Protein Alignment APC4 and anapc4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572522.2
• Gene: APC4 / 31835
• FlyBaseID: FBgn0052707
• Length: 775
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_005160577.1
• Gene: anapc4 / 494046
• ZFINID: ZDB-GENE-041212-10
• Length: 806
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 814
• Identity: 202/814 - (24%)
• Similarity: 348/814 - (42%)
• Gaps: 124/814 - (15%)

  Fly     6 SMKLLGARNMSCIVERMEWNNKMDLIAYGTEKGEVVIQRL-NWQKIVTFPTPGEDV--RVRSLSW 67
            :.:.:|.:.:...:..|.|..|.||||.....||:::.|| |:.::.:.| |.|:.  .:.||:|
Zfish     3 AFRQVGEKQLPNPILYMAWCPKRDLIALANTTGELLLHRLANFHRVWSLP-PNENTGKEITSLAW 66

  Fly    68 QMDETLLAVGYSNGK-VALLDAESGTIISGLIYEDDIKKVYFSKAINSQENLGTYTCNVKDKHRR 131
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Zfish    67 RPDGKVLAFSVGDTKQVVLCDAEKAEILHLFPVEYPASCMHWMEVQDDSSTLTSFS-ESEDESSR 130

  Fly   132 FLPKLQPMTNIDPCLKTLDQKSFPKGSPCF-------LVVIMRSGKVHLLLLGALQAGSIDLTQH 189
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Zfish   131 FLPKL-------PTL----PKSYSTTSKIFSEEKSEEVTNLLGEVRLNILVVGG-PSGFVEL--- 180

  Fly   190 ILHPHEFDVYDVR-------------MNGDCNAIYALLR-----DGQELILLHFQNQVLQDCMAP 236
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Zfish   181 ----YAYGLYKIATLSGILGTCRSLGLSSDLKSLSVITEIRSTDDNPEIRYIQLDTGLLSSCLPE 241

  Fly   237 MLELATHCAHILETKNYINDTQQCLTEAWETVQLEMDNKLTRYANSQPYGV-ISAHFLELHVFGF 300
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Zfish   242 LTKMARKFTHISTLLQYLRVSLTCMCEAWEEILMQMDLRLTKFVQEKNTSTQVQDEFLELLLWGH 306

  Fly   301 ATFEVEEFLFETLSEKGFKKIANSVDLSLSNLQSLVFKQLNGAAINMFYFLNTIAGFGRMSHFFE 365
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Zfish   307 ASPELQALLMNQLTVKGLKMLGQSIDSSYSSIQKLVISHLQSGSEALLYHLSEVKGMALWKQKFQ 371

  Fly   366 SL-ISPDVANEAMRACGGFVLKVHELQRTIDTLAYDMKLFHAWMIFTILRLSHQEIPDDL-VLTE 428
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Zfish   372 PLGLDPSDIEDAIVAVGSFTLKASELLQVIDKSMKNFKAFFRWLYVAMLRMSEDHVPPELNKMTQ 436

  Fly   429 EENIAMADFIC---AMEPELDDRSDDEDELDSQSQTPPPARSKFNLERVGQYL---DNAYLTQLY 487
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Zfish   437 KDLAFVADFLSEHFSANEELFDRKG----------------KYFNVERVGQYLKDEDEDLVSP-- 483

  Fly   488 PRDPVQLWEEMVTDNECLSNCKLFVPHDVNLSLVQQRDKMFNAIDAVFHKPTESISGSFKVSSTV 552
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Zfish   484 PNMDGNQWVTFVKQSTHLKDSPLLFPTYPQKSLHFVKRLMEASIDLCLQKPAAVIGDSVK---QA 545

  Fly   553 ICNDLPPMEPGEDHRDR---------DLVTCTYYV----NEAS---------RTDMLACTISGQE 595
            :|..|..:....::..|         |.....:||    .|.|         .||......:|..
Zfish   546 VCLRLYTVPESSENTPRLFELPSLWNDKKAAMHYVVFCMPEISPSKIYILRRPTDPNRSVPNGLV 610

  Fly   596 AMILEF---SRAGDECVRCTRITLEPGLFTTSVSEDFCYLRFVDLQFYNESSLSILAQSINAGPG 657
            |:.|..   |...||       |..|      .|.|:.| ..:|.:||::.:|:::.:.:.....
Zfish   611 ALNLNTPLNSSIDDE-------TPAP------ASVDYSY-SCLDARFYDDETLTVVLRRLEDDEN 661

  Fly   658 -MRPHSFFIQFSLTAALNYSTQHRMGPLVKLSEATVSQSIHDIADGAAFKGLDGFS-DMLAVSGS 720
             ||   ...|..|.:|:::..:......::|.:.|....:..:|.|...:.:|..| ..:||:|.
Zfish   662 KMR---VLAQLPLNSAMSWDEEFSWDLSLRLEQQTEGIPVQGVAWGNQSREMDNISAQFVAVNGI 723

  Fly   721 RKVATVLSDRKRKMTIFEMEIEEEEDDTEMSQAS 754
            ||||.|||...|.:.:|||:.|||||:.|.:..|
Zfish   724 RKVACVLSANLRHVRVFEMDAEEEEDEEERADES 757

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
APC4	NP_572522.2	ANAPC4_WD40	22..111	CDD:403945	29/92 (32%)
		ANAPC4	222..418	CDD:463744	57/197 (29%)
anapc4	XP_005160577.1	ANAPC4_WD40	19..111	CDD:403945	29/92 (32%)
		ANAPC4	226..425	CDD:463744	57/198 (29%)