DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Muc12Ea and Muc68E

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001368944.1 Gene:Muc12Ea / 32384 FlyBaseID:FBgn0052602 Length:3321 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_996064.1 Gene:Muc68E / 2768990 FlyBaseID:FBgn0053265 Length:1799 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1693 Identity:545/1693 - (32%)
Similarity:777/1693 - (45%) Gaps:247/1693 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1679 PTTLK--PTEGTSAQPTTLKPTEG--TSAKPTTLKPTEGTT-AKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTE 1738
            ||.:|  |.|..:.:    |.:.|  |:.:..|..|.|.|| |:.||..|...||.:..|.    
  Fly   113 PTKIKSLPVEVENDR----KDSSGIDTTVEDLTPIPEETTTVAQETTYDPEGSTTREDDTT---- 169

  Fly  1739 GTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTE 1803
             .:.:.||.||.:.||.:.:|..|.|.|            |.|:.||..| ||:    ||.:...
  Fly   170 -VAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEEST------------TVAQETTYDP-EGS----TTREDDT 216

  Fly  1804 RTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTS-AQPTTLKPTEGTTAK--PTTLKPTEGTSAKPTTLK 1865
            ..:.:.||.||.:.||.:.:|..|.|.|: ||.||..| ||:|.:  .||:      :.:.||.|
  Fly   217 TVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDP-EGSTTRDDETTV------AIETTTEK 274

  Fly  1866 PTEGTTAKPTTLKPTEGTS-AKPTTLKPTEGTTAK---------PTTLKPTDGTTAKPTTLKPTE 1920
            |.:.||.:.:|..|.|.|: |:.||..| ||:|.:         .||.||.|.||.:.:|..|.|
  Fly   275 PEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDP-EGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEE 338

  Fly  1921 GTS-AKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSANAQPTTLK 1984
            .|: |:.||..|...||.:..|.     .:.:.||.||.:.||.:.:|..|.|.|:. ||.||..
  Fly   339 STTVAQETTYDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTV-AQETTYD 397

  Fly  1985 PTEGTTAKPTTLKPTKGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTT-AKPTTLKPTEGTSAK---- 2044
            |...||.:..|.     .:.:.||.||.:.||.:.:|..|.|.|| |:.||..| ||::.:    
  Fly   398 PEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDP-EGSTTREDDT 456

  Fly  2045 -----PTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTS-AQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPT 2103
                 .||.||.:.||.:.:|..|.|.|: ||.||..|...||.:..|.     .:.:.||.||.
  Fly   457 TVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPE 516

  Fly  2104 EGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAK--PTTLKPTEGTSAKPTSLKPTEGTTAKPTTLK 2166
            :.|||:.:|..|.|.|:....|....||:|.:  .||:      :.:.|:.||.:.|||:.:|..
  Fly   517 DDTTAEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTV------AIETTTEKPEDDTTAEDSTPI 575

  Fly  2167 PTEGTT-AKPTTLKPTDGTSAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTL 2230
            |.|.|| |:.||..|...|:.:..|.     .:.:.||.|..:.||.:.:|..|.|.||.     
  Fly   576 PEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKREDDTTVEDSTPIPEESTTV----- 630

  Fly  2231 KPTEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTS-AKPTT 2294
                   ||.||..|...||.:..|.     .:.:.||.||.:.|||:.:|..|.|.|: |:.||
  Fly   631 -------AQDTTNDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQETT 683

  Fly  2295 LKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTS-AKPTTLKPTEGTTAKPT 2358
            ..|...||.:..|.     .:.:.||.||.|.||.:.:|..|.|.|: |:.||..|...||.:..
  Fly   684 YDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDD 743

  Fly  2359 TLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAK--PTTLKPTEGTSAK 2421
            |.     .:.:.||.||.|.|||:.:|..|.|.|:....|....||:|.:  .||:      :.:
  Fly   744 TT-----VAIETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTV------AIE 797

  Fly  2422 PTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTA--KPTTLKPTDGTT 2484
            .||.|..:.|:.:.:|..|.|.||....|....||::.:      .|.||.  :.||.||.|.||
  Fly   798 TTTEKREDDTTVEDSTPIPEETTTVGQETTYDPEGSTTR------EEDTTVAIETTTEKPEDDTT 856

  Fly  2485 AKPTTLKPTEGTS-AKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGT 2548
            |:.:|..|.|.|: |:.||..|...||.:..|.     .:.:.||.|..:.||.:.:|..|.|.|
  Fly   857 AEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTT-----VAMETTTEKREDDTTVEDSTPIPEEST 916

  Fly  2549 S-AQPTTLKPTERTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTERTS-AQPTTLKPTE 2611
            : ||.||..|...|:.:..|....|.||.     ||.:.|:.:.:|..|.|.|: .|.||..|..
  Fly   917 TVAQDTTNDPEGSTTREEDTTVAIETTTE-----KPEDDTTVEDSTPIPEETTTVGQETTYDPEG 976

  Fly  2612 GTTAKPTTLKPTKGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTE 2676
            .||.:..|.     .:...||.||.:.||.:.:|..|.|.||....|....||:    ||.:...
  Fly   977 STTREDDTT-----VAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGS----TTREDDT 1032

  Fly  2677 GTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTS-AKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPT 2740
            ......||.||.|.||.:.:|..|.|.|: |:.||..|...||.:..|.     .:.:.||.||.
  Fly  1033 TVAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTIAQETTYDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPE 1092

  Fly  2741 EGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAK---------PTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTS 2796
            :.||.:.:|..|.|.|:....|....||:|.:         .||.||.|.||.:.:|..|.|.|:
  Fly  1093 DDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTT 1157

  Fly  2797 AKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTA--KPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTT-AKPTTLKPTE 2858
            ....|....||:|.:      .|.||.  :.||.||.:.|:.:.:|..|.|.|| .:.||..|..
  Fly  1158 VAQDTTNDPEGSTTR------EEDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEETTTVGQETTYDPEG 1216

  Fly  2859 GTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAK--PTTLKP 2921
            .||.:..|.     .:...||.||.:.||.:.:|..|.|.|:....|....||:|.:  .||:  
  Fly  1217 STTREDDTT-----VAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTV-- 1274

  Fly  2922 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAK--PTTLKPTEGTSAKPTTL 2984
                :...||.||.:.||.:.:|..|.|.|:....|....||:|.:  .||:      :...||.
  Fly  1275 ----AIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTV------AIDTTTE 1329

  Fly  2985 KPTEGTTAKPTTLKPTEGTT-AKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTT 3048
            ||.:.||.:.:|..|.|.|| |:.||..|...||.:..|.     .:.:.||.||.:.||.:.:|
  Fly  1330 KPEDDTTVEDSTPIPEESTTIAQETTYDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPEDDTTVEDST 1389

  Fly  3049 LKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAK--PTTLKPTEGTSAQPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTS-AK 3110
            ..|.|.|:....|....||:|.:  .||:      :.:.||.||.|.||.:.:|..|.|.|: .:
  Fly  1390 PIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREEDTTV------AIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEETTTVGQ 1448

  Fly  3111 PTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTS-AKPTTLKPTEGTTA 3174
            .||..|...||.:..|.     .:.:.||.||.|.||.:.:|..|.|.|: |:.||..|...||.
  Fly  1449 ETTYDPEGSTTREDDTT-----VAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEETTTVAQETTYDPEGSTTR 1508

  Fly  3175 KPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTA 3239
            ..||:      ..:.||.||.:.|:|:.:|..|...||....| ...|.::...||..|.|.||.
  Fly  1509 DDTTV------AIETTTEKPEDDTTAEGSTPIPDTSTTVNQDT-TTDESSTVVTTTNIPKESTTL 1566

  Fly  3240 KPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTPERTSQKTTTLKPTSE---KTTTESLP 3301
            ..:||.|.|.::|         |..:..|||.....::|..:|.::|||:|:|.   :|||.|||
  Fly  1567 GDSTLSPGENSTA---------GQVSTSTTLVYDTTSSPIPSSSRSTTLEPSSSSSPETTTSSLP 1622

  Fly  3302 PFN 3304
            |.:
  Fly  1623 PLS 1625

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc12EaNP_001368944.1 PHA03247 <175..670 CDD:223021
PHA03247 <659..1197 CDD:223021
PHA03247 <1049..1651 CDD:223021
PHA03247 <1723..2186 CDD:223021 164/490 (33%)
PHA03247 <2110..2706 CDD:223021 193/608 (32%)
Muc68ENP_996064.1 ChtBD2 <1761..1791 CDD:214696
ChtBD2 1626..1668 CDD:214696 545/1693 (32%)
ChtBD2 1688..1734 CDD:214696
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
10.910

Return to query results.
Submit another query.