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Protein Alignment Muc12Ea and Y46B2A.3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001368944.1 Gene:Muc12Ea / 32384 FlyBaseID:FBgn0052602 Length:3321 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_493835.1 Gene:Y46B2A.3 / 189942 WormBaseID:WBGene00021578 Length:1145 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:920 Identity:307/920 - (33%)
Similarity:396/920 - (43%) Gaps:134/920 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   419 EGTSAKPTTLK---------PTAGTTAKPTTLK---PTEGTSAKPT----TLKP---TEGTTAKP 464
            |..|.||..:.         .|.|||.....:|   .|.|.:.:||    |::.   |.|.|..|
 Worm   156 ESQSDKPNNVNMVCCSPWKVSTRGTTNTNRNIKAHETTRGFTQRPTAAGWTIRANGITRGQTRVP 220

  Fly   465 -TTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTEGTTAK 528
             ||.:||.    :|||...|.|  |..||...:.|.|.:|||.....|  |..||...:.|.|.:
 Worm   221 GTTREPTH----RPTTAGWTNG--ANGTTRDTSRGFTQRPTTAGWRNG--ANGTTRDTSRGFTQR 277

  Fly   529 PTTLKPTEGTSAQPTTLKPTKGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAK 593
            |||.....|  |..||:..::..|.:|||...|.|  |..||:..:.|.|.:|||...|.|  |.
 Worm   278 PTTAGWRNG--ANGTTIDTSREFTQRPTTAGWTNG--ANGTTIDTSRGFTQRPTTAGWTNG--AN 336

  Fly   594 PTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTKGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAK 658
            .||:..:.|.|.:|||...|.|  |..||:..::..|.:|||...|.|  |..||:..:.|.|.:
 Worm   337 GTTIDTSRGPTHRPTTAGWTNG--ANGTTIDTSREFTQRPTTAGWTNG--ANGTTIDTSRGPTHR 397

  Fly   659 PTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKLTEGTSAK 723
            |||.....|  |..||...:.|.|.:|||.....|  |..||:..:...|.:|||...|.|  |.
 Worm   398 PTTAGWRNG--ANGTTRDTSRGFTQRPTTAGWRNG--ANGTTIDTSREFTQRPTTAGWTNG--AN 456

  Fly   724 PTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTKGTTAK 788
            .||:..:.|.|.:|||...|.|  |..||...:.|.|.:||....|.|  |..||:..::|.|.:
 Worm   457 GTTIDTSRGFTQRPTTAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQRPTIAGWTNG--ANGTTIDTSRGFTQR 517

  Fly   789 PTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAK 853
            |||...|.|  |..||...:.|.|.:||....|.|.:.      .|.|.|..|.|   |.|.|.:
 Worm   518 PTTAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQRPTIAGWTNGANG------ITRGQTRVPGT---TRGPTHR 571

  Fly   854 PTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAK 918
            |||...|:|  |..||...:.|.:.:|||...|.|  |..||...:.|.|.:||....|:|  |.
 Worm   572 PTTAGWTNG--ANGTTRDTSRGFTQRPTTAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQRPTIAGWTNG--AN 630

  Fly   919 PTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAKSTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAK 983
            .||:..:.|.:.:|||...|:|  |..||...:.|.:.:||....|.|  |..||...:.|.|.:
 Worm   631 GTTIDTSRGFTQRPTTAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQRPTIAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQR 691

  Fly   984 PTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAK 1048
            |||...|.|  |..||...:.|.|.:|||...|.|.:.      .|.|||.         |.|.:
 Worm   692 PTTAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQRPTTAGWTNGANG------TTSGTSR---------GFTQR 739

  Fly  1049 PTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAK 1113
            ||....|.|.:.      .|.|.|..|.|                |.|.|.:|||...|.|  |.
 Worm   740 PTIAGWTNGANG------ITRGQTRVPGT----------------TRGPTHRPTTAGWTNG--AN 780

  Fly  1114 PTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAK 1178
            .||...:.|.|.:|||...|.|  |..||...:.|.|.:||....|.|  |..||...:.|.:.:
 Worm   781 GTTRDTSRGFTQRPTTAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQRPTIAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQR 841

  Fly  1179 PTTLKPTEGTTAKPTTLNQLRERVPSQHFEPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTKGTTAKS 1243
            ||    ..|.|.:...:.:.:.|||.    .|.|.|.:|||...|.|  |..||...::|.|.:.
 Worm   842 PT----AAGWTIRANGITRGQTRVPG----TTRGPTHRPTTAGWTNG--ANGTTRDTSRGFTRRP 896

  Fly  1244 TTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKP 1308
            ||...|.|  |..||...:.|.|.:||....|.|  |..||...:.|...:||....|.|...  
 Worm   897 TTAGWTNG--ANGTTSGTSRGFTQRPTAAGWTNG--ANGTTSGTSRGFAQRPTAAGWTNGANG-- 955

  Fly  1309 TTLKPTEGTS 1318
                .|.|||
 Worm   956 ----TTSGTS 961

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc12EaNP_001368944.1 PHA03247 <175..670 CDD:223021 92/270 (34%)
PHA03247 <659..1197 CDD:223021 178/537 (33%)
PHA03247 <1049..1651 CDD:223021 85/270 (31%)
PHA03247 <1723..2186 CDD:223021
PHA03247 <2110..2706 CDD:223021
DUF5585 2574..2944 CDD:465521
DUF5585 2938..3278 CDD:465521
Y46B2A.3NP_493835.1 VMO-I 34..170 CDD:452732 4/13 (31%)
FhaB <285..965 CDD:442443 263/783 (34%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

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