DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31793 and Abcc10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609930.4 Gene:CG31793 / 326161 FlyBaseID:FBgn0051793 Length:1307 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001101671.1 Gene:Abcc10 / 316231 RGDID:1306696 Length:1494 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1339 Identity:442/1339 - (33%)
Similarity:677/1339 - (50%) Gaps:176/1339 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    17 LSSLMFCFALPILFKG-RKQTLQPTDLYKTLNEHEAASLGDEFFQGWEDEVARCRRKGDSGRKPS 80
            ||...:.:..|:|.:| |.:..||.|..:.......|.|...|...|::....            
  Rat   222 LSRFSYAWLAPLLARGVRGELRQPQDTCRLPRRLHPAYLARAFQAHWKEGAQL------------ 274

  Fly    81 VLRVIGRVFGWRLIMSGITIAALELGTRATV--------PLLLAGLISEFSEHGNGHSYNAQIYA 137
                      ||.:........:.||....|        ||||:.|:. |.|.|.....:..:|.
  Rat   275 ----------WRALYGAFGCCYIALGLLKMVGTMLGFSGPLLLSLLVG-FLEEGQEPLSHGLLYV 328

  Fly   138 VLLIACILASVLLTHPYMMGMMHLAMKMRVAVSSAIYRKALRLSRTSLGGTTTGQVVNLLSNDLN 202
            :.|.:..:.|.:|.:.|...:..:.::.||||.|.:|||.|:|..:.   ..||:|:|||..|..
  Rat   329 LGLASGSVISAVLQNQYGYEVRKVTLQARVAVLSILYRKTLKLGPSR---PPTGEVLNLLGTDSE 390

  Fly   203 RFDRCLIHFHFLWLGPLELLIASYFLYEQIGMASFYGISILVLYLPLQTYL-SRVTSKLRLQTAL 266
            |.......||..|..||:|.|..|.||||:|:|...|:.:.:|.:|:...: :|:.:  ..|..|
  Rat   391 RLLNFAGSFHEAWGLPLQLAITLYLLYEQVGVAFLAGLVLALLLVPVNKVIATRIMA--NNQEML 453

  Fly   267 R-TDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWERPFGKLIGQMRRSEMSSIRQMNLLRGILLSFEITLGRIA 330
            | .|.||::|.|::|||:|:|.:.||:..|..:...|..|:..:|.:..|....:.....|..:.
  Rat   454 RHKDARVKLMTELLSGIRVLKFFRWEQALGDRVKACRTQELGRLRVIKYLDAACVYLWAALPVVI 518

  Fly   331 IFVSLLGFVLGGGELTAERAFCVTAFYNILRRTVSKFFPSGMSQFAELLVSMRRITNFMMREEAN 395
            ..|..:.:||.|.:|||.:.|...|..::|...::. ||..::...|..||:.||..|       
  Rat   519 CIVIFITYVLLGHQLTATKVFTALALVHMLILPLNN-FPWVINGLLESKVSLDRIQRF------- 575

  Fly   396 VIDMSERRDEKAEEEQHLLKEVEKRSYPVGIGKEPDTLVEIKALRARW---GQEQHDLVLNNVNM 457
             :|:.....|              ..|......||.|::|:......|   |..|...:   .::
  Rat   576 -LDLPSYSPE--------------AYYSPDPPTEPSTVLELHEALFSWDPTGTSQKTFI---SHL 622

  Fly   458 SLRRGQLVAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPPESGSVQVSG---KYSYASQEPWLFNASVRDNILF 519
            .:::|.||.::|.||.|||||:.||.|||....|.|.||.   .:..|:||||:..|::|||:||
  Rat   623 QVKKGMLVGIVGKVGCGKSSLLAAITGELHRLCGWVAVSDLSKGFGLATQEPWIQCATIRDNVLF 687

  Fly   520 GLPMDKQRYRTVLKRCALERDLELL-HGDGTIVGERGASLSGGQRARICLARAVYRRADVYLLDD 583
            |...|.|.||.||:.|||..||.:| .||.|.|||:|.:|||||||||.||||||:...:|||||
  Rat   688 GKTFDAQLYREVLEACALNDDLSILPAGDQTEVGEKGVTLSGGQRARIALARAVYQEKTLYLLDD 752

  Fly   584 PLSAVDTHVGRHLFDECMRGFLGKQLVILVTHQLQFLEDADLIVIMDKGHVSACGTYEEMLKSGQ 648
            ||:|||..|..||...|:.|.||....:|.||:.::||.|||:::|:.|.:...|...|:|...|
  Rat   753 PLAAVDADVANHLLHRCILGVLGHTTRLLCTHRTEYLERADLVLLMEAGRLVRAGPPSEILPLVQ 817

  Fly   649 DFAQLLVESTQNSGGGDEIITSP---NLSRQSSALSTKSSNGSSSSLESMVEKEKPKPSAVSSQE 710
            .....|.:..|.:..|.    ||   ||.:.:..|.. :.|.|...::               :|
  Rat   818 AAPTALADKEQVTDSGQ----SPSVHNLEKTTEELDV-AQNTSGRLVQ---------------EE 862

  Fly   711 SRSGGQIGLSMYKKYF---GAGCGVLVFVVLIMLCIGTQILASGGDYFLSYWV-----------K 761
            |:|.|.:.|.:|:.|:   |:|....:.:.|:::    |...:|.|::|::|:           :
  Rat   863 SKSEGAVALHVYRAYWRAMGSGLATAILISLLLM----QATRNGADWWLAHWLSQLKAGRNSSEE 923

  Fly   762 NTASSS------------------------------TLDIYYFTAINVGLV----ICALLRTLLF 792
            ..||||                              :.|::::..:...:.    :|.|||.:||
  Rat   924 RPASSSPRSMGFFSPRLLLFSPGNLYIPLHKATSNGSSDVHFYLTVYATIAGVNSLCTLLRAVLF 988

  Fly   793 FNITMHSSTELHNTMFQGLSRTALYFFHTNPSGRILNRFANDLGQVDEVMPAVMLDCIQIFLTLT 857
            ....:.::..||:.:...|....:.|:.:.||||:||||::|:..||:.:|.::...:...:.|.
  Rat   989 AAGALQAAASLHHRLLHRLLMAPVTFYDSTPSGRVLNRFSSDVACVDDSLPFLLNILLANSVGLL 1053

  Fly   858 GIICVLCVTNPWYLINTFAMMLAFYYWRDFYLKTSRDVKRLEAVARSPMYSHFSATLVGLPTIRA 922
            |::.||....||.|:....:...:|..:..|..:.|:::||.::..||:|||.:.||.|||.:||
  Rat  1054 GLLAVLGSGLPWLLLLLPPLSFIYYGVQRRYRASFRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLPVLRA 1118

  Fly   923 MGAQQTLIGQYDNYQDLHSSGYYTFVSTSRAFGYYLDLFCVAYV-----ISVILHNFFNPPLHNA 982
            .||......:.....:|:....:...:|.:.....|.|...|.|     |:::.|   ...|.|.
  Rat  1119 AGATYRFEEENQRLLELNQRCQFASYATMQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIALVQH---QQGLANP 1180

  Fly   983 GQIGLAITQALGMTGMVQWGMRQSAELENAMTSVERVLEYK-DL--DPEGDFNSPAEKQPPK--- 1041
            |.:||.::.||.:||::...:....:.|..|.||||:.||. |:  :|.|        |||:   
  Rat  1181 GLVGLVLSYALSLTGLLSGLVSSFTQTEAMMVSVERLEEYSCDIPQEPHG--------QPPQSPH 1237

  Fly  1042 ---SWPKEGKLVTKDLSLRYEPDTNSPCVLKGLSFTIQPMEKVGIVGRTGAGKSSLINALFR-LS 1102
               ||..:|.:..:|:.|.|.|  ..|..|.|::|.::|.||:|||||||:|||||...||| |.
  Rat  1238 QRVSWLTQGSVEFQDVVLVYRP--GLPNALDGVTFRVEPGEKLGIVGRTGSGKSSLFLVLFRLLE 1300

  Fly  1103 YNDGAILIDSLDTNDIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFEQYPDDKLWKALEDVHLKE 1167
            .:.|.:|:|.:||:.:.|.:|||::::|||||.|||||:|.||||...:.|..||:|||..|| .
  Rat  1301 PSAGQVLLDGVDTSQLELAELRSQLAVIPQEPFLFSGTVRENLDPQGLHEDRALWQALEQCHL-S 1364

  Fly  1168 EISELPSGLQSIISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALIQATIRNK 1232
            |::....||...:.|.|.:.|:|||||:|||||:|.:.:||.:|||||:||.:||.|:|.||..:
  Rat  1365 EVAMAIGGLDGELGERGRDLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEATASVDQKTDQLLQQTICRR 1429

  Fly  1233 FKDCTVLTIAHRLNTIMDSDKVLVMDAGHVVEFGSPYEL 1271
            |.:.||||||||||||::||:|||:.||.|||..||..|
  Rat  1430 FANKTVLTIAHRLNTILNSDRVLVLQAGRVVELDSPSAL 1468

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31793NP_609930.4 PLN03130 10..1305 CDD:215595 442/1339 (33%)
Abcc10NP_001101671.1 MRP_assoc_pro 201..1471 CDD:188098 442/1339 (33%)

Return to query results.
Submit another query.