Protein Alignment CG43672 and Abca6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788912.3
• Gene: CG43672 / 318910
• FlyBaseID: FBgn0263747
• Length: 1690
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_671751.2
• Gene: Abca6 / 76184
• MGIID: 1923434
• Length: 1624
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1861
• Identity: 361/1861 - (19%)
• Similarity: 712/1861 - (38%)
• Gaps: 469/1861 - (25%)

  Fly    12 LVWKNFQKQKHNKLVLILSLVLPVMSSLFLLFIRSSSDSNMRDYSIRAE--AELLEFSWSSLIGK 74
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Mouse    19 ILLKKWRRKRESLLEWSIPIIIGLHMGLFSYLAR-----NIQVLEVPPQDLGSLNEFNGSSLV-- 76

  Fly    75 IQERRAKMASKQRNFTTNVFIPDIRVAFAPNSNAALRRLMGDALGKLSMSEDKIVDFENCNDMRI 139
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Mouse    77 -------------------------VVYTPISNIT-QQIMNKTTFAPTMKGTRIIGVPSIED--- 112

  Fly   140 HAASEHYLASVCFRNVDESLNGLPTVLNFAIIMPSE-LRNYEDTWIGDS-----WKETTTLMDRD 198
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Mouse   113 -------LDEVLLHNIPDALG---VIFNDSFSYQLKVLRMYGNPFLKEDLLAHCW---------- 157

  Fly   199 VAEEDEFDED--GYTDYMGEGFVPLQYHISMQFLRATA--SKVEKLPK---VVMRRFNENPNVLL 256
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Mouse   158 ----DTHSQAFCSLSKYWERGFVALQTAINAGIIEVTTNHSVMEELMSIDGINMKTLPFIPRDLS 218

  Fly   257 SEGIGTSVVLLILLGFMFPVTILTTLIVEERELGQRYMLKILNASATLQMAAWFFN---VFTHFL 318
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Mouse   219 DYEI---FILFCLLYFSSFIYFASSNVTKERKQCKEVM-KVMG----LQDSAFWLSWGLIYVGFI 275

  Fly   319 -ITSLLITILLKIEWNGATAAVNKCPWPILLCFLISYGCSVTSLIILMTSAMRR---SRVAMVMA 379
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Mouse   276 FIISIFIAIIIT-----STQIIMMTGFLVIFTLFFLYGLSLIAVTFLMAVLLQKAVLTNLIVLFF 335

  Fly   380 PIIWILLALPLLSK------KELLSDGPDVFYGFATVLLCNVSFSRGLSKIFYIEDYTL-GVTIG 437
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Mouse   336 TLFWGCVGFTVLHKELPPSLEWVLS----IFSPFA--------FTSGMAKVIF-QDYNLNGV--- 384

  Fly   438 KYMFYRVSKSDFGIFVPIVCFYV---QTIFCTLLAMIFENNAYFWLAIRVKNL--LKKYHATRSA 497
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Mouse   385 --VFPDPSGES---YVMIAVFFILAFDSLLYLVLALYFDKILLYGAEHRSAPLFFLNPTSCFRKT 444

  Fly   498 VGR---LKRQI-PEVS----FSKTSAE----ALIEFRGVWQKY---SNSTYVVQDITLNVYAGEV 547
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Mouse   445 ANRNKVIERDLDPELPSDEYFEPVDPEYQGKEAIRIRNIKKEYKGKSGKVKALKGLFLDIYESQI 509

  Fly   548 VALLGHNASGKSTIIKMLYGRTRPKLGE--IYLSGFNIVTQRKEALKNSSISMSYKTLFTELVVL 610
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Mouse   510 TAILGHSGAGKSSLLNILSGLYVPTAGSVTVYNKNLSDMQDLKEIRKAIGVCPQHNVQFDALTVK 574

  Fly   611 DHLVFLSRLRGLSKTEAKLEAKALLRYLKLEDWEKTLVNDLTIGQRRVLQFLCAFAGGNQIVILD 675
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Mouse   575 ENLTLFAKIKGILPQDVEQEVQQILSELDMQNIRDDLAEHLSEGQKRKLTFGIATVGDPQILLLD 639

  Fly   676 KPFDGIDEQRTSLFYSLILDQKKNRSIFFTSNNQKVASGIADRIFVLSKGKLQAFGTVKKLCRML 740
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Mouse   640 EPTVGLDPFSRQRIWGFLKERRADHVILFSTQFMDEADILADRKVLIANGALKCTGSSVFLKRKW 704

  Fly   741 NESYRLIIFGNEKCSFKDVYAFMATFIPEIEMDSILADCASFLVKHKYHTELINLIENLARLKND 805
            ...|.|.:|.:|.|..:.:.:|:...||..::.:...:...:::..:..:|......:|.:....
Mouse   705 GLGYHLSLFMDETCDSERLTSFINHHIPYAKLKAKTKEKLVYILPLERTSEFPEFFSDLDKYSGQ 769

  Fly   806 LNVYSFEIHECSIDDILASL----------YTRDKST-------LEFGQPGLQTLLASRQQSAKR 853
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Mouse   770 -GLMSYEVSMSTLNDVFLNLEGEPSTKQDFEKRETATDSESLNDMEVAYPSL-----SQVQET-- 826

  Fly   854 RFIIPTMYL-------LEELRQLLIADTRNWFLPILKL---TLPSLVVVWT----LSMPYFWH-- 902
               :.||.|       :..||.|.:...|..||.||.|   .|..||:.:.    |.:...|.
Mouse   827 ---VSTMSLWRMQVCAIARLRILKLKRERKAFLIILLLLGIALLPLVIEYVANALLEVKNNWEFK 888

  Fly   903 ---NCRQPGHITFPMSDHGDGIILMQKDTLDSELLVASEMYAKVGVTEVDKTVDITTFIYNYEYK 964
               ....||.:  |..             |.:.|||       :..||    .:|..|:.:.:::
Mouse   889 TDLYFLSPGQL--PQG-------------LRTSLLV-------INNTE----SNIEDFLQSLKHQ 927

  Fly   965 NSLLSDADIME------------AVIFSNVQIEVLF----NTKWPHTAPDSLAQALNSLAVAFID 1013
            |.:| :.|..|            |:|.|..|.:..|    |||..|..| .|...:::..:..::
Mouse   928 NIVL-EVDDFENRNATNSLSYNGAIIVSGRQKDYRFSAVCNTKRLHCFP-ILMNVISNGILHMLN 990

  Fly  1014 GDAGIKVELEVL-PFSTIHTLQLHLNIDGYDLIFASCLSFCFCFIWSI-PLLHMTLSRDGRYNY- 1075
            ....|:::.::. ||..:          .:..|..:|| |..|.|.|: |  |:.:|....|..
Mouse   991 HTQYIRIKEDIFSPFIVL----------VWTGIQETCL-FILCVICSLSP--HIAMSSVSDYKKK 1042

  Fly  1076 -----------------------VELIAGMPTIVLIVAFLIY--ELL-----------VVLLALF 1104
                                   :.|.:||   :|...|..|  :||           |::|||
Mouse  1043 ADSQLWISGLYPSAYWCGQAVVDISLFSGM---LLTSYFTSYTSKLLNIDMTSEIVFSVIVLAL- 1103

  Fly  1105 PINIAVIFFHWDLLM-----DSNIHIYSVYVMFIIAACVFSLNILITIMPISDMPFVYLKVLLAY 1164
            ....:::|..:.:..     ..|..::|:..:.:||         ||...:::.||....|:.|.
Mouse  1104 GCAASLVFLTYVISFVFGKRKKNSTLWSICFLLVIA---------ITFEKVANGPFNEALVISAT 1159

  Fly  1165 SL-------GILVYIAVKELRPFTNPNTAHFLLLDFHPFYALLHNLMRIASISEKIWLCSDRQIY 1222
            .|       |:||   |.|:|.:..          :..|..:.|.|..:     .:.||
Mouse  1160 MLVPSFALNGLLV---VLEMRAYQY----------YIEFEEIKHGLSAV-----DLLLC------ 1200

  Fly  1223 ETSVYADQCNTIPNCCDDDAQEFYHLRYLCCVYLLLVVVWISIFIFLKSHMVKRRP--------- 1278
                      .||         :.|.       ||.:.|...:.:....::|:|.|
Mouse  1201 ----------LIP---------YIHT-------LLFIFVLRCLELKYGKNVVRRDPIFRIAPQSL 1239

  Fly  1279 -RQPKYFWDSDPDSKYDQNILHIMEPSELENTWIHEKSRVSTL-------ERNHIESKALHVEHL 1335
             .||      :|:...|::          ||... |:.|.|..       |:..|.:..||.|
Mouse  1240 KAQP------NPEEPIDED----------ENVQA-ERLRTSDALSTPNLDEKPVIIASCLHKE-- 1285

  Fly  1336 SVFFGLK----------AAIKHIDFMVNRYQVMSVFGANGTGKSVLLKTILGIYTPSSGRIISSK 1390
              :.|.|          .|::::.|.||:.:::.:.|.:|.|||..::.|.||..|::|::...:
Mouse  1286 --YAGQKKHCCSRRTRNMAVRNVSFCVNKGEILGLLGPDGAGKSSSIRMIAGITKPTAGQVELKR 1348

  Fly  1391 TVPFKSKDLDSCHMVGYSAQEFQTMQLMTILETWDLILRIRRSKQISFRAEATKLCKIFGLYKYR 1455
            .........||....||..||......:|:.|..:|...::..::.......::|.....|:
Mouse  1349 LSSAVGHQGDSRAEFGYCPQENGLWPNLTVKEHLELYAAVKGLRKEDAVVAISRLVNALKLH--- 1410

  Fly  1456 FNSLSICSQ----GVLKRLSLGIALMSDAELILLDDPFTHLDIVSQRSMLHIIHD-LRRRGHSII 1515
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Mouse  1411 -DQLNVQVQNLVAGATRKLCFVLSILGNSPVLILDEPSTGLDVSGKHQVWQAIQAVVKDNEKGVL 1474

  Fly  1516 YTCSDTAYSTPALRMATLSYPG-IAVIGEREEMQQNYYSSYYMVETRIHLAELGSPIDFDSQSTE 1579
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Mouse  1475 LSTHDLAEAEALCDRAAIMVSGRLRCIGPIQHLKRK-FGQDYVLELRVK--------DVSQEP-- 1528

  Fly  1580 AKEDRAGTTGTLLRHKHQEFSAAFTDSADRWKYLKLCGVIENVFPHAIIKNVSFPRVCFWLS-SH 1643
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Mouse  1529 ------------LVHR---------------EILKL-------FPQAARQDRCFSLLTYKLPVTD 1559

  Fly  1644 MYPMSRIVDTLHRNKQ--DFYSFSVSQPSVNSVFLSIHRQK 1682
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Mouse  1560 VHPLSQAFHKLEAVKHGFDLEDYSLSQCTLDRVILELSKEQ 1600

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG43672	NP_788912.3	rim_protein	<266..>732	CDD:130324	109/501 (22%)
		ABC_subfamily_A	519..737	CDD:213230	54/222 (24%)
		P-loop containing Nucleoside Triphosphate Hydrolases	1330..1517	CDD:476819	41/201 (20%)
Abca6	NP_671751.2	rim_protein	<169..1600	CDD:130324	331/1649 (20%)