DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG34408 and LOC1278030

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001285078.1 Gene:CG34408 / 31953 FlyBaseID:FBgn0085437 Length:1728 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061517697.1 Gene:LOC1278030 / 1278030 VectorBaseID:AGAMI1_007181 Length:1706 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1808 Identity:998/1808 - (55%)
Similarity:1239/1808 - (68%) Gaps:182/1808 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MYSEWASLSAQITANSCGAQCFSVLNKFPASAGREVVVSVVKQLGTNLGITQNAEPSHLVKDEEV 65
            ||||||||...|..|...||..|||.||....||:|...|:|||.:.||||.|||||:|..|:||
Mosquito     1 MYSEWASLYPVIAENINNAQTQSVLGKFSTVGGRDVAAVVIKQLASTLGITNNAEPSNLHTDQEV 65

  Fly    66 KWCMDVICFGLSLPLQEHETIKDCVNVYCEWLTALHPQPRISVPKPICEDANLYARQIINHFHNL 130
            :|||||||.||||||.||:.|||.||:||||::|:.||.::|||:||.:|.|.|.|:||.|.:||
Mosquito    66 QWCMDVICHGLSLPLSEHDIIKDGVNIYCEWISAVLPQTKLSVPRPIIDDPNTYVRKIIKHLYNL 130

  Fly   131 FVPRQGEILPFLYQTTLGADTIKRQAVLCHRVLRTLQQTAQISQLMDRQTWDTLLLFLLAINEIL 195
            ||||.||:.||:|:..||.|||.||||||||||||||.|||.||::..:||:.||||||||||||
Mosquito   131 FVPRPGEVWPFIYEEELGTDTINRQAVLCHRVLRTLQDTAQNSQILTVETWEALLLFLLAINEIL 195

  Fly   196 LAPPTVKDDVGDQLCERVLSVLFEVWLLACVRSFPSPSMWKTLQESCAMWRHRVALVDQWNRVNL 260
            ||||.|||||||||||||||||||||||||.|.|||||:|||.|||||.||||:|||:|||||||
Mosquito   196 LAPPIVKDDVGDQLCERVLSVLFEVWLLACSRCFPSPSLWKTFQESCAAWRHRIALVEQWNRVNL 260

  Fly   261 ALTARLLEFSYGPAFPQLKNADEDGQLIPIGMSNDCVAQTWYRFLRMIGNPTALCSPHIISKSSH 325
            .|||:||||:||||||::|.||||..|:|.||:||.:||.|.|||:::|.||.||.|.:||::..
Mosquito   261 VLTAKLLEFTYGPAFPEMKIADEDVHLVPDGMTNDGIAQAWIRFLKILGAPTDLCCPQVISRTPQ 325

  Fly   326 FVQWALTHEKGAETHQHPCLQQLPQIFLNAMKGISSQVDAFLGVYQPPPQQTDGVVTNLLEIRHS 390
            |:|..|.:..|.|...||||..||||||..||||:..||||||:.|....:     :||||   |
Mosquito   326 FIQAVLLNADGIEPQHHPCLLSLPQIFLKTMKGIAGLVDAFLGIAQYRMDE-----SNLLE---S 382

  Fly   391 LNEATSST-------LQQFIHSSSATNIANQQNQPAHHHHHLHYPHLHLHGAG----SFLRDNFM 444
            :::.|.:.       :...:||||.:.|:.:                  |..|    |.||.:  
Mosquito   383 ISQLTFTNNANGGGGVGGGMHSSSGSVISFR------------------HSGGEIKPSVLRAS-- 427

  Fly   445 SNSASSALNAIMGHHGGHHGHHHQQQQQQQQQLQISASPTSS---LTTSGS--------SAVG-- 496
            .......|.|.:|..|.:              ......||.|   :.:||.        |.:|  
Mosquito   428 GGLGGLGLGAALGVVGSN--------------AAAGTGPTGSAPGVVSSGGGSGCINNVSIIGCS 478

  Fly   497 -STSAGGSHSAGVVGSISFG-------ATESPGPGQASA----------SATPTPPLQRRLAKSF 543
             |:|:.||..|...|::.||       |.||.|...:.|          |.:|||||||||||||
Mosquito   479 SSSSSAGSAGAANGGNVGFGFSYDTSTAAESLGFCNSKAALLIADTNGGSNSPTPPLQRRLAKSF 543

  Fly   544 SVAPTI---------TQQKGLSKTSLIGLTGGGARNAISSSSTTTTNAGSTGGTGSGDGSAPAPL 599
            ||||::         .|.||.:|.|..|||        ||.||::::..:               
Mosquito   544 SVAPSLPSAHAVISMAQAKGFTKGSFSGLT--------SSRSTSSSHPNN--------------- 585

  Fly   600 PTTPTSTSGPPSASSSINSLPLTSMGAGVELAVARPKCNSILHVFHEWLFEAAHIGGDTWRQNRK 664
              .|.|.|.|.:..||:.||...:.   ..||..||:||||||:|.||||:|||||||||.||.|
Mosquito   586 --VPQSASLPSTGFSSMLSLCQENR---YPLAANRPRCNSILHLFGEWLFDAAHIGGDTWMQNTK 645

  Fly   665 KQACEASKRPSSMIMEHRKGSISLSQPNSLNDPQSLPPTLTIDKYESGRAEAIGTLCKIFCAKKT 729
            |:|.||.:|||||||::|||  |||||.||::...:.|.|||||||||:|||:|.||:|||||||
Mosquito   646 KRAAEAKRRPSSMIMDNRKG--SLSQPPSLSEVNDVSPGLTIDKYESGKAEALGALCRIFCAKKT 708

  Fly   730 GEEILPVYLARFYMALQQCLKITESRECDETLASILLHSSDLFRLDLDGINVLLPGFIAALEIVL 794
            ||||||||||||||||.|.||..:||||.|||||||.:||||||:||:||.||||.||:|||::|
Mosquito   709 GEEILPVYLARFYMALHQGLKTNDSRECMETLASILYNSSDLFRIDLEGIQVLLPSFISALELIL 773

  Fly   795 PDKDLKLKTQSMVFNRTELRRSAINILLSIMVLPLHYQTLPIRDLTCESSEKMFTFIQLKSRLMN 859
            |:|||::::|:::.|:|||||:|||||||::.||||:|||||||:....:::..||:.||.||:|
Mosquito   774 PEKDLRMRSQNVLINKTELRRAAINILLSMLALPLHFQTLPIRDIMGGPNDRSITFLHLKPRLIN 838

  Fly   860 ILMNALQVETDAQNTHMLLGGLLLCVQDAVTFEETELGGGNANLSQNSSGVQHHDANLLSSACSE 924
            |||||||||||.||||||||||.|||||:|||||||.|...|..|.:.:.   ..:|||||||||
Mosquito   839 ILMNALQVETDPQNTHMLLGGLHLCVQDSVTFEETENGSAEALHSLHPTA---ETSNLLSSACSE 900

  Fly   925 RSASLVSAGTASLGGQTTATMGAGSGSIRDTASAHDYPSLTISDDMSFEFGQELE--GVTTYDNA 987
            :||..:::..:|:||.:|||:            :::..||...||.|.:...|||  ....||:|
Mosquito   901 KSAYSMNSANSSIGGHSTATL------------SNEPSSLPAFDDFSSDIIHELELSSSAIYDSA 953

  Fly   988 HALFVRATYLVCHRLISSWKTDLNVSLAALELLSGLARLHIRETDALECKRAVKWICDYICYQCS 1052
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.:.::::|.|||||||||||||||||||
Mosquito   954 HALFVRATYLVCHRLISSWKTDLNVSLAALELLTGLAGMRVKDSDVLECKRAVKWICDYICYQCS 1018

  Fly  1053 RPPPAHSKDLHSTIVAAFQCTAAWLMQHPYLLQDKDCLQTVLEVVELGISGTKSQSKGTDIPKFK 1117
            ||||||.||||||||||||||:||||.||||||||:||..|||||||||||:||..|..:..|:|
Mosquito  1019 RPPPAHIKDLHSTIVAAFQCTSAWLMNHPYLLQDKECLTIVLEVVELGISGSKSVGKPGEPVKYK 1083

  Fly  1118 DEKELKPASMRVRDAAENLLTIILEQVGYFPSECGPESISSLLDELALMKHCNSM------VPAA 1176
            ||||||||||||||||||:||:||||:.|||:|||.:|:||||||:.|.||.|:.      :|  
Mosquito  1084 DEKELKPASMRVRDAAENMLTMILEQIDYFPNECGKQSLSSLLDEVVLAKHSNTSGEYVGELP-- 1146

  Fly  1177 AASSEQAIAKFKYFVTENSTILALLEEPLGNDQDPQPTVTLLIRGPFGRHAWTMQLRHLPRSKSG 1241
               .||||.|||||||||||:|||.|||||||||||||||:||||||||||||||||||.|||||
Mosquito  1147 ---QEQAIKKFKYFVTENSTVLALFEEPLGNDQDPQPTVTILIRGPFGRHAWTMQLRHLSRSKSG 1208

  Fly  1242 IKYHAINPGRPIPMNDVTQRLDSEQKNFPDGVDKVQPCVADYSIPTIEQMREQYGTAVIRELESL 1306
            .||||.|||||:||||:..|.:.|.|.|||.||::.|||.||||||::...::.|....::|..|
Mosquito  1209 TKYHAPNPGRPVPMNDIMMRQEMEYKYFPDSVDRIPPCVVDYSIPTLDSAEQKIGNQSTKQLARL 1273

  Fly  1307 LENQSIHEKLAWAEADTSADSLSHAQECVPPTVCHEFHAARLFLSHFGFLGFETRNPQNPAEALG 1371
            :|.|..:|||:|||.:.|.|.|.||||..||:|||||.||||||||||||..    .||.|....
Mosquito  1274 VEQQVGYEKLSWAETECSVDGLGHAQEASPPSVCHEFQAARLFLSHFGFLTI----GQNNASGQK 1334

  Fly  1372 NPPQRPLI-VLDTKSAAFAADLDRLDKLSARTHDSVYVFYVKSGQTSAQQIIANMGEESSASHDP 1435
            .....||: .|||....|..||..|||:|.|:.|:::|||||:||::..:||.||..|:.:|.:|
Mosquito  1335 LDGSAPLLTTLDTSKPEFCQDLRMLDKMSPRSCDTIHVFYVKAGQSTEAEIIGNMDPENLSSIEP 1399

  Fly  1436 HFASMLQTLGWPVQVSEHSGWTGFAHNSWSLK------GTPEEQLKSTANELNYNGSQRVLYWAD 1494
            ||..||.|:||||.|.||:|||||..:||.:.      ....||...:..|.|.||.:.||||||
Mosquito  1400 HFWRMLYTIGWPVAVQEHAGWTGFIGSSWKIPRDNKPCAQQGEQKTGSPEEWNLNGEKTVLYWAD 1464

  Fly  1495 VSSEIAFVVPTTWN---LRYNSDT--CDSGSISSTDQIGS-SNVWTRGEADSAAGLAKSKSRNLS 1553
            ||||:|.|||...|   :....||  .|..|.:||....| |.:..|     ::.::.::.|..|
Mosquito  1465 VSSEMAIVVPNRNNKVDITTGEDTGAGDGSSCASTTYERSVSEIQPR-----SSSVSTNQPRQYS 1524

  Fly  1554 LELDTNR----RDVKEPVPPTRRKGNVTKPTLLAQAP-AKIFLVWLESYEDYLNFPLEDLLAYTR 1613
            |:.::.|    ....:|:||.||:...|||:.|..|| |||.|||||||||:|.||::.||.|||
Mosquito  1525 LDSESARYGSMSKSADPIPPVRRRTGATKPSTLYTAPSAKILLVWLESYEDHLTFPIDGLLPYTR 1589

  Fly  1614 TGEELQ---TQQLPRASDCHVIFVHSLLSGLLRVKLQGPPGRMSFATPLVDGMVLSRRVVGNLVR 1675
            .|...|   ...:| :|:|.:|::|:|.|.|||||||||.|||:||.||:||||:|:||:|:|:|
Mosquito  1590 AGYSTQHGTVASIP-SSECFIIYLHALSSSLLRVKLQGPVGRMNFAIPLIDGMVVSKRVIGSLIR 1653

  Fly  1676 QTALNISRRRRLDNDNYQPPHVRRRLKVQDIVQKYKMDLSEADLLAHLFQRAI 1728
            |||.|:::|:|||||:|||||||||:|:|:::|:||.||:|.::||.||:.:|
Mosquito  1654 QTACNMAKRKRLDNDSYQPPHVRRRIKIQEMMQRYKKDLTEPEMLADLFKSSI 1706

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG34408NP_001285078.1 RALGAPB_N 152..273 CDD:466561 99/120 (83%)
LOC1278030XP_061517697.1 None

Return to query results.
Submit another query.