DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Prp16 and DHX38

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_572947.1 Gene:Prp16 / 32373 FlyBaseID:FBgn0026713 Length:1222 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_054722.2 Gene:DHX38 / 9785 HGNCID:17211 Length:1227 Species:Homo sapiens


Alignment Length:1268 Identity:772/1268 - (60%)
Similarity:953/1268 - (75%) Gaps:87/1268 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSD-DDESGVHRLEGTAGQETRGGLVIRKPKDAGAGGGGGFK--VPQGSMLGLDKLAAKRRAEKE 62
            |.| .:::.:||||||......|||:. |.|.| |.....||  .|:.|:||||.||:.:|.|:|
Human     1 MGDTSEDASIHRLEGTDLDCQVGGLIC-KSKSA-ASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRRERE 63

  Fly    63 --------RSERLISFKDSEFDDTGGGSSTPQANASGASSEFAFKKPDTKSFEKLRGQLREHKDD 119
                    :..::.|:||.|      .|...|.:|.....:.|     .::..|.| ..|..:.:
Human    64 EKDDGEDKKKSKVSSYKDWE------ESKDDQKDAEEEGGDQA-----GQNIRKDR-HYRSARVE 116

  Fly   120 TPSHTGGVSEKARERLREHIQRDRKRGPVSSTAAEGRDRDRDWDRDRRRDRDRDRDRDRDRRQHR 184
            ||||.|||||:..||.|:..:..|:.|..:|:..|     :||.:::.||||.||.||||     
Human   117 TPSHPGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEE-----KDWKKEKSRDRDYDRKRDRD----- 171

  Fly   185 ERERDRHRS-WDRDRGRDRDRDRSMSERSVHTPREPGTPGGSSGGISNSSWDDEDGEFG-QRKSD 247
            ||:|.||.| .:||.|.:|...|:..|...|.|::..||       |.|:|::||..:| .|:|.
Human   172 ERDRSRHSSRSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATP-------SRSTWEEEDSGYGSSRRSQ 229

  Fly   248 WDMPTP--------RRH--GNKSGDWSVRSGGSRRNHGRQDDTVRPTPAHRYNQWAHGRKRSGAT 302
            |:.|:|        |.|  ..:..|.|||...|       |||..|||:::||:||..|:..|:|
Human   230 WESPSPTPSYRDSERSHRLSTRDRDRSVRGKYS-------DDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGST 287

  Fly   303 P----------WGEDPESLDL------WEEEQRRLDREWYNIDEGYDDENNPFGGPNSEYFRKRE 351
            |          .||:..|.|.      ||::||:.||:||.:|||||:.:||....:.:|.|:||
Human   288 PRLSRGRGRREEGEEGISFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRRE 352

  Fly   352 EQLEQKRTKRISAQQRQNNRDNELWERNRMLTSGVVTLISVNDDFDEEALERVHLLVHHIIPPFL 416
            :.|.:::.||||||:||.|.|||.||.|||||||||..:.|::||:|:...:|||:||:::||||
Human   353 QHLHKQKQKRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFL 417

  Fly   417 DGRIVFTKQPEPVVPVKDPTSDMALLARKGSALVRNYREQKERRKAQKKHWELSGTKLGNIMGVQ 481
            |||||||||||||:||||.|||:|::|||||..||.:||||||:|||.|||||:|||||:||||:
Human   418 DGRIVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMGVK 482

  Fly   482 RPQDEDDMRFDKEKDKADYRKDQKFADHMRDQDTGGKSDFSRKKTISEQRRFLPVFASRQELLNV 546
            :.::.|  :...|..|.|||.:|||||||: :.:...|:|::||:|.|||::||:||.:||||.:
Human   483 KEEEPD--KAVTEDGKVDYRTEQKFADHMK-RKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTI 544

  Fly   547 IRENSVIIIVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYSKRGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSDEMDTQLGEDV 611
            ||:||::|:|||||||||||||||||||||:..|||||||||||||||||||||:||...|||:|
Human   545 IRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEV 609

  Fly   612 GYAIRFEDCTSERTVIKYMTDGILLRESLRDPELDSYSAIIMDEAHERSLSTDVLFGLLREIVAR 676
            ||||||||||||.|:|||||||||||||||:.:||.||||||||||||||:||||||||||:|||
Human   610 GYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVAR 674

  Fly   677 RHDLKLIVTSATMDSSKFATFFGNVPTFTIPGRTFPVDVMFSKNTCEDYVESAVKQALQVHLTPN 741
            |.||||||||||||:.|||.||||||.|.|||||||||::|||...|||||:||||:|||||:..
Human   675 RSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGA 739

  Fly   742 EGDMLIFMPGQEDIEVTCEVLEERLAEIDNAPALSILPIYSQLPSDLQAKIFQKSSDGLRKCVVA 806
            .||:|||||||||||||.:.:.|.|.|::|||||::||||||||||||||||||:.||:|||:||
Human   740 PGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVA 804

  Fly   807 TNIAETSLTVDGIIYVIDSGYCKLKVYNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQAYRLY 871
            |||||||||||||::|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||
Human   805 TNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLY 869

  Fly   872 TQRQYKDELLALTVPEIQRTNLANTVLLLKSLGVVDLLQFHFMDPPPQDNILNSLYQLWILGALD 936
            ||..||:|||..||||||||||||.|||||||||.||||||||||||:||:|||:||||||||||
Human   870 TQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALD 934

  Fly   937 HTGALTTLGRQMAEFPLDPPQCQMLIVACRMGCSAEVLIIVSMLSVPSIFYRPKGREDEADGVRE 1001
            :||.||:.||.|.||||||...:||||:|.||||:|:|:||||||||:|||||||||:|:|.:||
Human   935 NTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIRE 999

  Fly  1002 KFQRPESDHLTYLNVYQQWRQNNYSSTWCNEHFIHIKAMRKVREVRQQLKDIMTQQNLSVISCGI 1066
            ||..||||||||||||.||:.||||:.|||:||||.||||||||||.||||||.||.:|:.|||.
Human  1000 KFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGT 1064

  Fly  1067 DWDIVRKCICSAYFYQAARLKGIGEYVNLRTGMPCHLHPTSALYGLGTTPDYVVYHELIMTAKEY 1131
            ||||||||||:|||:|||:|||||||||:||||||||||||:|:|:|.||||:|||||:||.|||
Human  1065 DWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEY 1129

  Fly  1132 MQCATAVDGYWLAELGPMFFSVKESGRSGREKKKQAAEHLKEMEEQMLKAQHEMEERKQQAAERE 1196
            |||.|||||.|||||||||:|||::|:|.:|.:::|.|....|||:|..|:.::..|:|:..:|.
Human  1130 MQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRS 1194

  Fly  1197 EQLATKQ-EIATPGN------ATPRRTPARIGL 1222
            ...:.:. :|.|||.      .||||||||.||
Human  1195 PLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL 1227

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Prp16NP_572947.1 HrpA 534..>1148 CDD:441249 491/613 (80%)
DHX38NP_054722.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 60..320 95/295 (32%)
HrpA 532..>1146 CDD:441249 491/613 (80%)
DEAH box 652..655 2/2 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1155..1227 25/71 (35%)

Return to query results.
Submit another query.