DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG9981 and Atp11b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_573124.1 Gene:CG9981 / 32609 FlyBaseID:FBgn0030746 Length:1060 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001413956.1 Gene:Atp11b / 361929 RGDID:1561719 Length:1175 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1112 Identity:415/1112 - (37%)
Similarity:623/1112 - (56%) Gaps:97/1112 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MGADKKKSADPLRIQI------GGIESRQQKPLNRVTTTKYTWFTFLPLNFYEQFRRAVYFYFLI 59
            :|.|....:|...|.|      .|:.:.|:...||:.::|||.:.|:|.|.:|||||...|||||
  Rat     9 LGFDPPHQSDTRTIYIANRFPQNGLYTPQKFIDNRIISSKYTVWNFVPKNLFEQFRRVANFYFLI 73

  Fly    60 ITIVSFFVNETISPLVSLLPLLFVMIITALKEGLEDYSRSKSDKLVNTARVTVIRNGKEEIINSQ 124
            |.:|...::...||:.|.|||.||:.:||:|:|.||:.|..||..||.|.|.|:|:|......|:
  Rat    74 IFLVQLMIDTPTSPITSGLPLFFVITVTAIKQGYEDWLRHNSDNEVNGAPVYVVRSGGLVKTRSK 138

  Fly   125 FIVPGDLVVVRNDGDVPCDLVLLQSSSADRKCFVNTANLDGETNLKT-ICVPTNYLLAGDHELQG 188
            .|..||:|.:..|...|.|||||.|...|..|.|.||:||||||||| :.||...:|.....|..
  Rat   139 NIRVGDIVRIAKDEIFPADLVLLSSDRLDGSCHVTTASLDGETNLKTHVSVPETAVLQTVANLDS 203

  Fly   189 KDCIV-CEPSSADLYTFNGRLELRSGNDGAGSSAGDALPLTIDNLLLRGVRVKSTERVVGCAIYT 252
            ...:: |:...||||.|.||:.:....:..      ..||..::|||||.|:|:|:.:.|.|:||
  Rat   204 LIAVIECQQPEADLYRFMGRMIITQQMEEI------VRPLGPESLLLRGARLKNTKEIFGVAVYT 262

  Fly   253 GMHTKLQLNSRYTGNKSASSEKYINRFMVALIVGMIVVVVVLYLIERHKEAKIVPTMPYQGPPT- 316
            ||.||:.||.:....|.::.||.:|.|::..::.:|...::..:::...:|:.....|:....| 
  Rat   263 GMETKMALNYKSKSQKRSAVEKSMNTFLIIYLIILISEAIISTILKYTWQAEEKWDEPWYNQKTE 327

  Fly   317 ---NFNSAWQIFEDFLSFLLLFNYMVPISAYMNIEVYRIFGMHFMHNDLHLYDEETDQPCRVNAS 378
               |.:...:...|||:||:|:|:::|||.|:.:|:.:..|..|:..||.||.||:||..:||.|
  Rat   328 HQRNSSKILRFISDFLAFLVLYNFIIPISLYVTVEMQKFLGSFFIGWDLDLYHEESDQKAQVNTS 392

  Fly   379 NLNEELGQVNILFSDKTGTLTKNLMKFVNCYVPGTNYQLQNTHLVSEG----------------- 426
            :||||||||..:|:|||||||:|.|:|..|.:.|..||..|..||.||                 
  Rat   393 DLNEELGQVEYVFTDKTGTLTENEMQFRECSINGLKYQEINGKLVPEGPSPDSAEGNDPYLGSLS 457

  Fly   427 --------------TDEKFELEKLDADAAVLFEALAVCHTVEV----LQEVGDKTLESSESVSEQ 473
                          |..:.|.| |..:..:.|:|:::||||::    ...:||...:.:.:.::.
  Rat   458 HLSSSAHLTATSLRTSPESETE-LIKEHDLFFKAVSLCHTVQISNVQTDGIGDGPWQPNLAPTQL 521

  Fly   474 SHLMSRNIVDRYQASSPDEKALLEGCASLGLVYEGQENDVLSICRYPSAEKVQFKRLHVLEFSSE 538
                      .|.|||||||||:|..|..|:::.|...:.:.:......|:  :|.||:|||.|:
  Rat   522 ----------EYYASSPDEKALVEAAARAGIIFIGISEETMEVKVLGRVER--YKLLHILEFDSD 574

  Fly   539 RQRMSVIVRDQSDTIWLYSKGAESAIFPRCKASPLVEQTDAQITKYAQNGLRTMAVGRRMLTDDE 603
            |:||||||:..|....|::|||||:|.|:|.... :.:|...:.::|..||||:.:..|..|.:|
  Rat   575 RRRMSVIVQAPSGEKLLFAKGAESSILPKCIGGE-IAKTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRQFTAEE 638

  Fly   604 LFHFEELYRK---ANTQLSNRNELIASCYETVENELDLLGATALEDALQEHVGETLEALQAAGLK 665
               :|::.|:   |.|.|..|.|.:|..::.:|.:|.||||||:||.||:.|.||:|||:.||:|
  Rat   639 ---YEDVNRRLFEARTSLQRREEKLAGVFQYIEKDLVLLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIK 700

  Fly   666 IWVLTGDKVETAYNIGLACRHIPRGSKQHFIIN------TTEPAELLARLDMIGDDE--PEVLIV 722
            :|||||||.|||.::.|:|.|..|......:||      ..|....|||  .|.:|.  ...|:|
  Rat   701 VWVLTGDKHETAVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKSDSGCAEQLRQLAR--RITEDHVIQHGLVV 763

  Fly   723 DGTTITALLEHTPRQFADLALRCRAVLCCRLSPLQKSEIVTLIK-RRKKYITAAIGDGANDVSMI 786
            |||:::..|....:.|.::...|.||||||::||||::::.||| ..:|.||.|:||||||||||
  Rat   764 DGTSLSLALREHEKLFMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMI 828

  Fly   787 QEAHIGIGITGREGKQAARCADFSIARFEMLRRLFLVHGHYNSQRLAFLVLFYCYKNIIITGCMA 851
            ||||:||||.|:||:||||.:|:::|||:.|.:|..||||:...|:|.||.::.|||:.......
  Rat   829 QEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAVARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQF 893

  Fly   852 LYQVYDLYSATNVYNSIYLWLFDIVYISFSFTVLAICDKDYSEETLLSHPELYKPLAHNRQASMG 916
            |||.|.|:|...:|:|:||.|::|.:.|....:.::.::......|.|.|.||:.::.||..||.
  Rat   894 LYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPVLIYSLLEQHIDPHVLQSKPTLYRDISKNRLLSMK 958

  Fly   917 VFSLWILNGFVQCFIIFFFTYAMLNDANVLFNGGQTASFQTFGTMLITIIVIVGNLKLLLVAHYM 981
            .|..|.:.||...||.||.:|.::.....|...||.....||||::.|::||...:|:.|..|:.
  Rat   959 AFLYWTVLGFSHAFIFFFGSYFLIGKDTSLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFW 1023

  Fly   982 TYRNFAMILASIAAFMLTTYLYNLYTSG---------ELYDVYNQFLSSLPIWLFTIICSVACLL 1037
            |:.|..:...||..:    ::::|:..|         .:|.|:.|.|||...|...::..|:||.
  Rat  1024 TWINHLVTWGSIIFY----FIFSLFYGGILWPFLGSQNMYSVFIQLLSSGSAWFAILLMVVSCLF 1084

  Fly  1038 PDFVIKV 1044
            .|.|.||
  Rat  1085 VDVVKKV 1091

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG9981NP_573124.1 P-type_ATPase_APLT_Dnf-like 28..936 CDD:319770 374/960 (39%)
Atp11bNP_001413956.1 None

Return to query results.
Submit another query.