DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG34408 and Ralgapb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001285078.1 Gene:CG34408 / 31953 FlyBaseID:FBgn0085437 Length:1728 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006235478.2 Gene:Ralgapb / 362257 RGDID:1306861 Length:1507 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1820 Identity:696/1820 - (38%)
Similarity:941/1820 - (51%) Gaps:417/1820 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MYSEWASLSAQITANSCGAQCFSVLNKFPASAGREVVVSVVKQLGTNLGITQNAEPSHLVK-DEE 64
            |||||.||.. :..|..|..  |||:.:|.|.||||..:||:.||..||.:..|....|:| |:|
  Rat     1 MYSEWRSLHL-VIQNDQGHT--SVLHSYPESVGREVANAVVRPLGQALGTSSVAGSESLLKTDKE 62

  Fly    65 VKWCMDVICFGLSLPLQEHETIKDCVNVYCEWLTALHPQPRISVPKPICEDANLYARQIINHFHN 129
            |||.|:|||:||:||| :.||:|.||:||.:|:.|| ..|:.|:|.|:.::.|||.:.|:.|..|
  Rat    63 VKWTMEVICYGLTLPL-DGETVKYCVDVYTDWIMAL-VLPKDSIPLPVIKEPNLYIQSILKHLQN 125

  Fly   130 LFVPRQGEILPFLYQTTLGADTIKRQAVLCHRVLRTLQQTAQISQLMDRQTWDTLLLFLLAINEI 194
            ||||||.:          |:..|:    ||.:|||.:|:.|:.|.:|.|:||:.||||||.||:|
  Rat   126 LFVPRQEQ----------GSSQIR----LCLQVLRAIQKLARESSIMARETWEVLLLFLLQINDI 176

  Fly   195 LLAPPTVKDDVGDQLCERVLSVLFEVWLLACVRSFPSPSMWKTLQESCAMWRHRVALVDQWNRVN 259
            |||||||:..:.:.|.|:::.||||||||||.|.||:|..|||.:|..|.|||..|:|:||::|.
  Rat   177 LLAPPTVQGGIAENLAEKLIGVLFEVWLLACTRCFPTPPYWKTAKEMVANWRHHPAVVEQWSKVI 241

  Fly   260 LALTARLLEFSYGPAFPQLKNADEDGQLIPIGMSNDCVAQTWYRFLRMIGNPTALCSPHIISKSS 324
            .|||:|||.|:|||:||..|..|||..|||..|.|:|:||||:|||.|:.||..|.:|.:||.:.
  Rat   242 CALTSRLLRFTYGPSFPPFKVPDEDANLIPPEMDNECIAQTWFRFLHMLSNPVDLSNPAVISSTP 306

  Fly   325 HFVQWALTHEKG--AETHQHPCLQQLPQIFLNAMKGISSQVDAFLGVYQPPPQQTDGVVTNLLEI 387
            .| |....:..|  .|..|:|||:.|||||..||:|||..||||||:.:|               
  Rat   307 KF-QEQFLNVSGMPQELSQYPCLKHLPQIFFRAMRGISCLVDAFLGISRP--------------- 355

  Fly   388 RHSLNEATSSTLQQFIHSSSATNIANQQNQPAHHHHHLHYPHLHLHGAGSFLRDNFMSNSASSAL 452
                                                                    .|:||    
  Rat   356 --------------------------------------------------------RSDSA---- 360

  Fly   453 NAIMGHHGGHHGHHHQQQQQQQQQLQISASPTSSLTTSGSSAVGSTSAGGSHSAGVVGSISFGAT 517
                                       ..:|.:.|:...|:||.:                    
  Rat   361 ---------------------------PPTPVNRLSMPQSAAVNT-------------------- 378

  Fly   518 ESPGPGQASASATPTPPLQRRLAKSFSVAPTITQQKGLSKTSLIGLTGGGARNAISSSSTTTTNA 582
                          |||..||       ...:|..|...|||.:                ||.:.
  Rat   379 --------------TPPHNRR-------HRAVTVNKATMKTSTV----------------TTAHT 406

  Fly   583 GSTGGTGSGDGSAPAPLPTTPTSTSGPPSASSSINSLPLTSMGAGVELAVARPKCNSILHVFHEW 647
            ...    ....|:.:|| ::|..||..|      ..||          |..|||.||||::|..|
  Rat   407 SKV----QHQASSTSPL-SSPNQTSSEP------RPLP----------APRRPKVNSILNLFGSW 450

  Fly   648 LFEAAHIGGDTWRQNRKKQACE---ASKRPSSMI-------------------MEHRKGSISLSQ 690
            ||:||.:            .|:   ...|.|||.                   ||.|:....:|.
  Rat   451 LFDAAFV------------HCKLHNGINRDSSMTASFIQILLSYKSSIATQASMEFRRKGSQMST 503

  Fly   691 PNSLNDP----QSLPPTLTIDKYESGRAEAIGTLCKIFCAKKTGEEILPVYLARFYMALQQCLKI 751
            ...:::|    ...|     |.||:|||||.||||:|||:|||||||||.||:||||.|.|.|:|
  Rat   504 DTMVSNPVFDASEFP-----DNYEAGRAEACGTLCRIFCSKKTGEEILPAYLSRFYMLLIQGLQI 563

  Fly   752 TESRECDETLASILLHSSDLFRLDLDGINVLLPGFIAALEIVLPDKDLKLKTQSMVFNRTELRRS 816
            .: ..|...|||::|:|..||..||.||:|::|.||:|||.:|||::|. |.:|.| |.||||||
  Rat   564 ND-YVCHPVLASVILNSPPLFCCDLKGIDVVVPYFISALETILPDRELS-KFKSYV-NPTELRRS 625

  Fly   817 AINILLSIMVLPLHYQTLPIRDLTCE---------SSEKMFTFIQLKSRLMNILMNALQVETDAQ 872
            :||||||::.||.|:.|:. .::..|         |.:|..||:.||.||:|||:.|||.|||..
  Rat   626 SINILLSLLPLPHHFGTVR-SEVVLEGKFSNDDSSSYDKPITFLSLKLRLVNILIGALQTETDPN 689

  Fly   873 NTHMLLGGLLLCVQDAVTFE----ETELGGGNANLSQNSSGVQHHDANLLSSACSERSASLVSAG 933
            ||.|:||.:|..|||:...|    :.|:|||..||                     :|.|..::|
  Rat   690 NTQMILGAMLNIVQDSALLEALGCQMEMGGGENNL---------------------KSHSRTNSG 733

  Fly   934 TASLGGQTTATMGAGSGSIRDTASAHDYPSLTISDDMSFEFGQELEGVTTYDNAHALFVRATYLV 998
            .:|..|          ||...|....:.|:..:..|.:.          ..|:|..|.:|:.:||
  Rat   734 ISSASG----------GSTEPTTPDSERPAQALLRDYAL----------NTDSAAGLLIRSIHLV 778

  Fly   999 CHRLISSWKTDLNVSLAALELLSGLARLHIRETDALECKRAVKWICDYICYQCSRPPPAHSKDLH 1063
            ..||.|.|:.|:::||||||||||||::.:. .|..:.|||:..:|.||.||||||.|.||:|||
  Rat   779 TQRLNSQWRQDMSISLAALELLSGLAKVKVM-VDLGDRKRAISSVCSYIVYQCSRPAPLHSRDLH 842

  Fly  1064 STIVAAFQCTAAWLMQHPYLLQDKDCLQTVLEVVELGISGTKSQSKGTDIPKFKDEKELKPASMR 1128
            |.|||||||...||.:||.:|.:||||:.|||:|||||||:||::...:: |:|.:||..|||||
  Rat   843 SMIVAAFQCLCVWLTEHPDMLDEKDCLKEVLEIVELGISGSKSKNSEQEV-KYKGDKEPNPASMR 906

  Fly  1129 VRDAAENLLTIILEQVGYFPSECGPESISSLLDELALMKHCNSMVPAAAASSEQAIAKFKYFVTE 1193
            |:||||..||.|::.:|.|||..||.|..||::|..|:|:  |.:|.....|      |:|||.:
  Rat   907 VKDAAEATLTCIMQLLGAFPSPSGPASPCSLVNETTLIKY--SRLPTINKHS------FRYFVLD 963

  Fly  1194 NSTILALLEEPLGNDQ-DPQPTVTLLIRGPFGRHAWTMQLRHLPR-SKSGIKYHAINPGRPIPMN 1256
            ||.|||:||:||||:| |..|:||:|:||..||.||..||..||| :|:..|.....| ||:|.|
  Rat   964 NSVILAMLEQPLGNEQNDFFPSVTVLVRGMSGRLAWAQQLCLLPRGAKANQKLFVPEP-RPVPKN 1027

  Fly  1257 DVTQRLDSEQKNFPDGVDKVQPCVADYSIPTIEQMREQYGTAVIRELESLLENQSIHEKLAWAEA 1321
            ||..:...:.:.||:.|||:....||.|||.:.::       |..|||..      ||||....|
  Rat  1028 DVGFKYSVKHRPFPEEVDKIPFVKADLSIPDLHEI-------VTEELEER------HEKLRSGMA 1079

  Fly  1322 DTSADSLSHAQ----------------ECVPPTVCHEFHAARLFLSHFGFLGFET-RNPQNPAEA 1369
            ...|..:...|                :|.||....||..|||||||||||..|. :.|.|..  
  Rat  1080 QQIAYEMHLEQQSEGELQKRSFPDPVTDCKPPPPAQEFQTARLFLSHFGFLSLEALKEPANSR-- 1142

  Fly  1370 LGNPPQRPLIVLDTKSAAFAADLDRLDKLSARTHDSVYVFYVKSGQTSAQQIIANMGEESSASHD 1434
              .||.  ||.||:....|..|:..||.|..|..|:|::||:|.||.:.|:|:.|:  |||.:..
  Rat  1143 --LPPH--LIALDSTIPGFFDDIGYLDLLPCRPFDTVFIFYMKPGQKTNQEILKNV--ESSRNVQ 1201

  Fly  1435 PHFASMLQTLGWPVQVSEHSGWTGFAHNSWSLK----GTPEEQLKSTANE----LNYNGSQRVLY 1491
            |||...|.:|||.|.|..|.||||....|||:.    |...||.:.|::|    ..:||.::|||
  Rat  1202 PHFLEFLLSLGWSVDVGRHPGWTGHVSTSWSINSCDDGEGSEQDEVTSSEDVGASIFNGQKKVLY 1266

  Fly  1492 WADVSSEIAFVVPTTWNLRYNSDTCDSGSISSTDQIGSSNVWTRGEADSAAGLAKSKSRNLSLEL 1556
            :||..:|||||||:.  :...:|:.:|   :.:||...||:      |...|:.|...  |:|||
  Rat  1267 YADALTEIAFVVPSP--VESLTDSLES---NISDQDSDSNM------DLMPGILKQPP--LTLEL 1318

  Fly  1557 DTNRRD-------------VKE-----PVPPTRRKGNVTKPTLLAQAPAKIFLVWLESYEDYLNF 1603
            ..|..|             :|:     ||||.   |..|          ::.:||:|.|:|..||
  Rat  1319 VPNHTDSLNSSQRLSPSSRMKKLPQGRPVPPL---GPET----------RVSVVWVERYDDIENF 1370

  Fly  1604 PLEDLLAYTRTGEE--------LQTQQLPRASDCHVIFVHSLLSGLLRVKLQGPPGRMSFATPLV 1660
            ||.||:....||.|        |::..|.:  :..|||:|.|.:||.|:|:||..|:.:...|||
  Rat  1371 PLSDLMTEISTGVETTANSSTSLRSTTLEK--EVPVIFIHPLNTGLFRIKIQGATGKFNMVIPLV 1433

  Fly  1661 DGMVLSRRVVGNLVRQTALNISRRRRLDNDNYQPPHVRRRLKVQDIVQKYKMDLSEADLLAHLFQ 1725
            |||::|||.:|.|||||.:||.||:||::|:|.||||||:.|:.|||.||:....|.:....|||
  Rat  1434 DGMIVSRRALGFLVRQTVINICRRKRLESDSYSPPHVRRKQKITDIVNKYRNKQLEPEFYTALFQ 1498

  Fly  1726  1725
              Rat  1499  1498

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG34408NP_001285078.1 RALGAPB_N 152..273 CDD:466561 66/120 (55%)
RalgapbXP_006235478.2 RALGAPB_N 135..255 CDD:466561 66/123 (54%)

Return to query results.
Submit another query.