Protein Alignment nonC and atr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_727132.1
• Gene: nonC / 31625
• FlyBaseID: FBgn0263968
• Length: 3218
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031758244.1
• Gene: atr / 100495593
• XenbaseID: XB-GENE-1012722
• Length: 2655
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 2663
• Identity: 524/2663 - (19%)
• Similarity: 914/2663 - (34%)
• Gaps: 856/2663 - (32%)

  Fly   128 DLRLSKIIRRL-INENNPTVSLE------LCSKLDQAVRTPINMGYMTCSFVWILDNMLTLYKQC 185
            ::.|.:::|.| |.|:...:|:|      |..||....:..|.....:......|..|:..:...
 Frog   298 EMPLLELVRVLFIFESKSYLSIEPVYLNMLLEKLAALFKAGILKNIQSAPLKEALCYMVHYFLSV 362

  Fly   186 PPPVLEE------------CSKTLGLIGFINRKSY---PIYEEFIVKN--YKSSKRMQKYMIMAL 233
            .||..|.            ||..:.::|..:::.|   |::|...|::  |...:.||
 Frog   363 VPPGYESAKEVREVHVRCICSAFVDVLGLQSKQEYLVFPLHEALRVESLAYMQQQSMQ------- 420

  Fly   234 RATLSCDTK-------CELHMYADKIMLLLKDFLENAES--ADIFIVVSNTLVQFAASYAETFEC 289
              .||.|::       .|:.....::.|..|....|..|  |.:.:...:.|.:..::...:..|
 Frog   421 --PLSTDSEGGGSSSSDEVQEKRPRLSLTAKPLRRNIPSTPAPVDMKTKSMLWKAVSAKLSSLLC 483

  Fly   290 HF-------TDVVDIVIGWQLEAGQPTDLKTHCAQVLEQLTPFFSKQIDFSYGLLDQFVEDITTL 347
            ..       .::|.::.|..         .|.|...| .:...|:|....:    :|.|.|::..
 Frog   484 KLEGDEVSEEEMVSLLEGVN---------TTICVAAL-SIVHIFAKNSTHT----NQSVSDLSNT 534

  Fly   348 EEGEPANTAERVGAFVGAFNTLLKCLARMQIFVGMPTCECIVKMA------VDHLIKIMPT---- 402
            ...:......:| ::|.. ..:||.|         ..|..|:..|      .|.|:||:..
 Frog   535 SGIQLVEMVPQV-SWVSP-EDILKIL---------KICRKILDSAHQRASINDILMKIIKIFDAI 588

  Fly   403 --LH----LNTEALVNINELICICLLNNFT--------GLDPILLEQVLLDQVKRMISLTELQRQ 453
              :|    ||.|.|.::..:|.:....|.:        ..||.|:  .|.:|:.:..| .|:|.|
 Frog   589 LYIHAGTRLNDETLKDLCAMISLPWFQNHSNHASFKVASFDPALV--TLSEQISQHFS-PEIQSQ 650

  Fly   454 SVLYL-----LLCTVRRLRARLTPSLVHFIFQSNPYMTKVRLRSPGETSYKLLLRTCQETLLIRN 513
            .|..|     :||...||      ::.|:...|...:.:.|               |     |:.
 Frog   651 LVFLLCLFPKMLCPEWRL------AVYHWALDSQHEIVRAR---------------C-----IKG 689

  Fly   514 VPLL-----QQAYKYLVDDIDACLEKLLITAPRSKARKASVLLVFHLSALAALAKQTSSIIGMYA 573
            .|:|     ||.|        ..:.|:||    .:...||.|          :.::.::.:||:|
 Frog   690 FPVLLCNISQQGY--------GPIPKILI----ERLNDASEL----------VKRELANAVGMFA 732

  Fly   574 CKPSILELLLTNCRAHELKFWSKYPAAQQAIFGLLVVHCQANHNFRTNSSLLRDQEL-SAENTSP 637
            ...:         ...||::....|.|..:.|     .|          |.||...| |:|.:..
 Frog   733 SGLA---------SGIELQYSPMAPTAAASDF-----LC----------SSLRVTALPSSEQSRM 773

  Fly   638 TANSFASILRFLDSVLGQAHQLA-PQNLRVLLQWIQMLLRECREKIDL-----------LMEQEN 690
            ||::....|..||..:..:.::| .:|:.:|...:..      ||.|:           |||..:
 Frog   774 TASTLKPFLALLDRNMPSSVKMAFIENMPMLFDHLSF------EKDDIDSRTVIESLLNLMEDPD 832

  Fly   691 ------FRGICRNIAATASKLVPLESAACIQTVLDYGLERLEKYPKLLILYRDTALQQLQMLSTN 749
                  |.|..|.:...|.     .....::.:|   :.|::|......:.||..::...:|:|.
 Frog   833 QDVRIAFSGNIRYLLTCAE-----YEEGYLKEIL---VSRMKKAYTNAKMSRDNEMKDTLILTTG 889

  Fly   750 --YHAPYFQIYAQLPLHL--TLTGGESSMPGMASRRVSVWQQRISQYSAVRDNVFRDFFDRVQKP 810
              ..|...::.....|||  .|....:|:.|.:       ...|...:|.:....:.||.:.:||
 Frog   890 DIGRAAKGELVPFALLHLLHCLLSKSTSVAGAS-------YTEIRSLAAAKSTSLQIFFSQYKKP 947

  Fly   811 EQDSLIHCLRELFV--------RSCQVAPQD---ERQM---------------NLSQCTKRCQRL 849
            ....|:..|.....        ||.::..|:   .|:.               :|::...|..:|
 Frog   948 ICQFLVESLHSSQAALLTNTPGRSSEMQKQEAAHHREAALDILSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQL 1012

  Fly   850 AIAWLQFEAARYCVDQRLRTTVGKP-----QETFLGFEAIIMRHARLLSGCAK-EIERS------ 902
            .:.:|..:|:.  ....|..|:.|.     :|..:.....|..|  |:..|.| |:|:|
 Frog  1013 LLPYLAAKASP--TASTLIRTIAKQLNVNRREILINNFKYIFSH--LVCSCTKDELEKSLHYLKN 1073

  Fly   903 ----ALDDLSLEELLSMQSNLSLLLG-----FLDALEKLIYNAAEGSAFA--------------L 944
                .|..|..::...:.:.|.|.||     ..:.|..|...|:....:.              |
 Frog  1074 ETEIELGSLLRQDYQGLHNELLLRLGEHYQQVFNGLSILASFASSDDPYQGPRTITKQEIMADYL 1138

  Fly   945 RPPEKQVAAFFRLN--------------------------------------------------- 958
            :|....:.|||.::
 Frog  1139 QPKLLGILAFFNMHLLSSSIGIEDKKMALNSLVFLMKLMGLKHISSVRVKMMTTLRTGLRYKEEF 1203

  Fly   959 -NPTCQSWFNRIR----------IGVVIIA----MHVQQPELVIRYAQQILVNS-KTQDPTYSQA 1007
             ...|.:|...:|          :..||:|    :|:|..|.|..:...|:.|. ..||
 Frog  1204 PELCCSAWDLFVRCLDPAYLGSLLSHVIVALLPLLHIQPKETVAVFRYLIVENRVAVQD------ 1262

  Fly  1008 IVYMAWSLVSCQEADSLRGLRLWARGKSCKSYKW-------LKYAADQAAGKRESALAGYRTILA 1065
            .::..:.|....|...::.:....|.::.||...       ::....:....|..||...:..|.
 Frog  1263 FLHEIYFLPDHPELKEIQKVLQEYRKETTKSTDLQTAMQLSIRAIQHENVDVRMHALTSLKETLY 1327

  Fly  1066 E---KELQSELEPHTRQFVVSQMM-------------------QCLQDLGQWSQLVELKQQQMTR 1108
            :   |.||...:..|.:.|:||::                   :||..||    .::..:...:.
 Frog  1328 KNQAKLLQYSTDSETVEPVISQLVTVLLIGCQDANPQARLFCGECLGQLG----AIDPGRLDFSA 1388

  Fly  1109 PEDRELNPFLQRSNVE--------VNALERLLAKSEESCSSMDALGGVFQQL------------- 1152
            .|.:....|...|.||        :..|.|......::..:.|:.....|:|
 Frog  1389 SETQGTRGFTFVSGVEDSDFAYELLTELTRAFLAYADNVRAQDSAAYAIQELLSIYECKEGRTDC 1453

  Fly  1153 ---SLW---PSNWDESVSSSGLSER--ASFSSIHMRQRTEDIVLHKLLEDRCVPDQAKNLLD--T 1207
               .||   |.:..| :....|:.|  :|..:::..:..:.|.|.||         ..|..|  .
 Frog  1454 PGRRLWKRFPEHVQE-ILEPHLNTRYKSSKKAVNWSRVKKPIYLSKL---------GNNFADWSA 1508

  Fly  1208 QWRDSLLNP---SFDQR---SCK---------ELTLLRHIVQGVSGG------QEL--SLLPVSS 1249
            .|...|:..   .|.:|   .|.         .:.||.||:..|..|      ||:  .::.|..
 Frog  1509 TWAGYLITKVRHEFARRVFGCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNKEDQQEVYAEIMAVLK 1573

  Fly  1250 ------GRCQNRSKFISSAILMRCLAWTQLLRQHCAPGSWETLCLDAAAAAREEGNLQLAETLLT 1308
                  .|.|:.:..:|........:....|.|      |          |||:.....||...|
 Frog  1574 HEDPLMRRLQDSASDVSQLSTQTVFSMLDHLTQ------W----------AREKFQALNAEKTNT 1622

  Fly  1309 QFFGQP--IGEIAALFSLEQGVQTDNPEML---------------RGYSELVKCLHLQ------Q 1350
                :|  .||:.|:.:.:.|...:....|               :.|:..|  :|.:      :
 Frog  1623 ----KPGHRGELKAVSNEDYGEYQNVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAV--MHFESFIMEKK 1681

  Fly  1351 QQSQTHSGDLSSSIDVCAALCLNIQKSNNQP--AAGADLL----LNLADWIAVRTCNGLTTNQSP 1409
            |:.|.|.|.|..   :.||:        ::|  .||...:    .:|.:.|......||..:.:.
 Frog  1682 QEIQEHLGFLQK---LYAAM--------HEPDGVAGVSAIRKKEASLKEQILEHESIGLLRDATA 1735

  Fly  1410 VLIQLLDQLPECPLTCDS--SQPLAIPQAERMVARLVHSCLQQRPNYAEALIAY---GNWCYRWG 1469
            ...:.:...||..:....  ...|.:.|...::.: |:..|..||.:...|..|   ..|.....
 Frog  1736 CYDRAIQLKPEEIIHYHGVVKSMLGLGQLSTVITQ-VNGVLNSRPEWTAELNTYRVEAAWKLSQW 1799

  Fly  1470 KKVADSCCVLTQADATAISQALDIPQPL------ESEKLDELLQALSTEQ--------------- 1513
            ..|.|    ...||..:.:.::.:.|.|      ||::..|.|:.:..||
 Frog  1800 DLVGD----YLSADRKSTTWSIRLGQLLLAAKKGESDRFYETLKVVRAEQIVPLSAASFERGSYQ 1860

  Fly  1514 -----------------------------PPANC------VEVCPDAARARDDEAAKNRLRRLTF 1543
                                         ||.:.      :|:..::.|||:...|   |||...
 Frog  1861 RGYEYIVRLHMLCELEHSVKMFLQKSSVEPPVDSLNLPARLEMTQNSYRAREPILA---LRRALQ 1922

  Fly  1544 LADKTPEALDAILQIWRRA--IANTYDYYKDAARSYFQYLSFKSGSGPEKPEGEGVVSQRERLHV 1606
            ..:|.|...|.|.:.|.::  :|....:::.|..:...             .||..:|:   |:|
 Frog  1923 TINKRPNDADIIGECWLQSARVARKAGHHQAAYNALLN-------------AGESRLSE---LNV 1971

  Fly  1607 DDSNLVTTTLRLLRLIVKHASGLQEVLEQGLH---TTPIAPWKVIIPQLFSRLNHHEPYVRKSVC 1668
            :.:..:.:...:.:.::        ||::|..   :..|||     |:  .:|.|....:
 Frog  1972 ERAKWLWSKGDVHQALI--------VLQKGAELFLSNTIAP-----PE--QQLIHGRAML----- 2016

  Fly  1669 DLLCRLAKSRPQLVIFPAVVGAN-------REQQDATAPPATARPTTEDACCYGYLLGELSKQAP 1726
             |:.||.:..           ||       ::.:|.|    |..|..||.  :.||.....|..|
 Frog  2017 -LVGRLMEET-----------ANFESNAVMKKYKDVT----TLLPEWEDG--HFYLAKYYDKLMP 2063

  Fly  1727 EAVQH--------VKLMVKELRRVCLLWDEYWIHSLAHIYNTYVSRVSALATDF----------- 1772
            ....:        ::.:|....|.....::|       ||.: :.|:.:|..||
 Frog  2064 MVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRSLQFGNQY-------IYQS-MPRMLSLWLDFGAKVYEWEKAG 2120

  Fly  1773 RPDDHEGKNNRFNVWRPQLLAD----------LEALVAVTSR----------------------- 1804
            |.|..:.||....:  .::::|          |.|...:.||
 Frog  2121 RADRLQMKNELIKI--NKVISDHKNQLAPYQFLTAFSQLISRICHSHDEVFAVLMEIVAKVFVAY 2183

  Fly  1805 PPETTYERSFRKRFDAPIRLT--------------------VDALRHRRYPEAWDKLKQLYHILQ 1849
            |.:..:..:...:...|:|:.                    .||.|      ..|||.:|.
 Frog  2184 PQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMKPSLGKFIGDATR------LTDKLLELC---- 2238

  Fly  1850 SNMIRGSGSTLKMQ-------------SISPVLCGIGRMRISMPGLDA---------HGP-DGDQ 1891
            :..:.|:.|.|.|.             :.|.:|  |....:.:|.|.:         |.| .|..
 Frog  2239 NKPVDGNTSILSMNIHFRMLKKLVEELTFSEIL--IPLQSVMIPTLPSTAGKRDHADHDPFPGHW 2301

  Fly  1892 VYIESVESSVCVLPTKTKPKKVAFYGSNGQRYTFLFKGMEDLHLDERIMQFLSISNAIMACRSDA 1956
            .||...:.:|.:||:..||||::..||:|:.|..:.|..:||..|.|:|:|.|:.|..:  |.||
 Frog  2302 AYIAGFDDAVEILPSLQKPKKISLKGSDGKSYIMMCKPKDDLRKDCRLMEFNSLINKCL--RKDA 2364

  Fly  1957 PGNGCYRAHH---YSVIPLGPQSGLISWVDGVTPVF--ALYKKWQQRRSQVAGNAGAGAVANVPR 2016
            ...  .|..|   |:||||..:.|:|.||:. |..|  .|.|.::::...:.|           :
 Frog  2365 ESR--RRELHIRTYAVIPLNDECGIIEWVNN-TAGFRNILIKLYKEKGIYMGG-----------K 2415

  Fly  2017 RFTDLFYNKLSPLLAKHNMQVSDPRRQWPISVLLQVLDE--LSQETPNDLLARELWCQA-GNAAE 2078
            ........|.:||..|                 |:|..|  |.:..|   |..|.:.:. .:...
 Frog  2416 ELRQCMLPKGAPLQEK-----------------LKVFKEALLPRHPP---LFHEWFLRTFPDPTS 2460

  Fly  2079 WRQSVRRFVRCMSVMSMIGYVIGLGDRHLDNVLINLGSGDIVHIDYNVCFEKGRTLRIPEKVPFR 2143
            |..|...:.|..:||||:||::||||||.:|:|.:..:|:.||:|:|..|.||.|..:||.||||
 Frog  2461 WYNSRSAYCRSTAVMSMVGYILGLGDRHGENILFDSLTGECVHVDFNCLFNKGETFEVPEIVPFR 2525

  Fly  2144 LTQNLVQAMGITGIEGPFRLGCEYVLKVMRKERETLLTLLEAFVYDPLVDWTTNDDAQALRRSLN 2208
            ||.|:|..||..|.||.||..||..:::||.:||.|:::|:.|::||||:|:
 Frog  2526 LTHNMVNGMGPMGTEGLFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKPFLHDPLVEWS------------- 2577

  Fly  2209 AKLQESADGGGAGGLG-VGDLKYHKKDKNKGKPLDSDVKRQPFLSKLGMLQKYWSTNKTELMP 2270
                :.|.||..|.:. .|::   ..:|.|...||.:.:.|      |:::   :.|:.:.:|
 Frog  2578 ----KPARGGSKGQVNETGEV---VNEKAKTHVLDIEQRLQ------GVIK---TRNRVKGLP 2624

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
nonC	NP_727132.1	SMG1	571..1140	CDD:464869	130/756 (17%)
		PIKKc_SMG1	1894..2196	CDD:270714	108/309 (35%)
		FATC	3189..3217	CDD:460514
atr	XP_031758244.1	UME	1134..1239	CDD:214825	11/104 (11%)
		FAT	1786..2104	CDD:396714	66/386 (17%)
		TEL1	<2145..2655	CDD:227365	148/557 (27%)
		PIKKc_ATR	2304..2578	CDD:270625	108/326 (33%)