DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG34126 and Bltp3a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001260066.1 Gene:CG34126 / 318872 FlyBaseID:FBgn0083962 Length:1518 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001418709.1 Gene:Bltp3a / 309637 RGDID:1307264 Length:1448 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1624 Identity:426/1624 - (26%)
Similarity:696/1624 - (42%) Gaps:347/1624 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVSLIKNQLLKHLSIYTKNLSSDKINLSTFRGEGELSNLELDERVLTELLELPSWLRLTSAWCNH 65
            |..:||.|:|||||.:|||||.|||||||.:|||:|::|||||.||..:||||:||.:|..:||.
  Rat     1 MAGIIKKQILKHLSRFTKNLSPDKINLSTLKGEGQLTHLELDEEVLQNVLELPTWLAITRVYCNR 65

  Fly    66 VSFRISWTKLKSVPITLTLDEVRITIETCNPTTRDAGGGSGAGGAGSPTAAASAALPQVPQGKYS 130
            .|.||.|||||:.||.|.||:|.:.::||.......|        .||.|.||.      |.:|.
  Rat    66 ASIRIQWTKLKTHPICLCLDKVEVEMKTCEDPRPPNG--------QSPIALASG------QSEYG 116

  Fly   131 FIHKVVDGITIVVNTVNVNFVSAAFTASVQMSRIRVESKTPKWANADLRLTRLKDAQKGIILIFK 195
            |..|||:|:.||||::.:...|.||.||.::.:::..|..|.|..:||||||:.|.::|.:|.||
  Rat   117 FAEKVVEGMFIVVNSITIKIHSKAFHASFELWQLQGYSVNPSWQQSDLRLTRITDPRRGEVLTFK 181

  Fly   196 ELSWQTVRIEASST----QDKSLTPLRLLTNHARCRITIRKRLSDCSLLASRLVLILDDLLWVLT 256
            |::|||:|:||.:|    ||...|||||:||..|.:|.:::|..||:::||:|..:|||||||||
  Rat   182 EITWQTLRVEADATENGDQDPVTTPLRLITNQGRIQIALKRRTKDCNVVASKLTFLLDDLLWVLT 246

  Fly   257 DSQLKAALHFVDSLSGLIKAATHATQKTKAARKMQTLPEYKAQVEQQQNRLSESAHTTNAQRM-- 319
            ||||||.:.:.:|||..::.:.. .:|:.|...:|..|...:..:........|...:::.|:  
  Rat   247 DSQLKAMMKYAESLSEAMEKSAQ-QRKSLAPEPVQITPPAPSAQQTWAQAFGGSQGNSSSSRLSQ 310

  Fly   320 -FNAFDVRETSYHFFSQRIDLHLCDDEGDGRSSYPDLD----KGGALQVSVTAFQVDYYPYHLAK 379
             |..|||:|:|||....|:|||:||   |.:|..|.:.    .|||:|::......||||:|.|.
  Rat   311 YFEKFDVKESSYHLLISRLDLHICD---DSQSREPGVSANRLTGGAMQLTFRKMAFDYYPFHRAG 372

  Fly   380 SDRSHWAKYKEASVAPALWLKESLNAFREAVLNLSQPN--RPATHAPLERSTPASPIMLSASMLG 442
            ....||.::.||....:.|.::.:..|:..:....:.:  :|..|..::     .|.        
  Rat   373 DSCKHWVRHCEAMETRSHWAQQLVTEFQSRMEKWCEESSVKPPWHLGVD-----PPF-------- 424

  Fly   443 SQHGAGSFSNGSSTPTAAGLAAGSGGSAGSGTASMNSQFSQAAQQRSTLENLAKLMSSCVILRIE 507
             :..|.|||:...:|.......|...:.||...|                   :|.|||:::|::
  Rat   425 -RKKADSFSSPGKSPLDKSPTQGRQAAFGSPAWS-------------------RLRSSCLVVRVD 469

  Fly   508 DFTLYRVTTSGKKA-MPKEFVSGDKDRYSFPAEMPIIHAEYTYFYYPGDFVFPLPPSKVFVHVNP 571
            |..:::|:|:|:.: .|...:|..:.|:..|:::..||.::|.:|:|.:...|:|...:::.:|.
  Rat   470 DLDIHQVSTAGQPSKKPSTLLSCSRKRHRLPSQVAAIHVQFTEYYFPDNQELPVPCPNLYIQLNG 534

  Fly   572 IQVHFDLSSILWLNSFGLNLHESLLRTSVGSQSTLHPQQQLPRGSIASNGSNGTQMAAVNVEQEP 636
            :.:..|..|:||.|.|.|:|:.||                             .|..|:...::|
  Rat   535 LTLTVDPVSLLWGNLFCLDLYRSL-----------------------------EQFKAIYKLEDP 570

  Fly   637 NLM--YMDVKVEAIMPRIVMEAALDAPSQKDRPKTMQIQVSRFALTNIREMGSSRADLAQALHSL 699
            ...  ::|::::|...::.........::..||:.:.:..|....||.|..........|.|...
  Rat   571 RGKDEHLDIRLDAFWLKVSFPLETRDLAKLHRPQALVLSTSGVIATNTRHAPHCSCPDLQGLFRG 635

  Fly   700 QEGSLVFGSG---FPSKEGDMCIVTDRILSHVAASDVSMMSPVSPTGQQLPRSASTQYLSRYVMW 761
            ...:..|.|.   ||...|...::....|.|...:|   ..|..|:.....|.|:.|        
  Rat   636 FAATEFFRSSYGHFPKVPGGFSLLHMVFLHHAFQTD---SLPAQPSSLPPQRPAAAQ-------- 689

  Fly   762 LEPRDVWCIKLDPVWVDFLGARSLGPNKSIPFVDAVPITLW----LHSGSAQA-QLDVGKSGTAG 821
                |:|.:....:.:||.|..:: ...::.||...|:::|    |....||| :|.:...|...
  Rat   690 ----DLWSLHFTQISLDFEGTENV-KGHALNFVAPFPLSIWACLPLRWQQAQARRLLLASEGRLK 749

  Fly   822 SMESMGMP-PLPTLPPLQPCNP-FLSDEDVRL---AGVASGASPPAPAP----------DRTADV 871
            ...|.|.| ....|.|....:. ..::.|::.   :|...||.....|.          :..||:
  Rat   750 PSASFGSPVHSEALAPESVSHQRSKTERDLKSLSGSGEVLGAVREGDAGVDHRGQVAELEDVADI 814

  Fly   872 HAIAHISNLVSLQIDHYQLLFLLRLAEELNEMSTFLNLDAERILQKQNEQKSIIFGCVVPQIEVT 936
            |.:.|.:..|.:::||||.|.||||.|.|..:...|..|.|.:.....:.:::..|.:.|..||.
  Rat   815 HMLVHSTAHVRVRLDHYQYLALLRLMEVLQGLQEQLTKDTEAMTGSPLQDQTVCVGVLFPSAEVA 879

  Fly   937 LVMPSPTPG---KESSGGDAESVVPDSASLGDDLHMNSGNITWPTPPPLDQLKSNTFGSVETPSP 998
            |:|| |.||   .:|:|.|..|::....|..:|....|.             .|:..|.| :|..
  Rat   880 LLMP-PDPGAAHADSAGSDTTSLIDSELSPSEDREPKSD-------------ASSDQGPV-SPEK 929

  Fly   999 VTNEPPFDNGIHISNPNTHGYNVQIQSTPTMASSTASQGSRPDTGISTQSQSQTQSISSASKSAK 1063
            |..:...:| :..|....|| :.::|....:|...|.:.......:..:..|:.|:.:| ..:|.
  Rat   930 VLRDSSAEN-LDASQERLHG-DGELQDVGPLAQQPAGKSHEAVESLQAKKLSRAQTATS-PPTAD 991

  Fly  1064 SAAARSGATDTVP---------------------------SLTKEINS----------------- 1084
            ..||.:|..:.:|                           .||||..|                 
  Rat   992 RDAALNGQGEPIPLRSIEGELSSAIHMTKDATKEALHATVDLTKEAVSLTRDAFSLGRDRMTSTM 1056

  Fly  1085 -------------------------------GLLSMKKGFSSFMTSIDS-AIKSGTPNDDASDTF 1117
                                           ...|||:..|  ..|.|. ::.||.|    .|..
  Rat  1057 HKMLSLPPAKEAMAKSDEGVAAPASGGPARLRFFSMKRTVS--QQSFDGVSLDSGGP----EDRI 1115

  Fly  1118 SIQSDISSDSDNFANVLGDDKTMDCMDVMFRLNPFTTDNMKASPVEVASEVYEEQPSSYKTNMSS 1182
            |:.||   .||:|..:|..:...:.:......:......::.|||..:|.  :..|   :||.|:
  Rat  1116 SVDSD---GSDSFVMLLESESGPESVPPGSVTSVLDDSGIQGSPVMDSSG--QGLP---ETNSSA 1172

  Fly  1183 PSEPSEGSTWRRRDL----VSMATFRLTTVELIRQQEGPKSSVRLQVAAVSCDECGAIP-WDELQ 1242
            .:.         .||    ||:...:::.|.|..:..|...:|.||...::..:.|.:. |..|.
  Rat  1173 SAS---------GDLALHSVSVLVLKVSEVSLGLEVRGEDLAVALQAQQLALQQLGTVGLWQFLH 1228

  Fly  1243 IARQANKTKFGARCKAWNLAPYNPEAP---------PCIRMRLE----ETLNMPKEIE-GIIDRK 1293
                       .:|...:.     |.|         |.:.:|.|    ..::.|...: |.:   
  Rat  1229 -----------GQCPGPSF-----EGPSDLKTDSTRPAVGLRFEVGPGAAVHSPLAAQNGFL--- 1274

  Fly  1294 RIQSWITHHAEIRVKDINMDLSMSTVIGLGDLAEDEVISPPMPLTVNLENVRINLLEDRPPVNIT 1358
                      ...::..:::|..|.:.|||...|||.:...:|:.:.|.:..:.|.:|.||:..|
  Rat  1275 ----------RFSLRGCDLELFTSVLNGLGPFLEDECVPVVVPMQMELLDCSVTLKDDIPPIYPT 1329

  Fly  1359 SPGPIPINLCIGRMRLERDQSGLLNI------QPIDTNMSDAQ----------------HQALGS 1401
            ||||:||.|.:.|:.|:|...|:.::      :|:.......|                |||.|.
  Rat  1330 SPGPVPITLTMERLMLKRGDDGVFHLGAPAQDRPLAEGPEKQQLPKEQVPLVPTGQGLGHQAQGD 1394

  Fly  1402 A-LFGAPRERDRELLSMQLVMQQMKLDNDQLRRQLVDSK-----VNTDNYRHKTKQEADVLRSY 1459
            | :|.          |.:|.:.|.| .:..|:::|.|:|     .|.|  |.|..||   :|.|
  Rat  1395 ATVFS----------SGELFLLQEK-GSPTLQQELADTKQALAIANQD--REKLLQE---IRKY 1442

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG34126NP_001260066.1 Chorein_N 3..98 CDD:463646 56/94 (60%)
Bltp3aNP_001418709.1 Chorein_N 1..>96 CDD:463646 57/94 (61%)

Return to query results.
Submit another query.