DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31793 and Cftr

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609930.4 Gene:CG31793 / 326161 FlyBaseID:FBgn0051793 Length:1307 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006236159.2 Gene:Cftr / 24255 RGDID:2332 Length:1665 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1481 Identity:421/1481 - (28%)
Similarity:719/1481 - (48%) Gaps:243/1481 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 NPRESAGILSSLMFCFALPILFKGRKQTLQPTDLYKTLNEHEAASLGDEFFQGWEDEVARCRRKG 73
            :|.|.|..:|.|.|.:..|||.||.:..|:.:|:|:..:...|..|.::..:.|:.|.|      
  Rat   193 SPLEKASFISKLFFSWTTPILRKGYRHHLELSDIYQAPSSDSADHLSEKLEREWDREQA------ 251

  Fly    74 DSGRKPSVLRVIGRVFGWRLIMSGITIAALELGTRATVPLLLAGLISEFSEHGNGHSYNAQIY-A 137
             |.:||.::..:.|.|.||.:..|:.:...|: |:|..|:||..:|:.: :..|....:..|| .
  Rat   252 -SKKKPQLIHALRRCFVWRFVFYGVLLYLGEV-TKAVQPVLLGRIIASY-DPDNTEERSIAIYLG 313

  Fly   138 VLLIACILASVLLTHPYMMGMMHLAMKMRVAVSSAIYRKALRLSRTSLGGTTTGQVVNLLSNDLN 202
            :.|....:...||.||.:.|:.|:.|:||:|:.|.||:|.|:||...|...:.||:::||||:||
  Rat   314 IGLCLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLISLLSNNLN 378

  Fly   203 RFDRCLIHFHFLWLGPLELLIASYFLYEQIGMASFYGISILVLYLPLQTYLSRVTSKLRLQTALR 267
            :||..|...||:|:.||::::....|::.:..::|.|:.:|::.:..|..|.::..|.|.:.|.:
  Rat   379 KFDEGLALAHFIWIAPLQVVLLMGLLWDLLQFSAFCGLGLLIVLVIFQAILGKMMVKYRDKRAAK 443

  Fly   268 TDQRVRMMNEIISGIQVIKMYTWERPFGKLIGQMRRSEMSSIRQMNLLRGILLSFEITLGRIAIF 332
            .::|:.:.:|:|..|..:|.|.||....|:|..:|..|:...|:...:|....|.....|...:|
  Rat   444 INERLVITSEVIDNIYSVKAYCWESAMEKIIESLREEELKMTRRSAYMRFFTSSAFFFSGFFVVF 508

  Fly   333 VSLLGFVLGGGELTAERAFCVTAFYNILRRTVSKFFPSGMSQFAELLVSMRRITNFMMREEANVI 397
            :|:|.:.:..| :...:.|...:|..:||.:|::.||:.:..:.:.|..:|:|.:|:..:|..|:
  Rat   509 LSVLPYTVING-IVLRKIFTTISFCIVLRMSVTRQFPTAVQIWYDSLGMIRKIQDFLQTQEYKVL 572

  Fly   398 D--------MSERRDEKAEEE-QHLLKEVEKRSYPVGIGKEPDTLVEIKALRARWGQEQH----- 448
            :        :.|......||. |.||::|:..:..                |.....|.|     
  Rat   573 EYNLMFTGLVMENVTAFWEEGFQELLEKVQLNNDD----------------RKTSNGENHLSFSH 621

  Fly   449 -----DLVLNNVNMSLRRGQLVAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPPESGSVQVSGKYSYASQEPWL 508
                 :.||.|:|:::::|:::|:.|..|:||:||:..|||||....|.::.||:.|::||..|:
  Rat   622 LCLVGNPVLKNINLNIKKGEMLAITGSTGAGKTSLLMLILGELEASEGIIKHSGRVSFSSQISWI 686

  Fly   509 FNASVRDNILFGLPMDKQRYRTVLKRCALERDL-ELLHGDGTIVGERGASLSGGQRARICLARAV 572
            ...::::||:||:..|:.||::|:|.|.|:.|: :....|.|::||.|.:|||||||||.|||||
  Rat   687 MPGTIKENIIFGVSYDEYRYKSVVKACQLQEDITKFAEQDNTVLGEGGVTLSGGQRARISLARAV 751

  Fly   573 YRRADVYLLDDPLSAVDTHVGRHLFDECMRGFLGKQLVILVTHQLQFLEDADLIVIMDKGHVSAC 637
            |:.||:||||.|...:|......:|:.|:...:..:..||||.:::.|:.||.|:|:.:|.....
  Rat   752 YKDADLYLLDSPFGYLDVLTEEQIFESCVCKLMASKTRILVTSKMEQLKKADKILILHEGSSYFY 816

  Fly   638 GTYEEMLKSGQDFAQLL-----------------VESTQNSGGGDEIITSPNLSRQS-------- 677
            ||:.|:.....||:..|                 :..|......|:..|:.|.::||        
  Rat   817 GTFSELQSLRPDFSSKLMGYDTFDQFTEERRSSILTETLRRFSVDDASTTWNKAKQSFRQTGEFG 881

  Fly   678 -----SALSTKSS--------------NGSSSSLE----SMV------EKEKPK----------- 702
                 |.||:.||              .|.|..|:    |:|      |...|:           
  Rat   882 EKRKNSILSSFSSVKKISIVQKTPLSIEGESDDLQERRLSLVPDSEHGEAALPRSNMITAGPTFP 946

  Fly   703 --------------PSAVSSQESRSGGQI-------------------GLSM------------- 721
                          ||:|||...|:...|                   .||.             
  Rat   947 GRRRQSVLDLMTFTPSSVSSSLQRTRASIRKISLAPRISLKEEDIYSRRLSQDSTLNITEEINEE 1011

  Fly   722 ---------------------YKKYFGAGCG---VLVFVVLIMLCIGTQILAS------------ 750
                                 |.:||....|   ||::.||:.|   .::.||            
  Rat  1012 DLKECFFDDMVKIPTVTTWNTYLRYFTLHRGLFAVLIWCVLVFL---VEVAASLFVLWLLKNNPV 1073

  Fly   751 -GGD-----YFLSYWVKNTASSSTLDIYYFTAINVG----LVICALLRTLLFFNITMHSSTELHN 805
             ||:     ...||.|..|:||    .||...|.||    |:..:|.|.|...:..:.:|..||.
  Rat  1074 NGGNNGTKIANTSYVVVITSSS----FYYIFYIYVGVADTLLALSLFRGLPLVHTLITASKILHR 1134

  Fly   806 TMFQGLSRTALYFFHTNPSGRILNRFANDLGQVDEVMPAVMLDCIQIFLTLTGIICVLCVTNPWY 870
            .|...:....:..|:...:|.|||||:.|:..:|:.:|..:.|.||:...:.|.|.|:....|:.
  Rat  1135 KMLHSILHAPMSTFNKLKAGGILNRFSKDIAILDDFLPLTIFDFIQLLFIVVGAIIVVSALQPYI 1199

  Fly   871 LINTFAMMLAFYYWRDFYLKTSRDVKRLEAVARSPMYSHFSATLVGLPTIRAMGAQQTLIGQYDN 935
            .:.|...:..|...|.::|.||:.:|:||:..|||:::|...:|.||.|:||...|......:..
  Rat  1200 FLATVPGLAVFILLRAYFLHTSQQLKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFRRQTYFETLFHK 1264

  Fly   936 YQDLHSSGYYTFVSTSRAFGYYLDLFCVAYVISVILHNFFNPPLHNAGQIGLAITQALGMTGMVQ 1000
            ..:||::.::.:::|.|.|...:|:..|.:.|.|...:..... ...|..|:.:|.|:.:...:|
  Rat  1265 ALNLHTANWFMYLATLRWFQMRIDMIFVLFFIVVTFISILTTG-EGEGTTGIILTLAMNIMSTLQ 1328

  Fly  1001 WGMRQSAELENAMTSVERVLEYKDLDPEGDFNSPAEKQ-----PPK-------------SWPKEG 1047
            |.:..|.:.::.|.||.||.::.|:..|....:...|:     .|.             :||..|
  Rat  1329 WAVNSSIDTDSLMRSVSRVFKFIDIQTEESICTKIMKELHSEDSPNALVIKNEHVKKCDTWPSGG 1393

  Fly  1048 KLVTKDLSLRYEPDTNSPCVLKGLSFTIQPMEKVGIVGRTGAGKSSLINALFRLSYNDGAILIDS 1112
            ::|.|||:::|..|.|:  :|:.:||:|.|.::||::||||:|||:|::|..|:....|.|.||.
  Rat  1394 EMVVKDLTVKYVDDGNA--ILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRMLNIKGEIQIDG 1456

  Fly  1113 LDTNDIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFEQYPDDKLWKALEDVHLKEEISELPSGLQ 1177
            :..|.:.|.:.|....:|.|:..:||||.|.||||..::.|:::||..:.|.||..|.:.|..|.
  Rat  1457 VSWNSMTLQEWRKAFGVITQKVFIFSGTFRQNLDPNGKWRDEEIWKVADQVGLKSVIEQFPGQLN 1521

  Fly  1178 SIISEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALIQATIRNKFKDCTVLTIA 1242
            ..:.:||...|.|.:||:||||::|.:.:|:::||.:||:||.|..:|:..:|..|..|||:...
  Rat  1522 FTLVDGGYVLSHGHKQLMCLARSVLSKAKIILLDEPSANLDPITYQVIRRVLRQAFAGCTVVLCE 1586

  Fly  1243 HRLNTIMDSDKVLVMDAGHVVEFGSPYELL-----------TASKAKVFHG 1282
            ||:..::|..:.||::.|:|.::.|...||           ::.|.|:|||
  Rat  1587 HRIEAMLDCQRFLVIEQGNVWQYESLQALLSEKSVFQRALSSSEKMKLFHG 1637

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31793NP_609930.4 PLN03130 10..1305 CDD:215595 421/1480 (28%)
CftrXP_006236159.2 None

Return to query results.
Submit another query.