DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Lrp4 and lrp4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_727914.1 Gene:Lrp4 / 32552 FlyBaseID:FBgn0030706 Length:2009 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_073763685.1 Gene:lrp4 / 110351181 ZFINID:ZDB-GENE-130129-1 Length:1913 Species:Danio rerio


Alignment Length:1829 Identity:777/1829 - (42%)
Similarity:1082/1829 - (59%) Gaps:134/1829 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   205 ESDENCNPEEDAVPNLQRDCEKTGIHVMCPRTFRCISKYWLCDGDDDCGDYSDETHCGARTNCTD 269
            :.|.:|....|....:...|.....|  | ...:||.:.||||||:||.|.|||..|..| .|.:
Zfish    54 DGDNDCGDHSDEDGCILPTCSPLDFH--C-ENGKCIRRSWLCDGDNDCEDDSDEQDCPPR-ECEE 114

  Fly   270 DQFECLNGFCIPRTWVCDGENDCKDFSDETHCNRTTCTDEHFTCNDGYCISLAFRCDGEHDCNDN 334
            |:|.|.||:||...|.|||:|||.|.||| .|::..|:|:.|.|.||.||:..:.|||:.||.|.
Zfish   115 DEFHCQNGYCIRSLWYCDGDNDCGDNSDE-QCDKRKCSDKEFRCTDGSCIAEHWYCDGDSDCKDG 178

  Fly   335 SDELKCAA--VINSCPEGEFKCRGGLGGAGGPSGQCILNRFRCDGDNDCGDWSDEENC-PQKPSL 396
            :||..|.:  :..:|...||:|         ..|:|||:.:.||||:||||||||.:| ..:|  
Zfish   179 TDEENCPSDVMTATCSVEEFQC---------AYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQP-- 232

  Fly   397 CTSNEYKCADGTCIPKRWKCDKEQDCDGGEDENDCGSLGSEHPLTCGSDEFTCNNGRCILKTWLC 461
            |.|.|:.|:.|.||...|:||.|.|||...||.:|.:      ..|.:|:|.|.:|||:..:|.|
Zfish   233 CRSAEFMCSSGMCINAGWRCDGEFDCDDQSDEKNCST------SMCMADQFRCMSGRCVRLSWRC 291

  Fly   462 DGYPDCAAGEDEVECHL----QCDLGQFLCPTKQNLTNLKICVHQKHICDGHNECPAGEDE---A 519
            ||..||:.|.||..|..    .|...||||...:       |:.|:.:|:...:|..|.||   .
Zfish   292 DGEDDCSDGSDEEGCEKTETPPCAPDQFLCGNGR-------CIGQRKVCNDVKDCEDGTDEHPHQ 349

  Fly   520 DC---PKERKCS-EPSPCEQLCIETTAGSNECACRLGYVMDKNKVNCTDIDECQYLTSPVCSQKC 580
            ||   ..:..|: ....|.|.| :.:.|..:|.|..||.:..:...|.|:|||  .....|||.|
Zfish   350 DCRSKSSDENCNVNNGGCSQKC-QMSRGLVQCTCHTGYTLTADGKTCRDVDEC--ADDGYCSQGC 411

  Fly   581 HNTMGSFKCSCETGYILRPDLRSCKALGGAMTLLVANRWDIRRVTLSNNRYSAIVKGLHNAIALD 645
            .|..|.|:|.|..||.||||.|||||||....||.|||.|||:|....:.|:.::..|.||||||
Zfish   412 TNIEGGFQCWCVQGYELRPDKRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLSNLENAIALD 476

  Fly   646 FHHRKGLMFWSDVSTDVIKMVYMNGTRVRDVIKWGLESPGGIAVDWIHDLLFWTDSGTRRVEVSN 710
            |||.:.|:|||||:.|.|....:||:.|.:|:..|||||||:|:||||:.|:||||||.|:||||
Zfish   477 FHHSQELVFWSDVTLDRIMRASLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAIDWIHNKLYWTDSGTSRIEVSN 541

  Fly   711 FQGNLRTVIASYDLDKPRAIVVHPGEALAFWSDWGPNPKIERAYMDGTQRKVIISKGVTWPNGLA 775
            ..|..|.|:....::|||||.:||.|...:|:|||..|:||.|.|||:.||:|....:.|||||.
Zfish   542 LDGTHRKVLLWQRMEKPRAIALHPIEGKIYWTDWGNMPRIEYANMDGSNRKIIADTHLFWPNGLT 606

  Fly   776 IDFPNSKIYWADAKQHAIECSNLDGSDRNKILSTHLPHPFALTLFEDTMYWTDWNTKTVSAADKI 840
            ||:.:.::||.|||.|.||.::|||.:|..::|..||||||:|:|||::|||||:||::::|:|.
Zfish   607 IDYASHRMYWVDAKHHVIERADLDGKNRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKF 671

  Fly   841 TGKEFRAVHENFHFPMDIHAYHPARQPEYA-DRCQKDRRGLRGGCSHLCLPNKTSRRCGCPIGLS 904
            |||....:....|||||||..||.|||... :||..:    .|||||||||:..:..|.||.|..
Zfish   672 TGKNQEVIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGGINRCGSN----NGGCSHLCLPSNKTYTCVCPTGFR 732

  Fly   905 LKEDGKTCKSTADKLVLVARRKDIRLRHLRDNQADPNDVDMIVPLDNLKHAVALDWCS-DTD-FI 967
             |.|...|..:.||.:|.|||.|||    |.:......:|.::||.::::||||||.| |:: ||
Zfish   733 -KLDQHNCAQSLDKFLLFARRTDIR----RISFDTTEQLDAVIPLADVRNAVALDWDSLDSESFI 792

  Fly   968 YWTDVERSTINKAHLNGSYQQRVVHSNLVSPVGLALDWITDKLYWTDPSTNRIEVATTNGKMRTL 1032
            |||||...:||:|..:||.|:.||.::|.||.|||:||:|.||||||..|:||||:.|:|.|||:
Zfish   793 YWTDVTTDSINRALWDGSKQEVVVDTSLESPAGLAIDWLTHKLYWTDAGTDRIEVSNTDGSMRTV 857

  Fly  1033 LIWEKLYKPRDIVVNPIEGFMFWSDWGDDPMIERANMDGHERVTITSKKLIYPNGLAIDYEKSKI 1097
            ||||.|.:||||||:||.|||:|:|||.:|.||||.||...|..|.|..|.:||||||||...::
Zfish   858 LIWENLDRPRDIVVDPIGGFMYWTDWGANPKIERAGMDAWNRTVIISSNLTWPNGLAIDYSTERL 922

  Fly  1098 YFVDGGTKTLENMNFDGSGRQVILNG-LGHPFGLDVNEGRVFWTDWDTKSVMSANKLTGKDTNVI 1161
            |:.|...||:|..|||||||||::.. |.|||||.::|.|::||||.:||:.||:||||.|...:
Zfish   923 YWADASVKTIEYGNFDGSGRQVLIGSQLPHPFGLTLHEDRIYWTDWQSKSIQSADKLTGLDRKTL 987

  Fly  1162 IANSTDLMDIRVFHRTRRRIFNACDKLNGGCSHLCLLNPT--SYTCACTVGVQLKEDRHTCSEGP 1224
            ..|..:||||.:||..|.::...|...||||||||||.|.  |::|||..|:.|:.|..||:...
Zfish   988 AENLENLMDIHMFHNHRTKVQTGCLVNNGGCSHLCLLAPAPKSWSCACPTGINLQADGKTCAHAM 1052

  Fly  1225 TQYILFAHRIDIRQISLDFDHLIDVVLPL-PPISNAVALDVDRKTGYIYWSDTIENVIMSSSPDG 1288
            ..:::||.|.|||.||||..:..||||.: ..:.|.:|:.||...|.:||||:....|..|:.:|
Zfish  1053 NSFLVFARRTDIRMISLDIPYFADVVLAVNTSMKNTIAIGVDPIEGKVYWSDSTLKKISRSNING 1117

  Fly  1289 LHVQKIVGDSLENPDGLVVDSIGRTIYWADAGRHTIEVASLDGSNRHVIAYKDLESPRGLALDYE 1353
            ...:.|:...|...|||.|||:||.|||.|.|.:.||||:|:||.|.|:.:::|:|||.:||.:|
Zfish  1118 TEHEDIISTGLMTTDGLAVDSVGRKIYWTDTGTNRIEVANLNGSMRKVLVWQNLDSPRAIALYHE 1182

  Fly  1354 AGLLFWTDWGHYRKIERSHLDGNERSRIVTANLGWPNGLSLDLKSKRIYWVDARLKTIDSCDYTG 1418
            .|.::|||||.:.|:|||.:||::|..::..||||||||::|....::.|.||..:.|::.|..|
Zfish  1183 MGYMYWTDWGEHAKLERSSMDGSDRVVLINNNLGWPNGLAVDKAGSQLLWADAHTERIEASDLNG 1247

  Fly  1419 NQRKLIMSSLHHPYALALSDDNIYWTDWKSKALHMTERRNISAKRDIITNIDGLMDIKIIYQNQN 1483
            :.|:.::|.:.|||.|.:...::|||||:|:::|..::........|.:::.|||||:.:  ::.
Zfish  1248 SNRRTLVSPVQHPYGLTVLGSHMYWTDWQSRSIHRADKNTGENAIIIRSSLPGLMDIQAV--DRT 1310

  Fly  1484 QSTMKNACGNNNGNCSHLCLRNPSGYSCQCPIGLRLRQNSTTQCQNLPEDYLLIALRSGIGMISL 1548
            .|...|.||..||.||||||...:|.||.||.|:.|:.:..: |::|||.|||.:.|..:..|||
Zfish  1311 ASAGLNKCGRRNGGCSHLCLPRLNGTSCACPTGVLLKADGRS-CEDLPETYLLFSNRVSVRRISL 1374

  Fly  1549 NSGDFMDVVLPINGVHGAVVLDYHYRKNLLFFADVNLDVIRRVNLLNLTESKVIVGTDVLTPNGI 1613
            ::.|..||.:|:..:...:.|||...:..|::.||:|||||||| |:.::.:.::.:.:.|.:|:
Zfish  1375 DTHDHTDVFVPVAELQNVISLDYDSVERKLYYTDVSLDVIRRVN-LDGSDMETVISSGLKTTDGL 1438

  Fly  1614 AVDWIADNLYWSDTDRKLIEVSRLDGSCRKRIVEDNLGDPRSLIVHPKKAYLFWSDWSSPAKIER 1678
            ||||:|.|:||:||.|..|||:.|||:.||.:|.::|.:||::.|.|.|.:|||:||...|||||
Zfish  1439 AVDWVARNMYWTDTGRNTIEVAHLDGTSRKVLVNNSLDEPRAIAVFPSKGFLFWTDWGHIAKIER 1503

  Fly  1679 SYLDGSNRTVIITSGIGFPTGLTIDFTNRRLLWADALEDNIGQVDFNGKRRQTIVPYAPHPFGLT 1743
            ::|||::|.|:|.:.:|:|.|||:|:..||:.|.||..|.|...|.|||.||.::....|||.||
Zfish  1504 AFLDGTDRKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIFWVDAHLDRIESSDLNGKLRQILISPVSHPFALT 1568

  Fly  1744 LF----------------ENSIFWTDWYNKSVYRSQKLARSGYGNPFEVRDALSGALDIRAVSLS 1792
            ..                |..|:||||..||:.|..|  .:|.... .|...:.|.:||..||..
Zfish  1569 QLKPVYSPLTPFSRISQQERWIYWTDWQTKSIQRVDK--HTGRSKE-TVLANVEGLMDIIVVSPQ 1630

  Fly  1793 RQPKSVNHCAQDNGGCTHLCLNRNVDYVCACPDVMDPKDVACSIKPKVLVH--ANLENDQLLEYS 1855
            || ...||||.:|||||||||.|:..::|||||..|.:  .||   .:..|  |:.|.|      
Zfish  1631 RQ-SGTNHCAANNGGCTHLCLARSNSFICACPDEADSR--PCS---TIAGHVPASPEKD------ 1683

  Fly  1856 DESTDDSTPPELLGESNDHG-----------------DDGHTKKSDQEREFFVLVALGVVIVMVV 1903
              :|...||.:...|....|                 .:........|......|..|.:.::.:
Zfish  1684 --TTGTQTPRKQATEKPHQGLSLVNCTEMNLSLEDCFQNSVISAPRDESPHISYVIGGALSILAI 1746

  Fly  1904 IIILVIFMLAFNTSKKKNKRNSRGSSRSVLTFSNPNYNVD------GTPMEPKTNIWKRFKYDKT 1962
            :|::..|::   ...||.|....|.|.  ||:|||:|...      .|..:|..|...|:|    
Zfish  1747 LILIAAFII---YRHKKFKFADPGVSN--LTYSNPSYRTSTQEVKIETAQKPAINSQLRYK---- 1802

  Fly  1963 HQERAGVYE 1971
             :|..||.:
Zfish  1803 -KEVQGVVD 1810

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Lrp4NP_727914.1 LDLa 267..301 CDD:238060 19/33 (58%)
LDLa 306..340 CDD:238060 16/33 (48%)
LDLa 347..390 CDD:238060 20/42 (48%)
LDLa 397..431 CDD:238060 16/33 (48%)
LDLa 442..476 CDD:238060 16/33 (48%)
LDLa 480..521 CDD:238060 12/43 (28%)
FXa_inhibition 576..604 CDD:464251 16/27 (59%)
LY 634..671 CDD:214531 19/36 (53%)
LY 680..714 CDD:214531 24/33 (73%)
LY 718..760 CDD:214531 20/41 (49%)
Ldl_recept_b 740..777 CDD:459654 19/36 (53%)
LY 761..803 CDD:214531 20/41 (49%)
LY 806..838 CDD:214531 18/31 (58%)
FXa_inhibition 882..912 CDD:464251 15/29 (52%)
LY 946..985 CDD:214531 20/40 (50%)
NHL <967..1142 CDD:302697 102/175 (58%)
LY 988..1030 CDD:214531 24/41 (59%)
NHL repeat 998..1037 CDD:271333 26/38 (68%)
NHL repeat 1038..1080 CDD:271333 25/41 (61%)
NHL repeat 1084..1119 CDD:271333 20/34 (59%)
FXa_inhibition 1185..1220 CDD:464251 19/36 (53%)
NHL 1260..>1445 CDD:302697 78/184 (42%)
NHL repeat 1260..1296 CDD:271320 12/35 (34%)
LY 1292..1334 CDD:214531 22/41 (54%)
NHL repeat 1302..1337 CDD:271320 21/34 (62%)
NHL repeat 1345..1383 CDD:271320 18/37 (49%)
FXa_inhibition <1499..1525 CDD:464251 12/25 (48%)
LY 1600..1640 CDD:214531 18/39 (46%)
LY 1643..1686 CDD:214531 21/42 (50%)
LY 1688..1729 CDD:214531 19/40 (48%)
FXa_inhibition 1801..>1825 CDD:464251 15/23 (65%)
lrp4XP_073763685.1 None

Return to query results.
Submit another query.