DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cac and unc-2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001356945.1 Gene:cac / 32158 FlyBaseID:FBgn0263111 Length:2110 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001355464.1 Gene:unc-2 / 180570 WormBaseID:WBGene00006742 Length:2171 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2108 Identity:1090/2108 - (51%)
Similarity:1352/2108 - (64%) Gaps:241/2108 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 PKKEENPPGGGPTSLFILTEDNPIRKYTRFIIEWPPFEYAVLLTIIANCVVLALEEHLPGGDKTV 68
            |.||:     ||:||||..|||.||:..:.||||.||||.:|||||.|||||::|:|||..||..
 Worm   223 PVKEK-----GPSSLFIFAEDNIIRRNAKAIIEWGPFEYFILLTIIGNCVVLSMEQHLPKNDKKA 282

  Fly    69 LAQKLEKTEAYFLCIFCVEASLKILALGLVLHKHSYLRNIWNIMDFFVVVTGFMTQYP------- 126
            |::.||:||.||:.|||:|..||::|.|..|||.||||:.||||||.|||:|.:|..|       
 Worm   283 LSEWLERTEPYFMGIFCLECVLKVIAFGFALHKGSYLRSGWNIMDFIVVVSGVVTMLPFSPATQT 347

  Fly   127 --QIGPEVDLRTLRAIRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIIKAMAPLLQIGLLVLFAIVIFAIIGLE 189
              |....||||||||:||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||||:||||||||
 Worm   348 ANQPVDSVDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSILCAMAPLLQIGLLVLFAIIIFAIIGLE 412

  Fly   190 FYSGALHKTCYSLEDPNKLVKEGESETPCNTDNILEKATGSFVCNNTTSMCLEKWEGPNSGITSF 254
            |||||.|..||:  :..::....|...||....   ...|.:.|:...:.||:||.|||.|||||
 Worm   413 FYSGAFHSACYN--ERGEIENVSERPMPCTNKT---SPMGVYNCDVKGTTCLQKWIGPNYGITSF 472

  Fly   255 DNIGFAMLTVFQCITMEGWTAILYWTNDALGSAFNWIYFVPLIVIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKE 319
            |||||||:||||||||||||.::|:|||:|||.:||.||:||||:||||||||||||||||||||
 Worm   473 DNIGFAMITVFQCITMEGWTTVMYYTNDSLGSTYNWAYFIPLIVLGSFFMLNLVLGVLSGEFAKE 537

  Fly   320 REKVENRQEFLKLRRQQQLERELNGYVEWICKAEEVILAEERTTEEEKMHIMEARRRNAAKRKKL 384
            ||:||||:||||||||||:|||||||:|||..||||||.|:|||||||..|||||||  |..|||
 Worm   538 RERVENRREFLKLRRQQQIERELNGYLEWILTAEEVILKEDRTTEEEKAAIMEARRR--AANKKL 600

  Fly   385 KSLGKSKSTDTE------EEEAEEDYGDDGYLK----TRSKPQGSCTGFWRAEKRFRFWIRHTVK 439
            |...|.:||:||      |:|.||:|.|:|...    ...|.:|.|....:..|:.|..||..||
 Worm   601 KQASKQQSTETEEDFEEDEDEMEEEYVDEGGTVEDEFAERKKRGCCHSVGKFIKQLRIQIRIMVK 665

  Fly   440 TQWFYWFVIVLVFLNTVCVAVEHYGQPSFLTEFLYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYALGPRIYFESS 504
            ||.|||.||.||||||.|||.||||||.:.|:||.||||:|||:|:.||.:|::|:|.|.||.|.
 Worm   666 TQIFYWSVITLVFLNTCCVASEHYGQPQWFTDFLKYAEFVFLGIFVVEMLLKLFAMGSRTYFASK 730

  Fly   505 FNRFDCVVISGSIFEVIWSEVKGGSFGLSVLRALRLLRIFKVTKYWSSLRNLVISLLNSMRSIIS 569
            |||||||||.||..||||:||.|||||:||:||||||||||:|.||.||||||.||:||||||||
 Worm   731 FNRFDCVVIVGSAAEVIWAEVYGGSFGISVMRALRLLRIFKLTSYWVSLRNLVRSLMNSMRSIIS 795

  Fly   570 LLFLLFLFILIFALLGMQLFGGQFNLPGGTPETNFNTFPIALLTVFQILTGEDWNEVMYQGIISQ 634
            ||||||||||||||||||||||:||.|...|.|:|:|||:||:||||||||||||||||..|.||
 Worm   796 LLFLLFLFILIFALLGMQLFGGRFNFPTMHPYTHFDTFPVALITVFQILTGEDWNEVMYLAIESQ 860

  Fly   635 GGAQK-GMIYSIYFIVLVLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTAAEEEQVEEDKEKQLQELEKE 698
            ||... |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   .::|..:::|..:|
 Worm   861 GGIYSGGWPYSIYFIVLVLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTAAEE---ADEKANEIEEESEE 922

  Fly   699 MEALQADGVH----VEN---GD-GAVAPSKSKGKKKEEEKKEEEEVTEGPKPMLPYSSMFILSPT 755
            ::....:|.|    :|.   || .|||.:..   ..:||.:|||....|||||:||||||.||||
 Worm   923 LDEQYQEGDHCTIDMEGKTAGDMCAVARAMD---DLDEECEEEESPFGGPKPMVPYSSMFFLSPT 984

  Fly   756 NPIRRGAHWVVNLPYFDFFIMVVISMSSIALAAEDPVRENSRRNKILNYFDYAFTGVFTIEMLLK 820
            ||.|...|.:|...||:..:|.||.:||::|||||||.|.:.|||:|.|.||.|||||..|||||
 Worm   985 NPFRVLIHSIVCTKYFEMMVMTVICLSSVSLAAEDPVDEENPRNKVLQYMDYCFTGVFACEMLLK 1049

  Fly   821 IVDLGVILHPGSYLREFWNIMDAVVVICAAVSFGFDMSGSSAGQNLSTIKSLRVLRVLRPLKTIK 885
            ::|.|::||||||.|:||||:|.:||.||..:|||..:..|||:||:||||||||||||||||||
 Worm  1050 LIDQGILLHPGSYCRDFWNILDGIVVTCALFAFGFAGTEGSAGKNLNTIKSLRVLRVLRPLKTIK 1114

  Fly   886 RVPKLKAVFDCVVNSLKNVVNILIVYILFQFIFSVIGVQLFNGKFFYCTDESKHTSAECQGSYFK 950
            |:|||||||||||||||||.||||||.||||||:||.|||||||||:|||:::..:..|.|.:|.
 Worm  1115 RIPKLKAVFDCVVNSLKNVFNILIVYFLFQFIFAVIAVQLFNGKFFFCTDKNRKFANTCHGQFFV 1179

  Fly   951 YEEDELLPKQELRVWKPRAFHYDNVAAAMLTLFAVQTGEGWPQVLQHSMAATYEDRGPIQNFRIE 1015
            |:.....|:.|.|.|:.|.|:|||...||||||.|.||||||.:.|:||..|:||:||...||:|
 Worm  1180 YDNQNDPPRVEQREWRLRPFNYDNTINAMLTLFVVTTGEGWPGIRQNSMDTTFEDQGPSPFFRVE 1244

  Fly  1016 MSIFYIVYFIVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGEAELQDGEIDKNQKSCIDFTIGARPLERYMPKN 1080
            :::||:::||||||||||||||||||||||||||||.:|::|||||.||||.:.|||...:||::
 Worm  1245 VALFYVMFFIVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGEAELSEGDLDKNQKQCIDFALNARPRSLFMPED 1309

  Fly  1081 RNTFKYKVWRIVVSTPFEYFIMMLIVFNTLLLMMKYHNQGDMYEKSLKYINMGFTGMFSVETVLK 1145
            :|:.||::||:|.|.|||||||.:|..|||:|||||:|....||:.|:..|...|.:|:||::||
 Worm  1310 KNSTKYRIWRLVTSPPFEYFIMTMICCNTLILMMKYYNNPLFYEEILRLFNTALTAVFTVESILK 1374

  Fly  1146 IIGFGVKNFFKDPWNIFDLITVLGSIVDALWMEFGSNSINVGFLRLFRAARLIKLLRQGYTIRIL 1210
            |:.|||:|:|:|.||.||.:||:|||.|||..|||.:.:::||||||||||||:||:||||||||
 Worm  1375 ILAFGVRNYFRDGWNRFDFVTVVGSITDALVTEFGGHFVSLGFLRLFRAARLIRLLQQGYTIRIL 1439

  Fly  1211 LWTFVQSFKALPYVCLLIAMLFFIYAIIGMQVFGNIKLGTVENSITRHNNFQSFIQGVMLLFRCA 1275
            ||||||||||||||||||.||||||||:||||||||.|... ..|.||||||||...|:||||||
 Worm  1440 LWTFVQSFKALPYVCLLIGMLFFIYAIVGMQVFGNIWLNAA-TEINRHNNFQSFFNAVILLFRCA 1503

  Fly  1276 TGEAWPNIMLACLKGKAC------DDDAEKAPGEYCGSTLAYAYFVSFIFFCSFLMLNLFVAVIM 1334
            |||.|.:||:|.::||.|      :.:.||  |:.|||.::||||.||:|..|||||||||||||
 Worm  1504 TGEGWQDIMMAAVQGKDCARAGSAEINFEK--GQTCGSNVSYAYFTSFVFLSSFLMLNLFVAVIM 1566

  Fly  1335 DNFDYLTRDSSILGAHHLDEFVRIWAEYDPNATGKIHYTEMYDMLKNMDPPLGFGNKCPNRLAYK 1399
            ||||||||||||||.||||||:|:||:|||.|||:|||:|||:||:.|.||:|||.|||.|||||
 Worm  1567 DNFDYLTRDSSILGPHHLDEFIRVWADYDPAATGRIHYSEMYEMLRIMAPPVGFGKKCPYRLAYK 1631

  Fly  1400 KLIRMNMPLDDELRVQFTTTLFALIRENLSIKMRAPEEMDQADMELRETITNIWPLQAKK-MLNL 1463
            .|||||||:.::..|.|||||||||||:||||||..||||:||.|||.|:..||||:||| |::|
 Worm  1632 HLIRMNMPVAEDGTVHFTTTLFALIRESLSIKMRPVEEMDEADEELRLTLKKIWPLKAKKNMVDL 1696

  Fly  1464 LVPPSDQLNKGKLSVGKIYAGFLILESWRSTRFGQLDSGMPMLELQDASRHPSQESLTGADAGHL 1528
            :|||:.:|...||:|||||||.||||::|:.:                         :|.:.|  
 Worm  1697 VVPPNHELCFQKLTVGKIYAGLLILENYRARK-------------------------SGTEVG-- 1734

  Fly  1529 HPGHSYMNGHRRSPSLRHNGSPLARSPSPRRRGHQYIHHDIGFSDTVSNVVEMVKETRH--PRHG 1591
              |.....|..||         |..:.......|.            |:..:..:||..  |:|.
 Worm  1735 --GQGLFGGGLRS---------LVAAAKAAESQHS------------SHTPQPPEETTPIIPQHA 1776

  Fly  1592 NSHPRYPRGSWSASTSPARSPSPSRYGGHLSRSKRTQLPYPTYGTTSLCQRSRSPSPARLQEMRE 1656
            ......|  :.||..|..:....|..||        |.||..:  .|.....:|...        
 Worm  1777 QQFSAAP--TMSAQGSLQQMQGTSSGGG--------QRPYSLF--NSFVDTIKSGKQ-------- 1821

  Fly  1657 RDRLGYGIDMGVTHVQH-SYPTLASRRAGIGRRLPPTPSKPSTLQLKPTNINFPKLNASPTHTHH 1720
                    |..||.||: |......:....||||....||             .:...|..|..|
 Worm  1822 --------DGDVTDVQYQSVDQQHEKMNSTGRRLSDMFSK-------------IRRGTSADHNPH 1865

  Fly  1721 STPHSV------HSLPHHRDLLR----DPRDMY-YSSRERERDRERLRDRDRDRDRD---RLHEY 1771
            .|.|.:      .|.|.:|.:.|    .|.:.| :..|.|.......|...:...||   |.:.|
 Worm  1866 QTEHLLAQDNRSPSSPRYRSMARASPPSPAERYGHPPRYRTESPPSSRSEYQMSIRDPIIRRNRY 1930

  Fly  1772 DLRYEYRDRERELYERERDREREVERER----LEYIAPLSFEQALAMGRTGRVLPSPVLNGFKPK 1832
            :.....|......|.:::.::::...::    |::....:::......|                
 Worm  1931 NTMEHSRSSHDPQYHQDQQQQQQPHHQQHSQHLQHSHHKTYQNHNQYSR---------------- 1979

  Fly  1833 SGLNPRHSD--SDEEDWCXQRLXLRSRNRKDQIWVXHQAICSSLSAPNLDHNFDTIRHSYQIPE- 1894
               :|.:||  |..|.:..:|...|.::...|                     |.......:|. 
 Worm  1980 ---SPIYSDDSSVAESYRREREFRRYQDSTPQ---------------------DVSEDDDPMPTA 2020

  Fly  1895 -HLQNLPYLCP-PVHQHQHQHQTQTQNQRQHQDQHLYQRYGTNVSTPKLGTTIS-DIKLAGVSLQ 1956
             ..:.||.:.. |.| ::..:|..:.|      |||...||       |||... |...:.    
 Worm  2021 VRARRLPLISTMPTH-YESAYQPSSYN------QHLNDSYG-------LGTGYQRDYHTSH---- 2067

  Fly  1957 ELSPNRQPQSQQKQEQQLHQDGWLRWYRQSGPYGSPVMASLPETRATSP--HSDIEFIRTMKRSE 2019
              |.:..|.|||:|.|.::....|...|.|..|.:|..:...|..:.||  :.......:.:|..
 Worm  2068 --SHSHHPTSQQQQHQPMYSTSPLISPRSSHSYYTPRSSQYYEIPSPSPDIYPSYRGSASPRRYP 2130

  Fly  2020 TGTTAITPRTTKTEAMIL-----SVPIT 2042
            |.|..:.|....:.|.::     |:|::
 Worm  2131 TSTVVVAPDREGSSARVIQAQPGSIPLS 2158

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
cacNP_001356945.1 Ion_trans 37..324 CDD:334124 191/295 (65%)
Ion_trans 441..677 CDD:334124 182/236 (77%)
Ion_trans 769..1050 CDD:334124 184/280 (66%)
Ion_trans 1094..1345 CDD:334124 168/256 (66%)
GPHH 1346..1416 CDD:339854 48/69 (70%)
Ca_chan_IQ 1418..1492 CDD:337190 51/74 (69%)
unc-2NP_001355464.1 Ion_trans 254..536 CDD:366146 184/286 (64%)
Ion_trans 667..904 CDD:366146 182/236 (77%)
Ion_trans 998..1279 CDD:366146 184/280 (66%)
Ion_trans 1323..1577 CDD:366146 168/256 (66%)
GPHH 1586..1639 CDD:374878 38/52 (73%)
Ca_chan_IQ 1650..1726 CDD:370105 51/75 (68%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C160159854
Domainoid 1 1.000 391 1.000 Domainoid score I400
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H20184
Inparanoid 1 1.050 1847 1.000 Inparanoid score I23
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S4478
OMA 1 1.010 - - QHG56527
OrthoDB 1 1.010 - - D172471at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000179
OrthoInspector 1 1.000 - - oto19394
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100303
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45628
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R175
SonicParanoid 1 1.000 - - X841
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1514.890

Return to query results.
Submit another query.