DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Muc11A and FLO1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001285150.1 Gene:Muc11A / 32174 FlyBaseID:FBgn0052656 Length:1552 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_009424.1 Gene:FLO1 / 851289 SGDID:S000000084 Length:1537 Species:Saccharomyces cerevisiae


Alignment Length:1287 Identity:250/1287 - (19%)
Similarity:406/1287 - (31%) Gaps:297/1287 - (23%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    63 LNTRCVTDGL---EICVPVKSAAEAPTAAVAKMVTITD---SPVVSESAPLVDSTNSGSGVEIST 121
            |.|...|:|:   |..:.:::...|.||     :|.|:   |...|.|..|...|        .|
Yeast   339 LTTVTGTNGVRTDETIIVIRTPTTATTA-----ITTTEPWNSTFTSTSTELTTVT--------GT 390

  Fly   122 EGAPAS------AVPTKPSIPVETTQ--------------APVETTQIPLETTQVAVE---TTQI 163
            .|.|..      ..||..:..:.|||              ....|..:|.:.|.:.:.   |...
Yeast   391 NGLPTDETIIVIRTPTTATTAMTTTQPWNDTFTSTSTELTTVTGTNGLPTDETIIVIRTPTTATT 455

  Fly   164 PLETTQASGETTTAAIEE--TTTGSEAPLEPESTV-----PSDTTPVDSTLAPGWEGTYPTIEPN 221
            .:.|||...:|.|:...|  |.||:.. |..:.|:     |:..|...:|..| |..|:     .
Yeast   456 AMTTTQPWNDTFTSTSTELTTVTGTNG-LPTDETIIVIRTPTTATTAMTTTQP-WNDTF-----T 513

  Fly   222 TPAEDPNAPAGTTLAPGEVDPNSPIDPNSPLDPNAPEESTNEPGLVDPTLPADTTTAPDSPVEGS 286
            :.:.:.....||...|                       |:|..:|..| |...|||..:|...:
Yeast   514 STSTEITTVTGTNGLP-----------------------TDETIIVIRT-PTTATTAMTTPQPWN 554

  Fly   287 SAAPGTPADVT--TAAPGAPADGSSAAPGSPADGSSAAPGSPADVTTAAP--------------- 334
            .....|..::|  |...|.|.|.:.....:|...::|       :||..|               
Yeast   555 DTFTSTSTEMTTVTGTNGLPTDETIIVIRTPTTATTA-------ITTTEPWNSTFTSTSTEMTTV 612

  Fly   335 ----GAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGAPADV 395
                |.|.|.:......|...::|       :||..|......|::...:...|::   |.|.|.
Yeast   613 TGTNGLPTDETIIVIRTPTTATTA-------ITTTQPWNDTFTSTSTEMTTVTGTN---GLPTDE 667

  Fly   396 TTAAPGAPADGSSA-----------------------APGAPADGSSAAPGSPADVTTA----AP 433
            |......|...::|                       ..|.|.|.:.....:|...|||    .|
Yeast   668 TIIVIRTPTTATTAMTTTQPWNDTFTSTSTEITTVTGTTGLPTDETIIVIRTPTTATTAMTTTQP 732

  Fly   434 GAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGAPADVTTAAPGAP-ADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTA 497
            ......|::...:...|::   |.|.|.|......| ::|..:....|..|:..:..:.....|.
Yeast   733 WNDTFTSTSTEMTTVTGTN---GVPTDETVIVIRTPTSEGLISTTTEPWTGTFTSTSTEMTTVTG 794

  Fly   498 APGAPAD------------GSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEES 550
            ..|.|.|            |.......|..|:..:..:.....|...|.|.|.:.....:|..|.
Yeast   795 TNGQPTDETVIVIRTPTSEGLVTTTTEPWTGTFTSTSTEMTTITGTNGVPTDETVIVIRTPTSEG 859

  Fly   551 SAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAP-ADGSSAAPGSPAE 614
            ..:       ||..|......|::.......|::   |.|.|.|......| ::|..:....|..
Yeast   860 LIS-------TTTEPWTGTFTSTSTEMTTITGTN---GQPTDETVIVIRTPTSEGLISTTTEPWT 914

  Fly   615 GS-----------SAAPGAPADVTTAAPGAP-ADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAP 667
            |:           :...|.|.|.|......| ::|..:....|..|:..:..:.....|...|.|
Yeast   915 GTFTSTSTEMTHVTGTNGVPTDETVIVIRTPTSEGLISTTTEPWTGTFTSTSTEVTTITGTNGQP 979

  Fly   668 AD------------GSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPAD------------GSSAAP 708
            .|            |..:....|..|:..:..:.....|...|.|.|            |.....
Yeast   980 TDETVIVIRTPTSEGLISTTTEPWTGTFTSTSTEMTTVTGTNGQPTDETVIVIRTPTSEGLVTTT 1044

  Fly   709 GSPAEGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAP--ADGSSAAPGSPADVTTA--------AP 763
            ..|..|:..:..:.....|...|.|.|.:......|  |..||.:..|...:|::        .|
Yeast  1045 TEPWTGTFTSTSTEMSTVTGTNGLPTDETVIVVKTPTTAISSSLSSSSSGQITSSITSSRPIITP 1109

  Fly   764 GAPADGSSAAPGS--PADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSS 826
            ..|::|:|....|  .:.||          ||....||...||..  |.:..|:.:..:.:..||
Yeast  1110 FYPSNGTSVISSSVISSSVT----------SSLFTSSPVISSSVI--SSSTTTSTSIFSESSKSS 1162

  Fly   827 AAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADG--SSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPAD 889
            ..|     .||:..||....|::|....:..  ||.:..:|...||:.|     :.|:|..:...
Yeast  1163 VIP-----TSSSTSGSSESETSSAGSVSSSSFISSESSKSPTYSSSSLP-----LVTSATTSQET 1217

  Fly   890 GSSAAPGSPAD-------VTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGAPADVTTAAPGAPADGSS 947
            .||..|.:...       ||..:..:.....|.:|...:..:....|...:.||..|.:..:.:.
Yeast  1218 ASSLPPATTTKTSEQTTLVTVTSCESHVCTESISPAIVSTATVTVSGVTTEYTTWCPISTTETTK 1282

  Fly   948 AAPGAPADGSSAA--------PGSPADV--TTAAPGAPADGSSAAPGAPADVTTAAPGAPADG-- 1000
            ...|.....:...        ....:||  .||:|...:..::...|...:.||..|.:..:.  
Yeast  1283 QTKGTTEQTTETTKQTTVVTISSCESDVCSKTASPAIVSTSTATINGVTTEYTTWCPISTTESRQ 1347

  Fly  1001 -------SSAAPGSPAEGSSAAPGAPADVTTAA--------------PGAPADGSSAAPGAPADG 1044
                   :|...|..:|.:|     ||.|:||.              |....:.|.::....|.|
Yeast  1348 QTTLVTVTSCESGVCSETAS-----PAIVSTATATVNDVVTVYPTWRPQTANEESVSSKMNSATG 1407

  Fly  1045 SSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSPPAGGSPAG 1109
            .:......|:.||....|....::.|..:...||::     ...|:.|....|..:...|.|.:.
Yeast  1408 ETTTNTLAAETTTNTVAAETITNTGAAETKTVVTSS-----LSRSNHAETQTASATDVIGHSSSV 1467

  Fly  1110 SNVPAGGDPADSNVPAGGAPADSNVPAGGAPADSNVPAGGAPADSNVPAGGA 1161
            .:|...|:  ..::.:.|....|..|. ..||.|.|....|..:.:..||.|
Yeast  1468 VSVSETGN--TKSLTSSGLSTMSQQPR-STPASSMVGYSTASLEISTYAGSA 1516

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc11ANP_001285150.1 PTZ00441 <185..>295 CDD:240420 22/114 (19%)
kgd 241..>349 CDD:476867 23/128 (18%)
PRK14959 <302..>417 CDD:184923 26/156 (17%)
PRK07764 <366..816 CDD:236090 100/538 (19%)
PRK07764 <696..1109 CDD:236090 94/478 (20%)
PRK07003 <996..>1250 CDD:235906 38/189 (20%)
CBM_14 1495..1547 CDD:426342
FLO1NP_009424.1 PA14 100..249 CDD:400161
FhaB <229..1102 CDD:442443 159/836 (19%)
Flocculin_t3 1235..1276 CDD:464047 8/40 (20%)
Chi1 1304..>1502 CDD:442692 43/210 (20%)
Flocculin_t3 1349..1392 CDD:464047 10/47 (21%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.