Protein Alignment GluRIIE and grin3a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036733.1
• Gene: GluRIIE / 318623
• FlyBaseID: FBgn0051201
• Length: 897
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073770471.1
• Gene: grin3a / 564832
• ZFINID: ZDB-GENE-130530-780
• Length: 1117
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 846
• Identity: 184/846 - (21%)
• Similarity: 338/846 - (39%)
• Gaps: 160/846 - (18%)

  Fly    97 GIAGVFG-PSSRHTAVHLMSICDAMDIPHI------YSYMSENAEGFNL---HPHPADLAKALYS 151
            |::.:.. |.:|...|.|..|...:.||.|      :...::|...|.:   :|..:. |..::|
Zfish   197 GVSAIISFPQNRDELVKLEFIASTLQIPVISVVQSEFQRQTQNLLHFQMAMQNPQTSQ-ANLIFS 260

  Fly   152 LITEFNW-------------TRFIFLYESAEYLNILNELTTMLGKSGTVITVLRYDMQLNGNY-- 201
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Zfish   261 LLSMNNWFDVSLVMCQQMNISDFVFLLHNNSKFHL-----------GTVLKISTNSSSKNDFHIF 314

  Fly   202 -KQVLRRVRKSVDNRIVVVGSSETMPEFLNQAQQVGIINEDYKYIIGNLDFHSFDLEEYKYSEAN 265
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Zfish   315 LQAQLESIKDSTSTLVTFGCDIRDIRRIFTTIAKFGLILPDYHWIIGD----SQNVEELR-TEGL 374

  Fly   266 ITGLRLFSPEKMAVKELLMKLGYPTDQDEFRNGSCPITVEMALTYDAVQLFAQTL-------KNL 323
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Zfish   375 PMGLLAHG-----------RMGEPS-LDHY-------------VQDALELVARAVGSAATVSPQL 414

  Fly   324 PFKPMPQNCSQRTESVR-DDGSSFKNYMRTLRLTDRLLTG--PIYFEGNVRKGYHLDVIELQ--P 383
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Zfish   415 ALIPGTTNCLARLEAKNLTSGTFLSRYMASTSFDG--LSGCISVQEESTIISESHHFIWNLQHDP 477

  Fly   384 SG---------------IVKVGTWDEDRQYRP-------QRL---------APTTAQFDSVDNSL 417
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Zfish   478 IGKPMWTRLGSWKHGKVVMDYGVWPNKRRSQPGADWRHSSRLHLRVVTLVEHPFVFTRDVDDEGL 542

  Fly   418 ANKTFIILLSVPNKPYAQLVETYKQLEGNS-----QYE----GYGVDLIKELADKLGFNF-TFVN 472
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Zfish   543 CPAGQLCLDPLTNDT-ALLESLFQGLQGANDTVPLEFKKCCYGYCIDLLEKLAEDMGFDFDLYIV 606

  Fly   473 GGNDYGSYNKSTNESTGMLREIMTGRADLAITDLTITSEREQALDFTIPFMNLGIAILYLKPQKA 537
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Zfish   607 GDGKYGAY--KNGRWTGLVGDLMSGAAHLAVTSFSINSARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTA 669

  Fly   538 TPELFTFMDPFSEEVWWFLGFSFLGVSLSFFILG-RLSPSEWDNPYPCIEEPEELENQFTLGNSI 601
            .| :..||.|....:|       ||:.:|..:.. .|:..||.:|:.........:..|:..:::
Zfish   670 AP-IGAFMWPLHWSMW-------LGIFVSLHVTAVFLTLYEWKSPFGMTPRGRNRDRVFSFSSAL 726

  Fly   602 WFTTGALLQQGSEI-GPKALSTRTVASFWWFFTLIVVSSYTANLAAFLTIEKPQSLINSVDD--L 663
            ......|..:.:.| .||..:.|.:.:.|..|.|..:|:|||||||.:..||....::.:.|  |
Zfish   727 NVCYAILFGRTAAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCLFCLSTYTANLAAVMVGEKTYEQLSGIHDPKL 791

  Fly   664 ADNKDGVVYGAKKTGSTRNFFMTSAEERYKKMNKFMSENPQYLTEDNMEGVNRVKTNTHY--AFL 726
            .....|..:|..:..|..::...|..|.::.|.:       |......:|::.:|.:...  ||:
Zfish   792 HHPSQGFRFGTVRESSAEDYVKKSFPEMHEYMRR-------YNAPTTPDGIDHLKDDPQKLDAFI 849

  Fly   727 MESTSIEYNTK--RECNLKKIGDALDEKGYGIAMRKDWPHRGKFNNALLELQEQGVLEKMKNKWW 789
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Zfish   850 MDKALLDYEVSIDADCKMLTVGKPFAIEGYGIGLKQNSPLTSNISELVSQYKSDGFMDMLHDKWY 914

  Fly   790 NEVGTGICATKEDAPDAT-PLDMNNLEGVFFVLLVGSCCALL-----YGIISWVLFVMKKA--HH 846
            ..|.   |..:..|...| .:.:.:..|:|.:|.||...:||     :.:..||:..|:::  |.
Zfish   915 KVVP---CGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVMLCVGVALSLLTTLGEHIVHRWVIPRMQESTEHK 976

  Fly   847 Y 847
            |
Zfish   977 Y 977

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
GluRIIE	NP_001036733.1	PBP1_iGluR_Kainate	40..402	CDD:380605	67/364 (18%)
		PBP2_iGluR_Kainate	419..790	CDD:270432	95/388 (24%)
		Lig_chan	551..824	CDD:459656	59/281 (21%)
grin3a	XP_073770471.1	None