DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG33791 and Ogdh

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001027100.1 Gene:CG33791 / 317974 FlyBaseID:FBgn0035240 Length:1282 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038948146.1 Gene:Ogdh / 360975 RGDID:1561359 Length:1038 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1074 Identity:544/1074 - (50%)
Similarity:714/1074 - (66%) Gaps:71/1074 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     6 LRSLARIRRSLTLG--LRGTDQHVLARQALRTIQTTSQRRGVHDLDSFANGCSAAYIEGLYNKWK 68
            ||:.|...|.||..  ::...|:..|  |:||.|...........:.|.:|.|:.|:|.:|..|.
  Rat     4 LRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNKPA--AIRTFQQIRCYSAPVAAEPFLSGTSSNYVEEMYCAWL 66

  Fly    69 RNPSSVDESWNELFSSNDWSSPK----RSPLQVSHSRKYRRPPVERIAVKARSGERTASGGASAA 129
            .||.||.:||:..|.:.:..:|.    :|||.:|                 ||...|.:...|..
  Rat    67 ENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGTAYQSPLSLS-----------------RSSLATMAHAQSLV 114

  Fly   130 PAAPPSDWKNIDDHHVIQAIIRAYQSRGHLAADLDPLGIVGPKKRTSV--------DGTQRHAAR 186
            .|.|..| |.::||..:|::|||||.|||..|.||||||:.....:||        |.......:
  Rat   115 EAQPNVD-KLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLDLAVFK 178

  Fly   187 EVLRQ-----HFSYIFNDLNTVFKLPSSTMIGGDQEFLSLKEILDRLERIYCGHIGVEYMQITSL 246
            |.||.     .:....:||:.||.||::|.|||.:..|.|:||:.|||..||.|||||:|.|..|
  Rat   179 ERLRMLTVGGFYGLHESDLDKVFHLPTTTFIGGQEPALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDL 243

  Fly   247 TKTNWLRDRFEKPGGLDLTKEEKKLILERLTRSTGFENFLAKKFSSEKRFGLEGCDIMIPAIKEV 311
            .:..|:|.:||.||.:..|.|||:.:|.||.|||.||.||.:|:|||||||||||:::|||:|.:
  Rat   244 EQCQWIRQKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTI 308

  Fly   312 VDRATDHGVESILIGMAHRGRLNVLANICRKPISDILSQFHG-LQATDSGSGDVKYHLGVFQERL 375
            :|.::.:||:.:::||.||||||||||:.||.:..|..||.. |:|.|.||||:|||||::..|:
  Rat   309 IDMSSANGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDMKYHLGMYHRRI 373

  Fly   376 NRQTNRMVRITVVANPSHLEHVNPVLLGKARAEMFQRGDTCGSTVMPIIIHGDASFSGQGVVYES 440
            ||.|:|.:.:::||||||||..:||::||.:||.|..|||.|..||.|::||||:|:|||:|||:
  Rat   374 NRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYET 438

  Fly   441 MHLSDLPNYTTYGTIHIVSNNQVGFTTDPRFSRSSRYCTDVAKVVNAPILHVNADDPEACIQCAR 505
            .||||||:|||:||:|:|.|||:|||||||.:|||.|.||||:||||||.|||:|||||.:...:
  Rat   439 FHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSDDPEAVMYVCK 503

  Fly   506 IAIDYRTRFKKDVVIDIVGYRRNGHNEADEPMFTQPLMYQRIKKLKPCLQLYADKLIKEGVVTDS 570
            :|.::|..|.||||:|:|.||||||||.|||||||||||::|:|.||.||.||:.|:.:|||...
  Rat   504 VAAEWRNTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQP 568

  Fly   571 EFKAMVSSYEKICEDAWAKSKTIKTIKYSSWIDSPWPGFF--EGRDRLKLCP-TGISTDTLKTIG 632
            |::..:|.|:||||:|:.:||..|.:....|:||||||||  :|:.|...|| ||:..|.|..||
  Rat   569 EYEEEISKYDKICEEAFTRSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMTCPSTGLEEDILTHIG 633

  Fly   633 NMFSTPPPPEHKFETHKGILRILAQRTQMVQDKVADWSLGEAFAFGSLLKEGIHVRLSGQDVERG 697
            |:.|:  .|...|..|.|:.|||..|.::|.::..||:|.|..||||||||||||||||||||||
  Rat   634 NVASS--VPVENFTIHGGLSRILKTRRELVTNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRLSGQDVERG 696

  Fly   698 TFSHRHHVLHHQSEDKVVYNSLDHLYPDQAPYSVSNSSLSECAVLGFEHGYSMASPNALVMWEGQ 762
            ||||||||||.|:.||.....::||:|:||||:|.||||||..|||||.|::||||||||:||.|
  Rat   697 TFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPNQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQ 761

  Fly   763 FGDFCNTAQCIIDTFIASGETKWVRQSGVVMLLPHSMEGMGPEHSSGRIERFLQMSDDDPDVYPD 827
            ||||.|.||||||.||..|:.|||||:|:|:||||.||||||||||.|.||||||.:|||||.|:
  Rat   762 FGDFNNMAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPN 826

  Fly   828 TCDADFVARQLMNVNWIVTNLSTPANLFHCLRRQVKMGFRKPLINFSPKSLLRHPLARSPFKDFN 892
            ..:.:|...||.:.||||.|.|||.|.||.||||:.:.||||||.|:||||||||.||:.|.:..
  Rat   827 LQEENFDISQLYDCNWIVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIVFTPKSLLRHPEARTSFDEML 891

  Fly   893 ECSCFQRIIPDKGPAGKQPDCVQKLVFCSGKVYYDLVKERDDHEQVETVALVRVEQVRRLPTRHL 957
            ..:.|||:||:.|||.:.||.|::|:||:|||||||.:||...:..|.||:.|:|          
  Rat   892 PGTHFQRVIPEDGPAAQNPDKVKRLLFCTGKVYYDLTRERKARDMAEEVAITRIE---------- 946

  Fly   958 FLFMITMIGRILQLCPFPYDLISQQLELYPKAELLWAQEEHKNMGAWSYVQPRFDTALLKNENES 1022
                        ||.|||:||:.::.:.||.|||.|.||||||.|.:.||:||..|.:    :.:
  Rat   947 ------------QLSPFPFDLLLKEAQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTI----DRA 995

  Fly  1023 RCVSYHGRPPSASPATGNKVQHYNEYKALITSIF 1056
            :.|.|.||.|:|:||||||..|..|.:..:.:.|
  Rat   996 KPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRFLDTAF 1029

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG33791NP_001027100.1 SucA 47..1057 CDD:440333 532/1031 (52%)
PHA03307 1078..>1280 CDD:223039
OgdhXP_038948146.1 SucA 49..1031 CDD:440333 532/1027 (52%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.