DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG34408 and RALGAPB

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001285078.1 Gene:CG34408 / 31953 FlyBaseID:FBgn0085437 Length:1728 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_005260519.1 Gene:RALGAPB / 57148 HGNCID:29221 Length:1507 Species:Homo sapiens


Alignment Length:1807 Identity:694/1807 - (38%)
Similarity:945/1807 - (52%) Gaps:391/1807 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MYSEWASLSAQITANSCGAQCFSVLNKFPASAGREVVVSVVKQLGTNLGITQNAEPSHLVK-DEE 64
            |||||.||.. :..|..|..  |||:.:|.|.||||..:||:.||..||....|...:|:| |:|
Human     1 MYSEWRSLHL-VIQNDQGHT--SVLHSYPESVGREVANAVVRPLGQVLGTPSVAGSENLLKTDKE 62

  Fly    65 VKWCMDVICFGLSLPLQEHETIKDCVNVYCEWLTALHPQPRISVPKPICEDANLYARQIINHFHN 129
            |||.|:|||:||:||| :.||:|.||:||.:|:.|| ..|:.|:|.|:.::.|.|.:.|:.|..|
Human    63 VKWTMEVICYGLTLPL-DGETVKYCVDVYTDWIMAL-VLPKDSIPLPVIKEPNQYVQTILKHLQN 125

  Fly   130 LFVPRQGEILPFLYQTTLGADTIKRQAVLCHRVLRTLQQTAQISQLMDRQTWDTLLLFLLAINEI 194
            ||||||.:          |:..|:    ||.:|||.:|:.|:.|.||.|:||:.||||||.||:|
Human   126 LFVPRQEQ----------GSSQIR----LCLQVLRAIQKLARESSLMARETWEVLLLFLLQINDI 176

  Fly   195 LLAPPTVKDDVGDQLCERVLSVLFEVWLLACVRSFPSPSMWKTLQESCAMWRHRVALVDQWNRVN 259
            |||||||:..:.:.|.|:::.||||||||||.|.||:|..|||.:|..|.|||..|:|:||::|.
Human   177 LLAPPTVQGGIAENLAEKLIGVLFEVWLLACTRCFPTPPYWKTAKEMVANWRHHPAVVEQWSKVI 241

  Fly   260 LALTARLLEFSYGPAFPQLKNADEDGQLIPIGMSNDCVAQTWYRFLRMIGNPTALCSPHIISKSS 324
            .|||:|||.|:|||:||..|..|||..|||..|.|:||||||:|||.|:.||..|.:|.|||.:.
Human   242 CALTSRLLRFTYGPSFPAFKVPDEDASLIPPEMDNECVAQTWFRFLHMLSNPVDLSNPAIISSTP 306

  Fly   325 HFVQWALTHEKG--AETHQHPCLQQLPQIFLNAMKGISSQVDAFLGVYQPPPQQTDGVVTNLLEI 387
            .| |....:..|  .|.:|:|||:.|||||..||:|||..||||||:.:|               
Human   307 KF-QEQFLNVSGMPQELNQYPCLKHLPQIFFRAMRGISCLVDAFLGISRP--------------- 355

  Fly   388 RHSLNEATSSTLQQFIHSSSATNIANQQNQPAHHHHHLHYPHLHLHGAGSFLRDNFMSNSASSAL 452
                                                                    .|:||    
Human   356 --------------------------------------------------------RSDSA---- 360

  Fly   453 NAIMGHHGGHHGHHHQQQQQQQQQLQISASPTSSLTTSGSSAVGSTSAGGSHSAGVVGSISFGAT 517
                                       ..:|.:.|:...|:||.:                    
Human   361 ---------------------------PPTPVNRLSMPQSAAVST-------------------- 378

  Fly   518 ESPGPGQASASATPTPPLQRRLAKSFSVAPTITQQKGLSKTSLIGLTGGGARNAISSSSTTTTNA 582
                          |||..||       ...:|..|...|||.:. |...::....:|||     
Human   379 --------------TPPHNRR-------HRAVTVNKATMKTSTVS-TAHASKVQHQTSST----- 416

  Fly   583 GSTGGTGSGDGSAPAPLPTTPTSTSGPPSASSSINSLPLTSMGAGVELAVARPKCNSILHVFHEW 647
                          :|| ::|..||..|      ..||          |..|||.||||::|..|
Human   417 --------------SPL-SSPNQTSSEP------RPLP----------APRRPKVNSILNLFGSW 450

  Fly   648 LFEAAHIGGDTWRQNRKKQACE---ASKRPSSMI-------------------MEHRKGSISLSQ 690
            ||:||.:            .|:   ...|.|||.                   ||.|:....:|.
Human   451 LFDAAFV------------HCKLHNGINRDSSMTASFIQILLSYKSSITTQASMEFRRKGSQMST 503

  Fly   691 ----PNSLNDPQSLPPTLTIDKYESGRAEAIGTLCKIFCAKKTGEEILPVYLARFYMALQQCLKI 751
                .|.:.|....|     |.||:|||||.||||:|||:|||||||||.||:||||.|.|.|:|
Human   504 DTMVSNPMFDASEFP-----DNYEAGRAEACGTLCRIFCSKKTGEEILPAYLSRFYMLLIQGLQI 563

  Fly   752 TESRECDETLASILLHSSDLFRLDLDGINVLLPGFIAALEIVLPDKDLKLKTQSMVFNRTELRRS 816
            .: ..|...|||::|:|..||..||.||:|::|.||:|||.:|||::|. |.:|.| |.||||||
Human   564 ND-YVCHPVLASVILNSPPLFCCDLKGIDVVVPYFISALETILPDRELS-KFKSYV-NPTELRRS 625

  Fly   817 AINILLSIMVLPLHYQTLPIRDLTCE---------SSEKMFTFIQLKSRLMNILMNALQVETDAQ 872
            :||||||::.||.|:.|:. .::..|         |.:|..||:.||.||:|||:.|||.|||..
Human   626 SINILLSLLPLPHHFGTVK-SEVVLEGKFSNDDSSSYDKPITFLSLKLRLVNILIGALQTETDPN 689

  Fly   873 NTHMLLGGLLLCVQDAVTFE----ETELGGGNANLSQNSSGVQHHDANLLSSACSERSASLVSAG 933
            ||.|:||.:|..|||:...|    :.|:|||..||                     :|.|..::|
Human   690 NTQMILGAMLNIVQDSALLEAIGCQMEMGGGENNL---------------------KSHSRTNSG 733

  Fly   934 TASLGGQTTATMGAGSGSIRDTASAHDYPSLTISDDMSFEFGQELEGVTTYDNAHALFVRATYLV 998
            .:|..|          ||...|....:.|:..:..|.:.          ..|:|..|.:|:.:||
Human   734 ISSASG----------GSTEPTTPDSERPAQALLRDYAL----------NTDSAAGLLIRSIHLV 778

  Fly   999 CHRLISSWKTDLNVSLAALELLSGLARLHIRETDALECKRAVKWICDYICYQCSRPPPAHSKDLH 1063
            ..||.|.|:.|:::||||||||||||::.:. .|:.:.|||:..:|.||.||||||.|.||:|||
Human   779 TQRLNSQWRQDMSISLAALELLSGLAKVKVM-VDSGDRKRAISSVCTYIVYQCSRPAPLHSRDLH 842

  Fly  1064 STIVAAFQCTAAWLMQHPYLLQDKDCLQTVLEVVELGISGTKSQSKGTDIPKFKDEKELKPASMR 1128
            |.|||||||...||.:||.:|.:||||:.|||:|||||||:||::...:: |:|.:||..|||||
Human   843 SMIVAAFQCLCVWLTEHPDMLDEKDCLKEVLEIVELGISGSKSKNNEQEV-KYKGDKEPNPASMR 906

  Fly  1129 VRDAAENLLTIILEQVGYFPSECGPESISSLLDELALMKHCNSMVPAAAASSEQAIAKFKYFVTE 1193
            |:||||..||.|::.:|.|||..||.|..||::|..|:|:  |.:|.....|      |:|||.:
Human   907 VKDAAEATLTCIMQLLGAFPSPSGPASPCSLVNETTLIKY--SRLPTINKHS------FRYFVLD 963

  Fly  1194 NSTILALLEEPLGNDQ-DPQPTVTLLIRGPFGRHAWTMQLRHLPR-SKSGIKYHAINPGRPIPMN 1256
            ||.|||:||:||||:| |..|:||:|:||..||.||..||..||| :|:..|.....| ||:|.|
Human   964 NSVILAMLEQPLGNEQNDFFPSVTVLVRGMSGRLAWAQQLCLLPRGAKANQKLFVPEP-RPVPKN 1027

  Fly  1257 DVTQRLDSEQKNFPDGVDKVQPCVADYSIPTIEQMREQYGTAVIRELESLLENQSIHEKLAWAEA 1321
            ||..:...:.:.||:.|||:....||.|||.:.::       |..|||..      ||||....|
Human  1028 DVGFKYSVKHRPFPEEVDKIPFVKADLSIPDLHEI-------VTEELEER------HEKLRSGMA 1079

  Fly  1322 DTSADSLSHAQ----------------ECVPPTVCHEFHAARLFLSHFGFLGFET-RNPQNPAEA 1369
            ...|..:...|                :|.||....||..|||||||||||..|. :.|.|..  
Human  1080 QQIAYEIHLEQQSEEELQKRSFPDPVTDCKPPPPAQEFQTARLFLSHFGFLSLEALKEPANSR-- 1142

  Fly  1370 LGNPPQRPLIVLDTKSAAFAADLDRLDKLSARTHDSVYVFYVKSGQTSAQQIIANMGEESSASHD 1434
              .||.  ||.||:....|..|:..||.|..|..|:|::||:|.||.:.|:|:.|:  |||.:..
Human  1143 --LPPH--LIALDSTIPGFFDDIGYLDLLPCRPFDTVFIFYMKPGQKTNQEILKNV--ESSRTVQ 1201

  Fly  1435 PHFASMLQTLGWPVQVSEHSGWTGFAHNSWSL------KGTPEEQLKSTAN--ELNYNGSQRVLY 1491
            |||...|.:|||.|.|..|.||||....|||:      :|:.:|::.|:.:  ...:||.::|||
Human  1202 PHFLEFLLSLGWSVDVGRHPGWTGHVSTSWSINCCDDGEGSQQEEVISSEDIGASIFNGQKKVLY 1266

  Fly  1492 WADVSSEIAFVVPTTWNLRYNSDTCDSGSISSTDQIGSSNVWTRGEADSAAGLAKSKSRNLSLEL 1556
            :||..:|||||||:.  :...:|:.:|   :.:||...||:      |...|:.|..|  |:|||
Human  1267 YADALTEIAFVVPSP--VESLTDSLES---NISDQDSDSNM------DLMPGILKQPS--LTLEL 1318

  Fly  1557 DTNRRD---VKEPVPPTRRKGNVT--KPTLLAQAPAKIFLVWLESYEDYLNFPLEDLLAYTRTGE 1616
            ..|..|   ..:.:.|:.|...:.  :|........::.:||:|.|:|..||||.:|:....||.
Human  1319 FPNHTDNLNSSQRLSPSSRMRKLPQGRPVPPLGPETRVSVVWVERYDDIENFPLSELMTEISTGV 1383

  Fly  1617 E--------LQTQQLPRASDCHVIFVHSLLSGLLRVKLQGPPGRMSFATPLVDGMVLSRRVVGNL 1673
            |        |::..|.:  :..|||:|.|.:||.|:|:||..|:.:...||||||::|||.:|.|
Human  1384 ETTANSSTSLRSTTLEK--EVPVIFIHPLNTGLFRIKIQGATGKFNMVIPLVDGMIVSRRALGFL 1446

  Fly  1674 VRQTALNISRRRRLDNDNYQPPHVRRRLKVQDIVQKYKMDLSEADLLAHLFQ 1725
            ||||.:||.||:||::|:|.||||||:.|:.|||.||:....|.:....|||
Human  1447 VRQTVINICRRKRLESDSYSPPHVRRKQKITDIVNKYRNKQLEPEFYTSLFQ 1498

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG34408NP_001285078.1 RALGAPB_N 152..273 CDD:466561 67/120 (56%)
RALGAPBXP_005260519.1 RALGAPB_N 135..255 CDD:466561 67/123 (54%)

Return to query results.
Submit another query.