DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31793 and Mrp4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609930.4 Gene:CG31793 / 326161 FlyBaseID:FBgn0051793 Length:1307 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_650086.2 Gene:Mrp4 / 41387 FlyBaseID:FBgn0263316 Length:1316 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1322 Identity:822/1322 - (62%)
Similarity:1028/1322 - (77%) Gaps:43/1322 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MQASKLPPNPRESAGILSSLMFCFALPILFKGRKQTLQPTDLYKTLNEHEAASLGDEFFQGWEDE 65
            |:|.:||.||||.:..|||||||||||:||||||:||:..|||:.|.||::.||||.....|:::
  Fly     4 MKADELPENPRERSSPLSSLMFCFALPVLFKGRKKTLEQKDLYRALKEHKSDSLGDRLCAAWDEQ 68

  Fly    66 VARCRRKGDSGRKPSVLRVIGRVFGWRLIMSGITIAALELGTRATVPLLLAGLISEFSEHGNGHS 130
            ||:       ...|.:.|.:.:|||:.|.::|:.:.|.|..|:.|.|:.|.|:::.|:.:....|
  Fly    69 VAK-------NETPRLGRALTKVFGFHLFITGVFLLAQEFLTKVTQPICLIGVMAYFAGNDPDRS 126

  Fly   131 YNAQIYAVLLIACILASVLLTHPYMMGMMHLAMKMRVAVSSAIYRKALRLSRTSLGGTTTGQVVN 195
             .||::|..|||..:.||.:.||||:|::||.||||:|:||.|||||||||||:||.||.|||||
  Fly   127 -KAQLWAAGLIAGSVFSVCIGHPYMLGLLHLGMKMRIALSSLIYRKALRLSRTALGDTTVGQVVN 190

  Fly   196 LLSNDLNRFDRCLIHFHFLWLGPLELLIASYFLYEQIGMASFYGISILVLYLPLQTYLSRVTSKL 260
            |||||:.|||..||:.|:||:.||||:..:|.:|.:||::|.:|::|::|:||.|:||.:.||.|
  Fly   191 LLSNDVGRFDLVLINVHYLWIAPLELIAVTYLMYLEIGISSMFGVAIMLLFLPFQSYLGKRTSVL 255

  Fly   261 RLQTALRTDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWERPFGKLIGQMRRSEMSSIRQMNLLRGILLSFEIT 325
            ||:||||||:||||||||||||||||||.||:||||::...|.:||..|:|:|.:||||:||.:.
  Fly   256 RLRTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEKPFGKVVEMTRFNEMLCIKQVNYIRGILISFAMF 320

  Fly   326 LGRIAIFVSLLGFVLGGGELTAERAFCVTAFYNILRRTVSKFFPSGMSQFAELLVSMRRITNFMM 390
            |.||....||:.|||.|..|.||:||.|||:||||||:|:.|||.|:|:|||||||:||:..||.
  Fly   321 LSRIFTSSSLIAFVLLGNILNAEKAFFVTAYYNILRRSVTMFFPQGISEFAELLVSVRRLEAFMH 385

  Fly   391 REEANVIDMS--ERRDEKAEEEQHLLKEVEKRSYPVGIGKEPDTLVEIKALRARWGQEQHDL--V 451
            |.|..|.|.|  :..::|||.        .....|.|.| .|:.|:|....:|||  |.|.|  .
  Fly   386 RPETKVRDKSKVKNANQKAES--------PNGDSPKGNG-IPENLIEFSQFQARW--ESHSLEPT 439

  Fly   452 LNNVNMSLRRGQLVAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPPESGSVQVSGKYSYASQEPWLFNASVRDN 516
            |.::|:.|.|.:|||||||||:||||||||||||||.|||:::::|.||||:||||||..:||.|
  Fly   440 LEDINLQLGRRKLVAVIGPVGAGKSSLIQAILGELPGESGTLRINGSYSYAAQEPWLFTGTVRQN 504

  Fly   517 ILFGLPMDKQRYRTVLKRCALERDLELL-HGDGTIVGERGASLSGGQRARICLARAVYRRADVYL 580
            |||||..||.|||||:|:||||||.||| .||.||||||||||||||:|||.||||||||||:||
  Fly   505 ILFGLDWDKHRYRTVVKKCALERDFELLPFGDKTIVGERGASLSGGQKARISLARAVYRRADIYL 569

  Fly   581 LDDPLSAVDTHVGRHLFDECMRGFLGKQLVILVTHQLQFLEDADLIVIMDKGHVSACGTYEEMLK 645
            ||||||||||||||||||:||||:|..:|||||||||||||.||||||||||.:||.|||..|.:
  Fly   570 LDDPLSAVDTHVGRHLFDQCMRGYLRSELVILVTHQLQFLEQADLIVIMDKGRISAMGTYSSMKR 634

  Fly   646 SGQDFAQLLVESTQNS--------GGGD--EIITSPNLSRQSSALSTKSS-NGSSSSLESMVEKE 699
            ||.||||||....:::        .|||  :::..|:|||:.|..|..|: |.|.:||.||.| .
  Fly   635 SGLDFAQLLTAPNKDAEDLDEIDGAGGDGLDLLNVPSLSRRGSKNSKPSTRNNSFTSLSSMAE-S 698

  Fly   700 KPKPSAVSSQESRSGGQIGLSMYKKYFGAGCGVLVFVVLIMLCIGTQILASGGDYFLSYWVKNTA 764
            ..:.:::..||:|..|:|||.:||:|..:|....:...::.||:.||||.|..||||||||....
  Fly   699 MAQEASLQMQETRVEGKIGLGLYKEYLTSGSSWFMIFFMVFLCLATQILCSAADYFLSYWVDKNV 763

  Fly   765 SSST------LDIYYFTAINVGLVICALLRTLLFFNITMHSSTELHNTMFQGLSRTALYFFHTNP 823
            ...|      .|:|||.|:||.:|:..::||:||:.:.|.|||:|||.|:||::|.|:|||:|||
  Fly   764 DGQTDINTDPQDMYYFAALNVAVVVFTIVRTMLFYKMAMRSSTQLHNAMYQGITRAAMYFFNTNP 828

  Fly   824 SGRILNRFANDLGQVDEVMPAVMLDCIQIFLTLTGIICVLCVTNPWYLINTFAMMLAFYYWRDFY 888
            ||||||||:.||||:|||:|:||||.:|:||||.|||.|:|:|||:|||.|.|:.:.|||.|:||
  Fly   829 SGRILNRFSKDLGQLDEVLPSVMLDVVQLFLTLLGIIVVICITNPYYLILTLALAIIFYYIREFY 893

  Fly   889 LKTSRDVKRLEAVARSPMYSHFSATLVGLPTIRAMGAQQTLIGQYDNYQDLHSSGYYTFVSTSRA 953
            |||||||||||||||||:|||.|||:.|||||||:|||:.||.::||.|||||||||||::|:||
  Fly   894 LKTSRDVKRLEAVARSPIYSHLSATITGLPTIRALGAQKELIAEFDNLQDLHSSGYYTFLATNRA 958

  Fly   954 FGYYLDLFCVAYVISVILHNFFNPPLHNAGQIGLAITQALGMTGMVQWGMRQSAELENAMTSVER 1018
            ||||||.||..|::.:||:.|.||| .:.|::|||||||:||||||||.|||||||||.||:|||
  Fly   959 FGYYLDCFCTLYIVIIILNYFINPP-QSPGEVGLAITQAMGMTGMVQWAMRQSAELENTMTAVER 1022

  Fly  1019 VLEYKDLDPEGDFNSPAEKQPPKSWPKEGKLVTKDLSLRYEPDTNSPCVLKGLSFTIQPMEKVGI 1083
            |:||.:::|||:|:|...|:|..|||::|:::.:||.|||.||..:..|||.|:|.|:|.|||||
  Fly  1023 VVEYDEIEPEGEFDSREGKKPSPSWPEKGEIIAEDLCLRYFPDPQAKYVLKALNFRIRPCEKVGI 1087

  Fly  1084 VGRTGAGKSSLINALFRLSYNDGAILIDSLDTNDIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPF 1148
            |||||||||||||||||||||:|.|.||..||.|:||.||||||||||||||||||:||||||||
  Fly  1088 VGRTGAGKSSLINALFRLSYNEGIITIDERDTADMGLFDLRSKISIIPQEPVLFSGSMRYNLDPF 1152

  Fly  1149 EQYPDDKLWKALEDVHLKEEISELPSGLQSIISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEA 1213
            |:|.|.|||.|||:|.||..|||||:||||.|||||:|||||||||||||||||||||:||||||
  Fly  1153 EEYNDAKLWDALEEVKLKPLISELPNGLQSKISEGGSNFSVGQRQLVCLARAILRENRVLVMDEA 1217

  Fly  1214 TANVDPQTDALIQATIRNKFKDCTVLTIAHRLNTIMDSDKVLVMDAGHVVEFGSPYELLTASKAK 1278
            |||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||:||||||||:|||||||||||:|::|
  Fly  1218 TANVDPQTDALIQATIRSKFRDCTVLTIAHRLNTIMDSDRVLVMDAGHLVEFGSPYELLTSSESK 1282

  Fly  1279 VFHGMVMQTGKASFDHLLKVAE 1300
            :||||||:||:.:||.||||||
  Fly  1283 IFHGMVMETGQNTFDSLLKVAE 1304

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31793NP_609930.4 PLN03130 10..1305 CDD:215595 817/1313 (62%)
Mrp4NP_650086.2 MRP_assoc_pro 13..1292 CDD:188098 807/1299 (62%)

Return to query results.
Submit another query.