DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits

Protein Alignment Muc12Ea and Muc11A

DIOPT Version :9

Sequence 1:	NP_001368944.1	Gene:	Muc12Ea / 32384	FlyBaseID:	FBgn0052602	Length:	3321	Species:	Drosophila melanogaster
Sequence 2:	NP_001285150.1	Gene:	Muc11A / 32174	FlyBaseID:	FBgn0052656	Length:	1552	Species:	Drosophila melanogaster

Alignment Length:	1644	Identity:	516/1644 - (31%)
Similarity:	725/1644 - (44%)	Gaps:	329/1644 - (20%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

  Fly  1697 PTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPT----------DGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTE 1751
            |.:..:..||      ...||..|:..:          |.|.:.......|||.   |.:..||:
  Fly    77 PVKSAAEAPT------AAVAKMVTITDSPVVSESAPLVDSTNSGSGVEISTEGA---PASAVPTK 132

  Fly  1752 GTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGT-TAKPTTLKPTEGT--SAQPTTLKPTERTSAQPTTLK 1813
            .:....||..|.|      ||..|.|.| .|..||..|.|.|  |.:.||....|.|:.....|:
  Fly   133 PSIPVETTQAPVE------TTQIPLETTQVAVETTQIPLETTQASGETTTAAIEETTTGSEAPLE 191

  Fly  1814 PTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKP-TEGT--TAKPTTLKPTEGTSAKP-TTLKPTEGTTAKP 1874
            | |.|....||  |.:      :||.| .|||  |.:|.|  |.|..:|.. |||.|.|.....|
  Fly   192 P-ESTVPSDTT--PVD------STLAPGWEGTYPTIEPNT--PAEDPNAPAGTTLAPGEVDPNSP 245

  Fly  1875 ----TTLKPT--EGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTE 1933
                :.|.|.  |.::.:|..:.||          .|.|.|||..:   |.||:||.|.|  |.:
  Fly   246 IDPNSPLDPNAPEESTNEPGLVDPT----------LPADTTTAPDS---PVEGSSAAPGT--PAD 295

  Fly  1934 GTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSANAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 1998
            .|||.|..  |.:|:||.|.:  |.:|::|.|.:                 |.:.|||.|..  |
  Fly   296 VTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PADGSSAAPGS-----------------PADVTTAAPGA--P 337

  Fly  1999 TKGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2063
            ..|:||.|..  |.:|::|.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|.:               |
  Fly   338 ADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS---------------P 381

  Fly  2064 TEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2128
            .||:||.|..  |.:.|||.|..  |.:|:||.|..               |.:|:||.|.:  |
  Fly   382 AEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA---------------PADGSSAAPGS--P 425

  Fly  2129 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTSLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTSAKPTTLKP 2193
            .:.|||.|..  |.:|:||.|.|  |.||::|.|..  |.:.|||.|..  |.||:||.|..  |
  Fly   426 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--P 480

  Fly  2194 TEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2258
            .:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |
  Fly   481 ADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 535

  Fly  2259 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2323
            .:|:||.|.:  |.|.::|.|.:  |.:.|:|.|..  |.:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |
  Fly   536 ADGSSAAPGS--PAEESSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--P 590

  Fly  2324 TDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKP 2388
            .|.|||.|..  |.:|:||.|.:  |.||::|.|..  |.:.|:|.|..  |.||::|.|..  |
  Fly   591 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--P 645

  Fly  2389 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2453
            .:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |
  Fly   646 ADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 700

  Fly  2454 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2518
            .:|:||.|.:  |.||::|.|.:  |.|.|||.|..  |.:|:||.|..               |
  Fly   701 ADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA---------------P 744

  Fly  2519 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTERTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2583
            .:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|:|.|..  |.:|::|.|.:  |
  Fly   745 ADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--P 799

  Fly  2584 TEGTSAQPTTLKPTERTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTKGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2648
            .||:||.|.:  |.:.|:|.|..  |.:|::|.|..  |..|:||.|.:  |.:.|||.|..  |
  Fly   800 AEGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 854

  Fly  2649 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2713
            .:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.||::|.|.:  |.:.|:|.|..  |
  Fly   855 ADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 909

  Fly  2714 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2778
            .:|::|.|.:  |.||:||.|..  |.:.|||.|..  |.:|:||.|..  |.:|::|.|.:  |
  Fly   910 ADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--P 964

  Fly  2779 TDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2843
            .|.|||.|..  |.:|:||.|..  |.:.|||.|..  |.:|::|.|.:  |.||:||.|..  |
  Fly   965 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--P 1019

  Fly  2844 TEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2908
            .:.|||.|..  |.:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|.:  |
  Fly  1020 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--P 1074

  Fly  2909 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2973
            .:.|||.|..  |.:|:||.|.:  |.||:        |..|.|...:.: |..|..|....  |
  Fly  1075 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGS--------PPAGGSPAGSNV-PAGGDPADSNV--P 1124

  Fly  2974 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 3038
            ..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |
  Fly  1125 AGGAPADSNV--PAGGAPADSNV--PAGGAPADSNV--PAGGAPADANV--PAGGAPADSNV--P 1179

  Fly  3039 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQ---PTTLKPTDGTT---AK 3097
            ..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |..|..|.   |....|.|...   ..
  Fly  1180 GGGAPADANV--PAGGAPADSNV--PAGGAPAGSNV--PAGGAPADSNVPAGGAPADSNVPAGGA 1238

  Fly  3098 PTTLKPTEGTSAKPTTL--KPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTDGTTAKPTTLKP----T 3156
            |.......|:|...:.|  .|..|:......:.| .|..:.|  ..|.......|.|.:|    .
  Fly  1239 PAGSNVPAGSSPGSSVLGPNPPAGSVVPSIPVLP-GGAGSWP--WHPRPNIPIVPPTWRPLLPGQ 1300

  Fly  3157 EGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP------TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKP 3215
            .|:.|..:.|  ..|....|....|      :...:.:||  ||...|.|......|.:
  Fly  1301 NGSGAPGSGL--INGIVNPPQRPHPFWPNWQSWVNSWRPT--KPVPSTEAPVQPQNPQQ------ 1355

  Fly  3216 TTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTPER 3280
             ...|.:..::.|.|.:..|.....|....|....:|   :::.:...:::.:..||..|   |.
  Fly  1356 -PQNPQQPGNSNPETAESVEQAAPVPPANVPASNENA---SVEDSNKASSEKSKDKPKSG---ED 1413

  Fly  3281 TSQKTTTLKPTSEKTTTES 3299
            .|::....||:||:...:|
  Fly  1414 QSKEQEQKKPSSEEKEKDS 1432

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Muc12Ea	NP_001368944.1	PHA03247	<175..670	CDD:223021
		PHA03247	<659..1197	CDD:223021
		PHA03247	<1049..1651	CDD:223021
		PHA03247	<1723..2186	CDD:223021	154/485 (32%)
		PHA03247	<2110..2706	CDD:223021	217/595 (36%)
Muc11A	NP_001285150.1	PRK07764	<366..816	CDD:236090	202/570 (35%)
		PRK07764	<696..1109	CDD:236090	182/507 (36%)
		CBM_14	1495..1547	CDD:279884
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	0	0.000	Not matched by this tool.
Domainoid	0	0.000	Not matched by this tool.
eggNOG	0	0.000	Not matched by this tool.
Homologene	0	0.000	Not matched by this tool.
Inparanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
Isobase	0	0.000	Not matched by this tool.
OMA	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoDB	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoFinder	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoInspector	1	1.000	-	-		mtm6373
orthoMCL	0	0.000	Not matched by this tool.
Panther	0	0.000	Not matched by this tool.
Phylome	1	0.910	-	-
RoundUp	0	0.000	Not matched by this tool.
SonicParanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
	2	1.910