DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31793 and CG9270

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_609930.4 Gene:CG31793 / 326161 FlyBaseID:FBgn0051793 Length:1307 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_995741.2 Gene:CG9270 / 35366 FlyBaseID:FBgn0032908 Length:1292 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1309 Identity:937/1309 - (71%)
Similarity:1086/1309 - (82%) Gaps:38/1309 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MQASKLPPNPRESAGILSSLMFCFALPILFKGRKQTLQPTDLYKTLNEHEAASLGDEFFQGWEDE 65
            |||.||..||||||||.|:|||||||||||||||:||:|||||..|.||:|.:|||:||..|:.|
  Fly     1 MQAKKLQTNPRESAGIFSTLMFCFALPILFKGRKKTLEPTDLYNALKEHKAETLGDKFFATWQSE 65

  Fly    66 VARCRRKGDSGRK-PSVLRVIGRVFGWRLIMSGITIAALELGTRATVPLLLAGLISEFSEHGNGH 129
            |..|   |||.:| ||::|||.:||||:|.:|||.:..||||||||:||:|..||:||:.:|||.
  Fly    66 VRSC---GDSPKKEPSIIRVILKVFGWQLFLSGIVVGVLELGTRATLPLILGALIAEFTRNGNGD 127

  Fly   130 SYNAQIYAVLLIACILASVLLTHPYMMGMMHLAMKMRVAVSSAIYRKALRLSRTSLGGTTTGQVV 194
            ...||||.:.||..||.|||:.||.|||:||||||||||||:||||||||||||:||.|||||||
  Fly   128 GLWAQIYGLTLILSILFSVLMFHPLMMGLMHLAMKMRVAVSTAIYRKALRLSRTALGDTTTGQVV 192

  Fly   195 NLLSNDLNRFDRCLIHFHFLWLGPLELLIASYFLYEQIGMASFYGISILVLYLPLQTYLSRVTSK 259
            ||:||||.||||.||||||||||||||||:|||||:|||:||.|||.||:|:||:||:|||:||:
  Fly   193 NLISNDLGRFDRALIHFHFLWLGPLELLISSYFLYQQIGVASLYGIVILLLFLPIQTFLSRLTSR 257

  Fly   260 LRLQTALRTDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWERPFGKLIGQMRRSEMSSIRQMNLLRGILLSFEI 324
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||:|||:||.::|||||||||::|.:||.||||||
  Fly   258 LRHQTALRTDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWEKPFGRLIERLRRSEMSSIRKVNYIRGTLLSFEI 322

  Fly   325 TLGRIAIFVSLLGFVLGGGELTAERAFCVTAFYNILRRTVSKFFPSGMSQFAELLVSMRRITNFM 389
            ||.|||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.||||||||||||::|::|||..||
  Fly   323 TLSRIAIFVSLLGFVLMGGELTAERAFSVTAFYNILRRTVCKFFPSGMSQFAEMMVTLRRIKGFM 387

  Fly   390 MREEANVIDMSERRDEKAEEEQHLLKEVEKRSYPVGIGKEPDTLVEIKALRARWGQEQHDLVLNN 454
            ||.|...:.:...:..|..|                  .||  ||::::.:|||..:..:.||.|
  Fly   388 MRSETEALYLKGGQTNKLFE------------------GEP--LVKLQSFQARWNHDHVEPVLEN 432

  Fly   455 VNMSLRRGQLVAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPPESGSVQVSGKYSYASQEPWLFNASVRDNILF 519
            :|:||...|||||||||||||||||||||||||.|||.::|.|..||||||||||||||||||||
  Fly   433 INISLSPPQLVAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPGESGKLKVQGDISYASQEPWLFNASVRDNILF 497

  Fly   520 GLPMDKQRYRTVLKRCALERDLELLHGDGTIVGERGASLSGGQRARICLARAVYRRADVYLLDDP 584
            ||||||.|||.|::.||||||.||||||.|.||||||||||||||||.|||||||:||.||||||
  Fly   498 GLPMDKHRYRNVIRNCALERDFELLHGDRTFVGERGASLSGGQRARISLARAVYRQADTYLLDDP 562

  Fly   585 LSAVDTHVGRHLFDECMRGFLGKQLVILVTHQLQFLEDADLIVIMDKGHVSACGTYEEMLKSGQD 649
            |||||||||||||:|||||||..:|||||||||||||.||||||||||.:||.||||||||||||
  Fly   563 LSAVDTHVGRHLFEECMRGFLRDKLVILVTHQLQFLEHADLIVIMDKGKISAVGTYEEMLKSGQD 627

  Fly   650 FAQLLVESTQNSGG---------GDEIITSPNLSRQSSALSTKSSNGSSSSLESMVEKEKPKPSA 705
            |.:||....|..|.         ||........|||||.:|..|.....||.||:::.|: :|  
  Fly   628 FGKLLATEAQEMGDSNQEQVNAEGDSRNDKSTYSRQSSRVSRVSVTSVDSSTESILDNER-QP-- 689

  Fly   706 VSSQESRSGGQIGLSMYKKYFGAGCGVLVFVVLIMLCIGTQILASGGDYFLSYWVKNTASSSTLD 770
              :|||||.|:|||.:|.|||.||.|.|:.:::...|:|||||||||||||||||||..|||:.|
  Fly   690 --AQESRSQGKIGLGIYGKYFSAGSGWLMVILVAFFCLGTQILASGGDYFLSYWVKNNDSSSSTD 752

  Fly   771 IYYFTAINVGLVICALLRTLLFFNITMHSSTELHNTMFQGLSRTALYFFHTNPSGRILNRFANDL 835
            ||.|:.||..|||.|||||||||::.|||||:||||||||:|||||||||.|||||||||||.||
  Fly   753 IYIFSGINAALVIFALLRTLLFFSMAMHSSTQLHNTMFQGVSRTALYFFHANPSGRILNRFAMDL 817

  Fly   836 GQVDEVMPAVMLDCIQIFLTLTGIICVLCVTNPWYLINTFAMMLAFYYWRDFYLKTSRDVKRLEA 900
            |||||::|||||||||||||::|||.|||:|||||||||..|.|||::.|.|||.||||:|||||
  Fly   818 GQVDEILPAVMLDCIQIFLTISGIIGVLCITNPWYLINTITMFLAFHFLRTFYLSTSRDLKRLEA 882

  Fly   901 VARSPMYSHFSATLVGLPTIRAMGAQQTLIGQYDNYQDLHSSGYYTFVSTSRAFGYYLDLFCVAY 965
            :|||||||||||||.||.|||||.||..|..:||||||:||||||||:||:||||||||||||||
  Fly   883 IARSPMYSHFSATLNGLSTIRAMEAQDLLTKEYDNYQDIHSSGYYTFLSTNRAFGYYLDLFCVAY 947

  Fly   966 VISVILHNFFNPPLHNAGQIGLAITQALGMTGMVQWGMRQSAELENAMTSVERVLEYKDLDPEGD 1030
            ||||.|.::||||:.|.|||||.||||:.|||.|||||||||||||:||||||||||:.|:.||:
  Fly   948 VISVTLMSYFNPPVDNPGQIGLVITQAMSMTGTVQWGMRQSAELENSMTSVERVLEYRHLEAEGE 1012

  Fly  1031 FNSPAEKQPPKSWPKEGKLVTKDLSLRYEPDTNSPCVLKGLSFTIQPMEKVGIVGRTGAGKSSLI 1095
            |.||.:|:||.:||:||.:..:.|||||.||..:..|||.|:|.|.|.||:||||||||||||||
  Fly  1013 FESPDDKKPPMNWPQEGLISAEQLSLRYNPDPKADRVLKSLNFIIMPREKIGIVGRTGAGKSSLI 1077

  Fly  1096 NALFRLSYNDGAILIDSLDTNDIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFEQYPDDKLWKAL 1160
            |||||||||:|:::||:.|...|||||||||||||||||||||||:|.||||||||.|:|||:||
  Fly  1078 NALFRLSYNEGSLVIDNTDILGIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTLRCNLDPFEQYADEKLWEAL 1142

  Fly  1161 EDVHLKEEISELPSGLQSIISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALI 1225
            |:||||:|:||||:||:|:::|||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1143 EEVHLKDEVSELPNGLESVVAEGGSNYSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALI 1207

  Fly  1226 QATIRNKFKDCTVLTIAHRLNTIMDSDKVLVMDAGHVVEFGSPYELLTASKAKVFHGMVMQTGKA 1290
            |:|||.||:||||||||||||||:|||:|:|:|||.:||||||:||||.|.:|||:|||:|||::
  Fly  1208 QSTIRRKFRDCTVLTIAHRLNTIIDSDRVMVLDAGTLVEFGSPFELLTQSWSKVFYGMVLQTGRS 1272

  Fly  1291 SFDHLLKVA 1299
            ||:||||:|
  Fly  1273 SFEHLLKLA 1281

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31793NP_609930.4 CFTR_protein 1..1273 CDD:273530 918/1281 (72%)
ABC_membrane 112..364 CDD:294371 199/251 (79%)
ABCC_MRP_domain1 434..632 CDD:213217 155/197 (79%)
ABC_membrane 736..955 CDD:294371 167/218 (77%)
ABCC_MRP_domain2 1047..1268 CDD:213211 169/220 (77%)
CG9270NP_995741.2 CFTR_protein 6..1257 CDD:273530 916/1278 (72%)
ABC_membrane 92..362 CDD:294371 210/269 (78%)
ABCC_MRP_domain1 412..611 CDD:213217 156/198 (79%)
ABC_membrane 718..981 CDD:294371 201/262 (77%)
ABCC_MRP_domain2 1029..1250 CDD:213211 169/220 (77%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C45455737
Domainoid 1 1.000 179 1.000 Domainoid score I1056
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0054
Homologene 1 1.000 - - H74563
Inparanoid 1 1.050 1131 1.000 Inparanoid score I210
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG51855
OrthoDB 1 1.010 - - D138195at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001028
OrthoInspector 1 1.000 - - otm26173
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100026
Panther 1 1.100 - - P PTHR24223
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X771
1211.900

Return to query results.
Submit another query.