DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Muc11A and Muc12Ea

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001285150.1 Gene:Muc11A / 32174 FlyBaseID:FBgn0052656 Length:1552 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001368944.1 Gene:Muc12Ea / 32384 FlyBaseID:FBgn0052602 Length:3321 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1644 Identity:516/1644 - (31%)
Similarity:725/1644 - (44%) Gaps:329/1644 - (20%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    77 PVKSAAEAPT------AAVAKMVTITDSPVVSESAPLVDSTNSGSGVEISTEGA---PASAVPTK 132
            |.:..:..||      ...||..|:..:          |.|.:.......|||.   |.:..||:
  Fly  1697 PTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPT----------DGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTE 1751

  Fly   133 PSIPVETTQAPVE------TTQIPLETTQVAVETTQIPLETTQASGETTTAAIEETTTGSEAPLE 191
            .:....||..|.|      ||..|.|.| .|..||..|.|.|  |.:.||....|.|:.....|:
  Fly  1752 GTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGT-TAKPTTLKPTEGT--SAQPTTLKPTERTSAQPTTLK 1813

  Fly   192 P-ESTVPSDTT--PVD------STLAPGWEGTYPTIEPNT--PAEDPNAPAGTTLAPGEVDPNSP 245
            | |.|....||  |.:      :||.| .|||  |.:|.|  |.|..:|.. |||.|.|.....|
  Fly  1814 PTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKP-TEGT--TAKPTTLKPTEGTSAKP-TTLKPTEGTTAKP 1874

  Fly   246 IDPNSPLDPNAPEESTNEPGLVDPT----------LPADTTTAPDS---PVEGSSAAPGT--PAD 295
                :.|.|.  |.::.:|..:.||          .|.|.|||..:   |.||:||.|.|  |.:
  Fly  1875 ----TTLKPT--EGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTE 1933

  Fly   296 VTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PADGSSAAPGS-----------------PADVTTAAPGA--P 337
            .|||.|..  |.:|:||.|.:  |.:|::|.|.:                 |.:.|||.|..  |
  Fly  1934 GTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSANAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 1998

  Fly   338 ADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS---------------P 381
            ..|:||.|..  |.:|::|.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|.:               |
  Fly  1999 TKGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2063

  Fly   382 AEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA---------------PADGSSAAPGS--P 425
            .||:||.|..  |.:.|||.|..  |.:|:||.|..               |.:|:||.|.:  |
  Fly  2064 TEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2128

  Fly   426 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--P 480
            .:.|||.|..  |.:|:||.|.|  |.||::|.|..  |.:.|||.|..  |.||:||.|..  |
  Fly  2129 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTSLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTSAKPTTLKP 2193

  Fly   481 ADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 535
            .:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |
  Fly  2194 TEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2258

  Fly   536 ADGSSAAPGS--PAEESSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--P 590
            .:|:||.|.:  |.|.::|.|.:  |.:.|:|.|..  |.:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |
  Fly  2259 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2323

  Fly   591 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--P 645
            .|.|||.|..  |.:|:||.|.:  |.||::|.|..  |.:.|:|.|..  |.||::|.|..  |
  Fly  2324 TDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKP 2388

  Fly   646 ADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 700
            .:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |
  Fly  2389 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2453

  Fly   701 ADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA---------------P 744
            .:|:||.|.:  |.||::|.|.:  |.|.|||.|..  |.:|:||.|..               |
  Fly  2454 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2518

  Fly   745 ADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--P 799
            .:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|:|.|..  |.:|::|.|.:  |
  Fly  2519 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTERTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2583

  Fly   800 AEGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 854
            .||:||.|.:  |.:.|:|.|..  |.:|::|.|..  |..|:||.|.:  |.:.|||.|..  |
  Fly  2584 TEGTSAQPTTLKPTERTSAQPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTKGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2648

  Fly   855 ADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--P 909
            .:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.||::|.|.:  |.:.|:|.|..  |
  Fly  2649 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2713

  Fly   910 ADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--P 964
            .:|::|.|.:  |.||:||.|..  |.:.|||.|..  |.:|:||.|..  |.:|::|.|.:  |
  Fly  2714 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2778

  Fly   965 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGSSAAPGA--P 1019
            .|.|||.|..  |.:|:||.|..  |.:.|||.|..  |.:|::|.|.:  |.||:||.|..  |
  Fly  2779 TDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2843

  Fly  1020 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGA--PADGSSAAPGS--PADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--P 1074
            .:.|||.|..  |.:|::|.|..  |.:|:||.|.:  |.:.|||.|..  |.:|:||.|.:  |
  Fly  2844 TEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 2908

  Fly  1075 ADVTTAAPGA--PADGSSAAPGS--PAEGS--------PPAGGSPAGSNV-PAGGDPADSNV--P 1124
            .:.|||.|..  |.:|:||.|.:  |.||:        |..|.|...:.: |..|..|....  |
  Fly  2909 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 2973

  Fly  1125 AGGAPADSNV--PAGGAPADSNV--PAGGAPADSNV--PAGGAPADANV--PAGGAPADSNV--P 1179
            ..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |
  Fly  2974 TEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 3038

  Fly  1180 GGGAPADANV--PAGGAPADSNV--PAGGAPAGSNV--PAGGAPADSNVPAGGAPADSNVPAGGA 1238
            ..|..|....  |..|..|....  |..|..|....  |..|..|.   |....|.|...   ..
  Fly  3039 TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQ---PTTLKPTDGTT---AK 3097

  Fly  1239 PAGSNVPAGSSPGSSVLGPNPPAGSVVPSIPVLP-GGAGSWP--WHPRPNIPIVPPTWRPLLPGQ 1300
            |.......|:|...:.|  .|..|:......:.| .|..:.|  ..|.......|.|.:|    .
  Fly  3098 PTTLKPTEGTSAKPTTL--KPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTDGTTAKPTTLKP----T 3156

  Fly  1301 NGSGAPGSGL--INGIVNPPQRPHPFWPNWQSWVNSWRPT--KPVPSTEAPVQPQNPQQ------ 1355
            .|:.|..:.|  ..|....|....|      :...:.:||  ||...|.|......|.:      
  Fly  3157 EGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP------TEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKP 3215

  Fly  1356 -PQNPQQPGNSNPETAESVEQAAPVPPANVPASNENA---SVEDSNKASSEKSKDKPKSG---ED 1413
             ...|.:..::.|.|.:..|.....|....|....:|   :::.:...:::.:..||..|   |.
  Fly  3216 TTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTPER 3280

  Fly  1414 QSKEQEQKKPSSEEKEKDS 1432
            .|::....||:||:...:|
  Fly  3281 TSQKTTTLKPTSEKTTTES 3299

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc11ANP_001285150.1 PRK07764 <366..816 CDD:236090 202/570 (35%)
PRK07764 <696..1109 CDD:236090 182/507 (36%)
CBM_14 1495..1547 CDD:279884
Muc12EaNP_001368944.1 PHA03247 <175..670 CDD:223021
PHA03247 <659..1197 CDD:223021
PHA03247 <1049..1651 CDD:223021
PHA03247 <1723..2186 CDD:223021 154/485 (32%)
PHA03247 <2110..2706 CDD:223021 217/595 (36%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 1 1.000 - - mtm6373
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
21.910

Return to query results.
Submit another query.