DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Muc11A and LOC116409830

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001285150.1 Gene:Muc11A / 32174 FlyBaseID:FBgn0052656 Length:1552 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_031755357.1 Gene:LOC116409830 / 116409830 XenbaseID:XB-GENE-29095799 Length:1403 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1157 Identity:289/1157 - (24%)
Similarity:504/1157 - (43%) Gaps:131/1157 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    98 SPVVSESAPLVDSTNSGSGVEIST-EGAPASAVPTKPSIPVETTQAPVETTQIPLETTQVAVETT 161
            |..|..|...|.:|...|..:::| |....|.|.|..    ||:.:.|.||:   ||:...|:||
 Frog    22 SSTVETSTSEVTTTEETSTSDVTTIEETSTSDVTTTE----ETSTSDVTTTE---ETSTSDVKTT 79

  Fly   162 QIPLETTQASGETTTAAIEETTTGSEAPLEPESTVPSDTTPVDSTLAPGWEGTYPTIEPNTPAED 226
                |.|..|..|||   |||:|......|..||  ||.|..:.|         .|.:..|..|.
 Frog    80 ----EETSTSDVTTT---EETSTSDATTTEDTST--SDVTTTEET---------STSDVTTTEET 126

  Fly   227 PNAPAGTTLAPGEVDPNSPIDPNSPLDPNAPEE-STNEPGLVDPTLPADTTTAPDSPVEGSSAAP 290
            ..:...||            :..|..|....|| ||::....:.|..:|.||..::         
 Frog   127 STSDVTTT------------EETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEET--------- 170

  Fly   291 GTPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAA 355
             :.:||||....:.:|.::....|.:|.::....|.:||||....:.:|.::....:..|.::..
 Frog   171 -STSDVTTTEDTSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTIDATTTE 234

  Fly   356 PGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGAPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSA 420
            ..|.:||||....:.:|.::....|.::.::....:.:||||....:.:|.::....:.:|.::.
 Frog   235 ETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDATTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTT 299

  Fly   421 APGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGAPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSS 485
            ...|.:||||....:.:|.::....|.::.::....:.:||||....:.:|.::....:.:|.::
 Frog   300 EETSTSDVTTTEDTSTSDVTTTEETSTSDITTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTT 364

  Fly   486 AAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEES 550
            ....|.:||||....:.:|.::....:.:|.::....|.:||||....:.:|.::....|..:.:
 Frog   365 TEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEDTSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTIDAT 429

  Fly   551 SAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEG 615
            :....|.:||||....:.:|.::....:.:|.::....|.:||||....:.:|.:|....|..:.
 Frog   430 TTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDATTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTSTEETSTIDA 494

  Fly   616 SSAAPGAPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPAD 680
            ::....:.:||||....:.:|.::....:.:|.::....|.:||||....:.:|.::......:|
 Frog   495 TTTEDTSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEETSTSDVTTTEEISTSDVTTTEETLTSD 559

  Fly   681 GSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPA 745
            .::....|.:||||....:.:|.::.......:.::....|.:||||     |.|.||:....|.
 Frog   560 ATTTEDTSTSDVTTTEETSTSDATTTEDTFTIDATTPKDTSSSDVTT-----PKDTSSSDVTTPK 619

  Fly   746 DGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGSP 810
            |.||      :||||     |.|.||:...:|.|.:::....|.|.||:...:|.:.||:...:|
 Frog   620 DTSS------SDVTT-----PKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTP 673

  Fly   811 ADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGS 875
            .|.:::....|.|.||:....|.|.||:...:|.|.:::....|.|.||:....|.|.||:...:
 Frog   674 KDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTT 738

  Fly   876 PADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSSAAPGAPADVTTAAPG 940
            |.|.:......|.|.||:...:|.|.:::....|.|.||:...:|.:.||:....|.|.:::...
 Frog   739 PKDTSIPDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVT 803

  Fly   941 APADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADVTTAAPGAPADGSSAAP 1005
            .|.|.||:....|.|.||:...:|.|  ||.|.......::.|    ||||     |.|.||:..
 Frog   804 TPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKD--TAIPDVTTPKDTSIP----DVTT-----PKDTSSSDV 857

  Fly  1006 GSPAEGSSAAPGAPADVTTAAPGAPADGSSAAPGAPADGSSAAPGSPADVTTAAPGAPADGSSAA 1070
            .:|.:.||      :||||     |.|.||:....|.|.||      :||||     |.|.||:.
 Frog   858 TTPKDTSS------SDVTT-----PKDTSSSDVTTPKDTSS------SDVTT-----PKDTSSSD 900

  Fly  1071 PGSPADVTTAAPGAPADGSSAAPGSPAEGSPPAGGSPAGSNVPAGGDPADSNVPAGGAPADSNVP 1135
            ..:|.|.:::....|.|.||:...:|.:.|        .|:|....|.:.|:|.   .|.|:::|
 Frog   901 VTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTS--------SSDVTTPKDTSSSDVT---TPKDTSIP 954

  Fly  1136 AGGAPADSNVPAGGAPADSNVPAGGAPADANVPAGGAPADSNVPGGGAPADANVPAGGAPADSNV 1200
                  |...|...:.:|...|...:.:|...|...:.:|...|...:.:|...|...:.:|.. 
 Frog   955 ------DVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVTTPKDTSSSDVT- 1012

  Fly  1201 PAGGAPAGSNVPAGGAPADSNVPAGGAPADSNVPAGGAPAGSNVPAGSSPGS 1252
                           .|.|:::|....|.|::......|.....|:.|:.|:
 Frog  1013 ---------------TPKDTSIPDVTTPKDTSSSDVTTPKDVTNPSASTNGA 1049

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc11ANP_001285150.1 PTZ00441 <185..>295 CDD:240420 22/110 (20%)
kgd 241..>349 CDD:476867 23/108 (21%)
PRK14959 <302..>417 CDD:184923 22/114 (19%)
PRK07764 <366..816 CDD:236090 101/449 (22%)
PRK07764 <696..1109 CDD:236090 121/412 (29%)
PRK07003 <996..>1250 CDD:235906 62/253 (25%)
CBM_14 1495..1547 CDD:426342
LOC116409830XP_031755357.1 Mucin-like 611..701 CDD:464997 32/100 (32%)
PspC_subgroup_2 <662..1045 CDD:468202 119/448 (27%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.