Protein Alignment Nrd1 and nrd1b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572757.2
• Gene: Nrd1 / 32143
• FlyBaseID: FBgn0030344
• Length: 1147
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001038180.2
• Gene: nrd1b / 557565
• ZFINID: ZDB-GENE-050208-422
• Length: 1061
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1101
• Identity: 370/1101 - (33%)
• Similarity: 585/1101 - (53%)
• Gaps: 117/1101 - (10%)

  Fly    55 KSETDKKLYKTLLLGNGLHALIVSDPSPMPHDGFTTSESSSSKSTVSTSSSIISRSESTSSTSTD 119
            ||..|.|.|:.:.|.|||.||::||.|         |:|.|.:.:|...   :.......|.|..
Zfish    46 KSPNDYKTYRYIELSNGLKALLISDVS---------SQSESCRESVDKE---VEEEGDRGSASDI 98

  Fly   120 SESSEESSSEEGDEKLAACALLIDYGSFAEPTKYQGLAHFLEHMIFMGSEKYPKENIFDAHIKKC 184
            |:.||........||.:|.||.|..|||::|....|||||||||:||||||||.||.|||.:||.
Zfish    99 SKHSERGKQSCRSEKQSAAALCISVGSFSDPADLPGLAHFLEHMVFMGSEKYPVENGFDAFLKKH 163

  Fly   185 GGFANANTDCEDTLFYFEVAEKHLDSSLDYFTALMKAPLMKQEAMQRERSAVDSEFQQILQDDET 249
            ||..||:||||.|:|.|:|..|:|..:||.:......|||..:|:.||..|||||:|.....|..
Zfish   164 GGSDNASTDCERTIFQFDVQRKYLREALDRWAQFFICPLMIPDAVDREVEAVDSEYQMAQPLDSN 228

  Fly   250 RRDQLLASLATKGFPHGTFAWGNMKSLKENVDDAEL--HKILHEIRKEHYGANRMYVCLQARLPI 312
            |::.|..|||..|.|...|.|||.::||:...:.::  ::.|.:..:.:|.|..|.:.:|::..:
Zfish   229 RKEMLFGSLAKAGHPMSKFFWGNAQTLKQEPREKKINTYERLRDFWRRYYSAQYMTLAVQSKETL 293

  Fly   313 DELESLVVRHFSGIPHNEVKAPDLSSFNYKDAFKAEFHEQVFFVKPVENETKLELTWVLPNVRQY 377
            |.||..|...|..||:|.:...|.|  :.:|.|......:::.|.||:....|.::|.||...::
Zfish   294 DTLEEWVREIFVQIPNNGLPKADFS--DLQDPFDTPDFCKLYRVVPVQKVHALTISWALPPQAKH 356

  Fly   378 YRSKPDQFLSYLLGYEGRGSLCAYLRRRLWALQLIAGIDENGFDMNSMYSLFNICIYLTDEGFKN 442
            ||.||..::|:|:|:||.||:.:.||:|.|||.|..|..|:|||.||.||:|:|.|.|:|||.:|
Zfish   357 YRVKPLHYISWLIGHEGVGSVLSLLRKRCWALSLFGGNSESGFDQNSTYSIFSISITLSDEGLQN 421

  Fly   443 LDEVLAATFAYVKLFANCGSMKDVYEEQQRNEETGFRFHAQRPAFDNVQELVLNLKYFPPKDILT 507
            ..:|:...|.|:|:..:.|..:.:|||.|:.|...|.:..|....:.|..:..|::.||.:..|.
Zfish   422 FLQVIHIIFQYLKMLQSVGPQQRIYEEIQKIEANEFHYQEQTEPIEFVANMSENMQLFPKEHFLC 486

  Fly   508 GKELYYEYNEE--H--LKELISHLNEMKFNLMVTSRRKYDDISAYDKTEEWFGTEYATIPMPEKW 568
            |.:|.:::|.|  |  :...:|.|...|.|:::.| .::|.:...  .|:||||:|:...:|:::
Zfish   487 GDQLMFDFNPEASHCVISAALSLLTPGKANILLLS-PQHDGLCPL--KEKWFGTQYSVEDIPQEF 548

  Fly   569 RKLWEDSVPL-PELFLPESNKYVTDDFTLHWHSMGRPEVPDS--PKLLIKTDTCELWFRQDDKFD 630
            |.||....|| |||.||..||::..||||.     ..:.||:  |..:|..:...||||:|:||.
Zfish   549 RDLWAGDFPLHPELQLPAENKFIATDFTLR-----TSDCPDTDFPVKIIDNERGRLWFRKDNKFK 608

  Fly   631 LPEAHMAFYFISPMQRQNAKNDAMCSLYEEMVRFHVCEELYPAISAGLSYSLSTIEKGLLLKVCG 695
            :|:|:..|..::|..:::.||..:..|:..:|..::.|..|.|..|.|.|:|...:.||.:::.|
Zfish   609 IPKAYARFQLLTPFIQESPKNLVLFDLFVNIVAHNLAELAYDAEVAQLQYNLLPGDHGLFIRLKG 673

  Fly   696 YNEKLHLIVEAIAEGMLNVAETLDENMLSAFVKNQRKAFFNALIKPKALNRDIRLCVLERIRWLM 760
            :|.||.|:::.|.:.:.:.:.|.|  :.:.|::..:|.::..||:|:.|.:|:||.:||..||.:
Zfish   674 FNHKLPLLLKLIVDHLADFSATPD--VFNMFIEQLKKTYYIILIRPERLGKDVRLQILEHHRWSV 736

  Fly   761 INKYKC-LSSVILEDMREFAHQFPKELYIQSLIQGNYTEESAHNVMNSLLSRLNCKQIRERGRFL 824
            :.||:. ::...:.|:..||::|..||:::.|:|||:|...:...       |.|        |:
Zfish   737 MQKYEAIMADPSVADLMTFANRFKAELFVEGLVQGNFTSAESKEF-------LQC--------FI 786

  Fly   825 EDI--------------TVKLPVGTSIIRCHALNVQDTNTVITNFYQIGPNTVRVESILDLLMMF 875
            |.:              .|:||....:.:..:||..|.|:.:|.:||.|...:|..::::||:|.
Zfish   787 EKLKYAPHPIEPPVLFRVVELPQTHHLCKVQSLNKADANSEVTVYYQTGLKNLREHTLMELLVMH 851

  Fly   876 VDEPLFDQLRTKEQLGYHVGATVRLNYGIAGYSIMVNSQETKTTADYVEGRIEVFRAKMLQILRH 940
            ::||.||.|||||.|||.|....|...||.|:|:.|.:|.||.:.|:|||:||.|.....:.|..
Zfish   852 MEEPCFDFLRTKETLGYQVYPICRNTSGILGFSVTVETQATKFSTDFVEGKIEAFLVSFGEKLVQ 916

  Fly   941 LPQDEYEHTRDSLIKLKLVADLALSTEMSRNWDEIINESYLFDRRRRQIEVLRTLQKDEIINFVI 1005
            |..:.:.....:|||||...|..|..|:.|||.|::.:.|:|||..::||:|:.:.|||:::|.:
Zfish   917 LSDEAFGAQVTALIKLKECEDTQLGDEVDRNWFEVVTQQYVFDRLNKEIEILKDVTKDELVSFYM 981

  Fly  1006 SIDGDNMRKLSVQVIGHRPAGMPEPLCGEDTAKCASKSDDESESENDDDDDEDEEEEESSEEEEE 1070
            ....:|.||||:.|:|.                                              .|
Zfish   982 EHRKENSRKLSIHVVGF----------------------------------------------GE 1000

  Fly  1071 EEKEKEGLKGEDE-----DDLFYSLENKLNIVFLPAKFNNAFIITDIEKFKDDQYVYPQQK 1126
            ||||   :.|||:     :...|:..:||..:...|....:.:||||..|....:::|..|
Zfish  1001 EEKE---IHGEDQCSSNPETSSYANISKLTFLSAAAMKEKSTMITDIRAFTSSLHLHPYHK 1058

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nrd1	NP_572757.2	Ptr	55..1030	CDD:440648	351/998 (35%)
nrd1b	NP_001038180.2	Ptr	29..997	CDD:440648	350/989 (35%)