Protein Alignment ldd and ABCA8

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001285513.1
• Gene: ldd / 318066
• FlyBaseID: FBgn0083956
• Length: 1998
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001275914.1
• Gene: ABCA8 / 10351
• HGNCID: 38
• Length: 1621
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 1541
• Identity: 350/1541 - (22%)
• Similarity: 603/1541 - (39%)
• Gaps: 343/1541 - (22%)

  Fly   637 YLLGLVV-------FVALSV-RERIWMRESRNSMLMRSMGLKAHSELVAWALM--SFLELCVIF- 690
            ||...::       :.:::| |||     .|...||..|||:..:..::|.|:  .|:.:..:|
Human   225 YLFSCIISFSSFIYYASVNVTRER-----KRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFL 284

  Fly   691 ALI----SGVLYSGGILGYTNWFFMMFYC--LSFGLCLISFCYMCTNFFNSANIGAVASALLFFI 749
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Human   285 ALVIRSTQFIILSG---------FMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKS----------FLT 330

  Fly   750 SLCPFIIVLMFDA--------KLSVFESFLVDLSFTTAFAKGWGELIRMELQQEGLTVRHLIQVG 806
            .|..|::.:.:..        .|.....:::.|....||..|..:|:.::.........|
Human   331 GLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPH----- 390

  Fly   807 PARSECAMALLMFLL--DLLLYAVIGLAYQRY-----------------------KKTDN----- 841
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Human   391 PSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALED 455

  Fly   842 --------YSFVKVSRSQLDGKLGASLVNVSKLYGSKC----AVSNLSLDFARNQVSCLLGRNGA 894
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Human   456 EMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGA 520

  Fly   895 GKSTLIKLLTGQIRQSSGKVLLAG------------EHQVGVCWQDNILIPTLTAREHLQLYAQI 947
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Human   521 GKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKI 585

  Fly   948 KIPPGGSGGV--EEIRSEVAQTLQSLNFGKHESYPSWQLSGGYRRRLCVAIAFIASPSVVILDEP 1010
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Human   586 K-------GILPQEVDKEIQRVLLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEP 643

  Fly  1011 CNGVDAKARKDIWQLIERLRQGRAVIFATHFMDEAKYLSDSLVIMRNGRIIAQHSRDSLQRLCTS 1075
            ..|:|..:|..:|.|::..:..|.::|:|.|||||..|:|..|.:..|::....|...|::....
Human   644 TAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGI 708

  Fly  1076 NYSIRLRCADATGVTFVIQKAQQLLPQTQVTHSGAADYPHSLTIN-------------------- 1120
            .|.:.|:..:......:....:|.:|..:::........::|.:.
Human   709 GYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGI 773

  Fly  1121 ASYAEHLTPGAVEFLEL------------LQSQVTAGSISDVELTTSSSLEQEFEQLNRNGEDAG 1173
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Human   774 ENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLV--EMEQVLSSLNKMRKTIG 836

  Fly  1174 PRRPASDRSGVVAGPAMITDEPPTACKQFRLLMGKRLRHLSRNYRLLLYVLL---LPALFE--LC 1233
                     ||......|     .|..:.|||   :|:|..:....||.:|:   .|.|.|  :.
Human   837 ---------GVALWRQQI-----CAIARVRLL---KLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMV 884

  Fly  1234 AMWFVSYRLEDDFDTVLPLSRSLY----------PQTAQFLSHERATSFSEKLYPQLRTSCDHLG 1288
            .::..||..|        ||..||          |.|...:.::...|..:.:     .|.:|..
Human   885 KIYQNSYTWE--------LSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFI-----QSVEHQN 936

  Fly  1289 ---ECRVFNTSQQSYDWVLNSWGEYSERRYGGYGLNGSGATVWYNNKGYHSMMAWLNDLNSELLR 1350
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Human   937 IALEVDAFGTRNGTDD-----------PSYNG------AITVCCNEKNYSFSLA----CNAKRLN 980

  Fly  1351 ---TTMNDSESSILTLNEPWKLGFAELST--SSILRQAGDGSMVFILLIAFGLVVASG-----SV 1405
               ..|:...:.:|.:.:|    ...:.|  |:.|....|..:.|:..|.|.||:.|.     ::
Human   981 CFPVLMDIVSNGLLGMVKP----SVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAM 1041

  Fly  1406 YLVNERVNGEKLQQRLCGVSAVTYWLVALVWDYLVMVLGLIVCLVVILMFGMPVFVDRQQLVGII 1470
            ..:::..|..:.|.|:.|:|...||....:.|   :.|..:|.:.:.||..:..|.|  .|:.||
Human  1042 SSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVD---VSLYFLVFVFIYLMSYISNFED--MLLTII 1101

  Fly  1471 GL-----SLAFSFACVPSVHVAEKIF----SDSSI-----AIVSIF-CANLIVPLVTMGIILILG 1520
            .:     ::.:||:.:...:|...||    .:|.|     .:|::| .|.....:....|..|.
Human  1102 HIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIF- 1165

  Fly  1521 VVGDGPAWDDWRHALNQAFLIFPIHALGDGFLELCKNYMVALVF--RRYDIDSYKHPLASDLLGR 1583
                             .|||.|...:|..||.  .:.:.:.:|  .|.|:..:...|...|
Human  1166 -----------------TFLIPPATMIGCLFLS--SHLLFSSLFSEERMDVQPFLVFLIPFL--- 1208

  Fly  1584 HFTALLLVGVAALIINVLIEWHLLRRLWQR----------------------------VERLLDC 1620
            ||       :..|.....:||...::..::                            :||:
Human  1209 HF-------IIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERV--- 1263

  Fly  1621 TYRRELDKLGQLKLVNIQSIFKSCVDTGEAVRAENLWLAYRRGHYAVRNVNFSVQRGECFGLLGK 1685
               |..:.|..........|..||:....|.:.:..: :.|:...|.|||:|.|::||..||||.
Human  1264 ---RTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCF-SKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGH 1324

  Fly  1686 NGAGKSTIFKLLTGQLQPDVGQIYFEQPG-------ISYCPQSNPLDPLLTTTECIRFYGRLRGI 1743
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Human  1325 NGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGL 1389

  Fly  1744 R--DLDQFLDRVLDTYELRPYKDVQVRNLSGGNRRKLTVAVTCCGCTPTVLMDEPTSDMDPVTRD 1806
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Human  1390 RKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQ 1454

  Fly  1807 MVYATIEQLLL-ARRAVVLTSHSVSEIEHLCQRVAVLRAGQVIASDSPQRLKSEHGGYYAVTC-F 1869
            .::..|..... ..|..:||:|.::|.|.:|.|||::.:|::....|.|.|||:.|..|.:.. .
Human  1455 QMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKV 1519

  Fly  1870 CGPAQQAILSRSLNQRLPGARDLQHYAHSLRFLVRVRSPGSLGDAPLLSELFAILCDV--CVNVA 1932
            ...||...|...:.:..|.|...:.|:..:.:.:.|.      |...|::.|..|..|  ..::.
Human  1520 KNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVE------DVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLE 1578

  Fly  1933 RFSLSRCRFETVFERILDSSESNGSNGVHKDQQQQVAKNDLPSKSP 1978
            .:|||:...|.||   |:.|:........:|....|....||.:.|
Human  1579 EYSLSQSTLEQVF---LELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP 1621

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ldd	NP_001285513.1	rim_protein	179..1867	CDD:130324	325/1425 (23%)
ABCA8	NP_001275914.1	rim_protein	<235..>790	CDD:130324	127/590 (22%)
		ABC_subfamily_A	480..703	CDD:213230	72/229 (31%)
		rim_protein	<1033..1598	CDD:130324	153/615 (25%)
		ABC_subfamily_A	1285..1506	CDD:213230	74/221 (33%)