Protein Alignment CG43672 and Abca9

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_788912.3
• Gene: CG43672 / 318910
• FlyBaseID: FBgn0263747
• Length: 1690
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001417081.1
• Gene: Abca9 / 287788
• RGDID: 1305931
• Length: 1653
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1926
• Identity: 379/1926 - (19%)
• Similarity: 703/1926 - (36%)
• Gaps: 559/1926 - (29%)

  Fly    25 LVLILSLVLPVMSSLFLLFIRSSSDSNMRDYSIRAEAELLEFSWSSLIGKIQERRAKMASKQRNF 89
            |.:..|..|...:|..|...:.:....||...:|...::......:.:.|.:.||..:.....:|
  Rat     4 LKISASAFLRTFTSTSLKSFKKNKQVKMRKRRLRLGQQMWALLCKNWLRKFRMRRETLLEWLLSF 68

  Fly    90 TTNVFIPDIRVAFAPNSNAALRRLMGDALGKLSMSEDKIVDFENCNDMRIHAASEHYLASVCFRN 154
            ..      |.:|:..:||.   ..:.||.....|...::.||.:.|          |:  :.|..
  Rat    69 LL------ILLAYQLSSNL---HQVHDAPEMSMMDLGRVDDFNDSN----------YI--IVFAP 112

  Fly   155 VDESLNGLPTVLNFAIIMP----------------SELR-NY---------EDTW---IGDSW-- 188
            ..|:.:   .::|.|.:.|                |||. ||         :||:   :..||
  Rat   113 ESETTH---EIMNIAALAPFMKGRTIVACPDESSMSELNLNYSIDAVRVIFKDTFSYHLKFSWGQ 174

  Fly   189 --------KETTT----LMDRDVAEEDEFDEDGYTDYMGEGFVPLQYHISMQFLRATA--SKVEK 239
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  Rat   175 RIPKTKEHKDHTAPCEPFKNKMVCENSVFWE--------KGFVAFQTAINAGIIEVTTNHSVMEE 231

  Fly   240 LPKVVMRRFNENPNVLLSEGIGTS-VVLLILLGFMFPVTILTTLIVEERELGQRYMLKILNASAT 303
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  Rat   232 LMSVIGSVMKMQP-FIAQGGVATDFFIFFCVISFSSFIYYLSVNVTQERQ-----SITTLMAMMG 290

  Fly   304 LQMAAWFFN---VFTHF-LITSLLITILLKIEWNGATAAVNKCPWPILLCFLISYGCSVTSLIIL 364
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  Rat   291 LRESAFWLSWGLMYAGFILVVATLMSLIVK-----STQVVVLTGFMVVFLLFLLYGLSLITLSFL 350

  Fly   365 MTSAMRR---SRVAMVMAPIIWILLALPLLSKKELLSDGPDVFYGFATVLLCNVS---FSRGLSK 423
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  Rat   351 MSVLLKKPFLTGLAVFLLTVFWGSLGFTALYKH---------LPAFMEWILCFLSPFAFINGMAQ 406

  Fly   424 IFYIEDYTLGVTI------GKYMFYRVSKSDFGIFVPIVCFYVQTIFCTLLAMIFENNAYFWLAI 482
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  Rat   407 LIHL-DYDVNSNVNLNSPNNSYL----------------------ILATLFMLVLDALLYLALAL 448

  Fly   483 RV-KNLLKKYHATRSAVGRLKRQIPEVSFSKTSAEALI--------------------EFRG--- 523
            .. |.||.||...||.:..||   ....|.:..|:.::                    ||:|
  Rat   449 YFDKILLSKYGHQRSPLFFLK---SSYWFQRRGADHVVLENEIDSAPSLNDSLEPVSPEFQGKEA 510

  Fly   524 -----VWQKYS---NSTYVVQDITLNVYAGEVVALLGHNASGKSTIIKMLYGRTRPKLGEIYLSG 580
                 :.::|:   .....::.:..::|.|::.|||||:.:||:|:|..|.|.:.|..|.|.:
  Rat   511 IRIKNLRKEYTGKHGKVEALRGLGFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLINTLSGLSPPTTGSITI-- 573

  Fly   581 FN-IVTQRKEAL---KNSSISMSYKTLFTELVVLDHLVFLSRLRGLSKTEAKLEAKALLRYLKLE 641
            :| .|::.:::.   |.:.:.......|..|.|.::|...::::|:...|.:.|.:.:||.|::|
  Rat   574 YNQTVSETEDSYAVPKLTGVCPQSNIQFGFLTVQENLRLFAKIKGILPQEVEQEVRQVLRDLEME 638

  Fly   642 DWEKTLVNDLTIGQRRVLQFLCAFAGGNQIVILDKPFDGIDEQRTSLFYSLILDQKKNRSIFFTS 706
            :.:.||..:|:.||:|.|.|..|..|..|:::||:|..|:|.......::|:.:::..|.|.|::
  Rat   639 NIQDTLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHHIWNLLKERRSGRVIVFST 703

  Fly   707 NNQKVASGIADRIFVLSKGKLQAFGTVKKLCRMLNESYRLIIFGNEKCSFKDVYAFMATFIPEIE 771
            .....|..:|||...:|.|:|:..|:...|.:.....|.|.:..||.|..:.:.:.:...||:..
  Rat   704 QFMDEADILADRKVFISNGRLRCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNETCDPESITSLVKKHIPDAR 768

  Fly   772 MDSILADCASFLVKHKYHTELINLIENLARLKNDLNVYSFEIHECSIDDILASLYTRDKSTLEFG 836
            :.:...:...:::..:...:..:|..:|.|..|. .:..:::...:::::...|  ..||..|..
  Rat   769 LTAQSDEQLVYILPLERTNKFPDLYRDLDRCSNH-GIEDYDVSMTTLNEVFLKL--EGKSMAEEP 830

  Fly   837 QPGLQTLLAS-------------------------------RQQ---SAKRRFI--------IPT 859
            ..|:...|.|                               |||   .||.||:        :.|
  Rat   831 DAGVCGRLLSDGAKDVESLVELERVLPLDSSGSSVSGMALWRQQLCAVAKVRFLKLKNERRSLMT 895

  Fly   860 M----------YLLEELRQLLIADTRNWFL-PILKLTLPS----------LVVVWT-LSMPYFWH 902
            |          .|||.|...:...:.:|.| |.:....|.          ||:..| .|:..|.|
  Rat   896 MLLLFGISFVPQLLEHLVYKVYHKSYSWGLSPSMYFLSPGQLPQDPLTHLLVINKTGSSIDNFIH 960

  Fly   903 NCRQPGHITFPMSDHG----------DGIILMQKDTLDSELLVASEMYAK--------------- 942
            :.||.| |...:...|          :|.:.:..|..|....||..  ||
  Rat   961 SLRQQG-IALDVDALGTRNGKEEALYNGAVTVLGDEKDLRFSVACN--AKRLNCFPVLADILSNG 1022

  Fly   943 -VGV---TEVDKTVDITTFIYNYEYKNSLLSDADIMEAVIFSNVQIEVLFNTKWPHTAPDSLA-- 1001
             :|:   :|..:|...|.|..:..|:...:|:|.....|..|..          |:.|..|::
  Rat  1023 LLGIFNSSERIQTDRSTVFEDHMLYEYGFMSNAFFWIPVAASLT----------PYIAMGSISDH 1077

  Fly  1002 ---------------------QALNSLAVAFIDGDAGIKVELEVLP--------FSTIHTLQLHL 1037
                                 |||..:.:.|:     |.:.::::.        .|.|.:|.:.:
  Rat  1078 KKKVLSQLWTSGLYPSAYWCGQALVDIPIYFL-----ILLLMQIMDSVFSSEEIMSVIESLLIQI 1137

  Fly  1038 NID-GY--DLIFASCLSFCFCFIWSIPLLHMTLSRDGRYN-----YVELIAGMPTIVLIVAFLIY 1094
            ... ||  .|||   |::...|::          |:||.|     :..||.   ||..|||..|.
  Rat  1138 PCSIGYASSLIF---LTYVISFVF----------RNGRKNSGIWSFFFLIV---TIFFIVATDIN 1186

  Fly  1095 E-----LLVVLLALFPINIAVIFFHWDLLMDSNIHIYSVYVMFIIAACVFSLNILITIMPISDMP 1154
            |     ||...|.:.|..:.     ..||:.|.:...||                 ..:..|:..
  Rat  1187 EYGFLQLLFCTLLIPPFTLI-----GSLLIFSEVSYDSV-----------------DYLGSSESQ 1229

  Fly  1155 FVYLKVLLAYSLGILVYIAVKELRPFTNPNTAHFLLLDFHPFYALLHNLMRIASISEKIWLCSDR 1219
            .|:|.:|:.|                     .||||     |:.:|.              |.:|
  Rat  1230 LVFLALLIPY---------------------LHFLL-----FFFILR--------------CLER 1254

  Fly  1220 QIYETSVYAD--------QCNTIPNCCDDDAQEFYHLRYLCCVYLLLVVVWISIFIFLKSHMVKR 1276
            .|.:.::..|        .|...||
  Rat  1255 YIRKKTLRVDPVFRISPRSCRAFPN---------------------------------------- 1279

  Fly  1277 RPRQPKYFWDSDPDSKYDQNILHIMEPSELENTWIHEKSRV--STLERNH-IESKALHVEHLSVF 1338
             |..|   .:.|.|.:.::    :.....:....:.||..:  |.|.:.: :::|....:...
  Rat  1280 -PEDP---GEEDEDVQMER----VRTSGAMTTPQMDEKPVIIASCLRKEYTVKTKRCFSKTKK-- 1334

  Fly  1339 FGLKAAIKHIDFMVNRYQVMSVFGANGTGKSVLLKTILGIYTPSSGRII-----SSKTVPFKSKD 1398
               |.|.::|.|.|.:.:|:.:.|.||.|||..:..|.|...|::|::.     .|..:.|
  Rat  1335 ---KIATRNISFCVKKGEVLGLLGHNGAGKSTTISMITGDTVPTAGQVFLKGSSGSAALGF---- 1392

  Fly  1399 LDSCHMVGYSAQEFQTMQLMTI---LETWDLILRIRRSKQISFRAEATKLCKIFGLYKYRFNSLS 1460
                  :||..||......:|:   ||.:..:..:|:.:.|   ...|:|.....|.......:.
  Rat  1393 ------LGYCPQENVLWPNLTVKEHLEVYAAVKGLRKKEAI---VTITRLVNALKLQDQLKALVK 1448

  Fly  1461 ICSQGVLKRLSLGIALMSDAELILLDDPFTHLDIVSQRSMLHIIHDL---RRRGHSIIYTCSDTA 1522
            ..|:||.::|...::::.:..::|||:|.|.:|...|:.|...|...   ..||..:     .|.
  Rat  1449 TLSEGVKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFTNTERGALL-----TTH 1508

  Fly  1523 YSTPAL----RMATLSYPGIAVIGEREEMQQNYYSSYYMVETRIHLAELGSPIDFDSQSTEAKED 1583
            |...|.    |:|.:....:..||..:.::.. :...|::|.:     |.:|...:|.:||
  Rat  1509 YMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSK-FGKDYLLEMK-----LKTPALVESLNTE---- 1563

  Fly  1584 RAGTTGTLLRHKHQEFSAAFTDSADRWKYLKLCGV---IENVFPHAIIKNVSFPRVCFWLSSHMY 1645
                   :||        .|..:|.:.:|..|...   :|:|.|               ||...:
  Rat  1564 -------ILR--------LFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVRP---------------LSEAFF 1598

  Fly  1646 PMSRIVDTLHRNKQDFYSFSVSQPSVNSVFLSIHRQKSNKD 1686
            .:.|:.:..     |...:|:||.::..|||.:.:::...|
  Rat  1599 KLERLKENF-----DLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGD 1634

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG43672	NP_788912.3	rim_protein	<266..>732	CDD:130324	112/517 (22%)
		ABC_subfamily_A	519..737	CDD:213230	62/252 (25%)
		P-loop containing Nucleoside Triphosphate Hydrolases	1330..1517	CDD:476819	45/197 (23%)
Abca9	NP_001417081.1	None