Protein Alignment GluRIIE and grin2ab

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036733.1
• Gene: GluRIIE / 318623
• FlyBaseID: FBgn0051201
• Length: 897
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073805448.1
• Gene: grin2ab / 570493
• ZFINID: ZDB-GENE-070424-223
• Length: 1445
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 984
• Identity: 214/984 - (21%)
• Similarity: 411/984 - (41%)
• Gaps: 214/984 - (21%)

  Fly     7 VILWSLFSIHISVNWAQYENFGGYDNYQSLESVPIGLLTDQNTEQMNIVFDHAIDVANQEVGTSL 71
            ::||:|              .||....:...|:.|.::..|..    .|.:.|:..| :.:|..|
Zfish     9 MVLWAL--------------LGGSQAAEKPPSLSIAVILGQTP----TVSESALRPA-RGIGAPL 54

  Fly    72 --TSLKEEVNYGDAYQSYGKLCRMLET----GIAGVFGPSSRHTAVHLM----SICDAMDIPHIY 126
              |.|..:||..|.......||.::..    |:  |:|..:...||..|    |...:|.|..|:
Zfish    55 DVTVLSIQVNQTDPGSMLTHLCELMSRQRLHGL--VYGDGTDQEAVAQMLDFVSSQTSMPILGIH 117

  Fly   127 S----YMSENAEGFNLHPHPADL---AKALYSLITEFNWTRFIFLYESAEYLNILNELTTMLGKS 184
            .    .|:|.....:.....|.|   |..:.:::.|::|  .:|...:.::......:.|:.
Zfish   118 GGSAMTMAEKDSSSSFFQFGASLQQEALLMLAIMEEYDW--HVFSVVTTKFPGFQEFIATVR--- 177

  Fly   185 GTVITV----LRYDMQ----LNG------NYKQVLRRVRKSVDNRIVVVGSSETMPEFLNQAQQV 235
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Zfish   178 ---VTVDHSFVRWDLQSVVTLDGVGEPEDRAHVQLKRIQSPV---ILLYCSKDEAALVMEEARSL 236

  Fly   236 GIINEDYKYIIGNLDFHSFDLEEYKYSEANITGLRLFSPEKMAVKELLMKLGYPTDQDEFRNGSC 300
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Zfish   237 GLTGAGFVWIVPSL----------------TTGNLEHIPE--AFPAGMISVTY----DEW---DY 276

  Fly   301 PITVEMALTYDAVQLFAQTLKNLPFKP---MPQ---NCSQRTESVRDDGSSFKNYMRTLRLTDRL 359
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Zfish   277 PLETRL---QDAVGIISSAAAAM-FREEGRIPDGTASCYGQSEKPEVPPSALRRYMMGVNL---- 333

  Fly   360 LTGPIYFEGNVRKGYHLDVIELQPSGIV----------KVGTWDEDRQYRPQRLAPTTAQFDSVD 414
                    |.....:..|..::.|..:|          |:|.| |:...|.:  .|...:::|..
Zfish   334 --------GGKDHSFMDDGYQVNPKLVVIVLNTEREWEKMGRW-ENHSLRLK--FPVWPRYNSFG 387

  Fly   415 NSLANKTFIILLSVPNKPYA--------------QLVETYKQLEGNS---QY-----EGYGVDLI 457
            :..|::..:.::::..:|:.              ..|...|.::.|:   .|     :|:.:|::
Zfish   388 DMDADENHLSIVTLEERPFVIVDDVDILTGTCMRNSVPCRKHIKDNTTEGSYVKKCCKGFCIDIL 452

  Fly   458 KELADKLGFNFTFVNGGNDYGSYNKSTNES-TGMLREIMTGRADLAITDLTITSEREQALDFTIP 521
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Zfish   453 KKIARNVKFTYDLYLVTN--GKHGKKINNVWNGMVGEVVYKKAVMAVGSLTINEERSEAIDFSVP 515

  Fly   522 FMNLGIAILYLKPQKATPELFTFMDPFSEEVWWFLGFSFLGV-SLSFFILGRLSPSEWDNPYPCI 585
            |:..||::: :.....|.....|::|||..||..:....|.| :::.|:...:||..::......
Zfish   516 FVETGISVM-VSRSNGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVTAIAVFLFEFISPLGFNRNLAQG 579

  Fly   586 EEPEELENQFTLGNSIWFTTGALLQQGSEI-GPKALSTRTVASFWWFFTLIVVSSYTANLAAFLT 649
            ::|.  ...||:|.::|...|.:......: .|:..:::.:.|.|.||.:|.::|||||||||:.
Zfish   580 KDPH--GPSFTIGKAVWLLWGLVFNNSVPVQNPRGTTSKFIVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMI 642

  Fly   650 IEKPQSLINSVDDLADNKDGVVY--------GAKKTGST-RNFFMTSAEERYKKMNKFMSENPQY 705
            .|:   .::.|..|:|.|....|        |....||| ||.     .:.|..|:::|   .:|
Zfish   643 QEE---FVDQVTGLSDRKFQSPYSYSPPFRFGTVPNGSTERNI-----RKNYPAMHQYM---VKY 696

  Fly   706 LTEDNMEGVNRVKTNTHYAFLMESTSIEYNTKRE--CNLKKIGDA--LDEKGYGIAMRKDWPHRG 766
            .....::.:..:||....||:.::..:.|...|:  |.|..||..  ....||||||:|....:.
Zfish   697 HQTGVVDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYMAGRDDGCKLVTIGSGYIFATTGYGIAMQKGSYWKR 761

  Fly   767 KFNNALLELQEQGVLEKMKNKWWNEVGTGICATKEDAPDATPLDMNNLEGVFFVLLVGSCCALL- 830
            ..:.|:|.:...|.:|:::.:|.    ||||..:::...::.||::|:.|||::|......:|:
Zfish   762 LVDLAILGIIGDGEMEELEAQWL----TGICHNEKNEVMSSQLDVDNMAGVFYMLAAAMALSLIT 822

  Fly   831 ---------------YGIIS---WVLFVMKKA-----HHYRVPLRDALKEEFQFVIDFN---NYV 869
                           .|:.|   .:||.:.:.     |...:.|:.|.:      :||:   |.:
Zfish   823 FVWEHLFYWRLRYCFTGLCSGRPGILFTISRGIWSCIHGVHIELKKAPE------LDFSPQANML 881

  Fly   870 RVLKNSASI 878
            .:||::..|
Zfish   882 HLLKSAKEI 890

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIIE	NP_001036733.1	PBP1_iGluR_Kainate	40..402	CDD:380605	78/408 (19%)
		PBP2_iGluR_Kainate	419..790	CDD:270432	102/408 (25%)
		Lig_chan	551..824	CDD:459656	77/287 (27%)
grin2ab	XP_073805448.1	None