Protein Alignment Nrd1 and ide

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572757.2
• Gene: Nrd1 / 32143
• FlyBaseID: FBgn0030344
• Length: 1147
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001082994.2
• Gene: ide / 561390
• ZFINID: ZDB-GENE-070410-85
• Length: 998
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1044
• Identity: 292/1044 - (27%)
• Similarity: 493/1044 - (47%)
• Gaps: 137/1044 - (13%)

  Fly    32 VRAITYSSLCKMTDQVKYLDIPD--KSETDKKLYKTLLLGNGLHALIVSDPSPMPHDGFTTSESS 94
            :|.::..|: :|:|......:.|  :|..||:.|:.|...|||.|:::|||        ||.:||
Zfish    11 IRRVSTLSI-RMSDPAVKRVVSDIIRSPEDKREYRGLEFTNGLKAILISDP--------TTDKSS 66

  Fly    95 SSKSTVSTSSSIISRSESTSSTSTDSESSEESSSEEGDEKLAACALLIDYGSFAEPTKYQGLAHF 159
            :                                           ||.:..||.::|....|||||
Zfish    67 A-------------------------------------------ALDVHMGSLSDPENISGLAHF 88

  Fly   160 LEHMIFMGSEKYPKENIFDAHIKKCGGFANANTDCEDTLFYFEVAEKHLDSSLDYFTALMKAPLM 224
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Zfish    89 CEHMLFLGTEKYPKENEYSQFLSEHAGSSNAFTSGEHTNYYFDVSHEHLQGALDRFAQFFLCPLF 153

  Fly   225 KQEAMQRERSAVDSEFQQILQDDETRRDQLLASLATKGFPHGTFAWGNMKSL-----KENVDDAE 284
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Zfish   154 DESCKDREVNAVDSEHEKNLMNDAWRLFQLEKATGNPKHPFSKFGTGNKLTLETRPSQQGID--- 215

  Fly   285 LHKILHEIRKEH---YGANRMYVCLQARLPIDELESLVVRHFSGIPHNEVKAPDLSSFNYKDAFK 346
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Zfish   216 ---IREELLKFHSTYYSSNLMGLCVLGRETLDELTSMVVKLFGEVENKNVPVPEFPT----HPFQ 273

  Fly   347 AEFHEQVFFVKPVENETKLELTWVLPNVRQYYRSKPDQFLSYLLGYEGRGSLCAYLRRRLWALQL 411
            .|...|.:.|.|:::...|.:|:.:|::::||:|.|..:|.:|:|:||.|||.:.|:.:.|...|
Zfish   274 EEHLRQFYKVVPIKDIRNLYVTFPIPDLQKYYKSNPGHYLGHLIGHEGPGSLLSELKSKGWVNTL 338

  Fly   412 IAGIDE--NGFDMNSMYSLFNICIYLTDEGFKNLDEVLAATFAYVKLFANCGSMKDVYEEQQRNE 474
            :.|..|  .||    |:.:.|  :.||:||..::::::...|.|::.....|..:.|::|.:...
Zfish   339 VGGQKEGARGF----MFFIIN--VDLTEEGLLHVEDIIFHMFQYIQKLRTEGPQEWVFQECKDLN 397

  Fly   475 ETGFRFHAQRPAFDNVQELVLNLKYFPPKDILTGKELYYEYNEEHLKELISHLNEMKFNLMVTSR 539
            ...|||..:........::...|.|:|.::||..:.|..|:..:.::.::..|......:.|.|
Zfish   398 TVAFRFKDKERPRGYTSKVAGLLHYYPLEEILAAEYLLEEFRPDLIEMVLDKLRPENVRVAVVS- 461

  Fly   540 RKYDDISAYDKTEEWFGTEYATIPMPEKWRKLWEDSVPLPELFLPESNKYVTDDFTLHWHSMGRP 604
            :.::  ...|:||||:||:|....:.::..|.|:::....:..||..|:::..:|.::      |
Zfish   462 KSFE--GQTDRTEEWYGTQYKQEAITDEAIKKWDNADLNGKFKLPMKNEFIPTNFEIY------P 518

  Fly   605 ---EVPDSPKLLIKTDTCELWFRQDDKFDLPEAHMAFYFISPMQRQNAKNDAMCSLYEEMVRFHV 666
               :.|.:|.|:..|...::||:|||||.||:|.:.|.|.||....:..:..|..||.|:::..:
Zfish   519 LEKDSPSAPTLIKDTAMSKVWFKQDDKFFLPKACLNFEFFSPFAYVDPLHCNMAYLYLELLKDSL 583

  Fly   667 CEELYPAISAGLSYSLSTIEKGLLLKVCGYNEKLHLIVEAIAEGMLNVAETLDENMLSAFVKNQR 731
            .|..|.|..|||||.|.....|:.|.|.|||:|.|::::.|.|.|...  .:||......    :
Zfish   584 NEYAYAAELAGLSYDLQNTVYGMYLSVKGYNDKQHILLKKIIEKMATF--EIDEKRFDII----K 642

  Fly   732 KAFFNALIKPKALNRD------IRLCVLERIRWLMINKYKCLSSVILEDMREFAHQFPKELYIQS 790
            :|:..:|...:|....      :||.:.| :.|........|..|.|..::.|..|....|:|::
Zfish   643 EAYMRSLNNFRAEQPHQHAMYYLRLLMTE-VAWTKDELRDALDDVTLPRLKAFIPQLLSRLHIEA 706

  Fly   791 LIQGNYTEESAHNVMNSLLSRLNCKQIRERGRFLEDITVKLPVGTSIIRCHALNVQD-------- 847
            |:.||.|::||..:|..|...|           :|....|..:.:.:||...:.|.|
Zfish   707 LLHGNITKQSALEMMQMLEDTL-----------IEHAHTKPLLPSQLIRYREVQVPDGGWYVYQQ 760

  Fly   848 -----TNTVITNFYQIGPNTVRVESILDLLMMFVDEPLFDQLRTKEQLGYHVGATVRLNYGIAGY 907
                 .|..|..:||..........:|:|....:.||.|:.|||||||||.|.:..|...|:.|.
Zfish   761 RNEVHNNCGIEIYYQTDMQNTHENMLLELFCQIISEPCFNTLRTKEQLGYIVFSGPRRANGVQGL 825

  Fly   908 SIMVNSQETKTTADYVEGRIEVFRAKMLQILRHLPQDEYEHTRDSLIKLKLVADLALSTEMSRNW 972
            ..::.|::   ...|:|.|:|.|...|.:.:..:..:.::....:|...:|.....|:.|.::.|
Zfish   826 RFIIQSEK---APHYLESRVEAFLKTMEKSVEEMGDEAFQKHIQALAIRRLDKPKKLAAECAKYW 887

  Fly   973 DEIINESYLFDRRRRQIEVLRTLQKDEIINF---VISIDGDNMRKLSVQVIGHRPAGMPEPLCGE 1034
            .|||::.|.|||...::..|:||.|:.|:.|   :::||.....|:||.|:.......  ||.||
Zfish   888 GEIISQQYNFDRDNIEVAYLKTLTKEHIMQFYRDLLAIDAPRRHKVSVHVLSREMDSC--PLVGE 950

  Fly  1035 DTAK 1038
            ..|:
Zfish   951 FPAQ 954

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nrd1	NP_572757.2	Ptr	55..1030	CDD:440648	282/1009 (28%)
ide	NP_001082994.2	Ptr	22..985	CDD:440648	289/1032 (28%)