Protein Alignment Hecw and herc56.4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572574.2
• Gene: Hecw / 31905
• FlyBaseID: FBgn0261931
• Length: 1426
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001139103.2
• Gene: herc56.4 / 100148091
• ZFINID: ZDB-GENE-090311-7
• Length: 992
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 493
• Identity: 127/493 - (25%)
• Similarity: 207/493 - (41%)
• Gaps: 73/493 - (14%)

  Fly   959 NILEILRERQGQHTMSRQLR------------EKINILRVEGVPALERLGHDLQLTILLSLFEQE 1011
            ||||||:       |:.|:.            .|||.|    :..|:.:..||....|.....::
Zfish   544 NILEILQ-------MAYQISCSTDITHHDFIIHKINDL----LDLLQTITADLLRMELYMQINED 597

  Fly  1012 IMGFVPIEERSPQGSPVLNSRMPQRAPPPFRRDFEAKLRSF-------YRKLESKGYGQGPHKLK 1069
            ....|.:||...:...:|       ...||..||..|.|.|       :|.:.:...|.....|
Zfish   598 FHDMVKLEEYYFRTVKIL-------VKFPFASDFITKQRMFNLLQEECFRNVPNLAMGNSFSNL- 654

  Fly  1070 LHIRRSHLLEDAFRRIMSANKKDLQRGRLAVLWDTEEGLDYGGPSREFFFLLSRELFNPYYGLFE 1134
            |||.|..:|.|..:.:.......:.  .|.|.:..|:|:|..|.|.|||.|:|:       ...|
Zfish   655 LHINRESVLTDTLQYLRQNTHSFMH--PLQVAFIGEDGIDMRGLSAEFFSLISK-------SFIE 710

  Fly  1135 YSANDTYTVQVSPLSAFVDNCHDW-----FRFSGRVLGLALVHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPVA 1194
            :   |...::|...|....|.|..     |.:.|.:.|:||.:::.::..|....:|.||:...:
Zfish   711 W---DKKILEVHESSLVWFNPHHTRGNKNFYYLGVICGMALYNRHHINIDFPLALFKKLLQQKPS 772

  Fly  1195 LSDLESLDNEFHQSLQWIRDNDIGTGVDLGLTFCVTEELLGSVVDRELKPGGKNIIINEKNKKEY 1259
            |.|||.|.....:||:.:.:.|....|:|       :.|..:...:||.|.|..|.:|:.|:::|
Zfish   773 LDDLEELSPVEARSLKNLLEEDEEEVVNL-------QHLDFTCKGQELVPNGSQIQVNKVNRQKY 830

  Fly  1260 LERMIKWRLERGVQEQTESLVRGFYEVIDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDTNDWRLNTEYRSG 1324
            ::..:.....:.|:.|.|...|||.:.......::|...||:.::.|:.:.:..:.:.:..| .|
Zfish   831 VDLYVDLEFNKSVKTQFEQFTRGFSKGCPLDAWTMFHPEELQELLHGSPQYNWKELQQSASY-EG 894

  Fly  1325 YHDNHQVIVWFWQVIERFSNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFSALRGSTGPRRFCIEKWGKPNA-- 1387
            ...:.::|..||.|....|.|.:.:.|.|:.||..:|..|.|       .|...|.:...|:.
Zfish   895 CSASDELIKNFWTVFFELSEENKKKFLMFLYGTERVPAGGLS-------KRALKISQTDCPDPDD 952

  Fly  1388 -LPRAHTCFNRLDLPPYPTPELLYEKLLLAVEETNTFG 1424
             ||.|.|||.||.||.|.....|::||:.|:.....||
Zfish   953 HLPEAQTCFERLVLPKYSDINTLHDKLIHAINSCAVFG 990

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Hecw	NP_572574.2	PHA03247	<411..562	CDD:223021
		WW	638..667	CDD:459800
		HECW1_helix	738..794	CDD:465766
		HECTc	1068..1424	CDD:238033	96/363 (26%)
herc56.4	NP_001139103.2	None