DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(1)G0020 and Nat10

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_572503.1 Gene:l(1)G0020 / 31811 FlyBaseID:FBgn0027330 Length:1008 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038960855.1 Gene:Nat10 / 311257 RGDID:1306717 Length:1024 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1042 Identity:542/1042 - (52%)
Similarity:721/1042 - (69%) Gaps:56/1042 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVKKKIDNRIRVMIENGVKLGHRTMFIVIGDKARDQVPILYDILTKSTVKARPTVLWCYKNKDEA 65
            |.:||:|||||::|||||....|::|:|:||:.:|||.||:.:|:|:||||||:|||||| |:..
  Rat     1 MHRKKVDNRIRILIENGVSERQRSLFVVVGDRGKDQVVILHHMLSKATVKARPSVLWCYK-KELG 64

  Fly    66 ISNHGKKR----AKKIAVGKVDVNEADLFDSFRVATTIHGRYYSETHAVLGRTYGVCVLQDFEAL 126
            .|:|.|||    .|||..|.:::.:.|.|:.|..||.|...||:|||.:||.|:|:|||||||||
  Rat    65 FSSHRKKRMRQLQKKIKSGTLNIKQDDPFELFVAATNIRYCYYNETHKILGNTFGMCVLQDFEAL 129

  Fly   127 TPNLLARTVETVEGGGLIILLLKTLQSLKQLYTMSMDVHKRFRTEAHQTVTCRFNERLILSLADC 191
            |||||||||||||||||:::||:|:.||||||||:||||.|:||||||.|..|||||.|||||.|
  Rat   130 TPNLLARTVETVEGGGLVVILLRTMNSLKQLYTMTMDVHSRYRTEAHQDVVGRFNERFILSLASC 194

  Fly   192 KRCLVVNDDLTVLPLSSKTINVEPVNPAGAGR--SPNEASLKELKESLLTVQPAGALVNLCKTYD 254
            |:|||::|.|.:||:||...::|.:.|.....  ||....|:||||||...||.|.||:.|||.|
  Rat   195 KKCLVIDDQLNILPISSHVASIEALPPQAPDENLSPAALELQELKESLQDTQPVGVLVDCCKTLD 259

  Fly   255 QANAVAQFIEALVDKQLKPPMSLTAARGRGKSAALGLSIAAAVAFGYVNIYVTSPHPENLITLFE 319
            ||.||.:|||.:.:|.|:..::|||||||||||||||:||.||||||.||:||||.|:||.||||
  Rat   260 QAKAVLKFIEGISEKTLRSTVALTAARGRGKSAALGLAIAGAVAFGYSNIFVTSPSPDNLHTLFE 324

  Fly   320 FVLKGFDALEYQEHADYTIIRSTNADYKKAIIRINITRSSRQTIQYIAPSDTHLLNAADLLLIDE 384
            ||.||||||:||||.||.|::|.|.::.||:||:|:.|..|||||||.|:|...|..|:|::|||
  Rat   325 FVFKGFDALQYQEHLDYEIVQSLNPEFNKAVIRVNVFREHRQTIQYIHPADAVKLGQAELVVIDE 389

  Fly   385 AAAIPLPLVKKMIGPYLVFMASTINGYEGTGRSLSLKLISQLQKDN------------------- 430
            ||||||||||.::||||||||||||||||||||||||||.||::.:                   
  Rat   390 AAAIPLPLVKSLLGPYLVFMASTINGYEGTGRSLSLKLIQQLRQQSAQSQVSTTAENKTTTTARL 454

  Fly   431 -NARP--PLKLEESIRYQENDDIEKWLINLLCLDASTVPSISSGCPTPDACELYYVDRDALFSYH 492
             :||.  .:.|:|||||...|.:||||.:|||||...:..|.||||.|:|||||||:||.||.||
  Rat   455 ASARTLHEVSLQESIRYAPGDAVEKWLNDLLCLDCLNITRIVSGCPLPEACELYYVNRDTLFCYH 519

  Fly   493 KAAEAFLHRLVSIYVSSHYKNTPNDLQMMSDAPAHHLFCLLGPV-QRMDALPEILVVIQVALEGQ 556
            ||:|.||.||:::||:|||||:||||||:||||||||||||.|| ...:||||:|.|:||.|||:
  Rat   520 KASEVFLQRLMALYVASHYKNSPNDLQMLSDAPAHHLFCLLPPVPPTQNALPEVLAVVQVCLEGE 584

  Fly   557 ISAQSISDSLGRGKKAAGDLIPWNVAEQYGDRDFPKLCGVRIVRVATHPNYQRMGYGKRAIQLLK 621
            :|.|||.:||.|||||:|||:||.|:||:.|.||..|.|.|:||:|.||:||.||||.||:|||:
  Rat   585 LSRQSILNSLSRGKKASGDLLPWTVSEQFQDPDFGGLSGGRVVRIAVHPDYQGMGYGSRALQLLQ 649

  Fly   622 DYYARKHTNLEDGPVASKDAGKGIEEVEEEELSLLKEQIRPRSRIPTLLQRLHERVPEHVDYIGT 686
            .||..:...||:..:   :..:.|..|..|.:|||:|.|.||..:|.||.:|:||..|.:||:|.
  Rat   650 MYYEGRFPCLEEKVL---ETPQEIHTVSSEAVSLLEEVITPRKDLPPLLLKLNERPAERLDYLGV 711

  Fly   687 SYGLTTELLKFWKNAGFVPVYLSQKSNELTAEHSCIMLHT------PNATPWLGLYYQDFRRRVL 745
            |||||..||||||.||||||||.|..|:||.|||||||.|      .....||..::.|||||.|
  Rat   712 SYGLTPRLLKFWKRAGFVPVYLRQTPNDLTGEHSCIMLKTLADEDEAERGAWLAAFWTDFRRRFL 776

  Fly   746 KLMGKTFREFETKLCLALLKNKSVDTEGSALKVLDKPMLDVYFLPHDLQRLESYARQQSEFRLII 810
            .|:...|..|...|.|.:::|:::  ..||..||.:..|:..|||:||:|||.|:|...::.||:
  Rat   777 ALLSYQFSTFSPALSLNIIQNRNI--AKSAPPVLGREHLEALFLPYDLKRLEMYSRNMVDYHLIM 839

  Fly   811 DLLTDIAQLYFQGRIDGLQLDLVQQGILLALGVQGKTVDALGLELNMPGNQLLAKFFDAMKRCNQ 875
            ||:..|::|||..::..|.|...|..:||.:|:|.|:||.|..|:.:|..||:..|...:::..:
  Rat   840 DLIPAISRLYFLNQLGDLALSAAQSALLLGMGLQHKSVDQLEKEIELPSGQLMGLFNRIIRKVVK 904

  Fly   876 CFRSVLEEHIEGGMLREADLSKGEELQPLTLSLDKELDQTAQKLSKQQRKELKRLKAEQLDEFQI 940
            .|..|.|:.||..|:...|:    .::|...:|..:||:.|::..::.:|::.:||...|.::.|
  Rat   905 LFNDVQEKAIEEQMVAVKDV----VMEPTIKTLSDDLDEAAKEFQEKHKKDVGKLKDMDLSQYII 965

  Fly   941 KGTEEDWSKALETNGTGGGSGLLSVKSGVKRLDGPIETREDGDLAAPLSKKKKK--NNPKQRRSQ 1003
            :|.:|:|::.|  :..|..:.::|:||..||   .:||:::    ...|||.||  ||.|..:.:
  Rat   966 RGDDEEWNEVL--SKAGQNASIVSLKSDKKR---KLETKQE----PKQSKKLKKSGNNRKDTKLK 1021

  Fly  1004 GK 1005
            .|
  Rat  1022 RK 1023

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(1)G0020NP_572503.1 TmcA 21..882 CDD:224361 493/895 (55%)
DUF1726 104..198 CDD:285542 72/93 (77%)
Helicase_RecD 276..461 CDD:282921 128/206 (62%)
GNAT_acetyltr_2 501..726 CDD:290437 135/225 (60%)
tRNA_bind_2 744..863 CDD:290444 44/118 (37%)
Nat10XP_038960855.1 TmcA 20..901 CDD:224361 491/886 (55%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166338847
Domainoid 1 1.000 270 1.000 Domainoid score I1766
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H6785
Inparanoid 1 1.050 1016 1.000 Inparanoid score I266
OMA 1 1.010 - - QHG54077
OrthoDB 1 1.010 - - D186208at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0003402
OrthoInspector 1 1.000 - - oto95734
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101162
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10925
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X2298
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1312.910

Return to query results.
Submit another query.