Protein Alignment CG43672 and CG8908

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788912.3
• Gene: CG43672 / 318910
• FlyBaseID: FBgn0263747
• Length: 1690
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_611464.3
• Gene: CG8908 / 37293
• FlyBaseID: FBgn0034493
• Length: 1626
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1893
• Identity: 395/1893 - (20%)
• Similarity: 729/1893 - (38%)
• Gaps: 495/1893 - (26%)

  Fly     5 ICHVFCLLVWKNFQKQKHNKLVLILSLVLPVMSSLFLLFIRSSSDSNMRDYSIRAEAELLEFSWS 69
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  Fly    14 IC-LLWLVICKTARFQFSNTLTSVIIIVGPIV--VFLV-----------------------YAAT 52

  Fly    70 SLIGKIQERRAKMASKQRNFTTNVFIPDIRVA-------FAPNSNAALRRLMGDALGKLSMSEDK 127
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  Fly    53 ALFREPQEE------------TSVKYPPVNITTKVPYIYYSP-ENLVLAAVI----------EDV 94

  Fly   128 IVDFENCNDMRIHAASE----------HYLASVCFRNVDESLNGLPTVLNFAIIMPSELR-NYED 181
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  Fly    95 VHDLKAVGSKAFASASELNKALIGKDTYGYVGIEFDDSFSDINELPINVTVGLRFPLHLRKNPKM 159

  Fly   182 TWIGDSWKETTTLMDRDVAEEDEFDEDGYTDYMGEGFVPLQYHISMQFLRATASKVEKLPKVVMR 246
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  Fly   160 VW------DNTSIL-----KHSKMDVD-Y--YQVEGFLVVQAKLSEALIRAKNEAV-VLPEVILQ 209

  Fly   247 RFNENPNVLLSEGIGTSVVLLILLGFMF-PVTI----LTTLIVEERELGQRYMLKILNASATLQM 306
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  Fly   210 HY---PDVAEVDRLDNRVA---LGGVLFLPVTISAAYLAQMIVMERRDHLRDMLELMGVRAWIYW 268

  Fly   307 AAWFFNVFTHFLITSLLITILLKIEWNGATAAVNKCPWPILLCFLISYGCSVTSLIILMTSAMRR 371
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  Fly   269 LSWFLVAFLLLSIPTVFMVLLLK--WRYFSLSDSS----LVLFFLLVYNLEVLTSAFMISSFFSD 327

  Fly   372 S---RVAMVMAPII----WILLAL---PLLSKKELLSDGPDVFYGFATVLLC---NVSFSRGLSK 423
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  Fly   328 TVGVQVAIVIVHLIGCLPWRLLLMGYVPTLPR---------------TIFVCLFLNSSLAMGLQQ 377

  Fly   424 IFYIEDYTLGVTIGKYMFYRVSKSDFGIFVPIVCFYVQTIFCTLLAMI----------FENNAY- 477
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  Fly   378 FIKSENLRLGLH-WTYLFERTDWDEFVHLGPILLF---MLFGCLLRILVLAYMEQLRSYQNRKWY 438

  Fly   478 ------FWLAIRVKNLLKKYHATRSAVGRLKRQIPEVSFSKTSAEA-------LIEFRGVWQKYS 529
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  Fly   439 FPVQPSFWC-------------------RWNRRPRSDDFDVEGQETGIRGHPLIVRARNI-EKVF 483

  Fly   530 NSTYVVQDITLNVYAGEVVALLGHNASGKSTIIKMLYGRTRPKLGEIYLSGFNIVTQRKEALKNS 594
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  Fly   484 NEWIAVKDLNLNFYQDEITVFLGHNDSGKSTILMLLAGFLRPSAGEITINGYDLATNQRKARQSM 548

  Fly   595 SISMSYKTLFTELVVLDHLVFLSRLRGLSKTEAKLEAKALLRYLKLEDWEKTLVNDLTIGQRRVL 659
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  Fly   549 CICPQPNVLFEKVNARWHLQFYCRLKGLNRQEASAETDKYLEIGRLQDFANTKVKNLPSGIKRML 613

  Fly   660 QFLCAFAGGNQIVILDKPFDGIDEQRTSLFYSLILDQKKNRSIFFTSNNQKVASGIADRIFVLSK 724
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  Fly   614 MLCCNLCGNSKILLLDEPGTSMDPAMRSNMWDLLRRERKGRCIIMATHNMNEAEVVADQIVVLCD 678

  Fly   725 GKLQAFGTVKKLCRM--LNESYRLIIFGNEKCSFKDVYAFMATFIPEIEMDSILADCASFLVKHK 787
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  Fly   679 AQVIGYGTTGFLTQIAGTGSSYLLICTKMDTCIVAEVTNFLQIRFPDIKLHNEFSIYVTYELPTK 743

  Fly   788 YHTELINLIENLARLKNDLNVYSFEIHECSIDDILASLYTRDKSTLEFGQPGLQT--------LL 844
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  Fly   744 YVQQYAALFLELEEALGELNL--AEISVCA--PTLGSVF------LQMGEEMRQSWNRISSFDLL 798

  Fly   845 ASRQQSAKRRFIIPTMYLLE---------------ELRQLLIADTRNWFLPILKLTLPSLVVVWT 894
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  Fly   799 SSPSPMLSLLNLLPTFEVREDDGRVKCCNQWRAIVEKKRLFTLRHQKFYCMI--IATPIIICLLI 861

  Fly   895 LSMPYFWHNCRQPGHITFPMSDHGDGIILMQKDTLDSELLVAS-EMYAKVGVTEVDKTVDITTFI 958
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  Fly   862 ISFSIF--------------------IFLV--DHHLSELLVTDLSIYPK-AVFVIDSPAEGNRFE 903

  Fly   959 YNY--------------------EYKNSLLSDAD----------IMEAVIFSNVQIEVLF-NTKW 992
            .:|                    :|   ||::.:          :..|...||....:.: |.|.
  Fly   904 RHYMANVIGQGGTVRSTSGTPIDDY---LLAEMESDQVKVQHTFLAGATFDSNANSIIAWSNNKL 965

  Fly   993 PHTAPDSLAQALNSLAVAFIDGDAGIKVELEVLPFSTIHTLQLHLNIDGYDLIFASCLSFCFCFI 1057
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  Fly   966 KHGS--ALSMGLVYAAI----GQELAKLDIRIVNKPYQDTVQQAVR----GLIYASTIEF----- 1015

  Fly  1058 WSIPLLHMTLSRDGRYNYVELIAGMPTIVLIVAFLIYELLVVLLALFPINIAVI----------- 1111
                                            |.|::..||:..|:|.: :.::
  Fly  1016 --------------------------------AVLVFHYLVLGTAIFAV-LPIVERRSKVQHQQF 1047

  Fly  1112 ------------FFHWDLLMDSNIHIYSVYVMFIIAACVFSLNILITIMPI---------SDMPF 1155
                        ...||         |..|:..|:...|.:...:.:::|:         |.:.|
  Fly  1048 SSGMSRSTYWLSHLSWD---------YCFYIAMILPLIVVAGITIGSVLPVIVQLLAFGFSAISF 1103

  Fly  1156 VYLKVLLAYSLG----ILVYI-AVKELRPFTNPNT--AHFLLLD----FHPFYAL---LHNLMRI 1206
            .||..|::...|    |::|| .:..|..|.:|.:  ..:.:::    .||.|:|   ::..:|:
  Fly  1104 TYLLCLMSNDFGKMFSIILYINMIGVLALFIHPKSPQTRYAVIESVLLVHPHYSLCCGMYEAIRM 1168

  Fly  1207 ASISEKIWLCSDRQIYETSVYADQCNTIPNCCDDDAQEFYHLRYLCCVYLLLVV-VWIS---IFI 1267
            ::.|.|                               :..:|.:....||.:|| .|:.   .::
  Fly  1169 STFSLK-------------------------------QLPYLIFSGAAYLTIVVFAWVPRRLNYV 1202

  Fly  1268 FLKSHMVKRRPRQPKYFWDSDPDSKYDQNILHIMEPSELENTWIHEKSRVSTLERNHIESKALHV 1332
            | ||  ::.....|.|   .|.|.:.|:                 .:.|::.|...|.....|.:
  Fly  1203 F-KS--IRNEKIYPSY---KDEDKEVDK-----------------MRRRLAYLTTAHYAFFPLIL 1244

  Fly  1333 EHLSVFFGLKAAIKHIDFMVNRYQVMSVFGANGTGKSVLLKTILGIYTPSSGRIISSKTVPFKSK 1397
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  Fly  1245 KNLSKRYGSFVAVRSLTLDLNPFECVGLLGRNGSGKSSIFRMIVGMESITVGS-IHIKGYSLKTR 1308

  Fly  1398 DLDSCHMVGYSAQEFQTMQLMT---ILETWDLILRIRRSKQISFRAEATKLCKIFGLYKYRFNSL 1459
            ..|:...||:..:|...:..||   .|....||..|||.   ..::....|.:.|.|..:....:
  Fly  1309 PKDASRHVGFCPRELMLLSFMTGKDALRFCCLINGIRRE---YIKSLVASLAECFELVPHMNKRI 1370

  Fly  1460 SICSQGVLKRLSLGIALMSDAELILLDDPFTHLDIVSQRSMLHIIHDLRRRGHSIIYT------- 1517
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  Fly  1371 STYSNGTKRKLMIAMGTLAPS-LMCLDEPTAGVDMHAKYEIWSILDGIRQGGRSILLTTHNLEEC 1434

  Fly  1518 ---CSDTAYSTPALRMATLSYPGIAVIGEREEMQQNYYSSYYM---VETRIHLAELGSPIDFDSQ 1576
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  Fly  1435 EFLCTN---------VGIMDHGSLLCYGSLSRLKHRFNMGIFVKVKMGTR---AEMDDERDNWMQ 1487

  Fly  1577 ST--EAKEDRAGTT--------GTLLRH--------KHQEFSAAFTDSAD-----RWKYLKLCGV 1618
            .|  ...:...|:|        ..||||        |....|.|..|:.:     |..|..|...
  Fly  1488 ITMMPPNDSEMGSTVGARRMMLAHLLRHHNPPVEPVKKSRTSRAQPDTTNSELNMRKDYEALLQE 1552

  Fly  1619 IENVF----PHAIIKNVSFPR--VCFWLSSHMYPMSRIVDTLH--RNKQDFYSFSVSQPSVNSVF 1675
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  Fly  1553 LEEVFKKDHPYSTVSEKYSYRGMITFCIPRGQIKWSAIFEYMENLKDEMQILYYSVSHTTFQDVF 1617

  Fly  1676 LSIHRQKS 1683
            :...|:::
  Fly  1618 MKFVRKQN 1625

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG43672	NP_788912.3	rim_protein	<266..>732	CDD:130324	135/507 (27%)
		ABC_subfamily_A	519..737	CDD:213230	72/217 (33%)
		P-loop containing Nucleoside Triphosphate Hydrolases	1330..1517	CDD:476819	47/189 (25%)
CG8908	NP_611464.3	rim_protein	<124..1626	CDD:130324	369/1734 (21%)