIRRVAIYILVH 152
               .|:|.|.  |:..|.|   :.|:.|.:        :.:.....|.|.           ::.:
Zfish    60 RDPTPDLVSN--EEEQPLYPLLAPVVFFCI--------KQTTRPRSWCLK-----------MVCN 103

  Fly   153 PLFSLFIITTILVNCIL--MIMPTTP---------TVESTEVIFTGIYTFESAVKVMARGFILCP 206
            |.|....:..||:||:.  |..|...         .:::.:......:..|..:|::|.| |...
Zfish   104 PWFEHVSMLVILLNCVTLGMYQPCEDLKCQSEWCIVLQAFDDCIFAFFAVEMVIKMIALG-IFGI 167

  Fly   207 FTYLRDAWNWLDFVVIALAYVTMGIDLGN--LAALRTFRVLRALKTVAIVPGLKTIVGAVIESVK 269
            ..||.|.||.|||.::....:...:|..|  |:|:||.||||.|:.:..||.::.:|..:::::.
Zfish   168 NGYLGDTWNRLDFFIVMAGMMEYSLDGHNASLSAIRTVRVLRPLRAINRVPSMRILVTLLLDTLP 232

  Fly   270 NLRDVIILTMFSLSVFALMGLQIYMGVLTQKCIKKFPLDGSWGNLTDENWDYHNRNSSN-----W 329
            .|.:|::|..|...:|.::|:|::.|:|..:|.....:...: ||:..:..|.|.:..:     .
Zfish   233 MLGNVLLLCFFVFFIFGIVGVQLWAGLLRNRCFMPSKVRDQY-NLSYMSLYYENEDGEDNPFICS 296

  Fly   330 YSEDEGISF-----PL-----C-----------GNISGAGQCDDDYVCL---QGFGP------NP 364
            .|:|.|:..     ||     |           ..:||.|    :|.|:   |.:..      ||
Zfish   297 SSKDNGMKRCSAVPPLKEGVECTLNASFLGHVYSGLSGTG----NYSCVNWNQYYSECKPGDLNP 357

  Fly   365 NYGYTSFDSFGWAFLSAFRLMTQDFWEDLYQLVLRAAGPWHMLFFIVIIFLGSFYLVNLILAIVA 429
            :.|..:||:.|:|:::.|:::|.:.|.|:...|:.|...::.::||::|.:|||:::||.|.::|
Zfish   358 HKGAVNFDNIGYAWIAIFQVITLEGWVDIMYYVMDAHSFYNFIYFILLIIVGSFFMINLCLVVIA 422

  Fly   430 MSYDELQKKAEEEEAAEEEAIREAEEAAAAKAAKLEERANAQAQAAADAAAAEEAALHPEMAK-- 492
            ..:.|.:::        |..:.:            |:||..::..:..|:.:|..:.:.||.|
Zfish   423 TQFAETKQR--------ENMLMK------------EQRARYRSNDSTLASYSEPGSCYEEMLKYV 467

  Fly   493 SPTYSCISYEL--------------------FVGGEKGNDDNNKEKMSIRSVEVESESVSVIQR- 536
            |..|..:...|                    ..||..|:..:......::|:.      |:||:
Zfish   468 SHLYRKVKRRLSRIYNSWQSKRRKKVNPNTGAGGGANGHSRHRGYGHWVQSIH------SLIQQH 526

  Fly   537 ----------QPAP---TTAHQATKVRKVST----TSLSLPGSPFNIRRGSRSSHKYTIRNGRGR 584
                      .|:|   |.:.:|.::|.::.    |..|.|.:..|:...::|.|...    :|.
Zfish   527 QRQHCHLSNGSPSPVATTGSSEALEMRSITAGQQLTVSSQPTATHNLSSSTQSVHSIY----QGD 587

  Fly   585 FGIPGSDRKPLVLSTYQDAQQHLPYADDSNAVTP-MSEENGAIIVPVYY----------GNLG-- 636
            |.....:|.|                  :|...| :|..||.:..|...          |:||
Zfish   588 FREAPQERTP------------------TNVAVPALSRLNGGMNYPTILPSLICNYSGGGSLGKE 634

  Fly   637 -SRHSSYTSHQ---------SRISYTSHGDLLGGMAVMGVSTMTKESKLRNRNTRNQSVGATNGG 691
             .:..:.|.|:         .:|...||..:|..||.:..:.:..|.
Zfish   635 RGKSDANTGHEVIQDFDKLHQQIEAHSHSRVLLQMAGVVPTQLLLEV------------------ 681

  Fly   692 TTCLDTNHKLDHRDYEIGLECTDEAGKIKHHDNPFIEPVQTQTVVDMKDVMVLNDIIEQAAGRHS 756
            .:|......|:..|.|||           ..|.|..|
Zfish   682 MSCPYCVRALESMDLEIG-----------DSDYPRSE---------------------------- 707

  Fly   757 RASDRGVSVYYFPTEDDDEDGPTFKDKALEVILKGIDVFCVWDCCWVWLKFQEWVSLIVFDPFVE 821
                 |..||.|..:.....|.:...|..|...:.:.         .|..|:|.::.||...:..
Zfish   708 -----GDMVYEFSYDAGFITGRSAHHKMQEKQNRLVQ---------FWEDFRERLTRIVDSKYFN 758

  Fly   822 LFITLCIVVNTMFMAMDHHDMNKEMERVLKSGNYFFTATFAIEATMKLMAMSPKYYFQEGWNIFD 886
            ..|.:.|::||:.|.:::|:..:|:..:|:..|..||:.|.:|...||:|.....|.:..:||||
Zfish   759 RGIMIAILINTLSMGIEYHEQPEELTNILEISNIVFTSMFVLEMLFKLLAFGIFGYIRNPYNIFD 823

  Fly   887 FIIVALSLLELGLEGVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNLLISIMGRTMGALGNLTFVLCIII 951
            .:||.:|:.|:......||||||:||||||.||.:..|.|...:.::.:||..:.....:|.:.|
Zfish   824 GVIVVISVWEIIGHADGGLSVLRTFRLLRVLKLVRFLPALRRQLLVLMKTMDNVATFCMLLMLFI 888

  Fly   952 FIFAVMGMQLFGKNYH---DHKDRFPDGDLPRWNFTDFMHSFMIVFRVLCGEWIESMWD-CMYVG 1012
            |.|:::||.|||..:.   ::.|..||    |.||...:.:.:.||::|..|    .|: .:|.|
Zfish   889 FTFSILGMHLFGCKFSLKMENGDTIPD----RKNFDSLLWAIVTVFQILTQE----DWNVVLYNG 945

  Fly  1013 DVSCIP----FFLATVVIGNLVVLNLFLALLLSNFGSSSLSAPTADNDTNKIA-EAFNRIGRFKS 1072
            ..|..|    :|:|.:..||.|:.||.:|:|:..|.:.. .|..:|.|..|.: .:..::.:.:|
Zfish   946 MASTSPWAALYFVALMTFGNYVLFNLLVAILVEGFQAEG-DANKSDGDEEKTSVNSEEKMEQLQS 1009

  Fly  1073 WVKRNIAD-CFKLIRNKLTNQISDQPSGERTNQISWIWSEGKGVCRCISAEHGDNELELGHDEIL 1136
            ....:|:| ..|.....|:......|.|.....|         :.|..:......:..||.:.:.
Zfish  1010 SEPLSISDPDLKFYSLMLSANGHVDPCGTLPPPI---------IMRTAATPMPTPKSSLGPESVF 1065

  Fly  1137 ADGLIKKGIKEQTQLEVAIGDGMEFTIHGDMKN-NKPKKSKYLNNATDDD----TASINSYGSHK 1196
                   .:.|..:......|...|    |.|: :.|::|......:..:    .:|.||.|...
Zfish  1066 -------DLTESRRGSAVSIDPNAF----DQKSLSSPRRSPCHPRGSGSNWGSRRSSWNSLGRAP 1119

  Fly  1197 NRPFKDESHKGSAETMEGEEKRDASKEDLGLDEELDEEGECEEGPLDGDIIIHAHDEDI-----L 1256
            :...||.|         ||.:...|.|..|..|:.|.|.| :...:.|..:.|....||     :
Zfish  1120 SLKRKDTS---------GERESLLSGEGRGSFEDDDIEAE-KLTNISGGSLQHPSSLDIPELPQM 1174

  Fly  1257 DEYPADCCPDSYY----------KKFPILAGD-DDS-------------PFW----QGW------ 1287
            .|| .||...|.:          |:..|...| |||             |.|    :.|
Zfish  1175 GEY-LDCNGRSQHILADLSASLNKEDSIAEEDLDDSFCFRLRRTLAAYKPKWCKDHEEWSLYLFS 1238

  Fly  1288 --GNLRLKTFQLIENKYFETAVITMILMSSLALALEDVHLPQRPILQDILYYMDRIFTVIFFLEM 1350
              ...|:...:||.:|.|:..|:..|.::.:.:|||..|:.|...|  .|...:.:|||||..||
Zfish  1239 PHNKFRMMCQKLISHKMFDYVVLVFIFLNCITIALERPHIQQSERL--FLLVSNYVFTVIFVAEM 1301

  Fly  1351 LIKWLALGF----KVYFTNAWCWLDFVIVMVSLINFVASLVGAG----GIQAFKTMRTLRALRPL 1407
            .:|.:||||    :.|..:.|..||.|:|.||||:.:.||...|    ||  .:.:|.||.||||
Zfish  1302 TVKVVALGFYSGNQSYLKSTWNVLDGVLVFVSLIDILVSLAWTGNRIFGI--LRVLRLLRTLRPL 1364

  Fly  1408 RAMSRMQGMRVVVNALVQAIPSIFNVLLVCLIFWLIFAIMGVQLFAGKYFKCEDMNGTKLSHEII 1472
            |.:||..|:::||..|:.::..|.|::|:|..|:::|.|:|||||.||:|.||..:...     |
Zfish  1365 RVISRAPGLKLVVETLITSLRPIGNIVLICCAFFIVFGILGVQLFKGKFFHCEGGDTRN-----I 1424

  Fly  1473 PNRNACESENYTWVNSAMNFDHVGNAYLCLFQVATFKGWIQIMNDAIDSREVDKQPIRETNIYMY 1537
            .|::.|...|..|:....|||::|.|.:.||.::...||:.||.|.:|:..||:||.|..|.:|.
Zfish  1425 TNKSDCLQANLKWIRRKYNFDNLGQALMSLFVLSCKDGWVNIMYDGLDAVGVDQQPERNHNPWML 1489

  Fly  1538 LYFVFFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFN----EQKKKAGGSLEMFMTEDQKKYYNAMKKMGSKKPL 1598
            |||:.|::..|||.||:|:||:::||:    :|::.....||:           ..:|:..||..
Zfish  1490 LYFISFLLIVSFFVLNMFVGVVVENFHKCRQDQEEVEARLLEL-----------KRQKLMEKKRR 1543

  Fly  1599 KAIPRPRWR----PQAIVFEIVTDKKFDIIIMLFIGLNMFTMTLDRYDASDTYNAVLDYLNAIFV 1659
            ||:.||.:.    .:..:..:.|:...|:.|...|.:|:.||:::.::.....:..|.|.|.:|.
Zfish  1544 KALRRPYYADYSPARLYIHTLCTNHYLDLFITGIICINVVTMSIEHFNQPSYLDEALKYCNYVFT 1608

  Fly  1660 VIFSSECLLKI--FALRYHYFIEPWNLFDVVVVILSILGLVLSDIIEKYF--VSPTLLRVVRVAK 1720
            :||..|.|||:  |.:| .:|.:.||..|:.:|:|||:|:.|.:|.....  ::||::|::||.:
Zfish  1609 IIFIIEALLKLVAFGIR-RFFKDRWNQLDLAIVLLSIMGITLEEIKMNAALPINPTIIRIMRVLR 1672

  Fly  1721 VGRVLRLVKGAKGIRTLLFALAMSLPALFNICLLLFLVMFIFAIFGMSFF--MHVKEKS---GIN 1780
            :.|||:|:|.|.|:|:||..:..:||.:.|:.||..|:.||:|..|:..|  :...|.:   |::
Zfish  1673 IARVLKLLKMATGMRSLLDTVMQALPQVGNLGLLFMLLFFIYAALGVELFGKLECTENNPCEGLS 1737

  Fly  1781 DVYNFKTFGQSMILLFQMSTSAGWDGVLDAIINEEACDPPDNDKGYPGNCGS--ATVGITFLLSY 1843
            ....|:.||.:.:.||::||...|:|::...:.|  |.|.:.      .|.|  ..|...:.:::
Zfish  1738 PHATFENFGMAFLTLFRVSTGDNWNGIMKDTLRE--CLPSET------QCLSYLPWVSPIYFVTF 1794

  Fly  1844 LVISFLIVINMYIAVILENYSQATEDVQE 1872
            ::::..:::|:.:||::::..::.::.:|
Zfish  1795 VLMAQFVLVNVVVAVLMKHLEESNKEAKE 1823

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
para	NP_001259619.1	Ion_trans	152..436	CDD:459842	85/331 (26%)
		Na_trans_cytopl	555..740	CDD:463401	37/207 (18%)
		Ion_trans	817..1028	CDD:459842	69/218 (32%)
		Na_trans_assoc	1054..1296	CDD:461936	56/289 (19%)
		Ion_trans	1300..1571	CDD:459842	109/282 (39%)
		Na_channel_gate	1561..1613	CDD:240441	12/59 (20%)
		Ion_trans	1621..1871	CDD:459842	75/260 (29%)
		GPHH	1882..1929	CDD:465306
cacna1ha	XP_073800984.1	None