Protein Alignment CG43672 and abca12

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788912.3
• Gene: CG43672 / 318910
• FlyBaseID: FBgn0263747
• Length: 1690
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_686632.6
• Gene: abca12 / 558335
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-9790
• Length: 5913
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1936
• Identity: 384/1936 - (19%)
• Similarity: 702/1936 - (36%)
• Gaps: 499/1936 - (25%)

  Fly    28 ILSLVLPV----MSSLFLL-FIRSSSDSNMRDYSIRAEAELLEFSWSSLIGKIQERRAKMASKQR 87
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Zfish  4182 ILTQTLPILKNSLNSPFVQNFIRTQTGIDVSGMS----ATLNQFS-------------------- 4222

  Fly    88 NFTT----NVFIPDIRVAFAPNSNAALRRLMGDALGKLSMSEDKIVDFE-----NCND-----MR 138
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Zfish  4223 NMTVLLEKNKFIMD----------------QITTLSVLMMNLSSCVNFDRYRGFNSTDELDKQAE 4271

  Fly   139 IHAASEHYLASVCFRNVDESLNGLPTVLNFAIIMPSELRNYEDTWIGDSWKETTTLMDRDVAEED 203
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Zfish  4272 KLAQNRELYASIIFKLPKENSSSLPPNIDYTIRM-----NIEN------------VMRTDRARNP 4319

  Fly   204 EFDEDGY-----TDYMGEGFVPLQYHISMQFLRATASKVEKLPKVVMRRFNENPNVLLSEGIGTS 263
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Zfish  4320 FWVKDAYISATRTQRYSRGFVYLQESIERAIIEMQTGNAMDGPAVQMQAF-PYPCYYKDEYLNS- 4382

  Fly   264 VVLLILLGFMFPVTILTTLI----------VEERELGQRYMLKILNASATLQMAAWFFNVFTHFL 318
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Zfish  4383 ------IAFAFPMALMISWVLFIAHFVKKLVHERELRLHEYMKMMGVNPISHFFAWLIESGAFLL 4441

  Fly   319 ITSLLITILLKIEWNGATAAVNKCPWPILLCFLISYGCSVTSLIILMTSAMRRSRVAMVMAPIIW 383
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Zfish  4442 VTVIILTIILK-----AGGILPRSDGFVLFLYLCDYGFSVLAVSFLVSSFFDKTNIAGLSGSLIY 4501

  Fly   384 ILLALPLLSKKELLSDGPDVFYGFATVLL---CNVSFS-RGLSKIF------YIEDYTLGVTIGK 438
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Zfish  4502 VISFFPFI------------------VLIHLEDNLSFSVKSALSLFSPTCFSYASQY-----IAR 4543

  Fly   439 YMFYRVSKSDFGIFVPIVCFYVQTI---------FCTLLAMIFENNAYFWLAIRVKNLLK-KY-- 491
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Zfish  4544 Y-----EKQEEGI--QWSNMYISPLAGDTSSFGWLCWLL--LIDSLVYFIIGIYIRMVFPGKYGI 4599

  Fly   492 --------------------HATRSAVGR----LKRQIPEVSFSKTSAEALI------EFRGVWQ 526
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Zfish  4600 AVPWYFPVTKSFWTDMFSCCSKTPKKIGRGLLFTNMMQDQSSMNKSKGKGSLVAKGEEDFSGLPV 4664

  Fly   527 KYS----NSTY----VVQDITLNVYAGEVVALLGHNASGKSTIIKMLYGRTRPKLGEIYLSGFNI 583
            ..|    ..||    .|.::.|:.|.|.|.:|||||.:||:|.:.:|.|...|.:|.|.:.|.::
Zfish  4665 GVSLYGLTKTYGKRNAVDNLNLSFYEGHVTSLLGHNGAGKTTTMSLLTGLFAPTVGTIEVYGMDM 4729

  Fly   584 VTQRKEALKNSSISMSYKTLFTELVVLDHLVFLSRLRG--LSKTEAKLEAKALLRYLKLEDWEKT 646
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Zfish  4730 QMFIDDVRKEMGVCMQYDVLFDHLTTKEHLLLYAQIKAPHWTKQEVKEQVHKILMETDMHAHRHK 4794

  Fly   647 LVNDLTIGQRRVLQFLCAFAGGNQIVILDKPFDGIDEQRTSLFYSLILDQKKNRSIFFTSNNQKV 711
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Zfish  4795 RVGTLSGGMKRKLSISIAFIGGSRLVVLDEPTTGVDPCSRRSIWDIIIQHKQERTIILSTHHLDE 4859

  Fly   712 ASGIADRIFVLSKGKLQAFGTVKKLCRMLNESYRLIIF-------GNEKCSFKDVYAFMATFIPE 769
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Zfish  4860 AEVLSDRIAFLERGGLKCCGSPFYLKDKLAKGYNLTLTKKVETADSKEKFDYEKLRDFIHSHLPD 4924

  Fly   770 I-EMDSILADCASFLVKH------KYHTELINLIENLARLKNDLNVYSFEIHECSIDDILASLYT 827
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Zfish  4925 ARQKDREMGDLVYALPPYTPQNASEYHSLLNSLDQNLDKL--HLGCYG--ISDTTLEEVFLQL-T 4984

  Fly   828 RD-------------KSTLEFGQPGLQTLLASRQ-------------------QSAKRRFIIPTM 860
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Zfish  4985 RDDLEPKESETWSVSESVIE------NDMFASRDSLSEDCNSMYLGEKASLTGNSTVRGFALGVQ 5043

  Fly   861 YLLEELRQLLIADTRNWFLPILKLTLPSLVVVWTLSM----------------PYFWHNCRQPGH 909
            .::..|.:.:....|:|.....::.||.|.|:..:.:                |..:|...|...
Zfish  5044 RVIAMLLKRVHHSRRDWKGLFSQVLLPVLFVIAAMGLGSIKSDLQHFPEIVLSPALYHVDEQYAF 5108

  Fly   910 ---------------ITFPMSDHGDGIILMQKDTLDSELLVASEMYAKVGVTEVDKTVDITTFIY 959
                           :::|..||     :...|..|..........::..|:..:.:...||...
Zfish  5109 FSNQNPNTSRLVDTMMSYPGIDH-----VCMTDPTDPVCKGRPSTGSQTWVSGGNSSATFTTCKC 5168

  Fly   960 NYEYKNSLLSDADIMEAVIFSNVQIEVLFNTKWPHTAPDSLAQALNSLAVAFIDGDAG----IKV 1020
            :.:.::......|.......|:   ::::|....:.....||.|.|.:...:...:.|    |.:
Zfish  5169 SNQVQSCPAQGYDPPRKRCPSS---QIVYNLTGVNIENYLLATANNFIRDRYGGWEFGKPLPIDL 5230

  Fly  1021 ELEVLPFSTIHTL-QLHLNIDGYDLI--FASCLSFCFCFIWSIPLLHMTLSRDGRYNYVELIAGM 1082
            ::::|......|| ::..|.:|:..:  :.:.|:..|        |..:|..:.||.|...|:..
Zfish  5231 KMDMLDVPANRTLSKVWYNSEGHHSMPAYLNSLNNFF--------LRSSLPPEKRYQYAISISSH 5287

  Fly  1083 P--------------TIVLIVAFLI---YELLVVLLALFPI-----------NIAVIF--FHWDL 1117
            |              .:.::||..:   |.::.....::.:           .|:.|.  |:|.:
Zfish  5288 PYPGQVQDEDLMVGGLVSILVALCVLTGYSIMTASFVIYEVQEHHTGSKRLQQISGISEPFYWII 5352

  Fly  1118 LMDSNIHIYSV-YVMFIIAACVFSL------------NILITIMPISDMPFVYLK---------- 1159
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Zfish  5353 NFFYDMALYMIPVVLSVVMVAAFQLPAFTERQNLAAVTLLLVLFGFSTFPWMYLLSAMFKDTEMA 5417

  Fly  1160 ------VLLAYSLGILVYIAVKELRPFTNPN---------TAHFLLLDFHPFYALLHNLMRIASI 1209
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Zfish  5418 FIGYVCINLFISVNTIISTSIIYFLGQLNQNDQSIQNIYQTMSNIFLVF-PQFSFGNGLMELARV 5481

  Fly  1210 SEKIWLCSDRQIYETSVYADQCNTIPNCCDDDAQEFYHLRYLCCVYLLLVVVWISIFIFLKSHM- 1273
                    |.|:...|.:.......|...|                   |:.|:.|.:||:..:
Zfish  5482 --------DMQVQILSGFGVDAYKNPFSMD-------------------VLGWMFISMFLQGFIC 5519

  Fly  1274 ----------VKRRPRQPKYFWDSDPDSKYDQNILHIMEPSELENTWIHEKSRVSTLERNHIESK 1328
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Zfish  5520 FTLRLLLNKTLLRKVRR-LFCW--------KRNAVQSYSPNEDEDV-LDERLRVG---RGDASSD 5571

  Fly  1329 ALHVEHLSV----FFGLKAAIKHIDFMVNRYQVMSVFGANGTGKSVLLKTILGIYTPSSG----R 1385
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Zfish  5572 ILQVNHLTKVYQNFSKRVQAVKSLSVGIPAGECFGLLGVNGAGKTTTFKMLTGDISPSGGSAKIR 5636

  Fly  1386 IISSKTVPFKSKDLDSCHM----VGYSAQEFQTMQLMTILETWDLILRIRRSKQISFRAEATKLC 1446
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Zfish  5637 DIDGRMV-----DIIDCRREGINIGYCPQVDALDDLLTGEEHLYFYARIRGISKRDISQVVNYLL 5696

  Fly  1447 KIFGLYKYRFNSLSICSQGVLKRLSLGIALMSDAELILLDDPFTHLDIVSQRSMLHIIHDLRRRG 1511
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Zfish  5697 KKLQLNYHRNNTSESYSCGTRRKLSTALALIGNPQILLLDEPSSGMDPRSKRHLWKIISE-QVMG 5760

  Fly  1512 HSIIYTCSDTAYSTPAL--RMATLSYPGIAVIGEREEMQQNYYSSYYMVETRIHLAELGSPIDFD 1574
            ...:...|.:.....||  |:|.:.......:|..:.::..:.|.:   ..:::|.  |:..|.|
Zfish  5761 KCAVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVKGQFRCLGSLQHIKNRFGSGF---TVKMYLT--GASYDVD 5820

  Fly  1575 SQSTEAKEDRAGTTGTLLRHKHQEFSAAFTDSADRWKYLKLCGVIENVFPHAIIKNVSFPRVCFW 1639
            ..|...:::   ..||.|:..|.                   .::|...|.|
Zfish  5821 MISNFMQQN---FPGTCLKDNHS-------------------NMVEYHVPVA------------- 5850

  Fly  1640 LSSHMYP--MSRIVDTLHRNKQ--DFYSFSVSQPSVNSVFLSIHRQKSNKD 1686
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Zfish  5851 ------PGGVASIFSLLESNKTVLQIKHFSVSQTTLDEVFINFATAKVDTD 5895

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG43672	NP_788912.3	rim_protein	<266..>732	CDD:130324	119/537 (22%)
		ABC_subfamily_A	519..737	CDD:213230	63/233 (27%)
		P-loop containing Nucleoside Triphosphate Hydrolases	1330..1517	CDD:476819	52/198 (26%)
abca12	XP_686632.6	rim_protein	4..>93	CDD:130324
		COG5412	<2412..2813	CDD:444167
		rim_protein	4105..5897	CDD:130324	384/1936 (20%)