Protein Alignment Ir8a and grin3a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_727328.1
• Gene: Ir8a / 31867
• FlyBaseID: FBgn0052704
• Length: 936
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073770471.1
• Gene: grin3a / 564832
• ZFINID: ZDB-GENE-130530-780
• Length: 1117
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 781
• Identity: 158/781 - (20%)
• Similarity: 289/781 - (37%)
• Gaps: 226/781 - (28%)

  Fly   227 KYRRQAELCTRFTL---NPR---------------------AICRSMPMPD----LYCGSGFTMQ 263
            :::||.:....|.:   ||:                     .:|:.|.:.|    |:..|.|.:.
Zfish   232 EFQRQTQNLLHFQMAMQNPQTSQANLIFSLLSMNNWFDVSLVMCQQMNISDFVFLLHNNSKFHLG 296

  Fly   264 RAMLLNVLRSLINAAQVSPGYPLAIYQDCNAT--ASSSEVSD-----------PLEKDDYNW--- 312
            ..:.::...|..|...:.....|...:|..:|  ....::.|           .|...||:|
Zfish   297 TVLKISTNSSSKNDFHIFLQAQLESIKDSTSTLVTFGCDIRDIRRIFTTIAKFGLILPDYHWIIG 361

  Fly   313 ------------LDMVHWSNFLAYA----PPLPH-IQDQFQ------------SP----VPGLT- 343
                        |.|    ..||:.    |.|.| :||..:            ||    :||.|
Zfish   362 DSQNVEELRTEGLPM----GLLAHGRMGEPSLDHYVQDALELVARAVGSAATVSPQLALIPGTTN 422

  Fly   344 -----FAVNISAGYYSSEHEAKTDL---------------------------------AAWSSVG 370
                 .|.|:::|.:.|.:.|.|..                                 ..|:.:|
Zfish   423 CLARLEAKNLTSGTFLSRYMASTSFDGLSGCISVQEESTIISESHHFIWNLQHDPIGKPMWTRLG 487

  Fly   371 EMR----LLNETISPARR--------------FFRIGTAESIPWSYLR--REEG---TGELIRD- 411
            ..:    :::..:.|.:|              ..|:.|....|:.:.|  .:||   .|:|..|
Zfish   488 SWKHGKVVMDYGVWPNKRRSQPGADWRHSSRLHLRVVTLVEHPFVFTRDVDDEGLCPAGQLCLDP 552

  Fly   412 ------------------RSGLPI-----WEGYCIDFIIRLSQKLNFEFEIVAPEVGHMGELNEL 453
                              ...:|:     ..|||||.:.:|::.:.|:|::.....|..|....
Zfish   553 LTNDTALLESLFQGLQGANDTVPLEFKKCCYGYCIDLLEKLAEDMGFDFDLYIVGDGKYGAYKN- 616

  Fly   454 GEWDGVVGDLVRGETDFAIAALKMYSEREEVIDFLPPYYEQTGISIAIRKPVRRTSLFKFMTVLR 518
            |.|.|:||||:.|....|:.:..:.|.|.:||||..|:: .|.:.|.:|.......:..||..|.
Zfish   617 GRWTGLVGDLMSGAAHLAVTSFSINSARSQVIDFTSPFF-STSLGILVRTRDTAAPIGAFMWPLH 680

  Fly   519 LEVWLSIVAALVGTAIMIWFMDKYSPYS----SRNNRQAYPYACREFTLRESFWFALTSFTPQGG 579
            ..:||.|..:|..||:.:...:..||:.    .||..:.:     .|:...:..:|:. |.....
Zfish   681 WSMWLGIFVSLHVTAVFLTLYEWKSPFGMTPRGRNRDRVF-----SFSSALNVCYAIL-FGRTAA 739

  Fly   580 GEAPKAISGRMLVAAYWLFVVLMLATFTANLAAFLTVERMQTPVQSLEQLARQSRINYTVVKDSD 644
            .:.||..:||.|:..:.:|.:..|:|:||||||.:..|:      :.|||:.        :.|..
Zfish   740 IKPPKCWTGRFLMNLWAIFCLFCLSTYTANLAAVMVGEK------TYEQLSG--------IHDPK 790

  Fly   645 THQYFVNMKFAEDTLYRMWKELALNASKDFKKFRIWDYPIKEQYGHILLAINSSQPVADAKEGFA 709
            .|......:|.         .:..::::|:.|   ..:|...:|.....|..:...:...|:...
Zfish   791 LHHPSQGFRFG---------TVRESSAEDYVK---KSFPEMHEYMRRYNAPTTPDGIDHLKDDPQ 843

  Fly   710 NVDAHENADYAFIHDSAEIKYEIT--RNCNLTEVGEVFAEQPYAVAVQQGSHLGDELSYAILELQ 772
            .:|       |||.|.|.:.||::  .:|.:..||:.||.:.|.:.::|.|.|...:|..:.:.:
Zfish   844 KLD-------AFIMDKALLDYEVSIDADCKMLTVGKPFAIEGYGIGLKQNSPLTSNISELVSQYK 901

  Fly   773 KDRFFEELKAKYWNQSNLPNCPLSEDQEGIT------LESLGGVFIATLFGLVLAMM-TLGMEVL 830
            .|.|.:.|..|::..     .|..:....:|      ::...|:|:....|:.|::: |||..::
Zfish   902 SDGFMDMLHDKWYKV-----VPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVMLCVGVALSLLTTLGEHIV 961

  Fly   831 Y 831
            :
Zfish   962 H 962

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir8a	NP_727328.1	PBP2_iGluR_putative	383..786	CDD:270435	105/451 (23%)
grin3a	XP_073770471.1	None