Protein Alignment Nrd1 and ide

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572757.2
• Gene: Nrd1 / 32143
• FlyBaseID: FBgn0030344
• Length: 1147
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002939138.2
• Gene: ide / 100490154
• XenbaseID: XB-GENE-481159
• Length: 1011
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1068
• Identity: 293/1068 - (27%)
• Similarity: 502/1068 - (47%)
• Gaps: 173/1068 - (16%)

  Fly    26 ITQLAGV------RAITYSSLCKMTDQ--VKYL--DIPDKSETDKKLYKTLLLGNGLHALIVSDP 80
            :.|:||:      |.:..:.:|:..:.  ||.:  || .||..||:.|:.|.|.||:.|:::|||
 Frog    10 VRQVAGILHRTALREVHQTKICRKMNSLAVKQIINDI-SKSPEDKREYRGLELANGIKAIVISDP 73

  Fly    81 SPMPHDGFTTSESSSSKSTVSTSSSIISRSESTSSTSTDSESSEESSSEEGDEKLAACALLIDYG 145
                    ||.:||:                                           ||.:..|
 Frog    74 --------TTDKSSA-------------------------------------------ALDVHIG 87

  Fly   146 SFAEPTKYQGLAHFLEHMIFMGSEKYPKENIFDAHIKKCGGFANANTDCEDTLFYFEVAEKHLDS 210
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 Frog    88 SLSDPNNIAGLAHFCEHMLFLGTKKYPKENEYSQFLSEHAGSSNAFTSGEHTNYYFDVSHEHLEG 152

  Fly   211 SLDYFTALMKAPLMKQEAMQRERSAVDSEFQQILQDDETRRDQLLASLATKGFPHGTFAWGNMKS 275
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 Frog   153 ALDRFAQFFLCPLFDESCKDREVNAVDSEHEKNLMNDAWRLFQLEKATGNPNHPFSKFGTGNKLT 217

  Fly   276 L-----KENVDDAELHKILHEIRKEH---YGANRMYVCLQARLPIDELESLVVRHFSGIPHNEVK 332
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 Frog   218 LETRPTQQGID------IRQELLKFHSTYYSSNLMSLCVLGRESLDSLTELIIKLFAEVENKIVP 276

  Fly   333 APDLSSFNYKDAFKAEFHEQVFFVKPVENETKLELTWVLPNVRQYYRSKPDQFLSYLLGYEGRGS 397
            .|:...    ..|:.|...|::.:.|:::...|.:|:.:|::::||:|.|..:|.:|:|:||.||
 Frog   277 LPEFPD----HPFQEEHLRQMYKIVPIKDIRNLYVTFPIPDLQKYYKSNPGHYLGHLIGHEGPGS 337

  Fly   398 LCAYLRRRLWALQLIAGIDE--NGFDMNSMYSLFNICIYLTDEGFKNLDEVLAATFAYVKLFANC 460
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 Frog   338 LLSELKAKGWVNTLVGGQKEGAKGF----MFFIIN--VDLTEEGLLHVDDIIFHMFQYIQKLRTE 396

  Fly   461 GSMKDVYEEQQRNEETGFRFHAQRPAFDNVQELVLNLKYFPPKDILTGKELYYEYNEEHLKELIS 525
            |..:.|::|.:......|||..:........::...|.|:|.:::|:.:.|..|:..:.::.::.
 Frog   397 GPQEWVFQECKDLNAVAFRFKDKERPRGYTSKVAGLLHYYPLEEVLSAEYLLEEFRPDLIEMVLD 461

  Fly   526 HLNEMKFNLMVTSRRKYDDISAYDKTEEWFGTEYATIPMP----EKWRKLWEDSVPLPELF-LPE 585
            .|......:.|.| :.::  ...|:||||:||:|....:.    |||:|     ..|...| ||.
 Frog   462 KLRPENVRVAVVS-KSFE--GKTDRTEEWYGTQYKQEDLAQEVIEKWQK-----ADLNGKFKLPM 518

  Fly   586 SNKYVTDDFTLHWHSMGRPEVPDS---PKLLIKTDTCELWFRQDDKFDLPEAHMAFYFISPMQRQ 647
            .|:::..:|.:      .|...|:   |.|:..|...:|||:|||||.||::.:.|.|.||....
 Frog   519 KNEFIPTNFEI------LPLEKDATSYPALIKDTAMSKLWFKQDDKFFLPKSCLNFEFFSPFAYV 577

  Fly   648 NAKNDAMCSLYEEMVRFHVCEELYPAISAGLSYSLSTIEKGLLLKVCGYNEKLHLIVEAIAEGML 712
            :..:..|..||.|:::..:.|..|.|..|||:|.|.....|:.|.:.||::|.|::::.|.|.|.
 Frog   578 DPLHCNMAYLYLELLKDSLNEYAYAAELAGLNYDLQNTIYGMYLSLKGYSDKQHILLKKIIEKMA 642

  Fly   713 NVAETLDENMLSAFVKNQRKAFFNALIKPKALNRD------IRLCVLERIRWLMINKYKCLSSVI 771
            ..  .:||......    ::|:..:|...:|....      :||.:.| :.|......:.|..|.
 Frog   643 TF--EIDEKRFEII----KEAYMRSLNNFRAEQPHQHAMYYLRLLMTE-VAWTKDELKEALDDVT 700

  Fly   772 LEDMREFAHQFPKELYIQSLIQGNYTEESAHNVM----NSLLSRLNCK-------------QIRE 819
            |..::.|..|....|::::|:.||.|:::|..:|    ::|:...:.|             |:.:
 Frog   701 LLRLKAFIPQLLSRLHVEALVHGNITKQAAMGIMQMVEDTLIEHAHTKPLLPSQLVRYREVQLPD 765

  Fly   820 RGRFLEDITVKLPVGTSIIRCHALNVQDTNTVITN-----FYQIGPNTVRVESILDLLMMFVDEP 879
            ||.|:                    .|..|.|..|     :||....:.....:|:||...:.||
 Frog   766 RGWFV--------------------YQQRNEVHNNCGIEIYYQTDMQSTSENMLLELLCQIISEP 810

  Fly   880 LFDQLRTKEQLGYHVGATVRLNYGIAGYSIMVNSQETKTTADYVEGRIEVFRAKMLQILRHLPQD 944
            .|:.|||||||||.|.:..|...||.|...::.|::   ...|:|.|:|.|.....:.|..:..:
 Frog   811 CFNTLRTKEQLGYIVFSGPRRANGIQGLRFIIQSEK---PPHYLESRVEAFLKTTEKSLEDMADE 872

  Fly   945 EYEHTRDSLIKLKLVADLALSTEMSRNWDEIINESYLFDRRRRQIEVLRTLQKDEIINF---VIS 1006
            .::....:|...:|.....||.|.::.|.|||::.|.|||...::..|:||.|::|:||   ::|
 Frog   873 AFQKHIQALAIRRLDKPKKLSAECAKYWGEIISQQYNFDRDNIEVAYLKTLVKEDIMNFYKNMLS 937

  Fly  1007 IDGDNMRKLSVQVIGHRPAGMPEPLCGE 1034
            :|.....|:||.|:.......  |:.||
 Frog   938 VDAPRRHKVSVHVLSREMDSC--PVVGE 963

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nrd1	NP_572757.2	Ptr	55..1030	CDD:440648	281/1023 (27%)
ide	XP_002939138.2	Ptr	42..998	CDD:440648	286/1036 (28%)