DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Prp16 and Dhx38

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_572947.1 Gene:Prp16 / 32373 FlyBaseID:FBgn0026713 Length:1222 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_848467.1 Gene:Dhx38 / 64340 MGIID:1927617 Length:1228 Species:Mus musculus


Alignment Length:1262 Identity:770/1262 - (61%)
Similarity:954/1262 - (75%) Gaps:83/1262 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 DESGVHRLEGTAGQETRGGLVIRKPKDAGAGGGGGFK--VPQGSMLGLDKLAAKRRAEKE----- 62
            :::.:||||||:.....|||:. |.|.| |.....||  .|:.|:||||.||:.:|.|:|     
Mouse     6 EDTSIHRLEGTSLDSQVGGLIC-KTKSA-ANEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRREREEKDDG 68

  Fly    63 ---RSERLISFKDSEFDDTGGGSSTPQANASGASSEFAFKKPDTKSFEKLRGQLREHKDDTPSHT 124
               :..|:.|:||.|      .|...|.:|...|.:.|     .:|..:.| ..|..:.:||||.
Mouse    69 EDKKKSRVSSYKDWE------ESKDDQKDAEEESEDQA-----GRSSRRDR-HYRSARVETPSHP 121

  Fly   125 GGVSEKARERLREHIQRDRKRGPVSSTAAEGRDRDRDWDRDRRRDRDRDRDRDRDRRQHRERERD 189
            |||||:..||.|:. :|||:...|.:::.|.:||.::      |.||||.||.|||...|:|.|.
Mouse   122 GGVSEEFWERSRQR-ERDRREHGVYASSKEEKDRKKE------RSRDRDYDRKRDRADERDRSRH 179

  Fly   190 RHRSWDRDRGRDRDRDRSMSERSVHTPREPGTPGGSSGGISNSSWDDEDGEFG-QRKSDWDMPTP 253
            ..|| |||.|.:|...|:..|...|.|::..||       |.|:|:::|..:| .|:|.|:.|:|
Mouse   180 SSRS-DRDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATP-------SRSAWEEDDSGYGSSRRSQWETPSP 236

  Fly   254 ----------RRHGNKSGDWSVRSGGSRRNHGRQDDTVRPTPAHRYNQWAHGRKRSGATPW---- 304
                      .|...:..|.|:||..|       |||..|||:::||:||..|:..|:||.    
Mouse   237 TPSYRDSERGHRPSTRDRDRSIRSKSS-------DDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRG 294

  Fly   305 ------GEDPESLDL------WEEEQRRLDREWYNIDEGYDDENNPFGGPNSEYFRKREEQLEQK 357
                  ||:..:.|.      ||::||:.||:||.:|||||:.:||....:.:|.|:||:.|.::
Mouse   295 RGRREDGEEGIAFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQ 359

  Fly   358 RTKRISAQQRQNNRDNELWERNRMLTSGVVTLISVNDDFDEEALERVHLLVHHIIPPFLDGRIVF 422
            :.||||||:||.|.|||.||.|||||||||..:.|::||:|:...:|||:||:::||||||||||
Mouse   360 KQKRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVF 424

  Fly   423 TKQPEPVVPVKDPTSDMALLARKGSALVRNYREQKERRKAQKKHWELSGTKLGNIMGVQRPQDED 487
            |||||||:||||.|||:|::|||||..||.:||||||||||.|||||:|||||:||||::.::.|
Mouse   425 TKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERRKAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPD 489

  Fly   488 DMRFDKEKDKADYRKDQKFADHMRDQDTGGKSDFSRKKTISEQRRFLPVFASRQELLNVIRENSV 552
              :...|..|.|||.:|||||||::: :...|:|::||:|.|||::||:||.:||||.:||:||:
Mouse   490 --KAMTEDGKVDYRTEQKFADHMKEK-SEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSI 551

  Fly   553 IIIVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYSKRGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSDEMDTQLGEDVGYAIRF 617
            :|:|||||||||||||||||||||:..|||||||||||||||||||||:||...|||:|||||||
Mouse   552 VIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRF 616

  Fly   618 EDCTSERTVIKYMTDGILLRESLRDPELDSYSAIIMDEAHERSLSTDVLFGLLREIVARRHDLKL 682
            ||||||.|:|||||||||||||||:.:||.|||:||||||||||:||||||||||:||||.||||
Mouse   617 EDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAVIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKL 681

  Fly   683 IVTSATMDSSKFATFFGNVPTFTIPGRTFPVDVMFSKNTCEDYVESAVKQALQVHLTPNEGDMLI 747
            ||||||||:.|||.||||||.|.|||||||||::|||...|||||:||||:|||||:...||:||
Mouse   682 IVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILI 746

  Fly   748 FMPGQEDIEVTCEVLEERLAEIDNAPALSILPIYSQLPSDLQAKIFQKSSDGLRKCVVATNIAET 812
            |||||||||||.:.:.|.|.|::|||||::||||||||||||||||||:.||:|||:||||||||
Mouse   747 FMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAET 811

  Fly   813 SLTVDGIIYVIDSGYCKLKVYNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQAYRLYTQRQYK 877
            |||||||::|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||||..||
Mouse   812 SLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYK 876

  Fly   878 DELLALTVPEIQRTNLANTVLLLKSLGVVDLLQFHFMDPPPQDNILNSLYQLWILGALDHTGALT 942
            :|||..||||||||||||.|||||||||.||||||||||||:||:|||:||||||||||:||.||
Mouse   877 NELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLT 941

  Fly   943 TLGRQMAEFPLDPPQCQMLIVACRMGCSAEVLIIVSMLSVPSIFYRPKGREDEADGVREKFQRPE 1007
            :.||.|.||||||...:||||:|.||||:|:|:||||||||:|||||||||:|:|.:||||..||
Mouse   942 STGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPE 1006

  Fly  1008 SDHLTYLNVYQQWRQNNYSSTWCNEHFIHIKAMRKVREVRQQLKDIMTQQNLSVISCGIDWDIVR 1072
            ||||||||||.||:.||||:.|||:||||.||||||||||.||||||.||.:|:.|||.||||||
Mouse  1007 SDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVR 1071

  Fly  1073 KCICSAYFYQAARLKGIGEYVNLRTGMPCHLHPTSALYGLGTTPDYVVYHELIMTAKEYMQCATA 1137
            ||||:|||:|||:|||||||||:||||||||||||:|:|:|.||||:|||||:||.||||||.||
Mouse  1072 KCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTA 1136

  Fly  1138 VDGYWLAELGPMFFSVKESGRSGREKKKQAAEHLKEMEEQMLKAQHEMEERKQQAAEREEQLATK 1202
            |||.|||||||||:|||::|:|.:|.:::|.|....|||:|..|:.::..|:|:..:|....:.:
Mouse  1137 VDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVR 1201

  Fly  1203 Q-EIATPGN------ATPRRTPARIGL 1222
            . :|.|||.      .||||||||.||
Mouse  1202 STKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL 1228

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Prp16NP_572947.1 HrpA 534..>1148 CDD:441249 490/613 (80%)
Dhx38NP_848467.1 HrpA 533..>1147 CDD:441249 490/613 (80%)

Return to query results.
Submit another query.