Protein Alignment Nrd1 and Y70C5C.1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572757.2
• Gene: Nrd1 / 32143
• FlyBaseID: FBgn0030344
• Length: 1147
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_507226.2
• Gene: Y70C5C.1 / 190566
• WormBaseID: WBGene00013492
• Length: 985
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1047
• Identity: 274/1047 - (26%)
• Similarity: 456/1047 - (43%)
• Gaps: 134/1047 - (12%)

  Fly    55 KSETDKKLYKTLLLGNGLHALIVSDPSPMPHDGFTTSESSSSKSTVSTSSSIISRSESTSSTSTD 119
            |...|::.|:.|.|.||:..|:||||        ||.:|
 Worm    18 KGAQDEREYRGLELTNGIRVLLVSDP--------TTDKS-------------------------- 48

  Fly   120 SESSEESSSEEGDEKLAACALLIDYGSFAEPTKYQGLAHFLEHMIFMGSEKYPKENIFDAHIKKC 184
                             |.||.::.|...:|.:..|||||.|||:|:|:.|||.||.:...:...
 Worm    49 -----------------AAALDVNVGHLMDPWELPGLAHFCEHMLFLGTAKYPSENEYFKFLTAH 96

  Fly   185 GGFANANTDCEDTLFYFEVAEKHLDSSLDYFTALMKAPLMKQEAMQRERSAVDSEFQQILQDDET 249
            .|.|||||..:.|.::|||....|..:||.|.....:|...:.|.:||..|||||....|.:|..
 Worm    97 AGRANANTATDHTNYFFEVKPDQLPGALDRFVQFFLSPQFTESATEREVCAVDSEHSNNLNNDAW 161

  Fly   250 RRDQLLASLATKGFPHGTFAWGNMKSLKENV--DDAELHKILHEIRKEHYGANRMYVCLQARLPI 312
            |..|:..|.|..|..:|.|..||.|:|.|:.  ...|....|.:..|:.|.:|.|..|:..:..:
 Worm   162 RFLQVHRSCAKPGHDYGKFGTGNKKTLLEDARKQGIEPRDALLQFHKKWYSSNIMTCCIIGKESL 226

  Fly   313 DELES-LVVRHFSGIPHNEVKAPDLSSFNYKDAFKAEFHEQVFFVKPVENETKLELTWVLPNVRQ 376
            |.||| |....|:.|.:.:::......|    .|..|...:...|.|:::..::.:::..|::..
 Worm   227 DVLESYLGTFEFAAIDNKKLERQIWKEF----PFGPEQLGKRIDVVPIKDTRQISISFPFPDLTG 287

  Fly   377 YYRSKPDQFLSYLLGYEGRGSLCAYLRRRLWALQLIAG--IDENGFDMNSMYSLFNICIYLTDEG 439
            .:.|:|:.::|:|:|:||.|||.:.|:|..|.:.|.:|  :...||      ..|.:.|.|:.||
 Worm   288 EFLSQPEHYISHLIGHEGHGSLLSELKRLGWVVSLQSGYVVQAAGF------GNFQVGIELSTEG 346

  Fly   440 FKNLDEVLAATFAYVKLFANCGSMKDVYEEQQRNEETGFRFHAQRPAFDNVQELVLNLKYFPPKD 504
            .:::||::...|.|:.:..:.|..:.|:||........|||..:.........:...|:..|.|.
 Worm   347 LEHVDEIIQLMFNYIGMMQSSGPKQWVHEELAELRAVTFRFKDKEQPMAMASCVAARLQRIPFKH 411

  Fly   505 ILTGKELYYEYNEEHLKELISHLNEMKFNLMVTSRRKYDDISAYDKTEEW------FGTEYATIP 563
            :|:...|...|....:|||:|        :::.|..|...:|...|.:|.      :|||.....
 Worm   412 VLSSPHLLTNYEPVRIKELLS--------MLIPSNMKIQVVSQKFKGQEGNTNEPVYGTEIKVTR 468

  Fly   564 MPEKWRKLWEDSVPLPE--LFLPESNKYVTDDFTLHWHSMGRPEVPDSPKLLIKTDTCELWFRQD 626
            :..:..:.:|:::....  |.|||.|:|:...|......:.:   .|.|:|:...:...:||:||
 Worm   469 ISSETMQKYEEALKTSHHALHLPEKNQYIATKFDQKPRELVK---SDHPRLINDDEWSRVWFKQD 530

  Fly   627 DKFDLPEAHMAFYFISPMQRQNAKNDAMCSLYEEMVRFHVCEELYPAISAGLSYSLSTIEKGLLL 691
            |::.:|:........:|:..|:.:...:..|:...:...:.||.|.|..|||:|.|.:...|:.:
 Worm   531 DEYKMPKQETKLALTTPIVSQSPRMTLLSRLWLRCLSDSLAEESYSAKVAGLNYELESSFFGVQM 595

  Fly   692 KVCGYNEKLHLIVEAIAEGMLNVAETLDENMLSAFVKNQRKAFFN-ALIKPKALNRD-IRLCVLE 754
            :|.||.||..|..:.:.:.:.|.  .:|:........:.::...| |..:|..|::. ..|.|::
 Worm   596 RVSGYAEKQALFSKHLTKRLFNF--KIDQTRFDVLFDSLKRDLTNHAFSQPYVLSQHYTELLVVD 658

  Fly   755 RIRWLMINKYKCLSSVILEDMREFAHQFPKELYIQSLIQGNYTEESAHNVMNSLLSRLNCKQIRE 819
            : .|..........||.|||::.|..:..:..:::.|:.||.||:....:...|:..|.......
 Worm   659 K-EWSKQQLLAVCESVKLEDVQRFGKEMLQAFHLELLVYGNSTEKETIQLSKDLIDILKSAAPSS 722

  Fly   820 RGRFLED----ITVKLPVGTSIIRCHALNVQDTNTV-ITNFYQIGPNTVRVESILDLLMMFVDEP 879
            |..|..:    ..::|..|...|..|.....|...| :|  ||||.......:::.|:...:.||
 Worm   723 RPLFRNEHILRREIQLNNGDEYIYRHLQTTHDVGCVQVT--YQIGVQNTYDNAVIGLIKNLITEP 785

  Fly   880 LFDQLRTKEQLGYHVGATVRLNYGIAGYSIMVNSQETKTTADYVEGRIEVFRAKMLQILRHLPQD 944
            .||.|||||.|||.|......|.|.....|:|...:   :.|:|..|||.|...:.:.:..:||:
 Worm   786 AFDTLRTKESLGYIVWTRTHFNCGTVALQILVQGPK---SVDHVLERIEAFLESVRKEIVEMPQE 847

  Fly   945 EYEHTRDSLIKLKLVADLALSTEMSRNWDEIINESYLFDRRRRQIEVLRTLQKDEIINFV---IS 1006
            |:|:....||.........||....:.||||....|.|.|....:|:|:|::|:::|...   |.
 Worm   848 EFENRVSGLIAQLEEKPKTLSCRFKKFWDEIECRQYNFTRIEEDVELLKTIKKEDVIALFDKKIR 912

  Fly  1007 IDGDNMRKLSVQVIGHRPAGMPEPLCGEDTAKCASKSDDESESENDDDDDEDEEEEESSEEEEEE 1071
            ......|||:|.|.|                    ||:|.:           ...|...:..|:.
 Worm   913 KGAAERRKLAVIVHG--------------------KSEDRA-----------AVNEIIKKHLEDG 946

  Fly  1072 EKEKEGL 1078
            :|:||.|
 Worm   947 KKKKEVL 953

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nrd1	NP_572757.2	Ptr	55..1030	CDD:440648	265/997 (27%)
Y70C5C.1	NP_507226.2	Ptr	16..965	CDD:440648	274/1047 (26%)