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Protein Alignment Mur29B and AT2G03000

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_723377.1 Gene:Mur29B / 319014 FlyBaseID:FBgn0051901 Length:555 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_178400.1 Gene:AT2G03000 / 814829 AraportID:AT2G03000 Length:535 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:530 Identity:138/530 - (26%)
Similarity:214/530 - (40%) Gaps:113/530 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    81 STTGSTTIEDSSTTASASTTDSSTASSTT-----IGESSSSSLG------------SSTSDSSTS 128
            |.|..||    .|||:...|.:|...||:     :..:|.||.|            .|.:|.:.|
plant    17 SVTNRTT----PTTATNLPTSTSNMRSTSLMTPRVAHTSMSSGGDFPDDRFFHARHQSATDRAAS 77

  Fly   129 D--------STTD--SSTASSTTIGDSSSSSLGSSTSDSSTSDSTTDSSTASSTTIGDSSTSSLG 183
            :        |||:  |||::|..:..:|.|..|:|...|||..|...|.:|..|....:||.|:.
plant    78 NRSRAIMPISTTNVPSSTSNSPRVLQTSMSRRGTSPMSSSTRRSVQASMSARETVPSSTSTRSMQ 142

  Fly   184 SSTSD----SSTSDSTTDSSTASSTTIGDSSTSSLGS----STSDSSTSDSTTDSSTAS---STT 237
            :|||.    .::|.:...||...:.|...:|....||    :|:.|:.|..|..||.:.   .|:
plant   143 TSTSTPEIMPTSSRNVITSSEEVANTFTQTSYIQFGSLWETNTTPSTRSWPTVPSSNSPRVLQTS 207

  Fly   238 IGDSSTSSLGSSTSDSSNSDSTTDSSTVSSTTIGDSSSSSLGSSTSDSSTSDSTTDSSTASSTTI 302
            :....||.:.|||..:..| |.:...||||:|           |||...||.||.:....||..:
plant   208 MSRRGTSPMSSSTRRNVQS-SMSGRETVSSST-----------STSSMQTSMSTPEIMPTSSRNV 260

  Fly   303 GDSSSSSLGSSTSDSSTS--------DSTTDSSTASSTTIGDSSTSSLGSSTSDS--STSDSTTD 357
              .:.|...::|..:.|.        ::.|.|||.|.||: .:||:::.||.|..  .||.||..
plant   261 --ITRSEEVANTFSTQTPYIQFGRLWETNTTSSTRSRTTV-PTSTTNVPSSNSSRVLQTSMSTRG 322

  Fly   358 SSTASSTTIGDSSSSSLGSSTSDSSTYDSTTDSSTASSTTIGDSSSSSLGSSTSDS--------S 414
            :...||:|.....:|.|...|..||.  ||.:....|:..:...|.....|.|..|        .
plant   323 TFPMSSSTRMSVQASMLAPGTVSSSM--STVEIMPTSARNMITMSEEVANSFTQTSYIQFGSLWE 385

  Fly   415 TSDSTTDSSTASSTTIGD---------------SSSSSLGSSTTDSST--VSSTTNAGSTASSTT 462
            |..:.|..|..:....|:               ||:|::.:|:..:.|  :....:..:|.|||.
plant   386 TFKTVTKLSRVAMVENGECVICLEEWRKETYVTSSTSNMRTSSLMTLTRFIDEQISLRATVSSTR 450

  Fly   463 SSPSISTSTSSPTNYKIA--------------ACYSIYKDGELNRGCVKVPEKHS-GCQAVRNEL 512
            ::..:.|:.|..|...:|              .|:..:...::.   .::|.||. ..:.|...|
plant   451 TTARLLTNESPATIRAVAMLPRVAMVEKGECVICFEEWSKSDME---TELPCKHKYHLECVEKWL 512

  Fly   513 GITEDSADQC 522
            .| ..|..||
plant   513 KI-HTSCPQC 521

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mur29BNP_723377.1 None
AT2G03000NP_178400.1 ROM1 85..>386 CDD:227709 93/317 (29%)
zf-RING_2 480..522 CDD:433370 10/46 (22%)

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