DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG4301 and Atp8a2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_573125.1 Gene:CG4301 / 32610 FlyBaseID:FBgn0030747 Length:1342 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038949921.1 Gene:Atp8a2 / 691889 RGDID:1594597 Length:1200 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1305 Identity:417/1305 - (31%)
Similarity:616/1305 - (47%) Gaps:298/1305 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    74 NRIKSTKYTLITFLPQNLLEQFRRIANFYFLVMTIISLLID-SPVSPMTSLLPLVFVIAVTAAKQ 137
            |||.:.||:::||||:.|.||.||.||.:||.:.::..:.| ||....|:|:|||.::.:...|:
  Rat    71 NRISTAKYSVLTFLPRFLYEQIRRAANAFFLFIALLQQIPDVSPTGRYTTLVPLVIILTIAGIKE 135

  Fly   138 GYEDILRYRTDNVVNSSPVTVIRDGKEAIIKSQDVIPGELIVVERDCDVPCDLVLLRSTDPHGKC 202
            ..||..|::.||.||.....|:|:|....|..::|..|:::.|.....:|.|:||..|::|.|.|
  Rat   136 IVEDFKRHKADNAVNKKKTIVLRNGMWHTIMWKEVAVGDIVKVLNGQYLPADMVLFSSSEPQGMC 200

  Fly   203 FITTANLDGESNLKT---LMVPRDLPTVDLPEMHKL-GIIECESPTTDLYSFNGKIELKGGEGRV 263
            ::.|||||||:|||.   |....|:.|.::  :.|| |.||||.|...||.|.|.:.|.|...  
  Rat   201 YVETANLDGETNLKIRQGLSHTADMQTREV--LMKLSGRIECEGPNRHLYDFTGTLHLDGKSS-- 261

  Fly   264 LPLSTENVLLRGSRVKNTECVIGCAVYTGMISKLQLNSRLTRNKNASSETYIN-----RFLIVIL 323
            :.|..:.:||||::::||:.|.|..||||..:||..||.....|.::.|...|     .|.|:::
  Rat   262 VALGPDQILLRGTQLRNTQWVFGVVVYTGHDTKLMQNSTKAPLKRSNVEKVTNVQILVLFGILLV 326

  Fly   324 VALIAIVTLLYFLKRY-NELFVIPKLTYLGDATDSYSVKQFLQDYLSFLILFNYLIPISLYVTIE 387
            :||::.|..|::...: .:.:.|.|:....|        .|..:.|:|:||:|.||||||.||:|
  Rat   327 MALVSSVGALFWNGSHGGKSWYIKKMDTTSD--------NFGYNLLTFIILYNNLIPISLLVTLE 383

  Fly   388 LQRVIGSWFMEWDLELYENETDQPCVVNTSNLNEELGQINILFSDKTGTLTKNEMNFQQCSINGN 452
            :.:...:.|:.||.::|..|.|.|.:..||||||||||:..||||||||||.|.|||::|||.| 
  Rat   384 VVKYTQALFINWDTDMYYIENDTPAMARTSNLNEELGQVKYLFSDKTGTLTCNIMNFKKCSIAG- 447

  Fly   453 KFLFKKTRLEDEETKALLDINKFSANQRVFFQALSICHTVQVASGSLEQADAGTAKREPVTAIKS 517
                                                     |..|..                  
  Rat   448 -----------------------------------------VTYGHF------------------ 453

  Fly   518 GPPEMYSISDITEESHNASQQSELNVGHTIDNSVSAHPNGVNSTIISSDVNPLLVSDDGYGVERR 582
              ||:            |.:||                                 |||       
  Rat   454 --PEL------------AREQS---------------------------------SDD------- 464

  Fly   583 KRPVVIKRSPNFARSNRMNNGAASDLNINQTDPNTVTNGVEPTTNFRPISLQFRRSTSEKDLQQS 647
                       |.   ||.:..:...:.|  ||..:.| :|.                       
  Rat   465 -----------FC---RMTSCPSDSCDFN--DPRLLKN-IED----------------------- 489

  Fly   648 WEAPSGQAPGHRRAHSYGAPNAYLTNPVTASTPPAGVLFRSPSTTSRESYAAPTFTRQPTILVRA 712
             |.|:                                              ||......|:|...
  Rat   490 -EHPT----------------------------------------------APCIQEFLTLLAVC 507

  Fly   713 ESQRRKNEIRDFIFTLDYQASSP------------DEKALVEACANLGMVYTGDDDETLRVRIVP 765
            .:...:.:..:.|    ||||||            ||.|||:....||.|:||            
  Rat   508 HTVVPEKDGDEII----YQASSPGVNLCGVGSLLADEAALVKGAKKLGFVFTG------------ 556

  Fly   766 PHMDYKRPF-----AKPREETFQRLHVLEFTSDRKRMSVIVRDTDGKKWIYTKGAESYVFPLCAN 825
                 :.|:     |..:|:||..|:||||:|||||||||||...|:..:|.|||::.:|...:.
  Rat   557 -----RTPYSVIIEAMGQEQTFGILNVLEFSSDRKRMSVIVRMPSGQLRLYCKGADNVIFERLSK 616

  Fly   826 SSAELVTKTDAHISDFARLGLRTLAIARRLISEEEYQDFLVELAQANSSLENRKQLSEECYAKIE 890
            .| :.:.:|..|:..||..|||||.:|...:||.||:::|....:|:..|::|.|..||||..||
  Rat   617 DS-KYMEETLCHLEYFATEGLRTLCVAYADLSENEYEEWLKVYQEASIILKDRAQRLEECYEIIE 680

  Fly   891 SNLDLLGATAVEDALQDDVADTLVSLQAAGIKIWVLTGDKVETALNIALSCGHIPPDAKKYFIME 955
            .||.||||||:||.||..|.:|:.:|..|.||||||||||.|||:||..||..:..:.....:.|
  Rat   681 KNLLLLGATAIEDRLQAGVPETIATLLKAEIKIWVLTGDKQETAINIGYSCRLVSQNMALILLKE 745

  Fly   956 CK---NREEMLLHLNALDREIIFGIGQECALLIDGKSLGVALA-EASSEFRDVAVKCTAVLCCRL 1016
            ..   .|..:..|...|..  :.|...:.||:|||.:|..||: |....|.|:|:.|.||:|||:
  Rat   746 DSLDATRAAITQHCTDLGN--LLGKENDVALIIDGHTLKYALSFEVRRSFLDLALSCKAVICCRV 808

  Fly  1017 SPLQKSEVVSLIKSSNENYNTASIGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGREGRQAARCADFAFAKFCML 1081
            |||||||:|.::|...:.. |.:||||||||.|||.||||:||.|.||.||...:|:|.|:|..|
  Rat   809 SPLQKSEIVDVVKKRVKAI-TLAIGDGANDVGMIQTAHVGVGISGNEGMQATNNSDYAIAQFSYL 872

  Fly  1082 KRLLLVHGHYHSVRLSLLVLYFFYKNIVFMGIMFLFQFHTLFSSSSVYDSLFLTLYNVIYTSLPI 1146
            ::||||||.:...|::..:||.||||:|...|...|.|...||...:::...:.|||||:|:||.
  Rat   873 EKLLLVHGAWSYNRVTKCILYCFYKNVVLYIIELWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVIFTALPP 937

  Fly  1147 LFIAISEKPYTEEKLMRTPQLYK--KNTD--NKQLHWPYFLMWVLFAIYHSVIIFYFAFCFFYYN 1207
            ..:.|.|:..|:|.::|.|||||  :|.:  |.::.|.:    .:.|:.||:|:|:.......::
  Rat   938 FTLGIFERSCTQESMLRFPQLYKITQNAEGFNTKVFWGH----CINALVHSLILFWVPMKALEHD 998

  Fly  1208 NVLLNYGQTVAFSCFGTLLMWTVVVVVNLK------LWLESMYLSFWYIFTIIISILGFVVTTVI 1266
            ..|.: |....:...|.::...|||.|.||      .|.:..:|:.|  .:::|.::.|.|.:..
  Rat   999 TPLTS-GHATDYLFVGNIVYTYVVVTVCLKAGLETTAWTKFSHLAVW--GSMLIWLVFFGVYSTF 1060

  Fly  1267 YNVINLDYDTDIYWAYNNLLASLPVWLWIIVTCVACLVPDYTIR---------MLQRALNIKSFS 1322
            :..|.:  ..|:......:|:|...||.:::...|||:.|...|         :|:....:::.|
  Rat  1061 WPTIPI--APDMKGQATMVLSSAHFWLGLLLVPTACLIEDVAWRAAKHTCKKTLLEEVQELETKS 1123

  Fly  1323 IFPGK 1327
            ...||
  Rat  1124 RVMGK 1128

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG4301NP_573125.1 Haloacid Dehalogenase-like Hydrolases 74..1317 CDD:473868 414/1293 (32%)
Atp8a2XP_038949921.1 ATPase-Plipid 68..1118 CDD:273734 414/1293 (32%)

Return to query results.
Submit another query.