DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG9915 and iws1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097000.1 Gene:CG9915 / 32593 FlyBaseID:FBgn0030738 Length:820 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002664782.3 Gene:iws1 / 100329390 ZFINID:ZDB-GENE-120914-2 Length:824 Species:Danio rerio


Alignment Length:861 Identity:247/861 - (28%)
Similarity:390/861 - (45%) Gaps:114/861 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    27 DTAAKAELKEIQDTNP-------DATNFEPVLPEKSKSKSPSPAPKNGDDNAEAIADRSRSRSRS 84
            |.:|.....|.:|..|       |.::.|....:.|.|:...|.|.:.|::           |.|
Zfish    11 DGSATPVQDEQEDAGPGSRQSDDDGSDNEDRKSDNSDSEMEPPRPADSDED-----------SSS 64

  Fly    85 ATRKSASRSRSGSHKSRSGSVHSAASGRRSRSGSKQSLNGSRRSRSGS-----APSRSGSRHS-- 142
            ..::.||.|.....:.::   |:|     |.|..:|....|.:|.:||     .|.:....||  
Zfish    65 PVKRRASTSDLEEEEEKT---HAA-----SDSEEEQQKRRSPKSDAGSDSDEDRPKQRTQNHSED 121

  Fly   143 ----GAAPGSPAGSRRSRSGSRRSR----SGSRQSRSGSRRSRSGSKQSHRSRSGSKRSRSGSRR 199
                |...|....:..|.|.....|    :||.:.....:|...||........|.|....||..
Zfish   122 EDEEGGRKGKWKTAMNSESEEDEDRAKEEAGSDEDDKRPKRRDLGSDDDDEDDEGPKTRVLGSDD 186

  Fly   200 SRSGSRRSRSGSKQSRGGSRRSRSGS-----KQSRSGSRRSRSGSKRSRSRSGSRRSNASRSGSR 259
            ...|.:|...||.......:|...||     ::.:..:..|....||.:.:  :..|:......:
Zfish   187 EDEGPKRRALGSDDEDERPKRKALGSDDDEDEEPKQKALNSDEDDKRPKRK--ALDSDDDDEDDK 249

  Fly   260 RSRSGSVSRRSRSGSGSRRSRSGSRRSRSGSKRSRSGSICSRSGSRRSRSGSARSRSGSRRSRSG 324
            |.:     |::...........|.:|...||.....      .|.:|...|| ....|..:|::.
Zfish   250 RPK-----RKALDSDDDDDKDEGPKRKALGSDDDED------EGPKRKALGS-DDDDGGPKSKAL 302

  Fly   325 SRRSRSGSRRSRSGSSRSRSGSGSRRSRSGSRRSRSGSSRSRSGSSRSRSGSRRSRSGSRRSRSG 389
            ........|..|...:......|.:|....|........::...........||:.:.......|
Zfish   303 DSDDDEDERPKRKVLASDDEDEGPKRKALDSDEDEGPKRKALDSDDEDERPKRRALASDDEDDEG 367

  Fly   390 SRRSRSGS-----------KRSRS-----------GSRRSRSGSRRSRSGSRRSRSGSRRSRSGS 432
            .:|...||           ||.::           ..::||..|....|||.....|..:|.:  
Zfish   368 PKRKALGSDDDEDEDDKPVKRKKAVLSDSDEDEEKAVKKSRIVSDDDDSGSDEGSGGPDKSLA-- 430

  Fly   433 RSRSRSISGGSRKGSRSRSGSAASQTASRRKRRAI--SESDDDGPKVTKKRVKI-TDTDNEEDEQ 494
             ::.:.:...|......:.|.     |.::..:|:  |:||..|.:..|....| .::.:||:|:
Zfish   431 -AKLKELGSDSEDEEDMKKGE-----AGKKDEKALFGSDSDSGGDEEEKMIADIFGESGDEEEEE 489

  Fly   495 DKGIGKEK-----------SQDKITESSDDENTPISNEPENSNFISDFDAMLMRKKEEKRVRRRK 548
            ..|..:|:           .|.|..:.||.:: .|....::.:::||||.||.|||.:...|||.
Zfish   490 FTGFNQEELEAERPQTQVSGQRKADDDSDSDD-GIDRGGKDMSYMSDFDMMLARKKAQSGKRRRN 553

  Fly   549 RD-IDLINDNDDLIDQLIVSMKNASDDDRQLNMIGQPATKKISMLKQVMSQLIKKHLQLAFLEHN 612
            || ...|:|.||::..:|..|..|:::||.||...:||.||:.:|..|:..|.|:.|:..|::..
Zfish   554 RDGGTFISDADDVVSAMITKMTEAAEEDRTLNSQKKPALKKLMLLPTVVMHLKKQDLKETFIDSG 618

  Fly   613 ILNVLTDWLAPLPNKSLPCLQIRESILKLLSDFPTIEKGLLKQSGIGKAVMYLYKHPQETKSNRD 677
            ::..:.:|::|||:||||.|:|||.:||:|.:.|::.:..||.||||:|||||||||:|::.|:|
Zfish   619 VMAAIKEWISPLPDKSLPALRIREELLKILQELPSVSQETLKFSGIGRAVMYLYKHPKESRPNKD 683

  Fly   678 RAGRLISEWARPIFNVSCNFSAMSKEERQERDLAQMSRHRHKSPDTEPSSSSKAP--TLNQTLSN 740
            .|.:||:||:||||.::.|:..|::||||:|||.|..     :|....||..:.|  .|.:.|:.
Zfish   684 LALKLINEWSRPIFGLTSNYKGMTREERQQRDLDQQI-----APRRRLSSGGQTPRRDLEKVLTG 743

  Fly   741 EDKMLRPGDPGWVARARVPMPSNKDYVIRPKSTVEGEVSASTKRKP-NRYEKHMKRFLDSKRLKE 804
            |:|.|||||||:.||||||||||||||:|||..|:|:.:....:|. :|.:|.|:||.|.|||.:
Zfish   744 EEKALRPGDPGFCARARVPMPSNKDYVVRPKWNVDGDSNRGPAKKGLSRVDKQMRRFADIKRLTK 808

  Fly   805 SRRAVEISIEGRKMAL 820
            ...||:||:||.:|.|
Zfish   809 PGHAVKISVEGNRMPL 824

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG9915NP_001097000.1 TFIIS_I <568..775 CDD:469629 101/208 (49%)
iws1XP_002664782.3 None

Return to query results.
Submit another query.