Protein Alignment CG9915 and Iws1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001097000.1
• Gene: CG9915 / 32593
• FlyBaseID: FBgn0030738
• Length: 820
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001385564.1
• Gene: Iws1 / 291705
• RGDID: 1304762
• Length: 765
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 802
• Identity: 240/802 - (29%)
• Similarity: 360/802 - (44%)
• Gaps: 134/802 - (16%)

  Fly   110 SGRRSRSGSKQSLNGSRRSRSGSAPSRSGSRHSGAAPGSPAGSRRSRSGSRRSRSGSRQSRSGSR 174
            ||.:|..|....:...|.|.| ........:|||:..||.  .|.|.:.:.....|..:..:|:.
  Rat     7 SGDQSDDGGATPVQDERDSGS-DGEDDVNEQHSGSDTGSV--DRHSENETSDREDGLTKIHNGTD 68

  Fly   175 RSRSGSKQSHRSRSGSKRSRSGSRRSRSGSRRSRSGSKQSRGGSRRSRSGSKQSRSGSRRSRSGS 239
            .........|.|.|.|:.           ..|.:....:|...:....|.|:  .....:..|.|
  Rat    69 SENDEPSNVHASDSESEE-----------LHRPKDSDSESEEHAESPASDSE--NEAVHQQGSDS 120

  Fly   240 KRSRSRSGSRRSNASRSGSRRSRSGSVSRRSRSGSGSRRSRSGSRRSRSGSKRSRSGSICSRSGS 304
            ::....:|....:....|.:.:.|.|.:..:....||........|.::....|........|.|
  Rat   121 EKEELLNGHASDSEKEEGRKHAASDSETEDTLQPQGSESDSEDPPRPQASDSESEEPPKPRISDS 185

  Fly   305 R-----RSRSGSARSRSGSRRSRSGS--------RRSRSGSR---RSRSGSSRSRSGSGSRRSRS 353
            .     :.|...:.|....|...|.|        |.|.|.|.   |.::..|.|......|.|.|
  Rat   186 ESEELPKPRISDSESEDPPRPQVSDSESEELPKPRVSDSESEDPPRPQASDSESEELPKPRVSDS 250

  Fly   354 GSRRSRSGSSRSRSGSSRSRSGSRRSRSGSRRSRSGSRRSRSGSKRSRSGSRRSRSGSRRSRSGS 418
            .|...:.|.    :..|.:...||...........|..:......::.|.....|.|...|.|..
  Rat   251 ESEDPQKGP----ASDSEAEDASRHKEKPESEDSDGENKREDSEVQNESDGHADRKGLHSSDSEE 311

  Fly   419 RRSRSGSRRSRSGSRSRSRSISGGSRKGSR---SRSGSAAS------QTASRRKRRAISESDDDG 474
            ...:          |.:..|...|.::|..   .|..:..|      :.::.:|.|.||::||..
  Rat   312 EEPK----------RQKIDSDDDGEKEGDEKVAKRKAAVLSDSEDEDKASAAKKSRVISDADDSD 366

  Fly   475 PKVTK----KRVKITDTDNEEDEQDKGIGKE-----KSQDKITESSDDENTPISNEPEN------ 524
            ..|..    ||.|...:|:||:     :|||     ||::|....||.|:   .||.||
  Rat   367 SDVVSDKSGKREKTVASDSEEE-----VGKEESSVKKSEEKDLFGSDSES---GNEEENLIADIF 423

  Fly   525 ---------------------------------------------SNFISDFDAMLMRKKEEKRV 544
                                                         .:|:|||:.||.|||.....
  Rat   424 GESGDEEEEEFTGFNQEDLEEEKNETQLKEAEDSDSDDNIKRGKHMDFLSDFEMMLQRKKSMCGK 488

  Fly   545 RRRKRD-IDLINDNDDLIDQLIVSMKNASDDDRQLNMIGQPATKKISMLKQVMSQLIKKHLQLAF 608
            |||.|| ...|:|.||::..:||.|..|:::|||||...:||.||:::|..|:..|.|:.|:..|
  Rat   489 RRRNRDGGTFISDADDVVSAMIVKMNEAAEEDRQLNNQKKPALKKLTLLPTVVMHLKKQDLKETF 553

  Fly   609 LEHNILNVLTDWLAPLPNKSLPCLQIRESILKLLSDFPTIEKGLLKQSGIGKAVMYLYKHPQETK 673
            ::..:::.:.:||:|||::|||.|:|||.:||:|.:.|::.:..||.||||:|||||||||:|::
  Rat   554 IDSGVMSAIKEWLSPLPDRSLPALKIREELLKILQELPSVSQETLKHSGIGRAVMYLYKHPKESR 618

  Fly   674 SNRDRAGRLISEWARPIFNVSCNFSAMSKEERQERDLAQMSRHRHKSPDTEPSSSSKAP--TLNQ 736
            ||:|.||:||:||:||||.::.|:..|::|||::|||.||.:.|..|     |:..:.|  .|.:
  Rat   619 SNKDMAGKLINEWSRPIFGLTSNYKGMTREEREQRDLEQMPQRRRMS-----STGGQTPRRDLEK 678

  Fly   737 TLSNEDKMLRPGDPGWVARARVPMPSNKDYVIRPKSTVEGEVS---ASTKRKPNRYEKHMKRFLD 798
            .|:.|:|.|||||||:.||||||||||||||:|||..||.|.|   |::|:..:|.:|.|::|.|
  Rat   679 VLTGEEKALRPGDPGFCARARVPMPSNKDYVVRPKWNVEMESSRFQATSKKGISRLDKQMRKFTD 743

  Fly   799 SKRLKESRRAVEISIEGRKMAL 820
            .::...|..||:|||||.||.|
  Rat   744 IRKKSRSAHAVKISIEGNKMPL 765

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG9915	NP_001097000.1	TFIIS_I	<568..775	CDD:469629	104/208 (50%)
Iws1	NP_001385564.1	MSCRAMM_ClfA	<18..417	CDD:468110	88/436 (20%)
		TFIIS_I	<474..738	CDD:469629	130/268 (49%)