DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cac and egl-19

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001356945.1 Gene:cac / 32158 FlyBaseID:FBgn0263111 Length:2110 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001023079.1 Gene:egl-19 / 177513 WormBaseID:WBGene00001187 Length:1877 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2011 Identity:828/2011 - (41%)
Similarity:1109/2011 - (55%) Gaps:288/2011 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 PKKEENPPGGGPTSLFILTEDNPIRKYTRFIIEWPPFEYAVLLTIIANCVVLALEEHLPGGDKTV 68
            |.::.|.......||..|:.:|||||....|:||.|||:.:|..|.|||:.||:.:..|..|...
 Worm    54 PLRQTNVVERSERSLLCLSLNNPIRKLCISIVEWKPFEFLILFMICANCIALAIYQPYPAQDSDY 118

  Fly    69 LAQKLEKTEAYFLCIFCVEASLKILALGLVLHKHSYLRNIWNIMDFFVVVTGFM-TQYPQIGPE- 131
            ....||..|..|:.:|.:|..|||:|:|.:.|..:||||.|||:||.:||.|.: |...::..: 
 Worm   119 KNTLLETIEYVFIVVFTIECVLKIVAMGFMFHPSAYLRNAWNILDFIIVVIGLVSTILSKMSIQG 183

  Fly   132 VDLRTLRAIRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIIKAMAPLLQIGLLVLFAIVIFAIIGLEFYSGALH 196
            .|::.|||.||||||:||||:|||||||.:|::||.|||.|.|||||.|:|:||||||.:.|.||
 Worm   184 FDVKALRAFRVLRPLRLVSGVPSLQVVLNAILRAMIPLLHIALLVLFVILIYAIIGLELFCGKLH 248

  Fly   197 KTCYSLEDPNKLVKEGESETPCNTDNILEKATGS-FVCNNTTSM--------CLEK--WEGPNSG 250
            .||.   ||.......:..|||.||     ..|| |.|..:.|:        |...  |.|||:|
 Worm   249 STCI---DPATGQLAQKDPTPCGTD-----TEGSAFKCQPSDSLTNMGVRWECSSNTTWPGPNNG 305

  Fly   251 ITSFDNIGFAMLTVFQCITMEGWTAILYWTNDALGSAFNWIYFVPLIVIGSFFMLNLVLGVLSGE 315
            ||:|||.|.||||||||:::||||.::||.|||:|..:.|||||.|:::||||:|||||||||||
 Worm   306 ITNFDNFGLAMLTVFQCVSLEGWTDVMYWVNDAVGREWPWIYFVTLVILGSFFVLNLVLGVLSGE 370

  Fly   316 FAKEREKVENRQEFLKLRRQQQLERELNGYVEWICKAEEVILAEERTTEEEKMHIMEARRRNAAK 380
            |:|||||...|..|.|.|.:||||.:|.||::||.:||::....|...|:|              
 Worm   371 FSKEREKARARGLFQKFREKQQLEEDLKGYLDWITQAEDIEPVNEDEQEDE-------------- 421

  Fly   381 RKKLKSLGKSKSTDTEEEEAEEDYGDDGYLKTRSKPQGSCTGFWRAEK---RFRFWIRHTVKTQW 442
              .:......:..|.|.||..||.          :|........|.||   |.|...|..||:|.
 Worm   422 --PVAQTVVGEEADEEGEERVEDV----------RPSKWAARMKRLEKLNRRCRRACRRLVKSQT 474

  Fly   443 FYWFVIVLVFLNTVCVAVEHYGQPSFLTEFLYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYALGPRIYFESSFNR 507
            |||.||:||.|||:.:..|||||..:|..|...|...|:.||..||.:|||:||...|..|.|||
 Worm   475 FYWLVILLVLLNTLVLTSEHYGQSEWLDHFQTMANLFFVILFSMEMLLKMYSLGFTTYTTSQFNR 539

  Fly   508 FDCVVISGSIFE---VIWSEVKGGSFGLSVLRALRLLRIFKVTKYWSSLRNLVISLLNSMRSIIS 569
            |||.|:..||.|   |.:..:|  ..|:||||:.||||||||||||:||||||.|||||:|||||
 Worm   540 FDCFVVISSILEFVLVYFDLMK--PLGVSVLRSARLLRIFKVTKYWTSLRNLVSSLLNSLRSIIS 602

  Fly   570 LLFLLFLFILIFALLGMQLFGGQFNL----PGGTPETNFNTFPIALLTVFQILTGEDWNEVMYQG 630
            ||.||||||:||||||||:|||:||.    |  .|..||:||..|||||||||||||||.|||.|
 Worm   603 LLLLLFLFIVIFALLGMQVFGGKFNFNPQQP--KPRANFDTFVQALLTVFQILTGEDWNTVMYHG 665

  Fly   631 IISQGG-AQKGMIYSIYFIVLVLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTAAEEEQVEEDKEKQLQE 694
            |.|.|| ...|:|..||:|||.:.|||.||||||||||||||:|..||.||:|:.:::.|.:.:|
 Worm   666 IESFGGVGTLGVIVCIYYIVLFICGNYILLNVFLAIAVDNLADADSLTNAEKEEEQQEIEGEDEE 730

  Fly   695 LEKEMEALQADGVHVENGDGAVAPSKSKGKKKEEEKKEEEEVTEGPKPMLPYSSMFILSPTNPIR 759
            .|:..:..:..|:....||..:..::.:       :..|.......||:...||:||||.||..|
 Worm   731 FEEGEDEGEEHGMDEPEGDEEMTSARPR-------RMSEVPAASTVKPIPKASSLFILSHTNSFR 788

  Fly   760 RGAHWVVNLPYFDFFIMVVISMSSIALAAEDPVRENSRRNKILNYFDYAFTGVFTIEMLLKIVDL 824
            ...:.|||..||...::..|.:||..||||||::.||.||.|||||||.||.|||:|:.||::..
 Worm   789 VFCNMVVNHSYFTNAVLFCILVSSAMLAAEDPLQANSTRNMILNYFDYFFTSVFTVEITLKVIVF 853

  Fly   825 GVILHPGSYLREFWNIMDAVVVICAAVSFGFDMSGSSAGQNLSTIKSLRVLRVLRPLKTIKRVPK 889
            |::.|.||:.|..:|::|.:||..:..||......      :|.:|.||||||||||:.|.|...
 Worm   854 GLVFHKGSFCRNAFNLLDILVVAVSLTSFVLRTDA------MSVVKILRVLRVLRPLRAINRAKG 912

  Fly   890 LKAVFDCVVNSLKNVVNILIVYILFQFIFSVIGVQLFNGKFFYCTDESKHTSAECQGSYFKYEE- 953
            ||.|..||:.::|.:.||::|..:.||:|::||||||.|.||.|.|.||.|.|||:|.|..||: 
 Worm   913 LKHVVQCVIVAVKTIGNIMLVTFMLQFMFAIIGVQLFKGTFFLCNDLSKMTEAECRGEYIHYEDG 977

  Fly   954 DELLPKQELRVWKPRAFHYDNVAAAMLTLFAVQTGEGWPQVLQHSMAATYEDRGPIQNFRIEMSI 1018
            |...|..:.|||....|::|||..||::||.|.|.|||||:|..::.:..||:|||.|.|..:::
 Worm   978 DPTKPVSKKRVWSNNDFNFDNVGDAMISLFVVSTFEGWPQLLYVAIDSNEEDKGPIHNSRQAVAL 1042

  Fly  1019 FYIVYFIVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGEAELQDGEIDKNQKSCIDFTIGARPLERYMPKNRNT 1083
            |:|.:.||..||.:||||..:|:|||.:||.|.::.|:||||:.||:|.:.|:|..||:|:||  
 Worm  1043 FFIAFIIVIAFFMMNIFVGFVIVTFQNEGEREYENCELDKNQRKCIEFALKAKPHRRYIPRNR-- 1105

  Fly  1084 FKYKVWRIVVSTPFEYFIMMLIVFNTLLLMMKYHNQGDMYEKSLKYINMGFTGMFSVETVLKIIG 1148
            .:|:||..|.|..|||.|.::||.||:.|..|::.....:|..|...|:.|||:|:.|.||||:.
 Worm  1106 LQYRVWWFVTSRAFEYVIFLIIVMNTVSLACKHYPSSRGFEDFLDVFNLIFTGVFAFEAVLKIVA 1170

  Fly  1149 FGVKNFFKDPWNIFDLITVLGSIVDALWMEF---GSNSINVGFLRLFRAARLIKLLRQGYTIRIL 1210
            ...||:..|.||:|||:.|:||.:|..:.:.   |:|.|::.|.||||..||:|||.:|..||.|
 Worm  1171 LNPKNYISDRWNVFDLLVVVGSFIDITYGKLNPGGTNLISINFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTL 1235

  Fly  1211 LWTFVQSFKALPYVCLLIAMLFFIYAIIGMQVFGNIKLGTVENSITRHNNFQSFIQGVMLLFRCA 1275
            ||||::||:|||||.|||.:||||||:||||.||.:.|.. ..||.|:|||.||...:::|||.|
 Worm  1236 LWTFMKSFQALPYVALLIVLLFFIYAVIGMQFFGKVALDD-STSIHRNNNFHSFPAAILVLFRSA 1299

  Fly  1276 TGEAWPNIMLAC--LKGKACD---DDAEKA--PGEYCGSTLAYAYFVSFIFFCSFLMLNLFVAVI 1333
            |||||.:|||:|  .:...||   ||..|.  ....||:..||.||:||...||||::|||||||
 Worm  1300 TGEAWQDIMLSCSDREDVRCDPMSDDYHKGGLNESRCGNNFAYPYFISFFMLCSFLVINLFVAVI 1364

  Fly  1334 MDNFDYLTRDSSILGAHHLDEFVRIWAEYDPNATGKIHYTEMYDMLKNMDPPLGFGNKCPNRLAY 1398
            ||||||||||.||||.|||:||||:|:||||:|.|:|.:.::..:|:.:.||||||..||:|||.
 Worm  1365 MDNFDYLTRDWSILGPHHLEEFVRLWSEYDPDAKGRIKHLDVVTLLRKISPPLGFGKLCPHRLAC 1429

  Fly  1399 KKLIRMNMPLDDELRVQFTTTLFALIRENLSIKMRAPEEMDQADMELRETITNIWPLQAKKMLNL 1463
            |:|:.|||||:.:..|.|..|||||:|.||  |:.....:|:|:.:||..|..||....|.:|:.
 Worm  1430 KRLVSMNMPLNSDGTVCFNATLFALVRTNL--KIYTEGNIDEANEQLRSAIKRIWKRTHKDLLDE 1492

  Fly  1464 LVPPSDQLNKGKLSVGKIYAGFLILESWRSTRF---------GQLDSGMPM-LELQDASR--HPS 1516
            :|||:.:  :..::|||.||.|||.:.:|  ||         |.|.:..|. :.||...|  |..
 Worm  1493 VVPPAGK--EDDVTVGKFYATFLIQDYFR--RFKKRKEMEAKGVLPAQTPQAMALQAGLRTLHEI 1553

  Fly  1517 QESLTGADAGHLHPGHSYMN---GHRRSPSLRHNGSPLARSPSPRRRGHQYIHHDIGFSDTVSNV 1578
            ...|..|.:|:|....::..   .|||..||.:|                .:|...|..      
 Worm  1554 GPELKRAISGNLETDFNFDEPEPQHRRPHSLFNN----------------LVHRLSGAG------ 1596

  Fly  1579 VEMVKETRHPRHGNSHPRYPRGSWSASTSPARSPSPSRYGGHLSRSKRTQLPYPTYGTTSLCQRS 1643
                  ::.|   ..|.|..:||......| ||.||                     |.||....
 Worm  1597 ------SKSP---TEHERIEKGSTLLPFQP-RSFSP---------------------THSLAGAE 1630

  Fly  1644 RSPSPARLQEMRERDRLGYGIDMGVTHVQHSYPTLASRRAGIGRRLPPTPSKPSTLQLKPTNINF 1708
            .||.|:::..       |..|:..:     :.|.:    .|..||||..|               
 Worm  1631 GSPVPSQMHR-------GAPINQSI-----NLPPV----NGSARRLPALP--------------- 1664

  Fly  1709 PKLNASPTHTHHSTPHSVHSLPHHRDLLRDPRDMYYSSRERERDRERLRDRDRDRDRDRLHEYDL 1773
            |..|    |.|..|...    |.:|| ..|......|||....:|....|.|.:....|......
 Worm  1665 PYAN----HIHDETDDG----PRYRD-TGDRAGYDQSSRMVVANRNLPVDPDEEEQWMRSGGPSN 1720

  Fly  1774 RYEYRD---RERELYERERDREREVERERLEYIAPLSFE------QALAMGRTGRVLP---SPVL 1826
            |.:.|:   ||..|          |.|.....:|.:|.|      :.:..|::.| ||   .|||
 Worm  1721 RSDRRNPHLREPML----------VARGAALALAGMSSEAYEGTYRPVGEGKSVR-LPFSSRPVL 1774

  Fly  1827 NGFKPKSGLNP------------RHSDSDEEDWCXQRLXLRSRNRKDQIWVXHQAICSSLSAPNL 1879
               :|.....|            |::|:        |: ..:|...::.:        ||....:
 Worm  1775 ---RPAEDSRPVDRLIGQSLGLGRYADA--------RIVGAARREIEEAY--------SLGEQEI 1820

  Fly  1880 DHNFDTIRHSYQIPEHLQNLPYLCPPVHQHQHQHQTQTQNQ--------------RQHQDQ 1926
            |...|::                 .|:.||...|..:..|:              |||..:
 Worm  1821 DLAADSL-----------------APLMQHVGMHDIRDINENSRSALLRPAENSSRQHDSR 1864

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
cacNP_001356945.1 Ion_trans 37..324 CDD:459842 153/299 (51%)
Ion_trans 441..677 CDD:459842 151/243 (62%)
Ion_trans 769..1050 CDD:459842 132/281 (47%)
Ion_trans 1094..1345 CDD:459842 134/260 (52%)
GPHH 1354..1407 CDD:465306 28/52 (54%)
Ca_chan_IQ 1417..1496 CDD:462591 30/78 (38%)
AF-4 <1512..>1704 CDD:461550 39/196 (20%)
egl-19NP_001023079.1 Ion_trans 87..379 CDD:459842 153/299 (51%)
Ion_trans 493..714 CDD:459842 141/224 (63%)
Ion_trans 797..1074 CDD:459842 132/282 (47%)
Ion_trans 1116..1376 CDD:459842 134/260 (52%)
GPHH 1385..1438 CDD:465306 28/52 (54%)
Ca_chan_IQ 1448..1523 CDD:462591 32/80 (40%)
CAC1F_C 1545..1827 CDD:465298 82/404 (20%)

Return to query results.
Submit another query.