Protein Alignment CG43672 and Abca12

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788912.3
• Gene: CG43672 / 318910
• FlyBaseID: FBgn0263747
• Length: 1690
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001414620.1
• Gene: Abca12 / 301482
• RGDID: 1304586
• Length: 2595
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1791
• Identity: 372/1791 - (20%)
• Similarity: 670/1791 - (37%)
• Gaps: 377/1791 - (21%)

  Fly   126 DKIVDFENCNDMRIHA----ASEHYLASVCF---------RNVDESLNGLPTVLNFAIIMPSELR 177
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  Rat   925 DRIQAADTVDEMEMIAKQLYKSNELFGSVIFKLPSNGSSHRGFDSERVSLPPIVRYTIRMSLKT- 988

  Fly   178 NYEDTWIGDSWKETTTLMDRDVAEEDEFDEDGYTDYMGEGFVPLQYHISMQFL--------RATA 234
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  Rat   989 -----------AQTTRSIRTKIWAPGPHNSPSHNQIYGRAFIYLQDSIERAIIELQTGRNSQEVA 1042

  Fly   235 SKVEKLPKVVMRRFNENPNVLLSEGIGTSVVLLILLGFMFPVTILTTLIVEERELGQRYMLKILN 299
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  Rat  1043 VQVQAVPYPCFMK----DNFLTS--VSYSLPIVLMVAWVVFIAAFVKKLVYEKDLRLHEYMKMMG 1101

  Fly   300 ASATLQMAAWFFNVFTHFLITSLLITILLKI-----EWNGATAAVNKCPWPILLCFLISYGCSVT 359
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  Rat  1102 VNSCSHFFAWLIESIGFLLVTIAILIVILKFGNILPKTNGF----------ILFLYFSDYSFSVI 1156

  Fly   360 SLIILMTSAMRRSRVAMVMAPIIWILLALP---LLSKKELLSDGPDVFYGFATVLLCNVSFSRGL 421
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  Rat  1157 AMSYLISVFFNNTNIAALIGSLIYVIAFFPFIVLVTVEDELSYVIKVFMS----LLSPTAFSYAS 1217

  Fly   422 SKIFYIEDYTLGVTIGKYMFYRVSKSD---FGIFVPIVCFYVQTIFCTLLAMIFENNAYFWLAIR 483
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  Rat  1218 QYIARYEEQGIGLQ-WENMYKSPVQDDTTSFG-----------WLCCLILADSF---IYFFIAWY 1267

  Fly   484 VKN---------------LLKKYHATRSAVGRLKR-------------QIPEVSFSKTSAEAL-- 518
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  Rat  1268 VRNVFPGTYGMAAPWYFPVLPSYWKERFGCAEVKHEKSNGLMFTNIMMQSTNPSANKTSPDCAFP 1332

  Fly   519 -------------IEFRGVWQKYSNSTYVVQDITLNVYAGEVVALLGHNASGKSTIIKMLYGRTR 570
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  Rat  1333 SNIEPEPKDLQVGVALHGVTKSYGSKT-AVDNLNLNFYEGHITSLLGPNGAGKTTTISMLTGLFG 1396

  Fly   571 PKLGEIYLSGFNIVTQRKEALKNSSISMSYKTLFTELVVLDHLVFLSRLRGLSKTEAKL--EAKA 633
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  Rat  1397 ATAGTIFVYGKDIKTDLNTVRKNMGVCMQHDVLFSYLTTKEHLLLYGSIKVPHWTKKQLHEEVKR 1461

  Fly   634 LLRYLKLEDWEKTLVNDLTIGQRRVLQFLCAFAGGNQIVILDKPFDGIDEQRTSLFYSLILDQKK 698
            .|:...|.......|..|:.|.:|.|....|..||:::||||:|..|:|.......:.:|...|.
  Rat  1462 TLKDTGLYSHRHKRVGTLSGGMKRKLSISIALIGGSRVVILDEPSTGVDPCSRRSIWDVISKNKT 1526

  Fly   699 NRSIFFTSNNQKVASGIADRIFVLSKGKLQAFGTVKKLCRMLNESYRLIIF--------GNEKCS 755
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  Rat  1527 ARTIILSTHHLDEAEVLSDRIAFLEQGGLRCCGSPFYLKEAFGDGYHLTLTKKKSPNLDTNAICD 1591

  Fly   756 FKDVYAFMATFIPEIEMDSILADCASFLV------KHKYHTELINLIENLARLKNDLNVYSFEIH 814
            ...|.|.:.:.:||..:..   |....||      ..|.....::|:..|.:....||:..:.|.
  Rat  1592 TVAVTAMIQSHLPEAYLKE---DIGGELVYVLPPFSTKVSGAYLSLLRALDKGMGKLNIGCYGIS 1653

  Fly   815 ECSIDDILASLYTRDKS-----TLE------FGQP---GLQT---LLASRQQSAKRRFIIPTM-- 860
            :.:::::..:| |:|..     :||      .|.|   |..|   |..|......|...:.|.
  Rat  1654 DTTVEEVFLNL-TKDSQKCGNMSLEHLTQRKVGNPSANGTSTPDDLSVSSSNFTDRDDKVLTRSE 1717

  Fly   861 ------YLLEELRQLLIA----DTRNWFLPILKLTLPSLVVVWTLSM----------------PY 899
                  .||:::..:||.    ..|||...|.::.||.:.|...:.:                |.
  Rat  1718 RLDGFGLLLKKIMAILIKRFHHTRRNWKGLIAQVVLPIVFVATAMGLGTLRDSSNSYPELLISPS 1782

  Fly   900 FWHNCRQPG-HITFPMSDHG-----------DGIILMQKDTLDSELL---------VASEMYAKV 943
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  Rat  1783 IYGNSEQTAFYANFDPSTNALVSALWNFPGIDNVCL---NTSDSQCLKKDNLGKWNTSGEAIDNF 1844

  Fly   944 GVTEVDKTVD---------------ITTFIYNYEYK---NSLLSDA------------------- 971
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  Rat  1845 GVCSCSDNVQECPKFNYSPPHRRTYSSQVIYNLTGKHMENYLISTANHFVQKRYGGWSFGMKLTN 1909

  Fly   972 DI---MEAVIFSNVQIEVLFNTKWPHTAPDSLAQALNS--LAVAFIDGDA-------------GI 1018
            |:   :.||..:....:|.::.:..|:.|..| .:||:  |.|...:.||             |:
  Rat  1910 DLRFDVTAVPVNRTLAKVWYDPEGYHSLPAYL-NSLNNFLLRVNMSEYDAARHGIIMYSHPYPGV 1973

  Fly  1019 KVELEVLPFSTIHTLQLHLNIDGYDLIFASCLSFCFCFIWSIPLLHMTLSRDGRYNYVELIAGMP 1083
            :.:.:....|.|..|.....:.||.:..||       |:..|...|.|.::.     ::.|:|:.
  Rat  1974 QDQEQATISSLIDILVALSILMGYSVTTAS-------FVTYIVREHQTKAKQ-----LQHISGIG 2026

  Fly  1084 TIVLIVAFLIYELLVVLLAL-FPINIAVIFFHWDLLMDSNIHIYSVYVMFIIAACVFSLNILITI 1147
            .....|...||:::..|:.: |.|.:..||........:|:...|:.::....|....:.:|..:
  Rat  2027 VTCYWVTNFIYDMVFYLVPVAFSIGVIAIFKLPAFYSGNNLGAVSLLLLLFGYATFSWMYLLAGL 2091

  Fly  1148 MPISDMPFV-YLKVLLAYSLGILVYIAVKELRPFTNPNTAHFLLLDFHPFYALLHNLMRIASISE 1211
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  Rat  2092 FHETGMAFITYVCVNLFFGINSIVSLSVVYFLSKEKPNDPTLELIS--------ETLKRIFLIFP 2148

  Fly  1212 KIWLCSDRQIYETSVYADQCNTIPNCCDDDAQEFYHLRYLCCVYLLLV---VVWISIFIFLKSHM 1273
            :  .|....:.|.|......:.:.....|...|.:.:..|..:::.||   .::..:.:.:...:
  Rat  2149 Q--FCFGYGLIELSQQQAVLDFLKAYGVDYPSETFEMDKLGAMFVALVSQGTMFFLLRLLINEWL 2211

  Fly  1274 VKRRPRQPKYF---WDSDPDSKYDQNILHIMEPSELENTWIH-EKSRVST------LERNHIESK 1328
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  Rat  2212 IKKL----RLFFRKFTSSP----------VMETVD-EDEDVHTERLRVESGAAEFDLVQLHRLTK 2261

  Fly  1329 ALHVEHLSVFFGLKAAIKHIDFMVNRYQVMSVFGANGTGKSVLLKTILGIYTPSSGRI-ISSKTV 1392
            ...:.|..:.     |:.:|...:...:...:.|.||.||:.:.|.:.|...||||.| |.:|:.
  Rat  2262 TYQLIHKKII-----AVNNISLGIPAGECFGLLGVNGAGKTTIFKMLTGDIIPSSGNILIRNKSG 2321

  Fly  1393 PFKSKDLDSCHMVGYSAQEFQTMQLMTILETWDLILRIRRSKQISFRAEATKLCKIFGLYKYRFN 1457
            .....|..| .:|||..||.....|:|:.|......|:....:...:....||.:...|..|:..
  Rat  2322 SLGHVDSHS-SLVGYCPQEDALDDLVTVEEHLYFYARVHGIPEKDIKETVHKLLRRLHLMAYKDR 2385

  Fly  1458 SLSICSQGVLKRLSLGIALMSDAELILLDDPFTHLDIVSQRSMLHIIHDLRRRGHSIIYTCSDTA 1522
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  Rat  2386 STSMCSYGTKRKLSTALALIGKPSILLLDEPSSGMDPKSKRHLWRIISEEVQNKCSVILT-SHSM 2449

  Fly  1523 YSTPAL--RMATLSYPGIAVIGEREEMQQNYYSSYYMVETRIHLAELGSPIDFDSQSTEAKEDRA 1585
            ....||  |:|.:.......||..:.::..:...:   ..::||
  Rat  2450 EECEALCTRLAIMVNGRFQCIGSLQHIKSRFGRGF---TVKVHL--------------------- 2490

  Fly  1586 GTTGTLLRHKHQEFSAAFTDSADRWKYLKLCGVIENVFPHAIIKNVSFPRVCFWLSSHMYPMSRI 1650
                     |:.:.|     ..:..|:::|      .||...:|:.....:.:.:......::.|
  Rat  2491 ---------KNNKVS-----MENLTKFMQL------HFPKTYLKDQHLSMLEYHVPVTAGGVANI 2535

  Fly  1651 VDTLHRNKQ--DFYSFSVSQPSVNSVFLSIHR-QKS 1683
            .|.|..||.  :..:|.|||.::..||::..: |||
  Rat  2536 FDLLETNKTALNITNFLVSQTTLEEVFINFAKDQKS 2571

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG43672	NP_788912.3	rim_protein	<266..>732	CDD:130324	120/521 (23%)
		ABC_subfamily_A	519..737	CDD:213230	66/219 (30%)
		P-loop containing Nucleoside Triphosphate Hydrolases	1330..1517	CDD:476819	52/187 (28%)
Abca12	NP_001414620.1	None